Microbiologie et Immunologie - Master Biologie Santé

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Master : Biologie Santé
Parcours : Infection et Immunité (InIm)
Responsables
Présentation
Objectifs et
débouchés
C. Braun-Breton : [email protected]
P. Bastien : [email protected]
Ce parcours vise à assurer au sein de l'Université de Montpellier une formation de
niveau Master sur les processus infectieux et les agents pathogènes de l’Homme.
L’enseignement se situe dans une perspective moléculaire et cellulaire qui caractérise
ce Master.
La microbiologie au sens large, incluant ici l’immunologie, entre dans le schéma
pédagogique de niveau L de chacune des universités.
Les laboratoires susceptibles d'accueillir des étudiants dans le cadre de ce Parcours de
Master (ainsi qu’éventuellement pour un doctorat ultérieur) sont pour la très grande
majorité associés aux grands instituts de recherche français (CNRS, INSERM, IRD,
CIRAD…) et sont particulièrement nombreux (plus de 70 encadrants potentiels). Ils
représentent une grande expertise dans le domaine, comme le montrent leur
engagement dans des projets nationaux ou européens, et leur visibilité internationale
bien établie.
La formation est ainsi soutenue par ces nombreux laboratoires de recherche, un
centre hospitalier régional universitaire important, et des entreprises dans le domaine
pharmaceutique ou du diagnostic médical.
Les liens avec le Pôle de compétitivité interrégional PACA-LR EuroBiomed (dont un des
axes majeurs est "Diagnostic et thérapeutique des maladies infectieuses et
tropicales") et l'IHU "Méditerranée-Infection/Infectiopole Sud", constituent des leviers
d’innovation et potentiellement d'insertion économique.
L'enseignement intégré pour les deux années de Master, bien que non-exhaustif dans
le domaine, vise à donner aux étudiants un niveau de compétences leur permettant
d'appréhender n'importe quelle thématique spécifique en recherche ou en
développement dans les domaines de la Microbiologie et de l’Immunologie, sous leurs
aspects moléculaires et cellulaires. Les UE du M1 sont les suivantes : Bases
moléculaires
des
maladies infectieuses;
Immunopathologie;
Approches
expérimentales en infectiologie; Biologie cellulaire. Elles peuvent être complétées par
des UE d'autres Parcours : Immunité fondamentale; Génomique fonctionnelle;
Statistiques appliquées à la biologie; Biochimie structurale; Phénomènes dynamiques
et interactions.
Les UE du M2 n'ont lieu qu'au premier semestre : Parasitologie moléculaire;
Bactériologie et Virologie; Immunologie. Les cours peuvent être dispensés soit sous
la forme de conférences exposant une somme de travaux de recherche récents, soit
sous la forme d'enseignements dirigés avec analyse critique d'articles.
Ce parcours dispense une formation ouverte qui trouve des applications concrètes,
soit en recherche dite académique avec des débouchés dans les Universités et les
organismes de recherche publics (type CNRS, INSERM, IRD, INRA…) ou semi-privés
(type CIRAD), soit sur des thématiques de thérapeutique, de diagnostic ou de soins,
qui enrichissent réciproquement les CHU et les entreprises dans le domaine.
1
Master : Biologie Santé
Parcours : Infection et Immunité (InIm)
Maquette pour l’étudiant :
M1
UE Obligatoires
M2
Bases moléculaires des maladies infectieuses
(Zumbihl, Segondy)
Parasitologie moléculaire (Braun-Breton,
Bastien)
Immunopathologie (Eliaou, Poul)
Bactériologie-Virologie (Zumbihl, Van de
Perre)
Approches expérimentales en infectiologie
(Braun-Breton, Ravel)
Immunologie (Corbeau,Taylor)
Biologie cellulaire (Mangeat)
Génomique fonctionnelle (Tazi)
UE Obligatoires à
choix restreint
(3 parmi 5 en M1 et
2 parmi 5 en M2)
Statistiques appliquées à la biologie (Julien,
Molinari)
Immunité fondamentale (Eliaou, Poul)
Information génétique-épigénétique
(Koenig, Lengronne)
Signalisation: méthodes et concepts
(Debant, Becamel, Bodin)
Biochimie structurale (Cerdan)
Bioinformatique biologie des systèmes
(Chavanieu, Trapani)
Phénomènes Dynamiques et interactions
(Parmeggiani)
Physiopathologie intégrée (Matecki, Perrin)
Biophysique moléculaire (Echaller-Glazer,
Parmeggiani)
UE obligatoire à
choix large
aucune
aucune
UE remise à niveau: outils mathématiques et
informatiques (Radulescu)
UE facultatives
Génétique médical et conseil génétique
(Koening)
Culture cellulaire (Zine, Hugnot)
2
Master : Biologie Santé
Parcours : Infection et Immunité (InIm)
Terrains de stage 1 :
UMR
Nom de l'équipe
(ou sous-équipe)
Mots-clés
Encadrants
potentiels
Biologie, Génétique et Pathologie
des Pathogènes Eucaryotes
Biologie moléculaire et cellulaire,
parasites, génétique, épigénétique,
mitose, réplication, ségrégation
chromosomique, variation antigénique,
biogenèse des flagelles, architecture
nucléaire
Biologie moléculaire, épigénétique,
variation antigénique, virulence,
régulation de l'expression génique,
architecture nucléaire, réparation de
l'ADN
P. Bastien, G. Merlin, M.
Pagès, Y. Sterkers
Parasitologie
MiVEGEC
Plasticité du génome de
Plasmodium
JJ Lopez Rubio
Stratégies et adaptation de la
transmission
Génétique et Biodiversité des
Systèmes Infectieux
Stratégies de Lutte et Prévention du
Contact Homme-Vecteur
D. Missé
DIMNP
Plasmodium et Toxoplasma:
biogenèse membranaire et
interactions avec la cellule hôte
EA
Vaccination Antiparasitaire :
Laboratoire de Biologie Cellulaire et
Moléculaire
Axe 2: Bases moléculaires et
cellulaires de l'infection par les
Trypanosomatidae et Axe 3:
Approches diagnostiques,
thérapeutiques, pronostiques et
vaccinales
C. Braun-Breton, M.
Lebrun, S. Besteiro, R.
Cerdan, M. Lamarque, K.
Wengelnik, W. Daher, M.
Brochet
S. Delbecq, B. Carcy
InterTryp
AL Banuls, B. Vergnes, C.
Ravel
F. Chandre
Jean-Loup Lemesre,
Rachel Bras-Goncalves,
Veerle Lejon, David
Berthier, Sophie
Thévenon, Laurence Flori
Bactério-Virologie
CPBS
1
Interactions moléculaires HôtesPathogènes
Métabolisme des ARN rétroviraux
Nathalie Chazal
Enzymes bactériennes de résistance
aux antibiotiques de type
aminoglycoside
Corinne LIONNE
Marylène Mougel
Certaines équipes, de par leur activité transversale, peuvent se retrouver dans deux des trois disciplines ci-dessous.
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Master : Biologie Santé
Parcours : Infection et Immunité (InIm)
DIMNP
IGH
IGMM
UMR 1333
U1047
INSERM U1058
HTLV-1 et Leucémie
Domaines membranaires et
Assemblage Viral
Plateforme CEMIPAI
Jean-Michel Mesnard
Delphine Muriaux
Pathogénie tuberculeuse et
nouvelles cibles thérapeutiques
Régulation post-traductionnelle des
protéines et pathogénie
bactérienne
Virologie moléculaire
L. Kremer
RNA Biogenesis
Edouard BERTRAND
HCV and Cancer
Ula Hibner
Adenoviruses: receptors, trafficking
and vectorology
Oncogenèse et Immunothérapie
Eric J. Kremer
Retroviruses, envelopes and
metabolic marlers
RNA metabolism
Marc Sitbon
Diversité, Génomes et Interactions
Microorganismes-Insectes
Bacterial virulence and infectious
disease
Infection by HIV and by agents with
mucocutaneous tropism: from
pathogenesis to prevention
R. Zumbihl
Hématopoïèse et immunothérapie
N Taylor, V Zimmermann,
V Dardalhon, S Kinet
M Sitbon, JL Battini, D.
Giovannini
Ula Hibner, D Grégoire, Y
Simonin
E. Kremer, F Mennechet
Emmanuel Cornillot
V. Molle, A. Blanc-Potard,
L. Gannoun
M. Benkirane
Marc Piechaczyk
Jamal Tazi
J.P. Lavigne, D.
O'Callaghan
Ph. Van de Perre
Immunologie
IGMM
Retrovirus, envelopes and
metabolic markers
Hepatitis C virus and cancer
Adenovirus : receptors, trafficking
and vectorology
Oncogenesis and immunotherapy
infections virales, immunothérapie,
anticorps monoclonaux
M Pelegrin
DIMNP
Cytokine receptor and signaling
G. Uzé, G. Cartron
G Lutfalla
IGH
Structure, fonction et évolution des
récepteurs de cytokines
Cytokines, évolution et mise en
place de l’immunité
Emergence des cellules souches
hématopoïétiques
Virologie moléculaire
Domiciliation, activation
immunitaire et infection
P Guglielmi
K. Kissa, E. Lelièvre
M. Benkirane
infection par le VIH, corécepteurs du
VIH, récepteurs couplés aux protéines
G, physiopathologie de l’activation
immunitaire
P Corbeau, V François
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Master : Biologie Santé
Parcours : Infection et Immunité (InIm)
Equipe IMGT®, international
ImMunoGeneTics information
system
U1508
CPBS
immunoinformatique, bioinformatique,
humanisation des anticorps, anticorps
thérapeutiques, immunoglobulines,
récepteur T (TR), protéine majeure
d’histocompatibilité (MH), ontologie,
IMGT-ONTOLOGY, immunogénétique,
déficit immunitaire
M.-P. Lefranc
Infection par le VIH et par agents à
tropisme cutanéo-muqueux
Interactions virus-cellules hôtes
JP Moles
Membrane domains and virus
assembly
Biologie cellulaire des infections
bactériennes
Autophagie et infection
D Muriaux, C Favard
Métabolisme des ARN rétroviraux
M Mougel
Interactions hôtes-virus et
immunité innée
L Briant, N Chazal
M Bonazzi
M Biard, L Espert
Immunité innée, interferon, HIV,
TRIM22, ISG20, Toll-like recepteur,
RIG1-MDA-5
N. Mechti
U 844 (Cellules Souches
Mésenchymateuses,
Environnement Articulaire et
Immunothérapies de la
Polyarthrite Rhumatoïde)
Service d’immunologie clinique et
thérapeutique
Rôle des microARNs dans les
fonctions monocytaires
Tolerance et Autoimmunité
Analyse génétique et
physiopathologie des maladies
inflammatoires
U 896 – IRCM (Institut
de Recherche en Cancérologie
de Montpellier)
C Jorgensen
miRNA, monocyte subsets,
inflammation, arthritis, ARN
interférence in vivo, liposome
cationique, miR-146a, Ly6Chigh
monocytes, arthrite expérimentale,
SNPs, rheumatoid arthritis, biomarkers
T cells, self-tolerance, Autoimmunity,
cancer immunity
genetic, inflammation, inflammasome,
autoinflammatory diseases, arthritis
F. Apparailly
T cells, self-tolerance, Autoimmunity,
cancer immunity
human T cell subsets, miRNAs,
inflammation
Cellules dendritiques
Nanotechnologies/ micelles
D. Geneviève
J. Hernandez
I. Touitou
J. Pène
Cellules dendritiques tolérogènes et
P. Louis-Plence
Lymphocytes T régulateurs
Macrophages, neurons, regeneration,
Biologie de la cellule souche
F. Djouad
mésenchymateuse et régénération inflammation
du cartilage
Cancer, Immunothérapie, anticorps
Immunothérapie et radiothérapie
A. Pelegrin, T. Chardes,
monoclonaux, ingénierie des anticorps,
en Oncologie
M.-A. Poul, C. Larbouret
Immunité et Cancer
association d’anticorps, anticorps bispécifiques
anti-tumor immune response, immune
escape, γδT cells, IL-17, CD39,
therapeutic monoclonal antibodies,
pre-clinical models
N.Bonnefoy, L. Gros, V.
Lafont, J.-F. Eliaou
Functional screening and targeting
in cancer
therapeutic antibodies, intrabodies,
diagnostic, immunotherapy
P Martineau, P Dariavach,
L Guglielmi, B Robert
5
Master : Biologie Santé
Parcours : Infection et Immunité (InIm)
INM, UMR1051
(Institut des Neurosciences
de Montpellier)
IRD-UMR-MD3 (Lab.
Pathologie du motoneurone:
Neuroinflammation et Thérapie
sclérose latérale amyotrphique (SLA),
neuroimmunologie, motoneurone
T. VINCENT, C. Raoul
Viral Emerging Diseases Unit
Immunité innée, protection des
épithéliums mucosaux, protéines de la
phase aigüe et inflammation,
physiopathologie vasculaire,
interactions hôte – pathogène (re)émergents, diagnostic ultrasensible de
pathogènes, Brésil, Thaïlande, Maroc,
France
F. Veas, S. Manguin
macrophages, dendritic cells, human T
cell subsets, neutrophils, cytokines,
vaccination, antigens, peptides, Human,
mouse and dog models.
J.-L. LEMESRE, R. BRASGONCALVES
Immuno-Physiopathologie
Moléculaire Comparée)
UMR177 INTERTRYP Bases moléculaires et cellulaires de
l’infection par les
- IRD/CIRAD –
(Interactions Hôte-VecteurParasite dans les maladies dues
aux Trypanosomatidés)
Trypanosomatidés et Approches
diagnostiques, thérapeutiques,
pronostiques et vaccination
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