Formation universitaire

Formation universitaire
Depuis octobre 1998 Maître de Conférences
Institut Méditerranéen d’Ecologie et de Paléoécologie (IMEP), Marseille
Ecologie des populations végétales - Espèces rares/endémiques et envahissantes
1997 –1998 Assistante-Professeur
Institut de Botanique, Laboratoire de Phanérogamie, Neuchâtel (Suisse)
1996 - 1997 Stage post-doctoral
Institut de Botanique, Laboratoire de Phanérogamie, Neuchâtel (Suisse)
Financement : European Science Foundation
Septembre 1992 - Février 1996 Doctorat en Sciences
Université des Sciences François Rabelais, Tours & Centre d'Ecologie Evolutive et Fonctionnelle
(CEFE - CNRS), Montpellier
Spécialité : Biologie des Populations
Mention : Très Honorable avec les Félicitations du Jury
Financement : Ministère de la Recherche et de la Technologie
Directeurs : J. D. Thompson et M. Debussche
Sujet : Variation du système de reproduction et structuration génétique des populations chez
quatre espèces du genre Cyclamen (Primulaceae)
1991-1992 DEA Biologie des Populations et Eco-éthologie
Université des Sciences François Rabelais, Tours
1990-1991 Maîtrise Biologie des Populations et des Organismes
1989-1990 Licence Biologie des Populations et des Organismes
1987-1989 DEUG B Sciences de la Vie et de la Nature
Université de Montpellier II, Montpellier
1986-1987 Baccalauréat Série D Lycée de Mazamet, Tarn
Publications scientifiques
La liste des publications comprend 28 articles indexés dans des revues scientifiques à comité de
lecture (dont 7 signés en 1er auteur), 7 articles non indexés dans des revues scientifiques à comité de
lecture, 6 chapitres dans des ouvrages collectifs, 4 actes de colloque.
Publications indexées dans des revues à comité de lecture
Revue scientifique (ordre alphabétique)
Nombre
d’articles
Facteur d’Impact
(ISI-JCR 2009)
Acta Botanica Gallica
4
0.064
American Journal of Botany
1
2.684
Annals of Botany
2
3.501
Biological invasions
1
3.074
Biological Journal of the Linnean Society
2
2.040
Botanical Journal of the Linnean Society
1
0.984
C.R. Biologies
2
1.712
Ecology
1
4.874
Ecological Indicators
1
2.967
Evolutionary Ecology
1
3.193
Flora
1
1.657

Folia Geobotanica
1
1.320
Heredity
3
4.122
Journal of Evolutionary Biology
1
3.816
Plant Molecular Biology Reporter
1
0.711
Plant and Soil
1
2.517
Plant Systematics and Evolution
1
1.410
Population Ecology
1
1.539
Taxon
2
2.747
Total
26
(noms soulignés = Doctorants/DES/M2R sous mon co-encadrement)
Baumberger T., Mesléard F., Croze T. & Affre L. soumis. Effects of submersion on survival, growth,
and biomass allocation according to development stages of the rare halophyte Limonium
girardianum. Aquatic Botany.
Baumberger T., Croze T., Mesléard F. & Affre L. in press. Habitat requirements and population
structure of the rare endangered Limonium girardianum in industrialized salt marshes. Flora.
Baumberger T., Affre L., Torre F., Vidal E., Dumas P.J. & Tatoni T. 2011. Plant community changes
as ecological indicator of seabird colonies’ impact on Mediterranean Islands. Ecological
Indicators, 15(1): 76-84.
Saatkamp A., Affre L., Baumberger T., Dumas P.J., Gasmi A., Gachet S. & Arène F. 2011. Soil depth
detection by seeds and diurnally fluctuating temperatures: different dynamics in 10 annual
plants. Plant and Soil, in press.
Youssef S., Baumel A., Véla E., Juin M., Dumas E., Affre L. & Tatoni T. 2011. Factors underlying the
narrow distribution of the Meditteranean annual plant Arenaria provincialis (Caryophyllaceae).
Folia Geobotanica, in press.
Saatkamp A., Affre L., Dutoit T. & Poschlod P. 2011. Germination traits explain soil seed persistence
across species - the case of Mediterranean annual plants in cereal fields. Annals of Botany.
107(3): 415-426.
Verlaque R., Affre L., Diadema K., Suehs C.M. & Médail F. 2011. Unexpected morphological and
karyological changes in invasive Carpobrotus (Aizoaceae) in Provence (S-E France) compared
to native South African species. C.R. Biologies, 334: 311-319.
Affre L., Suehs C.M., Charpentier S., Vilà M., Brundu G., Lambdon P., Traveset A., & Hulme P.E.
2010. Consistency on the habitat degree of invasion for three invasive plant species across
Mediterranean islands. Biological Invasions, 12: 2537-2548.
Saatkamp A., Affre L., Dutoit T. & Poschlod P. 2009. The seed bank longevity index revisited - limited
reliability evident from a burial experiment and database analyses. Annals of Botany, 104(4):
715-724.
Campagne P., Baumel A., Affre L., Juin M., Duong N., Roche P., Tatoni T. 2009a. Genetic signs of
connectivity in Primula vulgaris (Primulaceae) in a hedgerow network landscape. C.R. Biologies,
332: 652-661.
Campagne P., Affre L., Baumel A., Roche P. & Tatoni T. 2009b. Fine scale response to landscape
structure in Primula vulgaris Huds.: Does hedgerow network connectedness ensure connectivity
through gene flow?. Population Ecology, 51: 209-219.

Baumel A., Affre L., Véla E., Auda P., Torre F., Youssef S. & Tatoni T. 2009. Ecological magnitude
and fine scale dynamics of the mediterranean narrow endemic therophyte, Arenaria provincialis
(Caryophyllaceae). Acta Botanica Gallica, 156(2): 259-272.
Diadema K., Médail F., Castagné H., Affre L., Roux J.P. & Bretagnolle F. 2007. Ecologie, distribution
et morphologie comparées des nivéoles de Nice (Acis nicaeensis) et de Fabre (Acis fabrei),
Alliaceae endémiques des Alpes maritimes et de la Nesque (Vaucluse). Acta Botanica Gallica,
154(4): 619-634.
Suehs C.M., Charpentier S., Affre L. & Médail F. 2006. The evolutionary potential of invasive
Carpobrotus (Aizoaceae) taxa: are pollen-mediated gene flow potential and hybrid vigor levels
connected ? Evolutionary Ecology, 20: 447-463.
Diadema K., Bretagnolle F., Affre L., Yuan Y.M., & Médail F. 2005. Geographic structure of molecular
variation of Gentiana ligustica (Gentianaceae) in the Maritime and Ligurian regional hotspot,
inferred from ITS sequences. Taxon, 54(4): 887-894.
Thompson J.D., Lavergne S., Affre L., Gaudeul M. & Debussche M. 2005. Ecological differentiation of
Mediterranean endemic plants. Taxon, 54(4): 967-976.
Suehs C.M., Affre L. & Médail F. 2005. Unexpected insularity effects in invasive plant mating systems:
the case of Carpobrotus (Aizoaceae) taxa in the Mediterranean Basin. Biological Journal of the
Linnean Society, 85: 65-79.
Suehs C.M., Affre L. & Médail F. 2004a. Invasion dynamics of two alien Carpobrotus (Aizoaceae) taxa
on a Mediterranean Island: I. Genetic diversity and introgression. Heredity, 92: 31-40.
Suehs C.M., Affre L. & Médail F. 2004b. Invasion dynamics of two alien (Aizoaceae) taxa on a
Mediterranean Island: II. Reproductive strategies. Heredity, 93: 1-7.
Diadema K., Baumel A., Le Bris M. & Affre L. 2003. Genomic DNA isolation and amplification from
callus culture for DNA isolation in succulent plants, Carpobrotus sepcies. Plant Molecular
Biology Reporter, 21: 1-5.
Affre L. & Thompson J.D. 1999. Variation in self-fertility, inbreeding depression and levels of
inbreeding in four Cyclamen species. Journal of Evolutionary Biology, 12: 113-122.
Affre L. & Thompson J.D. 1998. Floral trait variation and covariation within and among four Cyclamen
(Primulaceae) species. Plant Systematics and Evolution, 212: 279-293.
Affre L., Thompson J.D. & Debussche M. 1997. Genetic structure of continental and island
populations of the Mediterranean endemic Cyclamen balearicum (Primulaceae). American
Journal of Botany, 84: 437-451.
Affre L. & Thompson J.D. 1997. Variation in the population genetic structure of two Cyclamen species
on the island of Corsica. Heredity, 78: 205-214.
Affre L. & Thompson J.D. 1997. Population genetic structure and levels of inbreeding depression in
the Mediterranean island endemic Cyclamen creticum (Primulaceae). Biological Journal of the
Linnean Society, 60: 527-549.
Thébaud C., Finzi A.C., Affre L., Debussche M. & Escarré J. 1996. Assessing why two introduced
Conyza differ in their ability to invade Mediterranean old fields. Ecology, 77: 791-804.
Debussche M., Grandjanny M., Debussche G. & Affre L. 1996. Ecologie d'une espèce endémique et
rare à distribution fragmentée : Cyclamen balearicum Willk. en France. Acta Botanica Gallica,
143: 65-84.
Affre L., Thompson J.D. & Debussche M. 1995. The reproductive biology of the Mediterranean
endemic Cyclamen balearicum Willk. (Primulaceae). Botanical Journal of the Linnean Society,
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Debussche M., Debussche G. & Affre L. 1995. La distribution fragmentée de Cyclamen balearicum
Willk. en France : analyse historique et conséquence des activités humaines. Acta Botanica
Gallica, 142: 439-450.
Publications non indexées dans des revues à comité de lecture
Baumberger T., Croze T., Affre L. & Mesléard F. in press. Co-occurring species indicate rare species'
habitats: the case of Limonium girardianum. Plant Ecology and Evolution.
Laffont-Schwob I., Dumas P.J., Pricop A., Rabier J., Miché L., Affre L., Masotti V., Prudent P. & Tatoni
T. 2011. Insights on metal-tolerance and symbionts of the rare species Astragalus tragacantha
aiming at phytostabilization of polluted soils and plant conservation. Ecologia Mediterranea,
37(2): 57-62.
Hardion L., Baumel A., Dumas P.J., Duong N., Affre L., Tatoni T. 2010. Phylogenetic relationships
and infrageneric classification of Astragalus tragacantha L. (Fabaceae), inferred from nuclear
ribosomal DNA Internal transcribed spacers data (nrDNA ITS). Ecologia Mediterranea, 36: 99-
106.
Suehs C.M., Affre L. & Médail F. 2004. Dynamique d'invasion de deux végétaux introduits dans le
bassin méditerranéen, Carpobrotus spp (Aizoaceae) sur l’île de Bagaud (Parc National de Port-
Cros, S.E. France) : hybridation, structure clonale et stratégies de reproduction. Scientific
Reports of the Port-Cros National Park, 20: 19-46.
Thompson J.D., Debussche M. & Affre L. 2001. Ecological and evolutionary aspects of population
differentiation in three related Cyclamen species in the western Mediterranean. Bocconea, 13:
165-172.
Barroit A., Gerbaud E., Affre L. & Raquet, V. 2000. Stratégies de reproduction et de dispersion des
graines chez les espèces messicoles: implications pour leur conservation dans le Parc naturel
régional du Luberon. Courrier Scientifique du Parc naturel régional du Luberon, 4: 128-142.
Bretagnolle F., Gory G. & Affre L. 1995. Deux nouveaux sites de nidification du martinet pâle (Apus
pallidus) en France continentale. Alauda, 63: 101-103.
Chapitres d’ouvrage
Affre L. 2011. Ecological and Evolutionary Insights from Plant Invasions: The Case of Carpobrotus
spp. (Aizoaceae) in the Mediterranean Basin. In: Berhardt L.V. (ed). Advances in Medicine and
Biology. Volume 16. Nova Science Publishers, Hauppauge, NY, USA, in press.
Affre L. & Médail F. 2010. Les griffes de sorcière (Carpobrotus spp.) en France méditerranéenne. In:
Barbault R. & Atramentowicz M. (eds.). Les invasions biologiques, une question de natures et
de sociétés. Editions Quae, Paris, pp. 27-28.
Diadema K., Médail F., Affre L., Castagné H., Torre F. & Bretagnolle F. 2004. Ecology and
demography of two endangered narrow endemic plants (Leucojum, Amaryllidaceae) in southern
France. In: Arianoutsou M. & Papanastasis V.P. (eds.). Ecology, Conservation and
Management of Mediterranean climate ecosystems. Millpress Science Publishers, Rotterdam,
pp 1-9.
Médail F., Affre L. & Suehs C.M. 2004. Carpobrotus sp. [C. edulis (L.) N.E. Br., C. aff. acinaciformis
(L.) L. Bolus], les griffes-de-sorcière. In: Muller S. (ed.). Plantes invasives en France. Collection
Patrimoines Naturels vol. 62, Publications scientifiques du Muséum National d’Histoire
Naturelle, Paris, pp. 52-55.
Suehs C.M., Medail M. & Affre L. 2001. Ecological and genetic features of the invasion by the alien
Carpobrotus (Aizoaceae) plants in Mediterranean island habitats. In: Brundu G., Brock J.,

Camarda I., Child L., Wade M. (eds). Plants invasions: Species ecology and ecosystem
management. Backhuys Publishers, Leiden, p. 145-158.
Suehs C.M., Médail F. & Affre L. 2003. Invasion by South African Carpobrotus (Aizoaceae) taxa in the
Mediterranean basin: the effects of islands on plant reproductive systems. In: Child. L.E., Brock
J.H., Brundu G., Brach K., Pysek P., Wade P.M. & Williamson M. et al. (eds.). Plant Invasions :
ecological threats and management solutions. Backhuys Publisher, Leiden, pp. 247-263.
Actes de colloque
Laffont-Schwob I., Dumas P.J., Rabier J., Miché L., Affre L. & Tatoni T. 2011. Insights on symbioses
of Astragalus tragacantha (Fabaceae), an endangered plant species, for ecological restoration
purpose". Proceedings of the 7th European Conference on Ecological Restoration.
Moragues E., Traveset A., Suehs C.M., Affre L. & Médail F. 2004. Effect of Carpobrotus spp. on the
pollination success of native species. Interspecific pollen transfer as a mechanism of
competition. In: Arianoutsou M. (ed.). Proceedings of the 10' MEDECOS – International
Conference on Ecology, Conservation and Management. Millpress Science Publishers,
Rotterdam. pp. 1-8.
Vilà M., Tessier M., Suehs C.M., Gimeno I., Lambdon P., Médail F., de la Bandera M.C., Moragues E.,
Traveset A., Dalias P., Petsikos B. & Affre L. 2004. Impact of plant invasion on species diversity
in Mediterranean islands. In: Arianoutsou M. (ed.). Proceedings of the 10' MEDECOS –
International Conference on Ecology, Conservation and Management. Millpress Science
Publishers, Rotterdam.pp. 1-7.
Affre L., Dutoit T., Jaeger M. & Garraud L. 2003. Ecologie de la reproduction, de la dispersion et
structure génétique chez les espèces messicoles : Propositions de gestion dans le Parc naturel
régional du Luberon. Les Actes du Bureau des Ressources Génétiques, 4: 405-428.
Communications orales et Posters
La liste des communications comprend 12 communications orales internationales et 21 nationales
(dont 4 en tant que conférencière invitée), 3 posters internationaux et 6 nationaux.
(noms soulignés = Doctorants/DES/M2R sous mon co-encadrement)
Communications orales internationales et nationales
2011. Pricop A-D, Laffont-Schwob I., Dumas P.J., Prudent P., Rabier J., Salducci M.-D., Affre L.,
Masotti V., Tatoni T. Trace metals and metalloids tolerance of an endemic plant species from
Marseille urban area, Astragalus tragacantha: prospect for phytostabilization of local industrial
polluted site. 5th European Bioremediation Conference in Chania (Crète).
2011. Pricop A-D, Laffont-Schwob I., Lixandru B., Dumas P.J., Prudent P., Rabier J., Salducci M-D,
Affre L., Masotti V., Tatoni T. Do we protect them or do they protect us? Heavy metals
tolerance and phytostabilization potential of rare protected species – Astragalus tragacantha L.
International Scientific Symposium "Bioengineering in animal production », Faculty of Animal
Science And Biotechnologies de Timisoara (Roumanie).
2011. Baumberger T., Mesléard F, Croze T., Thaler F. & Affre L.. Human disturbance effects on plant
populations: the case study of Limonium girardianum, a protected endemic species of coastal
salt marshes. IAVS 54th Symposium of the International Association for Vegetation Science,
Lyon.