1ereSVT - Theme 3 – chap 10 TP 3 LA CANCERISATION Mise en situation et recherche à mener « Fumer provoque le cancer du poumon, prévient l’emballage des paquets de cigarettes. L’alcool, le soleil (UV), l’amiante et même certains virus sont aussi des facteurs liés à l’apparition de cancer. Toutefois, ces agents ne déclenchent pas systématiquement la maladie. En effet, la quasi-totalité de la population y est exposée, mais seule une minorité est atteinte par la maladie. Où se situe la différence ? ». Probablement dans notre génome… Modifié d’après « Pour la Science », L’imbroglio génétique du cancer, n°46 janvier-mars 2005. Comment la génétique et l’environnement peuvent-ils expliquer l’apparition d’un cancer chez un individu ? Ressources Documents 2 et 3 p 260 et 3 p262 Document 1 : mode d’action de la protéine P53 dans la cellule La p53 est un facteur de transcription. Si une anomalie de l'ADN est détectée dons une cellule, la p53 se fixe à divers endroits de l' ADN, ce qui active la transcription de plusieurs gènes. Les produits de ces gènes permettent de stopper Ie cycle cellulaire pour une éventuelle réparation de l'ADN ou déclenchent le suicide de la cellule (apoptose). Ainsi, la p53 est une protéine suppresseur de tumeur. Document 2 : la structure de p53 et l’ADN La séquence de la protéine p53 montre qu’elle contient de très nombreux sites de fixation à l’ADN. La fixation de P53 sur l’ADN se fait notamment grâce à des acides aminés ARG (arginine) et GLY (glycine) qui sont facilement attirés par l’ADN de par leur structure. 1ereSVT - Theme 3 – chap 10 Matériel disponible et protocole d'utilisation du matériel Matériel : Geniegen2 Fichier p53 et cancer. Libmol Fichier Tabac et p53. Identifier les mutations sur la protéine P53 chez les individus atteints de cancers avec Geniegen2 1- Accéder à GenieGen2 : https://www.pedagogie.ac-nice.fr/svt/productions/geniegen2/ 2- Réaliser un alignement des séquences normales, cancer poumons et cancer du foie. 3- Réaliser la traduction des séquences pour obtenir les séquences de protéines. 4- Aligner les séquences obtenues et identifier les mutations dans les séquences de protéine. 5- Réaliser une capture d’écran. Observer les mutations dues au tabac avec LibMol. 1- Accéder à LibMol : https://libmol.org/ 2- Dans l’onglet « Fichiers », rechercher le terme «Tabac» et cliquer sur le fichier contenant « fumée du tabac. 3- Dans l’onglet « Commandes », cliquer sur colorer puis « par nature » 4- Réaliser une capture d’écran. Observer l’interaction moléculaire entre p53 et l’ADN avec LibMol. 1- Accéder à LibMol : https://libmol.org/ 2- Dans l’onglet « Fichiers », rechercher le terme « Protéine p53 » et cliquer sur le résultat. 3- Dans l’onglet « Commandes », afficher l’ADN sous forme de rubans, coloré en rouge. 4- Dans l’onglet « Commandes », afficher les protéines en squelette, colorées par chaîne. 5- Dans l’onglet séquence, sélectionner les aa touchés par la mutation (dans les 4 chaines), afficher en sphères et colorer. Réaliser une capture d’écran.