poly evol - Ent Paris 13

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Université Paris 13 - UFR SMBH
L2 - Sciences de la Vie
EVOLUTION
2012-2013
S4O2 Licence 2
Responsable :
Arnaud van Holt
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Chap. 1
Emergence des Théories de l'Evolution
2
3
Principe de la
Sélection
Naturelle
4
L’arbre dessiné par Darwin et présent dans « L’Origine des Espèces »
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Chap. 2
Mécanismes de l'évolution darwinienne
La mutation
Transposition à ADN par coupure-collage
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Rétrotransposition de type non
rétroviral
Rétrotransposition de type
rétroviral
Schéma des événements de
type cassure des brins et de
jonction des brins conduisant à
l’intégration de l’ADN doublebrin d’un rétrotransposon.
Conséquences de l’excision d’un
transposon.
Une excision fidèle provoque un retour à la
forme sauvage du gène, mais une excision
infidèle peut (1) laisser une portion du
transposon non excisée, soit (2) modifier
quelques paires de bases à l’endroit de
l’insertion, ou encore (3) provoque une
délétion d’un fragment du chromosome
autour du site d’insertion.
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Conséquences de l’insertion d’un
transposon.
A). Un transposon s’insère dans la
séquence codante d’un gène
normalement exprimé. L’ARN
transcrit est alors aberrant et la
protéine tronquée.
B).L’insertion d’un transposon à
proximité d’un gène normalement
inactif peut activer la transcription et
la traduction de ce gène.
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La panmixie : conditions
Effets de la sélection :
Génération 0 :
Valeur sélective w
w1 AA
w2 Aa
w3 aa
Evolution de la fréquence allélique
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Chap.3
Espèces et spéciation
L’espèce biologique ( Ernst Mayr, 1942) :
« groupe de populations naturelles au sein duquel les individus sont réellement ou potentiellement
capables de se reproduire ; toute espèce est séparée des autres par des mécanismes d’isolement
reproductif ».
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13
Chap.4
Complexité de l’évolution biologique
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Coalescence des gènes
Tous les allèles actuels proviennent de K
- génération 11
Parentèle :
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Paysage évolutif
Théorie des Jeux
La stratégie « bourgeois » du Tircis
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Chap.5 - Histoire de la Vie sur Terre
1. Des premières traces de vie aux premières faunes diversifiées
1.1 premières traces de vie sur Terre (-4,5 GA)
Espèce-phare : stromatolithes (-3,5 GA)
Gisement type : North Pole, Australie ; Gunflint, Ontario, USA
1.2 La faune d’Ediacara (-650 MA)
Espèce-phare : nombreux animaux à corps mou (Cnidaires …)
Gisement type : Ediacara, Australie
1.3 La faune de Burgess ( -500MA)
Espèces-phare : Anomalocaris, Pikaia
Gisement type : Burgess, Canada ; Chengjiang, Chine
1.4 Faunes marines du Silurien / Dévonien (-445 à –360 MA)
Espèces-phares : Scorpions de mer, Cephalaspis
Gisements types : nord de l’Europe
Pterichtys, poisson cuirassé sans mâchoire
Figure : A. Chavan & A. Cailleux,
Détermination pratique des fossiles, Masson
2. Faunes et flores terrestres de la fin de l’ère Primaire
2.1 De la conquête du milieu terrestre aux grandes forêts du Carbonifère
Espèce-phare : Rhynia
Gisements : tourbière de Rhynie, Ecosse
2.2 Sorties des eaux chez les premiers Tétrapodes (-385 MA)
Espèces-phares : Tiktaalik, Ichtyostega
Gisement type : Groenland
2.3 Grandes faunes reptiliennes et prémammaliennes (-300 à –250 MA)
Espèce-phare : Dimetrodon
Gisements : Europe, Am. Nord
2.4 La crise Permien-Trias (-250MA)
3. L’ère Secondaire, ère des Archosauriens
2.1 Faunes terrestres et marines
Espèces-phares : Iguanodon, Pteranodon, Plésiosaure
Gisements types : Belgique (Iguanodon) ; ouest USA (très nombreuses espèces)
2.2 Apparition des oiseaux
Espèce-phare : Archaeopteryx, Microraptor
Gisements types : Solnhofen, Allemagne ; province du Liaoning, Chine.
2.3 La crise Crétacé-Tertiaire (-65 MA)
4. l’ère Tertiaire, ère des Mammifères
4.1 Explosion mammalienne
Espèce-phare : Pakicetus
Gisements types : Badlands, USA ; Rancho LaBrea, USA ; Sibérie ; Pakistan.
4.2 Emergence de la lignée humaine
Espèce-phare : Australopithecus afarensis, Homo ergaster, Homo neandertalensis
Gisements types : vallée du Rift, Afrique de l’Est ; Dordogne et Limousin, France.
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Crise
Ordovicien
supérieur
Dévonien
sup.
PermienTrias
TriasJurassique
CrétacéTertiaire
% de taxons marins
touchés
F : 22
g : 55
sp : 85
F : 22
g : 50
sp : 75
F : 55
g : 80
sp : 95
F : 22
g : 50
sp : 75
F : 15
g : 45
sp : 75
Tableau : Pourcentage de taxons (Famille (F), genre (g), espèce (sp)) marins touchés lors de chaque
crise biologique majeure enregistrée.
 Schéma simplifié des effets
(sens des flèches) induit par une
éruption volcanique de type trapps
(d'après Wignall, 2001).
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Bibliographie :
Alberts B., Biologie moléculaire de la Cellule, 4ème édition, Médecine-Sciences, Flammarion, 2007.
Brondex F., Evolution, synthèse des faits et théories, Dunod, 2003.
Carroll Lewis, Alice de l’autre côté du miroir, poche, 1871 - 2010.
Collectif, L’évolution, comment les espèces s’adaptent, Dossier LR n°27, mai-juin 2007.
Collectif, sous la dir. de Le Guyader, L’évolution, Belin PLS, 1998.
Darwin C., L’Origine des espèces, GF-Flammarion, 1859 - 2008
Genermont J., laboratoire « Écologie, Systématique et Évolution », Univ. P-sud, communication
personnelle.
Gould S.J., La vie est belle, les surprises de l’évolution, Points Sciences, Seuil, 1991.
Ridley, Evolution biologique, De Boeck université,1997.
Solignac et al., Génétique et évolution, Hermann, 1997.
Schilthuizren, Grenouilles, mouches et pissenlits, les mécanismes de la spéciation, Dunod, 2002.
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