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BOUTTES Cédric
né le 24/05/1973 à Castres (81)
Portable : 06-16-67-22-65
Résident à Toulouse
Email : [email protected]
Site : http://cedric.bouttes.free.fr
Célibataire, Permis B
INGENIEUR EN
INFORMATIQUE/BIOINFORMATIQUE
6 ANS D’EXPERIENCE
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Conception et réalisation d’applications Java J2EE
(& Perl)
Conception et réalisation de base de données
Oracle (& Postgres)
Conduite & Développpement de projets
Bioinformatique : LIMS, analyse de séquences …
FORMATION EN INFORMATIQUE
Diplôme d’ingénieur CNAM en informatique (mention très bien), école d’ingénieur du CNAM de Montpellier (1999–2005)
Diplôme Universitaire Technologique en Informatique, IUT informatique de Toulouse (1998-1999)
Formation certifiée Microsoft : implémentation et support technique de Windows XP (2006)
FORMATION/EXPERIENCE EN BIOLOGIE
Licence professionnelle en biotechnologies végétales, ENFA et Université Paul Sabatier de Toulouse (1997-1998)
Stage de licence au laboratoire de biologie moléculaire (UMR 441) de l’INRA de Toulouse (mars à septembre 1998)
Clonage positionnel d’un gène symbiotique de Medicago Truncatula avec utilisation des techniques suivantes : marquage moléculaire
(PCR, AFLP), cartographie génétique (utilisation du logiciel MAPMAKER)
Ecole d’été analyse de séquences in silico, Parc universitaire de Luminy de Marseille (formation de 2 semaines en juillet 2000)
EXPERIENCE PROFESSIONNELLE EN INFORMATIQUE/BIOINFORMATIQUE
Ingénieur en développement, SSII à Toulouse (en CDI depuis le 24 octobre 2006),
Conception/Développement de la partie backend d’un système de gestion de contenu (ou CMS) d’une documentation
Tâches principales effectuées :
conception de la base de donnée du système (shéma relationnel, script SQL)
conception UML avec Together, implémentation en Java et tests (avec TestNG) des fonctionnalités applicatives
Environnement : Java J2EE (frameworks Spring, Hibernate), SGBD Oracle10g, Postgres, IDE Together (plugins Maven, TestNG)
Conception/Réalisation d’un module de saisie des Ordres de Fabrication intégré à un Progiciel de Gestion Intégrée (ou ERP)
Tâches principales effectuées :
- Reprise du prototype existant
- Industrialisation du prototype
- Conception et réalisation des évolutions
- Tests
- Transfert de compétence
Environnement : Adonix, Java J2EE (Struts, JOnAS, Eclipse), Oracle 9i, Unix
Ingénieur en développement, SSII STERIA à Toulouse (16 août-27 octobre 2006),
Mission d’intérim au forfait sur le développement d’une application Web J2EE de gestion des chargés d’affaires pour France Telecom.
Tâches principales effectuées : Développement en JAVA/J2EE (frameworks Struts, Spring, Hibernate, Jasper Report)
Ingénieur chef de projet bioinformatique à l’unité de recherche 1199 en Protéomique de l’INRA de Montpellier (avril 2002décembre 2005)
Responsable du projet de création d’une base de donnée protéomique (http://urgi.versailles.inra.fr/GnpProt/) intégrée dans le système
d’information de Génoplante et implémentation d’outils d’analyse autour de cette application.
Tâches principales effectuées :
- rédaction du cahier des charges, analyse Merise/UML du projet, élaboration du modèle conceptuel de donné
- implémentation de l’application selon un modèle architectural 3-tiers : interfaces Java (applets, JSP, Servlets à l’aide du
framework Struts), couche d’accès aux données (JavaBeans, ehcache d’Hibernate) et SGBD Postgres et Oracle
- participation à l’élaboration d’un format d’échange et d’importation des données dans la base
- implémentation en Perl d'outils d'analyse de séquences protéiques et d’outils de requêtage à base d’ontologies
- encadrement de stagiaires, veille technologique, rédaction de documentations, activités de formation
- valorisation : 1) poster aux conférences JOBIM 2005 (http://urgi.versailles.inra.fr/about/publications/PosterGnpProt.pdf)
2) mémoire d’ingénieur CNAM (http://cedric.bouttes.free.fr/Memoire.htm)
Ingénieur d’étude en développement d’applications bioinformatique au laboratoire du TAGC(Technique Avancée pour le
Génome et la Clinique) INSERM ERM 206 de Marseille (mars 2000-septembre 2001)
Développement du système ELOGE (Environnement logiciel pour la génomique fonctionnelle : http://tagc.univmrs.fr/bioinformatics/eloge/ ) en collaboration avec la société pharmaceutique IPSOGEN.
Tâches principales effectuées :
- analyse et conception de la base de donnée ELOGE (shéma relationnel, script SQL)
- réalisation de scripts en Perl d'extraction des données génomiques de banques de données publiques
- création de requêtes SQL pour répondre à des questions biologiques dans le domaine des puces à ADN
- réalisation des interfaces en Perl/CGI du module LIMS (Laboratory Information Management System)
Stage de DUT au Laboratoire Interactions PlantesMicro-organismes UMR 441 de l’INRA de Toulouse (juin-septembre 1999)
Programmation en Perl sous UNIX d’une application sur la base de données Prodom de domaines protéiques, application ayant pour
but la représentation graphique des régions transmembranaires sur séquences protéiques
Tâches effectuées :
- automatisation à l’aide de Perl du logiciel TMpred de détection des régions transmembranaires sur de multiples séquences.
- analyse informatique des résultats et représentation graphique des régions transmembranaires (librairie Perl GD.pm)
Poste d’analyste-programmeur au laboratoire de la Protection des Végétaux de Toulouse dans le cadre d’un contrat de
qualification (octobre 1996-octobre 1997)
Analyse, conception et développement d’une application de traitement de données agronomiques en Visual Basic sous Excel et d’une
base de donnée de gestion du laboratoire sous Access avec utilisation de procédures en Visual Basic.
BILAN DES COMPETENCES INFORMATIQUE/BIOINFORMATIQUE (techniques utilisées dans un cadre professionnel)
- langages de programmation : langage java, SQL, PHP, Perl, Java Script (jQuery, AJAX), XHTML, XML
- SGBD : Postgres, Oracle, MySQL
- outils de création de site internet : Dreamweaver, Photoshop, CMS (Drupal, osCommerce)
- technologies java : applets, JSP, Servlets, JavaBeans, JDBC, framework Struts, Spring, Hibernate, Jasper Report
- outils de développement et de tests : JBuilder, Netbeans, Eclipse, Together, Ant, CVS, Rational Rose, JMeter , TOAD, Maven,
TestNG
- systèmes d’exploitations : Windows, Unix, Linux
- méthodes d’analyse et conception : Merise, UML
- logiciels et outils bioinformatiques : BioPerl, BLAST, InterProScan, TMpred, NetPhos, MAPMAKER, MASCOT
LANGUES
Anglais (bon niveau, 4/5 au test bulat), allemand (notions)
LOISIRS
Musculation, natation, théatre, kung fu, plongée, aquariophilie, création de jeux de rôles, dessin