Levirusn’infectepasl’homme.Ilpeutêtrecultivéinvitrosur
descellulesvero(cellulesdereindesingevertafricain)en
présencedetrypsinedanslemilieudeculture.Ilreste
néanmoinsdifficileacultiver(SongetPark,2012).
Legénomeviralprésentelastructurecommuneàtousles
coronavirus.Unecoiffeen5’etunequeuepolyAen3’.L’ordre
desgènesestdansl’ordrecanoniqueretrouvécheztousles
coronavirus:réplicase‐S‐E‐M‐N.Laréplicaseestcodéepar
deuxORF,1aet1b.LegèneScodepourlaprotéinedespicule
àlasurfaceduvirionquiestlaprotéinelaplusimmunogène
duvirus.LegèneEcodepourlaprotéined’enveloppe,legène
MpourlaprotéinedematriceetlegèneNpourla
nucléocapsidequientoureetprotègel’ARNviral(Masters,
2006).LevDEPprésenteunORFsupplémentaireappeléORF3,
situéentrelegèneSetE.Paranalysephylogénétique,ense
basantsurlesséquencesdesgènesS,MetORF3,ilest
possibled’identifierdifférentsclustersselonlarégion
d’origine.EnAsie(Chine,CoréeduSud,Vietnam)etauxUSA,
lessoucheshypervirulentesdevDEPontétéidentifiéesetce,
malgrél’utilisationdevaccinsinactivésouatténuésavecla
soucheCV777enChineouDR13enCorée.AuxUSA,deux
typesdesouchesdevDEPcirculentactuellement,lessouches
hypervirulentesidentifiéesdèslespremierscasenavril2013
(Huangetal.,2013;Stevensonetal.,2013)etcelles
dénommées«InDel»présentantunedélétionpuisune
insertiondenucléotidesaudébutdugèneS(Okaetal.,2014;
Wangetal.,2014)(Figure2).
83p -5 (A B54 861 8) (0. 0 021)
AttDR 13(J Q023 162 ) (0. 00 06)
tt en uated v acci ne(K C1899 44) ( 0. 000 8)
SD -M( JX5607 61) ( 0. 000 4)
JS2 008( KC109 141) (0.00 09)
MK(A B5 4862 4) ( 0. 0147 )
r1/ 87(Z254 83 ) (0 .0 009)
CV777(AF353511
(0 .0 001 )
LZC(EF 1859 92) ( 0.0054
SM98(GU9 3779 7) (0 . 0036 )
D R1 3(J Q023 161) (0.00 29
CH/S/1986(JN547228) (0.0190)
CH -G M
-0
-201 3(K C7 875 39) ( 0.0040
CH-HK
-08 -20 11(J X2 424 62) ( 0.001 5)
CH-ST
-12 -20 12(K C7 875 43) ( 0.004 2)
CH/F JX
-2
20 12(J X0 706 72) ( 0.003 9)
C H/HB QX /10( JX 5013 18) ( 0.001 8
OH851(KJ3 99978) (0. 00 21)
JS 1201 03( KF4 5351 3) (0 .0050 )
CH-SH
- 12 -2011 (JX 24 2464 ) (0.0 073)
CH13 -GX( JQ9 792 88) ( 0.000 5)
CH2
-J S(JQ97 9290 ) (0.0 009)
CH/JLGZ U/20 11(J Q63 8923) (0 .0 055)
JS -20 0
-2( AY 6532 04) (0 .0 036)
LJ B/0 3(DQ 9857 39) ( 0. 014 2)
KH( AB548 622 ) (0. 02 54)
NK( AB548 623) (0. 01 95)
A D03( KC879 282) (0. 01 75)
KNU -09 02( GU1 801 45) (0 .010 3)
NPP ED01 08_1( KC76 4953 ) (0. 0 094)
CH/ FJND -3 (JQ 2829 09) ( 0. 012 1
J 110 2(J X18 845 4) (0 .0 004)
LC (JX 489 155 ) (0.00 00)
CHGD(J
261936) (0.0015)
GD -1(J X6 4784 7) (0 .0005 )
GD-A (JX11 2709 ) (0. 0 000)
CH/FJZ
-9 (KC 140 102 ) (0.00 56)
Z JCZ4( JX5241 37) (0. 001 1
Z J12 1030 (KF 7382 64) ( 0.005 9)
AH 2012 (KC210 145 ) (0. 00 34)
B
- 2011 - 1(J N8257 12) (0.000 9
CH/ XCYL/1 1(J X50 132 3) (0 .0 029)
J
-HZ2 012( KC21 0147 ) (0 .0 003)
GD-B(JX088695) (0.0016
S D130 502( KF7 382 61) ( 0. 0038 )
CH/ZMDZY/11(KC196276) (0.0045)
CO (KF 272920) (0. 00 00)
IA2(KF468753
(0.0002)
IA3(KF452322
(0 .0026 )
IA1(KF468754) (0 .0 005 )
Indiana(KF452323) (0 .0 000)
M N1(KF 468752) (0 .0 005)
OH1414(KJ408801) (0.00 07)
Souches
hypervirulente
USA
04/2013
1
2
Souche
européenn
deréférence
Souche«
InDel »
USA‐ 12/2013
Figure2–Arbrephylogénétiquebasésurlaséquence
nucléotidiquedugèneSde53souchesdevDEP
(adaptédeWangetal.,2014)
3.2. Transmissionduvirus
3.2.1. Transmissionoro‐fécaleetaérienne
LevDEPsetransmetessentiellementparvoieoro‐fécaleentre
porcs.
L’épizootieauseind’unélevagesensiblesurvientquatreàcinq
joursaprèsl’introductionoulaventedeporcs.Levirusest
ainsiprobablementintroduitenélevageviadesporcsinfectés
oupartransportmécanique(bottes,camions,etc.),d’où
l’importancedesmesuresdebiosécuritéetd’hygiènedansla
préventiondel’introductionduvirusenélevage.Levirusest
susceptibledepersisterplusfacilementsousuneforme
enzootiqueauseindel’élevageaprèsunepremièrephase
épizootique.Uncycleenzootiquepeutainsis’instaurerdans
lesélevagespratiquantunrythmederotationimportantet
desmélangesdeportéesissuesdebandesdifférentesetde
statutimmunitairehétérogène.
Uneétudedetransmissionduvirusparvoieaérienneaété
réalisée.DesporceletsontétéinfectésparlevDEP.Des
prélèvementsd’airontétéréaliséspendantlestroispremiers
jourssuivantl’infectiondanslessalleshébergeantlesanimaux
etsesontrévéléspositifspourladétectiondugénomeviral.
Desanimauxontensuiteétéinoculésaveclesprélèvements
d’airpositifsdiluésetontprésentédessignescliniquesetdes
lésionsdeDEP,indiquantquelevDEPprésentdansles
prélèvementsd’airétaitinfectieux.Uneautrepartiedecette
étudeamontréquedesprélèvementsd’airréalisésàplusde
16kmd’unélevageaffectéparlaDEPétaientpositifspourla
présencedegénomeviralsansquelecaractèreinfectieuxdes
prélèvementsn’aitpuêtredémontré(Alonsoetal.,2014).
Cetteétudesuggèrequelavoieaériennepeutcontribueràla
disséminationduvDEP.
3.2.2. Transmissionparlasemence
Latransmissionduvirusparvoievénériennen’estpasconnue
àl’heureactuelle.Elleestnéanmoinspossiblepuisqu’une
phasedevirémieestobservéeaumoinslorsdeprimo‐
infection.Cettehypothèseestégalementsupportéeparla
détectiondegénomeviraldanslessemencesprovenantde
verratsinfectésprésentsdansuncentred’insémination
artificielleaffectéparlaDEP(DufresneetRobbins,2014).
Cependantcetteobservationpourraitaussirésulterd’une
contaminationcroiséepardesfèceslorsdelacollecteoula
préparationdelasemence.
3.2.3. Transmissionparvoiealimentaire
L’agencecanadiennedel’inspectionalimentaire(Canadian
FoodInspectionAgency(CFIA))aannoncéenfévrier2014que
del’ARNduvirusdeDEPavaitétédétectédansdes
échantillonsdeplasmadeporcenprovenancedesEtats‐Unis
etentrantdanslacompositiond’alimentporceletpremierâge.
L’agencecanadienneaalorsémisl’hypothèseque
l’alimentationpouvaitcontribueràvéhiculerlevirus.Unbio‐
essaiaensuiteétéréaliséaucoursduqueldesporcelets
inoculésavecduplasmapositifenRT‐PCRpourlaprésencede
vDEPontprésentédessignescliniquesdeDEP.Parcontre,
lorsquelesgranulésutilisésenalimentation(del’ordrede5à
10%deplasmaincorporédansl’aliment)ontétédistribuésaux
porcelets,aucunanimaln’aprésentéd’infectionparlevDEP
(Pasicketal.,2014).Lesenquêtesréaliséesparlasuiteen
Ontario,Canada,surlespremiersélevagesaffectésparlaDEP
montrentquedix‐huitdesvingtpremiersélevagesconcernés
étaientlivrésparlamêmeusined’aliments;celaétait
égalementlecaspourl’élevageatteintdeDEPsituésurl’îledu
PrinceEdouard.Uneautreétudeayantutilisédesplasmas
positifspourlaprésencedegénomedevDEPincorporédans
desgranuléspouralimenterdesporceletsn’apaspermisde
reproduirelamaladie(Opriessnigetal.,2014).
LapossibilitédetransmissionduvDEPparvoiealimentairea
étédémontréeparunessaiexpérimental(Deeetal.,2014).
2015. Journées Recherche Porcine, 47.