Le format de presentation est le suivant :

Titre du stage
Diversité des communautés microbiennes de biofilms
colonisant des peintures antifouling en milieu marin
Nom et coordonnées du ou des encadreurs :
Jean-François Briand, Maître de conférences à l’Université du Sud-Toulon Var
Nom du laboratoire d'accueil :
Laboratoire MAPIEM -EA 4323- Biofouling & substances naturelles marines
Université du Sud Toulon-Var
Avenue George Pompidou, B.P. 56, 83162 La Valette-du-Var Cedex
Tél.: 04 94 14 25 79 (ou 23 76), E-mail : [email protected]
http://mapiem.univ-tln.fr/
Contexte scientifique :
Le processus de biofouling en milieu marin est un phénomène de colonisation des surfaces
immergées par de nombreux organismes vivants microscopiques (bactéries, diatomées…)
puis macroscopiques (balanes, algues…). Ce processus évolutif peut aboutir à la constitution
d’un agrégat complexe et quantitativement important (Railkin, 2004). Sur les coques de
bateaux, ce processus est notamment responsable d’une augmentation de la consommation de
carburant (et donc des émissions de CO2, gaz à effet de serre) et des coûts de nettoyage
(Fusetani, 2004).
Il apparaît suite à des études récentes que la phase initiale de développement du biofilm
conditionne, au moins en partie, la fixation de spores de macroalgues ou de larves
d’invertébrés (Qian et al., 2007, Chung et al., 2010). L’influence de la nature des revêtements
et des peintures doit notamment induire la mise en place de communautés bactériennes
différentes. La qualité des eaux d’immersion doit également jouer sur la communauté
planctonique et par conséquent sur le fouling. Une meilleure connaissance de ces
communautés bactériennes pionnières s’avère donc importante pour comprendre et
éventuellement prévoir la gravité du fouling.
Objectifs du stage :
L’objectif du stage est de mettre en évidence les différences spatio-temporelles de
structure des biofilms (abondance, diversité) qui se développent sur des peintures antifouling.
Ces immersions seront donc réalisées sur 5 revêtements en hiver et au printemps. L’influence
de la qualité des eaux d’immersion sera étudiée en immergeant les substrats au niveau de deux
sites côtiers contrastés.
Moyens de réalisation :
Cette étude s’inclue dans le cadre du projet ANTECOL (PNEC-EC2CO, 2011-2012).
Nous disposons d’un site d’immersion instrumenté dans la rade de Toulon et les mêmes
échantillons de peintures seront immergés en même temps en baie de Lorient sur le site du
Laboratoire de Biologie et Chimie Marine (LBCM) de l’Université de Bretagne-Sud.
Le laboratoire travaille par ailleurs sur le développement de peintures antifouling et nous
disposerons donc de trois peintures antifouling produites au sein du laboratoire et incluant des
biocides nouveaux, d’une peintures commerciale de référence et d’un substrat neutre (PVC).
Les études d’abondance des communautés microbiennes seront réalisées par cytométrie de
flux à la Plateforme REgionale de CYtometrie pour la Microbiologie (PRECYM, Univ.
Méditerranée, Aix-Marseille II).
Les études de diversité bactériennes seront réalisées par clonage-séquençage au
laboratoire.
- Références bibliographiques :
Chung HC, Lee OO, Huang YL, Mok SY, Kolter R, Qian PY (2010). Bacterial community
succession and chemical profiles of subtidal biofilms in relation to larval settlement of the
polychaete Hydroides elegans. ISME Journal 4:817-828.
Fusetani N. (2004). Biofouling and antifouling. Natural Product Reports 21: 94-104.
Qian P-Y, Lau SCK, Dahms H-U, Dobretsov S, Harder T. (2007). Marine biofilms as
mediators of colonization by marine macroorganisms: implications for antifouling and
aquaculture. Mar Biotechnol 9:399-410
Railkin A. I. (2004). Marine biofouling : colonization processes and defenses. Boca Raton,
Florida, US, CRC Press.