Master : Biologie Santé Parcours : Infection et Immunité (InIm) Responsables Présentation Objectifs et débouchés C. Braun-Breton : [email protected] P. Bastien : [email protected] Ce parcours vise à assurer au sein de l'Université de Montpellier une formation de niveau Master sur les processus infectieux et les agents pathogènes de l’Homme. L’enseignement se situe dans une perspective moléculaire et cellulaire qui caractérise ce Master. La microbiologie au sens large, incluant ici l’immunologie, entre dans le schéma pédagogique de niveau L de chacune des universités. Les laboratoires susceptibles d'accueillir des étudiants dans le cadre de ce Parcours de Master (ainsi qu’éventuellement pour un doctorat ultérieur) sont pour la très grande majorité associés aux grands instituts de recherche français (CNRS, INSERM, IRD, CIRAD…) et sont particulièrement nombreux (plus de 70 encadrants potentiels). Ils représentent une grande expertise dans le domaine, comme le montrent leur engagement dans des projets nationaux ou européens, et leur visibilité internationale bien établie. La formation est ainsi soutenue par ces nombreux laboratoires de recherche, un centre hospitalier régional universitaire important, et des entreprises dans le domaine pharmaceutique ou du diagnostic médical. Les liens avec le Pôle de compétitivité interrégional PACA-LR EuroBiomed (dont un des axes majeurs est "Diagnostic et thérapeutique des maladies infectieuses et tropicales") et l'IHU "Méditerranée-Infection/Infectiopole Sud", constituent des leviers d’innovation et potentiellement d'insertion économique. L'enseignement intégré pour les deux années de Master, bien que non-exhaustif dans le domaine, vise à donner aux étudiants un niveau de compétences leur permettant d'appréhender n'importe quelle thématique spécifique en recherche ou en développement dans les domaines de la Microbiologie et de l’Immunologie, sous leurs aspects moléculaires et cellulaires. Les UE du M1 sont les suivantes : Bases moléculaires des maladies infectieuses; Immunopathologie; Approches expérimentales en infectiologie; Biologie cellulaire. Elles peuvent être complétées par des UE d'autres Parcours : Immunité fondamentale; Génomique fonctionnelle; Statistiques appliquées à la biologie; Biochimie structurale; Phénomènes dynamiques et interactions. Les UE du M2 n'ont lieu qu'au premier semestre : Parasitologie moléculaire; Bactériologie et Virologie; Immunologie. Les cours peuvent être dispensés soit sous la forme de conférences exposant une somme de travaux de recherche récents, soit sous la forme d'enseignements dirigés avec analyse critique d'articles. Ce parcours dispense une formation ouverte qui trouve des applications concrètes, soit en recherche dite académique avec des débouchés dans les Universités et les organismes de recherche publics (type CNRS, INSERM, IRD, INRA…) ou semi-privés (type CIRAD), soit sur des thématiques de thérapeutique, de diagnostic ou de soins, qui enrichissent réciproquement les CHU et les entreprises dans le domaine. 1 Master : Biologie Santé Parcours : Infection et Immunité (InIm) Maquette pour l’étudiant : M1 UE Obligatoires M2 Bases moléculaires des maladies infectieuses (Zumbihl, Segondy) Parasitologie moléculaire (Braun-Breton, Bastien) Immunopathologie (Eliaou, Poul) Bactériologie-Virologie (Zumbihl, Van de Perre) Approches expérimentales en infectiologie (Braun-Breton, Ravel) Immunologie (Corbeau,Taylor) Biologie cellulaire (Mangeat) Génomique fonctionnelle (Tazi) UE Obligatoires à choix restreint (3 parmi 5 en M1 et 2 parmi 5 en M2) Statistiques appliquées à la biologie (Julien, Molinari) Immunité fondamentale (Eliaou, Poul) Information génétique-épigénétique (Koenig, Lengronne) Signalisation: méthodes et concepts (Debant, Becamel, Bodin) Biochimie structurale (Cerdan) Bioinformatique biologie des systèmes (Chavanieu, Trapani) Phénomènes Dynamiques et interactions (Parmeggiani) Physiopathologie intégrée (Matecki, Perrin) Biophysique moléculaire (Echaller-Glazer, Parmeggiani) UE obligatoire à choix large aucune aucune UE remise à niveau: outils mathématiques et informatiques (Radulescu) UE facultatives Génétique médical et conseil génétique (Koening) Culture cellulaire (Zine, Hugnot) 2 Master : Biologie Santé Parcours : Infection et Immunité (InIm) Terrains de stage 1 : UMR Nom de l'équipe (ou sous-équipe) Mots-clés Encadrants potentiels Biologie, Génétique et Pathologie des Pathogènes Eucaryotes Biologie moléculaire et cellulaire, parasites, génétique, épigénétique, mitose, réplication, ségrégation chromosomique, variation antigénique, biogenèse des flagelles, architecture nucléaire Biologie moléculaire, épigénétique, variation antigénique, virulence, régulation de l'expression génique, architecture nucléaire, réparation de l'ADN P. Bastien, G. Merlin, M. Pagès, Y. Sterkers Parasitologie MiVEGEC Plasticité du génome de Plasmodium JJ Lopez Rubio Stratégies et adaptation de la transmission Génétique et Biodiversité des Systèmes Infectieux Stratégies de Lutte et Prévention du Contact Homme-Vecteur D. Missé DIMNP Plasmodium et Toxoplasma: biogenèse membranaire et interactions avec la cellule hôte EA Vaccination Antiparasitaire : Laboratoire de Biologie Cellulaire et Moléculaire Axe 2: Bases moléculaires et cellulaires de l'infection par les Trypanosomatidae et Axe 3: Approches diagnostiques, thérapeutiques, pronostiques et vaccinales C. Braun-Breton, M. Lebrun, S. Besteiro, R. Cerdan, M. Lamarque, K. Wengelnik, W. Daher, M. Brochet S. Delbecq, B. Carcy InterTryp AL Banuls, B. Vergnes, C. Ravel F. Chandre Jean-Loup Lemesre, Rachel Bras-Goncalves, Veerle Lejon, David Berthier, Sophie Thévenon, Laurence Flori Bactério-Virologie CPBS 1 Interactions moléculaires HôtesPathogènes Métabolisme des ARN rétroviraux Nathalie Chazal Enzymes bactériennes de résistance aux antibiotiques de type aminoglycoside Corinne LIONNE Marylène Mougel Certaines équipes, de par leur activité transversale, peuvent se retrouver dans deux des trois disciplines ci-dessous. 3 Master : Biologie Santé Parcours : Infection et Immunité (InIm) DIMNP IGH IGMM UMR 1333 U1047 INSERM U1058 HTLV-1 et Leucémie Domaines membranaires et Assemblage Viral Plateforme CEMIPAI Jean-Michel Mesnard Delphine Muriaux Pathogénie tuberculeuse et nouvelles cibles thérapeutiques Régulation post-traductionnelle des protéines et pathogénie bactérienne Virologie moléculaire L. Kremer RNA Biogenesis Edouard BERTRAND HCV and Cancer Ula Hibner Adenoviruses: receptors, trafficking and vectorology Oncogenèse et Immunothérapie Eric J. Kremer Retroviruses, envelopes and metabolic marlers RNA metabolism Marc Sitbon Diversité, Génomes et Interactions Microorganismes-Insectes Bacterial virulence and infectious disease Infection by HIV and by agents with mucocutaneous tropism: from pathogenesis to prevention R. Zumbihl Hématopoïèse et immunothérapie N Taylor, V Zimmermann, V Dardalhon, S Kinet M Sitbon, JL Battini, D. Giovannini Ula Hibner, D Grégoire, Y Simonin E. Kremer, F Mennechet Emmanuel Cornillot V. Molle, A. Blanc-Potard, L. Gannoun M. Benkirane Marc Piechaczyk Jamal Tazi J.P. Lavigne, D. O'Callaghan Ph. Van de Perre Immunologie IGMM Retrovirus, envelopes and metabolic markers Hepatitis C virus and cancer Adenovirus : receptors, trafficking and vectorology Oncogenesis and immunotherapy infections virales, immunothérapie, anticorps monoclonaux M Pelegrin DIMNP Cytokine receptor and signaling G. Uzé, G. Cartron G Lutfalla IGH Structure, fonction et évolution des récepteurs de cytokines Cytokines, évolution et mise en place de l’immunité Emergence des cellules souches hématopoïétiques Virologie moléculaire Domiciliation, activation immunitaire et infection P Guglielmi K. Kissa, E. Lelièvre M. Benkirane infection par le VIH, corécepteurs du VIH, récepteurs couplés aux protéines G, physiopathologie de l’activation immunitaire P Corbeau, V François 4 Master : Biologie Santé Parcours : Infection et Immunité (InIm) Equipe IMGT®, international ImMunoGeneTics information system U1508 CPBS immunoinformatique, bioinformatique, humanisation des anticorps, anticorps thérapeutiques, immunoglobulines, récepteur T (TR), protéine majeure d’histocompatibilité (MH), ontologie, IMGT-ONTOLOGY, immunogénétique, déficit immunitaire M.-P. Lefranc Infection par le VIH et par agents à tropisme cutanéo-muqueux Interactions virus-cellules hôtes JP Moles Membrane domains and virus assembly Biologie cellulaire des infections bactériennes Autophagie et infection D Muriaux, C Favard Métabolisme des ARN rétroviraux M Mougel Interactions hôtes-virus et immunité innée L Briant, N Chazal M Bonazzi M Biard, L Espert Immunité innée, interferon, HIV, TRIM22, ISG20, Toll-like recepteur, RIG1-MDA-5 N. Mechti U 844 (Cellules Souches Mésenchymateuses, Environnement Articulaire et Immunothérapies de la Polyarthrite Rhumatoïde) Service d’immunologie clinique et thérapeutique Rôle des microARNs dans les fonctions monocytaires Tolerance et Autoimmunité Analyse génétique et physiopathologie des maladies inflammatoires U 896 – IRCM (Institut de Recherche en Cancérologie de Montpellier) C Jorgensen miRNA, monocyte subsets, inflammation, arthritis, ARN interférence in vivo, liposome cationique, miR-146a, Ly6Chigh monocytes, arthrite expérimentale, SNPs, rheumatoid arthritis, biomarkers T cells, self-tolerance, Autoimmunity, cancer immunity genetic, inflammation, inflammasome, autoinflammatory diseases, arthritis F. Apparailly T cells, self-tolerance, Autoimmunity, cancer immunity human T cell subsets, miRNAs, inflammation Cellules dendritiques Nanotechnologies/ micelles D. Geneviève J. Hernandez I. Touitou J. Pène Cellules dendritiques tolérogènes et P. Louis-Plence Lymphocytes T régulateurs Macrophages, neurons, regeneration, Biologie de la cellule souche F. Djouad mésenchymateuse et régénération inflammation du cartilage Cancer, Immunothérapie, anticorps Immunothérapie et radiothérapie A. Pelegrin, T. Chardes, monoclonaux, ingénierie des anticorps, en Oncologie M.-A. Poul, C. Larbouret Immunité et Cancer association d’anticorps, anticorps bispécifiques anti-tumor immune response, immune escape, γδT cells, IL-17, CD39, therapeutic monoclonal antibodies, pre-clinical models N.Bonnefoy, L. Gros, V. Lafont, J.-F. Eliaou Functional screening and targeting in cancer therapeutic antibodies, intrabodies, diagnostic, immunotherapy P Martineau, P Dariavach, L Guglielmi, B Robert 5 Master : Biologie Santé Parcours : Infection et Immunité (InIm) INM, UMR1051 (Institut des Neurosciences de Montpellier) IRD-UMR-MD3 (Lab. Pathologie du motoneurone: Neuroinflammation et Thérapie sclérose latérale amyotrphique (SLA), neuroimmunologie, motoneurone T. VINCENT, C. Raoul Viral Emerging Diseases Unit Immunité innée, protection des épithéliums mucosaux, protéines de la phase aigüe et inflammation, physiopathologie vasculaire, interactions hôte – pathogène (re)émergents, diagnostic ultrasensible de pathogènes, Brésil, Thaïlande, Maroc, France F. Veas, S. Manguin macrophages, dendritic cells, human T cell subsets, neutrophils, cytokines, vaccination, antigens, peptides, Human, mouse and dog models. J.-L. LEMESRE, R. BRASGONCALVES Immuno-Physiopathologie Moléculaire Comparée) UMR177 INTERTRYP Bases moléculaires et cellulaires de l’infection par les - IRD/CIRAD – (Interactions Hôte-VecteurParasite dans les maladies dues aux Trypanosomatidés) Trypanosomatidés et Approches diagnostiques, thérapeutiques, pronostiques et vaccination 6