Epidémiosurveillance des maladies vectorielles chez les

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Épidémiosurveillance des
maladies vectorielles chez les
équidés
Agnès Leblond1, François Valon2 et Pascal Hendrikx3
1 : INRA, UR346 Épidémiologie Animale, VetAgroSup, Université de Lyon, Marcy l’l’Etoile
2 : Président du Conseil Scientifique du RESPE, Clin. Vét. du Parc de Brières, St André des Eaux
3 : Chargé de mission surveillance épidémiologique, Direction scientifique, Afssa Lyon, Lyon
Surveillance des maladies vectorielles
!
!
!
Progrès de la médecine du XXème siècle, mais
Apparition de nouvelles maladies ou de maladies dans de
nouvelles zones
Causes
! Augmentation des transports et des mouvements des chevaux et
de leurs produits (semence)
! Modifications des agents, de l’l’environnement,
environnement, du mode de
vie
Dérive antigénique, propagation des vecteurs, modifications
climatiques
" Augmentation du risque d’
d’exposition aux maladies infectieuses
!
Introduction et migrations
Delta du Rhône
(Camargue, France)!
Delta du Danube
(Roumanie)!
Estuaires du Gadalquivir (Dona, Espagne)
Zone du Gharb (Maroc)
Impact des nouveaux outils de communication
" Nécessité d’
d’une information en temps réel, précise et exacte.
Premier cas de fièvre du Nil en France
Un cas d'infection humaine par le virus du
Il s'appelle West Nile, c'est un virus potentiellement
Nil occidental signalé en France
mortel qui se transmet uniquement par les moustiques
Le patient réside dans le Var, où la maladie a été
et, pour la première fois en France, il vient de
également signalée sur un cheval. Les autorités
contaminer un être humain ...
sanitaires renforcent le réseau de surveillance sur le
(11/10/03)
pourtour méditerranéen. La direction générale de la
santé (DGS) a annoncé qu'un cas d'infection par le
virus du Nil occidental (West Nile) venait, pour la
première fois en France quarante ans, d'être signalé ...
(14/10/03)
Le virus du Nil de passage dans le Midi
Via les oiseaux, il a contaminé un homme et un
cheval.
Le virus du Nil occidental (ou West Nile virus) a fait
une petite réapparition la semaine dernière dans le
sud de la France. Et il s'est encore trompé de cible.
«Normalement, ce type de virus vit plutôt une
histoire avec les oiseaux», explique Henriette De
Valk de l'Institut de veille sanitaire (IVS). Une fois de
plus, il a contaminé un homme et un cheval, dans le
Var, tous deux tirés d'affaire ...
(14/10/03)
Le virus du Nil vu sous ses plus petites
coutures
Le responsable de la nouvelle plaie estivale de
l’Amérique du Nord est désormais visible sous un
nouveau jour. Des chercheurs américains ont
déterminé la structure du virus ...
(18/10/03)
Surveillance des maladies vectorielles
!
Peu d’
d’affections ont des caractéristiques pathognomoniques
!
Un certain nombre d’
d’affections évoluent dans leur forme, leur
fréquence ou leur répartition géographique
! Emergence de nouvelles maladies (maladies nosocomiales, Borna,
EPM, ESB, virus Hendra, Nipah, SARS)
! Re-émergence d’
d’anciennes maladies (tuberculose, malaria, encéphalite
japonaise, West Nile, Dengue)
Systèmes de surveillance et d’alerte
en vue du contrôle des épidémies
Surveillance des maladies vectorielles
! Surveillance
! « Activité régulière visant à déceler
précocément et à contrôler les maladies
animales dans une population donnée »,
»,
! Monitoring
! « Activité visant à déceler les modifications
des paramètres épidémiologiques d’
d’une
maladie donnée ».
».
Implémentation d’
d’un système de surveillance :
Objectifs et modalités
!
!
Surveillance active
!
Actions répétées pour établir l’l’ absence d’
d’ une maladie dans une population,
!
Mesure de l’l’incidence de l’l’ infection
!
Échantillon représentatif de la population
!
Coûts !!
!
Ex : tests annuels pour la métrite contagieuse équine (Taylorella equigenitalis) en France,
Irlande et UK
Surveillance passive
!
Triade : propriétaire, vétérinaire et laboratoire,
!
L’ agent causal est identifié par le laboratoire
!
Mesure de l’l’incidence de la maladie
!
Réseaux de volontaires, représentativité ?
!
Coûts réduits
!
Qualité des données, connaissance des facteurs de risque
!
Ex : introduction du virus West Nile (WNv) aux USA en 1999
Implémentation d’
d’un système de surveillance :
Objectifs et modalités
!
Surveillance syndromique
! Cas particulier de surveillance passive
! Autorités sanitaires assistées par un recueil et une transmission
automatisée des données
! « suivi en temps réel des indicateurs de maladie afin de détecter
précocement une émergence, avant même la confirmation des
cas par le laboratoire »
! Intérêt développé depuis le 11 septembre 2001,
!
Détection d’
d’ attaques bioterroristes,
!
Puis surveillance des maladies infectieuses
Implémentation d’
d’un système de surveillance :
Objectifs et modalités
!
Déceler précocement l’l’introduction de maladie exotique
!
Connaître l’l’incidence d’
d’une maladie, la prévalence d’
d’une
infection déjà présente sur le territoire
! Développer les capacités de diagnostic et d’
d’isolement viral des
laboratoires,
! Développer des vaccins efficaces,
!
Améliorer les connaissances sur les cycles
épidémiologiques et les facteurs de risque
! Faire des calculs de risque
Implémentation d’
d’un système de surveillance :
Hiérarchisation des maladies vectorielles
MALADIE
Agent
pathogène
VECTEUR
ZOONOSE
Anémie
infectieuse des
équidés
Retroviridae,
Genre
Lentivirus
Mécanique :
Tabanidae
ou Stomox
MARC
Tiques
Louping ill
Flavivirus
SYNDR
Proba
survenue
maladie
Csqces
Filière
Cas sporadiques
(Ardèche, Var,…)
GENAL
FAIBLE
MOYEN
OUI
UK, Irlande, Norvège,
Bulgarie, Turquie,
Espagne
NEURO
TRES
FAIBLE
FAIBLE
NON
OIE
Maladie enzootique
(hyperendémique) en
France
GENAL
ELEVE
E
MOYEN
(?)
OUI
Nord-Est, Bretagne,
Centre, Auvergne, Ile de
France, Sud-Ouest et
Corse
GENAL
MOYEN
FAIBLE
OUI
Amérique, France,
Italie, Espagne,
Royaume Uni,
Allemagne, Suisse,
Suède, Israël
GENAL
FAIBLE
MOYEN
(?)
règlement
NON
Ixodes ricinus
Piroplasmose
Theileria equi
Babesia caballi
Tiques
Dermacentor
Rhipicephalus
Maladie de
Lyme
Borrelia
burgdorferi
Tiques
Ixodes ricinus
Anaplasmose
Anaplasma
Tiques
Granulocytaire
phagocytophilum
Ixodes ricinus
et
Rhipicephalus
équine
var. equi
REPARTITION
GEOGRAPHIQUE
(Conseil Scientifique du RESPE)
Implémentation d’
d’un système de surveillance :
Hiérarchisation des maladies vectorielles
!
Emergence de Anaplasma phagocytophilum en Camargue
Répartition géographique des écuries positives dans la zone d’étude
Négative
Douteuse
Négative
Positive
Positive
2002 : seroprévalence = 1.4% (0.8 – 2.0)
2007 : seroprévalence = 8.6% (7.5 – 9.7)
Implémentation d’
d’un système de surveillance :
Hiérarchisation des maladies vectorielles
MALADIE
Agent
VECTEUR
ZOONOSE
STATUT
REPARTITION
SYNDR
Proba
survenue
maladie
Csq
Filière
GEOGRAPHIQUE
Peste équine
Orbivirus
type Culicoides
NON
MARC
Exotique pour la France.
Présente en Afrique
centrale
GENAL
FAIBLE
(?)
TRES
ELEVE
Encéphalose
équine
Orbivirus
type Culicoides
NON
Afrique du Sud, Proche
et Moyen Orient
GENAL
FAIBLE
ELEVE
Murray
Valley fever
Flavivirus
Moustique Culex
OUI
Australie
NEURO
TRES
FAIBLE
ELEVE
Encéphalite
Japonaise
équine
Flaviviridae
Moustiques
Culex, Aedes
OUI
MARC
Maladie exotique
(Asie)
NEURO
FAIBLE
MOYEN
Encéphalites
Est, Ouest
Vénézuela
Alphavirus
Moustiques
Culex, Aedes
OUI
MARC
Maladie exotique
(Amérique)
GENAL
TRES
FAIBLE
ELEVE
Fièvre à
virus
West Nile
Flavivirus
Moustiques
Culex et Aedes
OUI
MARC
Sud de la France
(Camargue, Pyrénées
Orientales, Var,…)
GENAL
FAIBLE
à
MOYEN
MOYEN
NEURO
NEURO
NEURO
(Conseil Scientifique du RESPE)
Implémentation d’
d’un système de surveillance :
Hiérarchisation des maladies vectorielles
!
Encéphalite japonaise
! Vecteur : Culex
! Proche de WNV
Pourrait devenir
endémique dans
certaines zones
en cas d’
d’introduction
Aire de distribution de Culex tritaeniorhynchus
Implémentation d’
d’un système de surveillance :
Hiérarchisation des maladies vectorielles
!
Encéphalite de l’l’Est, de l’l’Ouest
! Risque d’
d’introduction faible
! Vecteur pont : Aedes albopictus
Risque de diffusion élevé
à moyen terme en cas
d’introduction
Zones potentielles d’activité d’Aedes albopictus
dans les 20 ans à venir, compte tenu de
différents scénarios climatiques (ECDC, 2007)
Implémentation d’
d’un système de surveillance :
Recueil et exploitation de l’l’information
!
Collecte et vérification
! Vétérinaires, laboratoires " Autorités
Autorités sanitaires
Recueil de l’information
Communication
Télédététection
Informatique santé
Site Web
PSTN Internet
PSTN Internet
Balises Argos
PDA
Valise
Télémédecine
PDA
Balises Argos
PDA
Balises Argos
PSTN Notes
Equipes de recherche
françaises & étrangères
Services de santé
locaux & régionaux
Réseau
Sentinelles
Implémentation d’
d’un système de surveillance :
Recueil et exploitation de l’l’information
!
Analyse et interprétation
! Exhaustivité, représentativité
des données ?
!
Communication
! Rapide et régulière,
! Rétro-information
! Diffusion des alertes
!
Confidentialité des données
France: Suspected human & equine cases
of West Nile virus infection 11 octobre 2003
A probable human case of infection of the mosquitoborne West Nile virus has been reported in France, the
Health Ministry stated. "All our European partners
have been informed of the appearance of this case." It
was reported on Mon 6 Oct 2003 that the person
concerned had received hospital treatment …
West Nile virus in the United States
Disease Outbreaks Reported 27 November 2002
As of 26 November 2002, the WHO Collaborating
Centre for Arthropod Borne Viruses - Western
Hemisphere, at the Centers for Disease Control and
Prevention (CDC) has reported 3 737 human cases
of the West Nile virus, with 214 deaths occurring in
39 states and the District of Columbia …
Implémentation d’
d’un système de surveillance
Surveillance syndromique de la FWN
Moustique vecteur
Hôtes accidentels
West
Nile
virus
West
Nile
virus
Hôtes accidentels
Oiseaux
hôtes
réservoirs
Cycles épidémiologiques de
la Fièvre de West Nile
Implémentation d’
d’un système de surveillance
Surveillance syndromique de la FWN
!
Surveillance et alerte pré
précoce :
! Sensibilité
Sensibilité comparé
comparée des diffé
différentes mé
méthodes de surveillance pour une
alerte pré
précoce vis à vis d’
d’une circulation du WNV aux USA
(CDC, 2003)
Implémentation d’
d’un système de surveillance
Surveillance syndromique de la FWN
!
Surveillance syndrome nerveux
! Praticiens vétérinaires et autorités
sanitaires
! Transmission électronique des
données à un site web sécurisé
! Syndromes nerveux chez les équidés
!
Cas suspects
! Tests de laboratoire :
!
ELISA et séroneutralisation
! Cas confirmé : IgM
! Cas probable : IgG
Implémentation d’
d’un système de surveillance
Surveillance syndromique de la FWN
•
Surveillance des cas de syndrome nerveux 2004
• 57 suspicions, 32 confirmés (56%), 9 probables (16%)
• Association significative syndromes nerveux / cas confirmés WNV
• Période épidémique : semaine 39 – 42 (4)
Période épidémique
Valeur seuil de début
(95 - 99% syndrome/w)
Valeur seuil de fin
(90% syndrome/w)
Implémentation d’
d’un système de surveillance
Surveillance syndromique de la FWN
Surveillance syndromique et alerte précoce (Valeur seuil = 3 / semaine)
" Syndromes nerveux équins : semaine 35
" Surveillance active d’
d’ oiseaux sentinelles : semaine 37
" Confirmation des cas équins par le laboratoire : semaine 38
Nombre de syndromes nerveux chez les chevaux
!
Déclaration des syndromes
Début des signes cliniques
Période
épidémique
Laboratoire équin
Oiseaux
Alerte « vrai
positif »
Alerte « faux positif »
Valeur seuil « critique » pour l’alerte
Temps (en semaines)
Implémentation d’
d’un système de surveillance
Surveillance syndromique de la FWN
Communication et alerte : site web sécurisé, permet la gestion de la
base de données, circulation de l’l’information et alerte
!
Vétos
Setinelles
LVD 13
LVD 30
LVD 34
DSV 34
DSV 30
Données cheval suspect
(données cliniques + prélèvements)
DSV 13
Résultats analyses
AFSSA
DGAL
ENVL
RESPE
I. Pasteur
sérologie
virologie
Implémentation d’
d’un système de surveillance
Surveillance syndromique
!
Recueil longitudinal de données cliniques
!
!
!
!
Évaluation du « bruit de fond »
Détection des émergences
Aide au diagnostic
Évaluation du système
! Efficacité et utilité pour la surveillance des maladies infectieuses chez le
cheval.
! Sensibilité, spécificité et précocité des alertes
! Rapport coût/efficacité du système
! Représentativité, acceptabilité, stabilité,…
stabilité,…
Le Futur de l’épidémiosurveillance
!
Émergence = événements rares # identifier des populations à risque
!
Maladies vectorielles dépendantes de l’l’environnement
# étude des conditions
mergence dans la population équine
conditions d’é
d’émergence
! Identifier des foyers de circulation du virus
! Facteurs de risque environnementaux
Environnement
(CDC, 2003)
Le Futur de l’épidémiosurveillance
Détection de foyers
- Recueil, en parallèle, de données sanitaires et environnementales
- Expliquer les phénomènes observés, puis prédire
Données
topographiques
Données attributaires
Base de données
Cartes
Structure spatiale ?
Test d’hypothèses
Visualisation
Exploration
SIG
Logiciels statistiques,
simulation
Modélisation
Schéma général de l’analyse de données spatiales
Le Futur de l’é
pidémiosurveillance
l’épidémiosurveillance
Détection de foyers
Application à la surveillance de la FWN
!
Identification de foyers à partir de la prévalence
! FWN : enquêtes sérologiques
!
17 vétérinaires, 488 chevaux, 99 écuries
Le Futur de l’é
pidémiosurveillance
l’épidémiosurveillance
Détection de foyers
Application à la surveillance de la FWN
•
Identification de
foyers à partir de
l’incidence
•
FWN 2004 :
Procédures SaTScan
pour une fenêtre de 6km
et 30 jours (p = 0,002)
• 13 août- 11 sept
• 6 sept- 3 oct
•
Hypothèse : Culex ?
Le Futur de l’é
pidémiosurveillance
l’épidémiosurveillance
Facteurs de risque environnementaux
Images satellites
!
!
Objectif : quantifier l’l’occupation du sol, l’l’humidité, la végétation, l’l’habitat,…
habitat,…
Réponse spectrale ± unique des composants du sol # différencier les thèmes
d’occupation
Absorption par la chlorophylle
Absorption par l’eau
Le Futur de l’é
pidémiosurveillance
l’épidémiosurveillance
Facteurs de risque environnementaux
Images satellites
!
Capteur SPOT-4:
!
!
!
Résolution 10 à 20 m, 60 x 60 km
Répétitivité : quelques jours à quelques semaines
Base de données ISIS du CNES-MEDIAS
!
Choix des images en fonction de la date d’
d’acquisition, de la couverture nuageuse, de l’l’angle de
prise de vue,…
vue,…
Le Futur de l’é
pidémiosurveillance
l’épidémiosurveillance
Facteurs de risque environnementaux
Classification de l’l’image
0 : h ors zon e
!
!
Image SPOT-4 du 09 sept-04
Définition des thèmes
d’occupation du sol :
! Capacité d’
d’accueil des différents
acteurs du cycle
!
Classification supervisée
! L’utilisateur connaît la signature
spectrale de catégories connues
1 : e au libre
2 : b ois
3 : vég étation sè ch e
4 : sol nu
6 : rizière
7 : ro selière
9 : san so uire haut e
11: cé ré ales
12 : ve rg ers
13 : pelouse
14 : prairie h umide
15 : sa nsouire basse
16 : sa lin
239 : no n classé
255
Le Futur de l’é
pidémiosurveillance
l’épidémiosurveillance
Facteurs de risque environnementaux
Données environnementales
Correction
géométrique de
l’image
! Déformations
! Orthorectification
(correction des erreurs
de parallaxe)
Géoréférencement
et importation
dans le SIG
Le Futur de l’é
pidémiosurveillance
l’épidémiosurveillance
Facteurs de risque environnementaux
!
!
!
Biotopes de la zone
humide
Biotopes des zones
de foyer
« buffers » - 1km
autour des écuries
(disjoints)
! : rapport des pourcentages
Pour chaque écurie i et pour
chaque thème T :
"it = [% Ti / % T
Zone Humide]
Le Futur de l’é
pidémiosurveillance
l’épidémiosurveillance
Facteurs de risque environnementaux
!
Zone humide % zones de cluster
!
Vecteur en zone humide : Culex modestus ?
Ht
e
Vg
tS
ch
e
m
Hu
ns
Sa
e
ie
ar
Pr
al
ot
us
lo
Pe
e
Bs
isT
Bo
Ro
! = 1,43 pelouse
ns
0.00
liè
5.00
! = 1,27 bois total
re
10.00
! = 0,16 eau libre
Sa
Zone humide / écuries
Ecuries
15.00
Ri
z
!
Camargue
20.00
se
! Milieux humide > 60%
25.00
u
Zone d’é
tude
d’étude
Ea
!
Futur de l’épidémiosurveillance
Cartes de prédiction
!
Influence de la structure du paysage
8:./040
Nîmes
5406-+77.+,
2.?+
8,7+9
21,3400+
806.3+9
>100+9
8.;
51,9+.77+
<4=740
*+,-./010
!"#$%
#$%"– #$&
#$&"– #$'
#$'"– #$(
)"#$(
Risque d’
d’endémicité du WNv sur le pourtour méditerranéen (Landsat
(Landsat TM)
Pradier S., Master II 2006, UJF Grenoble
Conclusions et perspectives
!
Nécessité collaboration de nombreuses spécialités:
vétérinaires, épidémiologistes, biologistes, géographes,
statisticiens, informaticiens,…
informaticiens,…
!
Systèmes nécessairement évolutifs
! gains sur la connaissance des cycles épidémiologiques, méthodes
diagnostiques
! évolution des maladies (émergence, ré-emergence).
Le Futur de l’é
pidémiosurveillance
l’épidémiosurveillance
Facteurs de risque environnementaux
!
Zone humide % zones de cluster
!
Procédure « Modèle Linéaire Généralisé »
! Riz et sansouire haute ont un effet positif
! % bien classés
!
!
100% négatifs
60% des cas
" Vecteur Culex modestus ?
Conclusions et perspectives
!
!
!
Hotspots located near the
areas of high birds
population density
Endemic or epizootic area ?
Role of :
! Bird migrations
! Meteorological conditions
!
!
Rainfall ?
Study sites around the
mediterranean basin
Le Futur de l’épidémiosurveillance
Facteurs de risque environnementaux
!
!
Données de terrain
Problèmes : biais, actualisation coûteuse
FWN en Camargue, 2002
Analyse multivariée écuries
Le Futur de l’épidémiosurveillance
Facteurs de risque environnementaux
Données environnementales
!
Images satellites :
! Ensemble de pixels localisés dans
l’espace
!
!
Objectif :
Capteurs :
! Mesurent la partie réfléchie du spectre
électromagnétique
! Longueurs d’
d’onde de 0,4 à 0,8
micromètres (visible, PIR, MIR),
! Résolution spatiale, spectrale et
temporelle
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