Le caryotype
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1 Le caryotype C'est l'ensemble des caractéristiques des chromosomes du génome : nombre, taille, position du centromère, disposition des bandes. I) Les cellules nécessaires à la réalisation du caryotype L'examen est réalisé sur des cellules en culture au stade de métaphase. Aprsè la naissance, on utilise des cellules sanguines ; avant la naissance, plusieurs prélèvements peuvent être pratiqués : chorion, liquide amniotique ou sang du cordon. 1) Amniocentèse - Le prélèvement du liquide amniotique se fait sous contrôle échographique par ponction transabdominale, entre la 16 ème et la 18ème semaine d'aménorrhée. - On récupère les cellules de desquamation foetale qu'il faut mettre en culture. - Le risque d'avortement spontané est de l'ordre de 0.5 %. - Le résultat peut être obtenu en trois à quatre semaines. 2) Biopsie des villosités chorioniques - Les annexes ont la même origine que l'embryon. - Le prélèvement se fait par voie transcervicale, entre la neuvième et la douzième semaine d'aménorrhée. - La mise en culture n'est pas nécessaire et le résultat peut être donné en 24 heures, puis confirmé au bout d'une semaine. - Le risque d'avortement est très variable. II) Etablissement du caryotype - Après mise en culture plus ou moins longue, on bloque les chromosomes en mataphase à la colchicine. - Pour les dénombrer et les étudier, ils sont dispersés, fixés, colorés et photographiés. - On étudie une vingtaine de mitose. 1) Classification - Selon la taille : approximation. - Selon le rapport centromérique : Chromosomes médiocentriques : 40 à 50 % Chromosomes submédians : 33 à 40 % Chromosomes distaux : 25 à 33 % Chromosomes acrocentriques : < à 25 % - Selon la technique de coloration en bandes : le marquage en bandes est basé sur des traitements particuliers des chromosomes, mais correspond à une réalité biochimique reproductible. - La coloration au Giemsa met en évidence les différentes bandes : Bandes G : riches en AT, de réplication tardive, riches en séquences Line, pauvres en séquences Alu, peu d’événements de cassures et contiennent peu de gènes Bandes R : profil inverse ; elles contiennent l’essentiel des gènes domestiques Bandes Q (idem bandes G) : coloration à la quinacrine fluorescente en UV Chaque bande est désignée par quatre paramètres : n° du chromosome, symbole du bras (q : long, p : court), n° de la région et n° de la bande. 2 2) Hybridation in situ - On utilise des sondes marquées complémentaires des séquences d'intérêt. - Elle permet la localisation précise d'un gène sur des chromosomes en métaphase et en interphase, la mise en évidence de petit réarrangement, de microdélétion. - La résolution est de l'ordre de la Mbase. III) Indications de la réalisation d'un caryotype 1) Chez la femme enceinte - Il est proposé : - après échographie, en cas de signes particulier comme une clarté nucale, - après des résultats de marqueurs sériques : alpha foeto protéine, HCG, oestriol - La décision sera prise en tenant compte de l'ensemble des résultas, de l'âge de la mère et de l'âge gestationnel. 2) Après la naissance - En cas de troubles endocriniens, d'anomalies de la reproduction (fausses couches à répétition, stérilité, ...), troubles de la puberté. - En psychiatrie : problèmes de retard mental, de troubles du comportement. - Chez des sujets porteurs d’anomalies chromosomiques équilibrées. - En oncohématologie, le caryotype peut être fait sur moelle osseuse -> intérêt diagnostic et pronostic 3) Cytogénétique des cancers Mise en évidence d'anomalies lors du diagnostic ou au cours du suivi thérapeutique. IV) Anomalies du caryotype - Il existe des anomalies constitutives et des anomalies acquises. - Une anomalie au niveau du zygote se répercute sur toutes les cellules de l’individu : 0.7 % des naissances vivantes, 7 % des enfants décédés pendant la période périnatale et 50 à 60 % des avortements avant le troisième mois. 3 1) Anomalies autosomales - Haploïdies et triploïdies sont non viables - Parmi les aneuploïdies, les monosomies sont létales - Les trisomies autosomales sont létales sauf les trisomies18 et 13, avec une survie limitée, et la trisomie 21 dont la fréquence de survenue varie avec l’âge maternel : en moyenne, 1 / 1000 naissances, 1 / 2500 à 20 ans, 1/ 100 à 40 ans et 1 / 50 à 45 ans 2) Anomalies des chromosomes sexuels - Trisomie X : 47XXX : elle passe souvent inaperçu ; la fréquence est de 1 / 1200. - Syndrome de Turner : 45 X0 : Aspect typique : femme de petite taille, relative dysmorphie, retard pubertaire, stérilité, surdité. La fréquence est de 1 / 2500. Un traitement possible et efficace. - Super mâle : 47 XYY, 48 XYYY, … : Pas de syndrome malformatif. La fréquence est de 1 / 2000. - Syndrome de Klinefelter : 47 XXY : Grande taille, hypogonadisme, gynécomastie, stérilité. La fréquence est de 1 / 1000.
