Traduit de Anglais vers Français - www.onlinedoctranslator.com Royaumes de la vie Connecté Guide pédagogique pour l'enseignant Arbre de la vie Troisième édition, 2022 Priscilla Spears, Ph.D. La science en images Corvallis, OR 97330 Dédié à M. Morris Jennison, mon professeur de biologie au lycée. Il m'a donné la liberté d'explorer. Les règnes du vivant interconnectés : Guide pédagogique sur l'Arbre de VieTroisième édition Troisième édition © 2022 par Priscilla Spears Deuxième édition © 2016, 2019 par Priscilla Spears Première édition © 2008, 2009 et 2013 par Priscilla Spears Publié et distribué par Big Picture Science Boîte postale 829 Corvallis, OR 97339www.bigpicturescience.biz Imprimé aux États-Unis d'Amérique L'acheteur est autorisé à reproduire des extraits de cet ouvrage, mais UNIQUEMENT pour un usage en classe. Veuillez demander aux autres enseignants d'acquérir leur propre exemplaire. Pour toute autre reproduction, même partielle, de cet ouvrage, veuillez contacter Priscilla Spears afin d'obtenir son autorisation. Vous pouvez la joindre via www.priscillaspears.com. ISBN-10 : 0-9821517-3-x ISBN-13 : 978-0-9821517-3-0 COUVERTURE AVANT : Image composite des graphiques des leçons sur « L’avènement des royaumes ». Veuillez noterque les fichiers de ces graphiques sont disponibles en téléchargement et impression gratuits sur le site web Big Picture Science,www.bigpicturescience.biz , sous une licence Creative Commons qui interdit toute utilisation commerciale. IMAGES DE LA QUATRE COUVERTURE, en partant du coin supérieur gauche : Modèle d’adénovirus – domaine public, photo du Dr Richard Feldmann, avec l’aimable autorisation du National Cancer Institute ; les autres photos sont la propriété de l’auteur. Algue rouge ; varech, une algue brune ; photomicrographie de spores de basidiomycète ; champignon de la rouille sur la face inférieure d’une feuille ; photomicrographie d’ascospores alignées dans les sacs d’un champignon en forme de coupe ; guêpe commune ; cônes de graines deÉphédra; strobile deEquisetum telmatiea ; renard roux;Zinniahybride. Autres livres de Priscilla Spears, disponibles surwww.bigpicturescience.biz : De la biosphère aux atomes : un guide pédagogique sur l'organisation du monde vivant.2e édition. (2013) Big Picture Science. ISBN 978-0-9821517-2-3. Leçons sur les plantes : Initier les enfants à la forme et à la fonction des plantes. 2e édition. (2010) Big Picture Science. ISBN 978-0-9821517-1-6. Changements dans la troisième édition À l'instar des êtres vivants qu'ils décrivent, les termes et concepts biologiques évoluent. L'évolution rapide de nos connaissances et de nos idées exige des mises à jour fréquentes. Lors de ma révision, j'ai donc révisé…Les règnes du vivant connectésHuit ans seulement après sa première publication, j'espérais que la seconde édition serait utile plus longtemps. Il n'en fut rien. Début 2022, j'ai compris qu'une nouvelle révision s'imposait. Mon objectif pour cette édition reste le même que pour les précédentes : proposer ce livre comme une source d'informations utiles pour initier les enfants à la diversité du vivant. Les modifications apportées à cette édition sont les suivantes : j’ai ajouté une leçon fondamentale importante : une introduction à l’Arbre de Vie dans son ensemble. Elle offre une vue d’ensemble indispensable avant d’étudier plus en détail chaque partie de l’Arbre de Vie. Chez les protistes, les biologistes ont abandonné le terme « chromalvéolés ». Le règne des champignons a fait l'objet d'une importante refonte de ses lignées. L'arbre phylogénétique et les noms de plusieurs branches sont nouveaux. Les embranchements du règne animal restent inchangés, mais le nom d'une branche de protostomiens a évolué. Autrefois appelée « Lophotrochozoa », cette branche est encore parfois désignée sous le nom de « Spiralia » par de nombreux biologistes. Dans le règne végétal, des études ont révélé que les anthocérotes constituent la première branche des bryophytes. Les hépatiques et les mousses sont désormais considérées comme des groupes frères. La position des gnétophytes au sein des gymnospermes reste à déterminer, et plusieurs hypothèses intéressantes sont actuellement à l'étude. Tout cela confirme l'idée que la vie est loin d'être monotone. Son étude ne devrait pas l'être non plus. J'espère que ce livre vous éclairera et enrichira votre exploration de la diversité du vivant. - Priscilla Spears, Ph.D., septembre 2022 À propos de la deuxième édition Au cours des huit années écoulées depuis que j'ai écritLes règnes du vivant connectésDepuis, les informations sur la diversité du vivant, et notamment sur les liens de parenté génétique entre les organismes, n'ont cessé d'affluer. Les biologistes ont levé certaines incertitudes et certaines conceptions des lignées fondamentales ont évolué. Rassurez-vous, ces changements ne sont pas majeurs, mais j'estimais qu'ils justifiaient une nouvelle édition. Je souhaitais également clore définitivement le chapitre des Cinq Règnes et me consacrer à la systématique phylogénétique, la classification de l'Arbre de la Vie utilisée par la plupart des biologistes et enseignée dans les cours de niveau supérieur. La terminologie scientifique évolue, j'ai donc apporté quelques modifications. J'ai introduit un nouveau terme pour désigner les principaux groupes d'eucaryotes : les supergroupes eucaryotes. Les quatre supergroupes actuellement reconnus incluent un nouveau, SAR, qui représente la lignée commune des chromalvéolés et des rhizariens. Les autres sont les archéplastides, les excavés et les unikontes, désormais également appelés Amorphea. J'ai enrichi le chapitre sur les virus, notamment avec des informations pour aider les enfants à comprendre les images qu'ils voient, et des détails supplémentaires sur les fascinants virus géants. J'ai mis à jour les listes de ressources, mais je constate que de nombreux ouvrages anciens restent les meilleurs disponibles. J'ai ajouté de nouveaux livres au fur et à mesure que j'en trouvais d'utiles. Les listes du site web sont à jour pour la fin de l'été 2016. Le changement le plus important de cette édition est sans doute la mise en couleur des cartes de l'Arbre de Vie. Du moins, les images prises avec la lumière sont en couleur. Les micrographies électroniques restent en noir et blanc, car je ne les colorise pas. - Priscilla Spears, Ph.D., septembre 2016. 1 Préface à la première édition Ce livre a évolué au cours des douze dernières années, commençant par une série de livrets que j'ai rassemblés en une publication intituléeCollection Royaumes de la VieLe projet a été confié à Montessori Services pour l'impression à partir de 2002. Ces dernières années, il m'est apparu clairement que les progrès de la systématique moléculaire – la classification des organismes à partir des informations fournies par leurs macromolécules – avaient engendré des changements importants. Il est temps de reconsidérer les cinq règnes et notre mission d'initier les enfants à la diversité du vivant. Nous devons leur montrer les relations et les liens entre les groupes d'organismes, et non de simples rangées de cases. Darwin est désormais le maître d'œuvre de la classification. Linné doit se retirer. Autrement dit, les idées sur la classification et sa représentation ont évolué. Les biologistes élaborent une classification « naturelle » appelée Arbre de la Vie, un schéma qui reflète l'histoire évolutive des organismes. Les représentations sont des diagrammes arborescents, et non des colonnes de cases alignées. Ces cases conviennent à la classification linnéenne car Linné a conçu son système en partant du principe que toute vie existante avait été créée instantanément sous sa forme actuelle. Il n'avait pas à se soucier de l'histoire des organismes. Notre conception actuelle du vivant inclut une histoire pour chaque être vivant, une longue lignée d'organismes remontant aux origines de la vie. Les diagrammes arborescents nous permettent de retracer cette histoire. Plus précisément, ils nous permettent de formuler des hypothèses à son sujet. Chaque diagramme arborescent présente une hypothèse sur l'évolution du vivant et ses liens de parenté. Cela signifie-t-il que nous abandonnons toute la classification linnéenne ? Absolument pas. Les noms binomiaux (genre et espèce) restent d'actualité. La plupart des noms de famille sont encore utilisés. Cependant, de nombreux termes figurant sur les arbres phylogénétiques ne peuvent être classés selon la classification linnéenne, tels que l'ordre, la classe, la sous-classe, etc. Ces étiquettes non classées étaient nécessaires car le nombre de rangs linnéens était insuffisant pour représenter toutes les branches du vivant. Dans cette transition, il n'est pas nécessaire de jeter tous nos supports pédagogiques sur la diversité du vivant, mais d'en ajouter de nouveaux. J'ai conçu des schémas arborescents pour illustrer les concepts de l'Arbre de Vie. Ces schémas diffèrent sensiblement des anciens. Ces derniers illustraient l'idée que toute vie est interconnectée, mais sans présenter de relations scientifiquement établies. Ils illustraient l'idée fondamentale d'une origine commune à toutes les formes de vie, sans aller plus loin. La nouvelle génération de schémas arborescents, notamment les cladogrammes des biologistes, illustre nos hypothèses sur les relations évolutives et l'histoire de la vie. Il est essentiel que les enfants découvrent ces nouveaux schémas et apprennent à les exploiter. Vous constaterez que j'ai représenté mon Arbre de Vie de manière large, sans sommet. Les mammifères n'en constituent pas le sommet, mais plutôt une branche d'un grand arbre. J'espère que cela nous permettra de nous percevoir comme une partie (certes importante) d'un ensemble vaste et interdépendant, plutôt que comme le but ultime. Je propose ce livre comme outil pédagogique pour les enseignants et les enfants dans le cadre de notre transition vers la classification phylogénétique (arbre de vie). Si vous constatez des erreurs ou avez des commentaires ou des suggestions concernant les leçons et les activités, je vous serais très reconnaissant de bien vouloir me les communiquer. Priscilla Spears, docteure en philosophie, Conifer, Colorado Octobre 2008 2 Remerciements Au fil des années, de nombreuses personnes m'ont apporté leur aide lors de la rédaction des précédents livrets et de cet ouvrage. Meredith Blackwell et Bryce Kendrick, deux éminents professeurs de mycologie, ont aimablement lu et commenté les textes originaux sur le règne fongique. Ces textes, révisés, figurent ici dans la section « Informations complémentaires sur le règne fongique ». L'une des tâches les plus ardues lors de la réalisation de ce livre a été de trouver des illustrations appropriées pour les tableaux. De nombreux scientifiques du monde entier ont généreusement partagé leurs travaux. Ils sont mentionnés dans les crédits photographiques en annexe. Plusieurs agences du gouvernement américain ont mis des photographies à la disposition du public, et j'ai eu le plaisir d'utiliser cette ressource. Les professeurs Peter Siver et Jason Oyadomari ont vérifié le tableau des protistes. Aaron Bell a offert ses excellentes micrographies électroniques à balayage ainsi que ses précieux encouragements. Alors que j'avais prévu de réviser monCollection Royaumes de la VieMes échanges avec Amy Henderson m'ont inspirée pour écrire les leçons sur « L'avènement des royaumes ». Ses précieux commentaires m'ont permis de remanier le livre en profondeur. Il est vite apparu que des tableaux seraient nécessaires pour accompagner ces leçons. En les concevant, j'ai encore davantage apprécié le talent et le savoir-faire de Carolyn Jones, d'InPrint for Children. Carolyn est une excellente conseillère et une graphiste de grand talent. Mon travail sur les tableaux de ce livre m'a permis de constater les nombreuses heures consacrées par Carolyn à la création de ses magnifiques tableaux et fiches pédagogiques de grande qualité. Nos échanges ont été extrêmement précieux, notamment ses conseils sur la conception de tableaux. Je suis reconnaissante des encouragements que j'ai reçus de nombreux éducateurs Montessori lors de mes projets d'enseignement des sciences. Ils sont trop nombreux pour être cités, mais je tiens à remercier Diana Butler, qui a partagé son expérience en classe avec mon concept de « plante de la semaine ». J'apprécie énormément ses précieux conseils. Je tiens également à remercier tout particulièrement mon amie et partenaire de marche, Anna Kalkwarf. Elle m'a aidée à m'éloigner de l'ordinateur pour faire l'exercice dont j'ai besoin et pour apprécier la nature, deux éléments essentiels à ma santé. Mon mari, Daniel Bean, a soutenu ce projet, comme il l'a toujours fait pour tous mes travaux d'écriture pédagogique. Remerciements supplémentaires pour la troisième édition-Je remercie les nombreux enseignants Montessori qui ont communiqué avec moi ces dernières années. Je suis particulièrement reconnaissant du soutien et de l'amitié de Cynthia Brunold-Conesa, qui a pris à cœur mon appel à restructurer l'étude de la biologie dans la pédagogie Montessori. Voir page 18 pour plus d'informations sur son ouvrage consacré aux leçons de biologie pour les classes élémentaires Montessori. Pour cette édition, Jim Whiting a réalisé un travail d'édition remarquable. Grâce à lui, le livre est plus agréable à lire et la ponctuation est plus correcte. À propos de l'auteur : Priscilla Spears conçoit des supports pédagogiques pour l'enseignement Montessori, du primaire au secondaire, depuis plus de vingt ans. Docteur en microbiologie, elle a également consacré beaucoup de temps à la recherche et à l'écriture sur un large éventail de sujets scientifiques. Parmi ses autres ouvrages figurent :Leçons sur les plantes : Initier les enfants à la forme et à la fonction des plantes,Visite guidée des plantes à fleurs,etDe la biosphère aux atomes : un guide pédagogique sur l'organisation du monde vivant Sa société, Big Picture Science, produit du matériel pédagogique scientifique. Elle travaille également comme consultante pour InPrint for Children. Les produits Big Picture Science sont vendus sur le site web www.bigpicturescience.biz et par Montessori Services, à Santa Rosa, en Californie. 3 4 Contenu Préface 1 Remerciements 3 7 Chapitre 1. Enseigner la diversité de la vie Questions sur les règnes, les domaines et l'Arbre de Vie : Règnes 7 11 et sous-groupes pour les niveaux élémentaires Tutoriel sur les diagrammes de ramification 15 Leçon clé : Introduction à l’arbre de vie 17 Chapitre 2. Caractéristiques des branches de la vie 19 Tableau : Comparaison des branches du vivant 20 Notes sur le tableau comparatif des branches du vivant Ressources pour l’étude des règnes et des branches du vivant 25 29 Chapitre 3. Les procaryotes 31 Introduction – Enseignement sur les procaryotes 31 L’apparition des procaryotes 32 Diagramme de ramification pour la leçon « L’arrivée des procaryotes » 38 Bactéries et objets du quotidien : une exploration de la pensée Que peuvent 39 44 Ressources pour l'étude des procaryotes Guide de 47 faire les enfants avec les bactéries ? 48 prononciation des termes relatifs aux procaryotes Chapitre 4. Les Protistes 49 Introduction – Enseigner les protistes L’apparition 49des protistes : les premiers eucaryotes Schéma arborescent 50de la leçon « L’apparition des protistes » Les protistes à étudier en 63 65 Ressources pour l'étude des protistes Guide de68 classe prononciation des termes relatifs aux protistes 70 Chapitre 5. Le règne fongique 71 Introduction - Enseignement sur les champignons : L'avènement du règne fongique 71 72 Diagramme arborescent de la leçon « L’avènement du règne fongique » 78 Informations complémentaires sur le règne fongique 79 Embranchements du règne fongique 85 Illustrations de champignons 88 Questions de recherche et suggestions d'activités 95 Ressources pour l'étude des champignons 96 Guide de prononciation des termes du règne fongique 98 5 Chapitre 6. Le règne animal 99 99 Introduction - Enseignement du règne animal L'avènement du règne animal 100 108 Diagramme arborescent pour la leçon « L’avènement du règne animal » Informations complémentaires sur le règne animal Guide de prononciation des termes du règne animal Les 110 113 embranchements du règne animal 114 123 Principaux groupes au sein des embranchements du règne animal Ressources pour l'étude du règne animal 125 Chapitre 7. Le règne végétal 131 Introduction - Enseignement du règne végétal L'avènement du règne végétal 132 131 Diagramme arborescent pour la leçon « L’avènement du règne végétal » 142 Informations complémentaires sur le règne végétal 144 Les principaux groupes du règne végétal 146 Spécimens et collections du règne végétal Questions 155 d'étude et suggestions d'activités 157 Guide de prononciation des termes du règne végétal 159 Ressources pour l'étude du règne végétal 160 Résumé des noms et des faits relatifs au règne végétal 167 Chapitre 8. Qu'est-ce qu'un virus ? Introduction des virus Une histoire sur les virus 163 167 168 Résumé des caractéristiques virales ; 170 Illustration 172 : Virus animaux ; 173 Comment « tuer » un virus ; Virus géants ; Images de virus 174 Comment les virus se répliquent 176 Modèle d'un adénovirus 177 Noms des virus et leur signification Classification des 180 virus 182 Quelques virus particuliers 183 Enquête sur les maladies virales 184 Glossaire des virus 185 Ressources pour l'étude des virus 186 Suggestions pour la fabrication d'un modèle de coronavirus 188 Annexe : Illustrations pour les récits de l’avènement des royaumes 6 189 Chapitre 1 Enseigner la diversité de la vie Ce que vous trouverez dans ce livre Les règnes du vivant connectésCe document contient des informations destinées aux enseignants du primaire et du collège, afin de les aider à initier leurs élèves à la diversité et aux interconnexions du vivant et de leur fournir un cadre pour approfondir leurs connaissances. Il présente les avancées récentes en matière de connaissances et d'approches pour l'étude des sciences de la vie. Il permet aux enseignants d'avoir une compréhension plus approfondie du sujet que leurs élèves, afin de les guider vers des explorations enrichissantes. On y trouve des suggestions de leçons d'introduction, accompagnées de tableaux, ainsi que des idées d'activités et de recherches pour les élèves. La classification biologique a connu de nombreuses évolutions ces dix dernières années, et d'autres changements sont encore à venir. Il est cependant essentiel d'intégrer certaines de ces évolutions dans nos programmes scolaires. Il n'existe pas de classification définitive et absolue. Une classification basée sur les grands domaines du vivant constitue néanmoins un excellent point de départ. Les enfants ont besoin d'appréhender la diversité du vivant dans son ensemble. Ils peuvent néanmoins continuer à étudier les trois règnes reconnus : les champignons, les animaux et les plantes.Nous devons simplement proposer une vision différente des royaumes. - une approche phylogénétique ou par arbre généalogiqueCela peut offrir aux enfants une perspective importante sur les liens qui unissent toute vie et son origine commune. Ils comprendront également mieux le cours de la vie à travers le temps. La première partie de cet ouvrage propose une série de questions, réponses et suggestions pour définir différentes approches de l'étude de la diversité du vivant. Le chapitre 2, « Les caractéristiques des principaux groupes du vivant », compare les propriétés fondamentales et les définitions des règnes et autres organismes que nous regroupons pour l'étude. Il peut servir de support de révision pour les enseignants et d'exercice pour les élèves du secondaire. Les chapitres 3 à 7 traitent respectivement des procaryotes, des protistes, des champignons, des animaux et des plantes. Chaque chapitre débute par un récit intitulé « Apparition du règne (ou du groupe) ». Ces récits présentent aux enfants l'origine du règne ou du groupe, ainsi que les principaux lignages qui le composent. Les enfants ont besoin de plus qu'une simple histoire ; c'est pourquoi ces chapitres incluent des instructions pour réaliser des schémas phylogénétiques, accompagnés d'illustrations des organismes représentatifs. L'annexe contient un jeu de cartes photographiques en couleur pour ces schémas. Vous pouvez les détacher et les utiliser comme fiches à placer sur les schémas. Si vous avez besoin de davantage de cartes en couleur, vous pouvez acheter un fichier à imprimer vous-même sur le site web de Big Picture Science (www.bigpicturescience.biz). Veuillez noter que les illustrations de photomicrographies électroniques restent en noir et blanc, car je ne les ai pas colorisées. Ces chapitres contiennent des informations complémentaires sur les organismes, des suggestions d'activités et d'explorations, ainsi qu'une sélection de ressources pédagogiques. J'ai consulté les ouvrages et les sites web mentionnés. Les diagrammes arborescents aideront les enfants à découvrir les principaux lignages de chaque règne ou groupe, ainsi que leurs relations. Nombre de ces lignages ne correspondent pas à une hiérarchie linnéenne, comme une classe ou un ordre. Certains lignages ont été nommés récemment. Leurs noms peuvent paraître étranges et inconnus. Fournir leur traduction française (étymologie) permettra de mieux les comprendre et de les mémoriser plus facilement. Un dictionnaire indiquant l'étymologie des mots est indispensable pour l'étude des sciences. Le chapitre 8 aborde une question fréquemment posée lors de l'étude de la diversité du vivant : « Qu'est-ce qu'un virus ? » Il présente des informations de base sur les virus, leur mode de réplication et leur classification. Une section consacrée aux images virales et à leur obtention aidera les enfants à comprendre les images qu'ils voient dans les livres ou sur Internet. 7 Questions sur les royaumes, les domaines et l'Arbre de Vie Devrions-nous utiliser les règnes pour classer le vivant ? Les biologistes n'utilisent plus les systèmes de classification à deux, cinq ou six règnes. Les règnes ne permettent pas de classer tous les êtres vivants, mais trois règnes restent valides : les champignons, les animaux et les plantes. Ils représentent simplement trois des plus grandes branches de l'arbre de la vie, mais ils ne constituent pas l'intégralité du vivant connu. Actuellement,Il est important que les enfants voient et utilisent la classification par arbre évolutifIls peuvent commencer leur étude de la diversité du vivant par une vue d'ensemble de l'Arbre de la Vie et poursuivre ensuite avec l'étude de lignées spécifiques, comme les règnes des champignons, des animaux et des plantes. Je vous recommande de ranger vos tableaux de règnes – surtout ceux avec des rangées de cases régulièrement espacées – et de ne les ressortir que pour les leçons sur l'histoire de la classification. Qu’est-il advenu des anciens systèmes de classification des royaumes ? Les biologistes n'utilisent plus la classification en deux règnes – plantes ou animaux – depuis environ 70 ans. Bien que le système des cinq (ou six) règnes ait été largement utilisé pour initier les élèves du primaire à la diversité du vivant, les biologistes l'ont abandonné il y a une vingtaine d'années, lorsqu'une multitude de nouvelles découvertes leur ont permis de comprendre les liens de parenté entre les organismes. Ce changement a profondément modifié les fondements de la classification. Les manuels universitaires comportent encore des chapitres sur deux groupes que l'on combine par commodité (procaryotes et protistes) et sur trois règnes valides (champignons, animaux et plantes), mais ils abordent rarement la question du rang de règne. Quels sont les domaines ? Le système des domaines utilise les Bactéries, les Archées et les Eucaryotes (prononcé you-KARE-eh-ah) comme premières branches du vivant, au lieu des règnes. Il repose sur des notions de biologie cellulaire et de biochimie accessibles dès le collège. Les enfants du primaire peuvent ainsi découvrir l'existence de ces branches du vivant et apprécieront sans doute les histoires sur les organismes fascinants du groupe des Archées. La leçon « L'apparition des Procaryotes », au début du chapitre 3, les préparera à utiliser ce système de classification lorsqu'ils seront prêts à aborder les détails biochimiques. Les domaines sont largement acceptés et ce système est utilisé dans l'enseignement supérieur. L'idée de domaine est née de l'étude des procaryotes, lorsque les informations concernant leurs acides nucléiques ont conduit les scientifiques à identifier deux lignées distinctes : le domaine des Bactéries et le domaine des Archées. Les Archées et les Bactéries ne sont pas des règnes ; elles ne sont pas équivalentes aux règnes végétal, animal ou fongique. Chacun est équivalent à…tous les règnes eucaryotes réunis. Comment la vision de la classification a-t-elle évolué ? Contrairement au système linnéen antérieur, notre classification actuelle tient compte du fait que la vie a une histoire et que certains organismes sont plus étroitement apparentés que d'autres. Les biologistes sont passés à une système de classification naturelle qui intègre l'histoire évolutiveCe système permet de situer chaque organisme dans sa lignée et de montrer ses liens avec le vivant. Son objectif est de regrouper un organisme ancestral et tous ses descendants au sein d'une même lignée. Certaines lignées importantes ne correspondent pas à la classification linnéenne (embranchement, classe ou ordre), mais doivent néanmoins être enseignées. Par exemple, les animaux à quatre membres (ou dont les ancêtres possédaient quatre membres) sont appelés tétrapodes. Cette lignée n'est ni un embranchement ni une classe, mais il s'agit d'un groupe essentiel à connaître. Parallèlement à ce nouveau système, les scientifiques utilisent de nouvelles méthodes pour illustrer la diversité du vivant. Les diagrammes de ramification (aussi appelés arbres évolutifs ou diagrammes phylogénétiques) montrent les relations et les connexions.Mieux que des rangées de cases. (Si vos tableaux de classification présentent des rangées de cases régulièrement espacées, ils omettent des informations importantes.) Chaque branche ou lignée peut être appelée un clade. Souvent, une caractéristique définissant un clade est indiquée sur le diagramme. Les arbres phylogénétiques les plus formels et scientifiques comportent de nombreuses lignes fines, et les branches sont difficiles à suivre. Les diagrammes de ramification que nous utilisons dans les classes de primaire devraient être… 8 Simple et facile à lire. Vous trouverez des exemples de diagrammes arborescents dans les chapitres consacrés à chaque règne. Leurs branches larges leur donnent un aspect plus schématique, mais permettent aux enfants de visualiser et d'apprendre plus facilement les lignées principales. La nouvelle approche peut être qualifiée deClassification de l'Arbre de Vieouphylogénétique(fye-lowgehNET-ik)systématiqueLe terme « phylogénétique » signifie « relatif à l'origine des espèces » et désigne une classification qui intègre l'histoire évolutive du vivant. La systématique, quant à elle, est une classification qui prend en compte les relations de parenté. Pour initier les enfants à la diversité du vivant, on peut leur présenter l'Arbre de Vie. Les leçons sur « L'apparition des règnes » et les schémas arborescents des chapitres 3 à 7 vous seront utiles. En classification phylogénétique, les branches du vivant sont définies par les caractéristiques nouvelles qu'elles possèdent. Par exemple, pour définir les chevaux, on parle de la structure de leurs pattes et de leurs sabots, mais on n'inclut pas les caractéristiques de leurs ancêtres, comme la quadrupédie. Les nouvelles caractéristiques sont décrites commedérivéLes caractéristiques « d’arrière-plan » sont appelées ancestral L'objectif est de se concentrer sur les caractéristiques dérivées de chaque groupe. Lorsqu'on initie des enfants à un domaine de la vie, il est préférable deleur donner les caractéristiques dérivéesqui définissent la lignée. Que montre un diagramme de ramification ? Un diagramme de ramification illustre une hypothèse sur l'évolutiond'une lignée du vivant. Cette hypothèse a été élaborée à partir de toutes les données dont disposent les biologistes sur les organismes, mais les données ADN sont particulièrement importantes. L'ADN est comme un second registre fossile ; il contient les informations nécessaires aux scientifiques pour déterminer les liens de parenté les plus étroits entre les organismes. Sur les diagrammes, les branches indiquent les groupes qui partagent un ancêtre commun récent et sont donc étroitement apparentés. Les espèces actuelles sont placées à l'extrémité des branches. Les enfants doivent apprendre à « lire » ces schémas.Aidez les enfants à comprendre que la vie à l'extrémité des branches est en perpétuelle évolution et que les branches elles-mêmes témoignent de l'histoire de la vie. Notez que les branches des schémas de ce livre sont grandement simplifiées et que chacune peut être développée pour une étude plus approfondie. Consultez le tutoriel sur les diagrammes arborescents à la fin de ce chapitre pour obtenir plus d'informations et de ressources sur l'étude des diagrammes en arbre. Qu’est-ce qui motive tous ces nouveaux groupes et classifications ? Pourquoi ne pas simplement classer selon les structures ? Nous procédons à une nouvelle classification lorsque nous disposons de nouvelles informations. La capacité d'analyser les acides nucléiques et autres molécules cellulaires a permis – et continue de permettre – un afflux considérable denouvelles informationsCes nouvelles données ont transformé la vision qu'ont les biologistes des relations entre les organismes. Elles n'ont pas invalidé toutes nos connaissances antérieures sur leur apparence, mais nous ont plutôt permis de déterminer quelles structures sont les plus importantes pour leur classification. Le problème de la classification basée uniquement sur l'apparence est que des organismes peuvent se ressembler simplement parce qu'ils se sont adaptés aux mêmes contraintes environnementales. Par exemple, certaines plantes des déserts africains ressemblent beaucoup aux cactus, mais elles appartiennent à des familles totalement différentes. Ces deux types de plantes ont des tiges épaisses et épineuses et peu ou pas de feuilles. C'est ce qui leur permet de survivre dans les déserts, mais ces caractéristiques ne signifient pas que ces plantes sont apparentées. Le terme «évolution convergenteCe terme est utilisé pour décrire la situation où des organismes non apparentés se ressemblent en raison de leurs adaptations à un environnement similaire. En revanche, il arrive que des organismes évoluent relativement vite, sous l'effet de pressions environnementales, et que des espèces apparentées présentent des différences notables. Ce processus est appelérayonnement adaptatif Le plus proche parent des grandes plantes hawaïennes à épée d'argent est l'asclépiade, une petite plante de la famille des tournesols originaire des côtes californiennes. Les éléphants sont apparentés aux damans, qui ont la taille d'un lapin. À première vue, rien ne laisse deviner que ces organismes partagent un ancêtre commun. 9 Quels termes devrions-nous utiliser compte tenu de l'évolution des systèmes de classification ? Linné a initié notre système de classification alors que les chercheurs n'avaient répertorié qu'une infime partie des espèces connues aujourd'hui. La découverte de nouveaux organismes a engendré le besoin de nouvelles catégories. Certaines de ces catégories ne portent pas de noms linnéens formels, mais elles n'en demeurent pas moins utiles. Il arrive qu'une même lignée possède plusieurs noms ou plusieurs niveaux taxonomiques (classe, sous-classe, ordre, par exemple). Une règle importante pour choisir le terme à utiliser est :Quels termes seront les plus utiles aux enfants lorsqu'ils rechercheront des informations ?En général, il est préférable de choisir des termes utilisés au niveau pré-universitaire ou pour un public adulte non spécialisé. Les enfants ne liront pas d'articles scientifiques complexes. Utilisez plusieurs termes lorsque des noms anciens et récents sont employés dans les livres destinés aux enfants. N'hésitez pas à utiliser un terme anglais ou générique s'il facilite les recherches d'informations. Dans certains cas, il peut s'avérer plus fiable que le nom scientifique « officiel ». Les grands embranchements du règne végétal constituent un exemple où les noms communs sont plus appropriés que les anciens noms de phylum (divisions). En revanche, les enfants ne pourront pas trouver d'informations sur les lignées ou les classifications récentes s'ils ne connaissent pas le nom scientifique du groupe. Ils devront peut-être effectuer des recherches sur Internet en utilisant les noms plus récents, car nombre d'entre eux ne figurent pas encore dans la littérature jeunesse. Il leur sera probablement utile d'entendre à la fois le terme scientifique et sa traduction. Par exemple, « Edysozoa », une branche du règne animal, signifie « animaux à mue ». Cependant, tous les termes ne se traduisent pas aussi clairement. Vous trouverez quelques exemples de termes plus récents dans la liste ci-dessous. Quels changements ont été récemment apportés aux règnes et aux embranchements ? Les changements font partie intégrante de la classification. Ils reflètent la nature dynamique des sciences. Les élèves doivent apprendre les termes qu'ils rencontreront dans les encyclopédies et la littérature jeunesse actuelles, et non des appellations obscures ou obsolètes. Par ailleurs, les publications plus anciennes peuvent contenir des informations utiles sur les organismes, et il est pertinent de connaître les anciennes classifications. Voici quelques suggestions d'évolution pour les leçons sur la classification. Les procaryotesAnciennement appelés « Règne des Monères », les procaryotes se divisent en deux branches distinctes : les domaines des Bactéries et des Archées, qui n’ont probablement pas d’ancêtre commun. Voir cidessous des suggestions de regroupements de bactéries et d’archées. Leur organisation cellulaire procaryote justifie leur regroupement pour l’étude, même s’ils ne sont pas étroitement apparentés. Autrefois connus sous les noms d’archéobactéries et d’eubactéries, ces termes sont désormais obsolètes. Il est recommandé d’abandonner les appellations obsolètes « Règne des Monères » et « Règne des Procaryotes », sauf à titre de référence historique. Les protistesLe règne des protistes (anciennement « Règne des Protistes ») est un ensemble d'expérimentations naturelles sur la cellule, encore en évolution. La section ci-dessous présente des sous-groupes susceptibles d'intéresser les étudiants. Commencez par des sous-groupes simples et laissez les étudiants approfondir le sujet s'ils le souhaitent. Une classification actuelle divise les protistes en supergroupes eucaryotes. Pour plus de détails, consultez le chapitre 4, « Les Protistes ». La raison pour laquelle les protistes ne sont pas appelés « Règne Protista » est qu'ils n'incluent pas tous les descendants de leur ancêtre commun. Techniquement, les règnes végétal, animal et fongique seraient également inclus si l'on regroupait tous les descendants en un seul règne. Les guillemets autour de « Règne Protista » sur l'Arbre de Vie indiquent qu'il ne s'agit pas des véritables règnes : animal, fongique et végétal. Règne des champignonsL'ancien embranchement des Zygomycètes a été divisé en plusieurs nouveaux groupes. Les principaux groupes du règne des champignons comprennent désormais les chytridiomycètes, les mucoromycètes, les gloméromycètes, les ascomycètes et les basidiomycètes. Les champignons dits inférieurs, tels que les oomycètes et les myxomycètes, sont des protistes et non de véritables champignons. Les lichens sont considérés comme des champignons car leur forme est déterminée par leur composante fongique. Presque tous les lichens contiennent des ascomycètes. Pour plus d'informations, veuillez consulter le chapitre 5, « Le règne des champignons ». 10 Règne animal–Il existe plus de 30 embranchements d'animaux, dont beaucoup sont petits et peu connus. Commencez par les embranchements communs que les enfants peuvent observer, vivants ou en images. Les biologistes regroupent les embranchements animaux selon leur phylogénie (les relations de parenté) en lignées telles que les protostomiens et les deutérostomiens. Les embranchements animaux ne doivent pas être représentés par une rangée de cases équidistantes. Le nom de l'embranchement des coraux et des méduses est Cnidaria. Utilisez ce nom et le terme générique « cnidaires », et non l'ancien nom « coelentérés ». Assurez-vous qu'aucun protozoaire ne figure dans vos supports pédagogiques sur le règne animal. Supprimez d'ailleurs le terme « protozoaire » de tous vos supports. Il signifie « premiers animaux » et n'est plus utilisé par les biologistes. Utilisez plutôt le terme « protiste ». Pour plus d'informations, consultez le chapitre 6, « Le règne animal ». Règne végétal–Ce règne commence avec les bryophytes. Veillez à ce que vos supports pédagogiques sur le règne végétal ne présentent pas de champignons. Les images ont un impact, et les champignons devraient être associés à leur règne frère, celui des animaux. Comme expliqué dans cet ouvrage, les membres du règne végétal vivent soit sur terre, soit descendent d'organismes ayant vécu sur terre. Les algues sont abordées dans la section consacrée aux protistes. Sur le tableau, les plantes terrestres commencent par l'étiquette « embryophytes ». Les algues vertes et les plantes forment une lignée, appelée Viriplantae. Ce concept plus inclusif de plantes vertes nécessite une compréhension préalable des plantes et des algues. Il est préférable de familiariser les élèves avec ces groupes fondamentaux séparément avant d'aborder des notions plus avancées. Pour les études introductives, il est conseillé de définir les plantes comme des organismes adaptés à la vie terrestre. Consultez le chapitre 7, « Le règne végétal », pour plus d'informations sur les lignées actuelles. Quelles subdivisions les enseignants doivent-ils présenter pour chaque règne ou groupe ? Pour commencer, il nous faut une vue d'ensemble assez simple. Dans les pages suivantes, je propose des subdivisions pour chaque groupe ou règne. Concernant les procaryotes et les protistes, j'ai prévu deux niveaux de complexité adaptés aux enfants d'âges et de niveaux différents. Vous trouverez des informations complémentaires dans les leçons « L'avènement du règne (ou du groupe) » au début des chapitres 3 à 7. Notez que, pour les bactéries, les subdivisions énumérées ci-dessous ne représentent qu'un infime échantillon de leur diversité. Les microbiologistes continuent de découvrir les lignées, dont il existe au moins 30. La classification formelle des bactéries reposant sur des caractéristiques biochimiques qui ne sont pas facilement compréhensibles pour les jeunes enfants, je n'ai présenté que quelques groupes, notamment ceux qui jouent un rôle essentiel dans le cycle de la vie. Informez les enfants qu'il existe bien d'autres types de bactéries. 11 Règnes et lignées avec des exemples d'organismes Remarque : Consultez les chapitres consacrés à chaque royaume pour obtenir les listes de prononciation. Les procaryotes(anciennement « Royaume Monera ») Avec 90 % de la diversité des procaryotes, le domaine des Bactéries est une branche du vivant bien plus vaste que celle des Archées. Certaines bactéries vivent à des températures élevées (thermophiles, « qui aiment la chaleur »), mais les archées sont les championnes de la thermophilie. On trouve des informations sur les archées sous le terme « extrêmophiles » (« qui aiment les conditions extrêmes »). Il existe aussi des archées qui vivent dans des conditions plus normales, comme dans l'océan, le rumen des vaches, la bouche humaine et le sol. Les bactéries comptent davantage d'espèces faciles à cultiver et sont souvent pathogènes. Par conséquent, leur classification est beaucoup plus poussée. Aperçu des procaryotes - groupes fonctionnels Bactéries – cyanobactéries, fixatrices d'azote, sporulantes, oxydant le soufre (préparent la nourriture pour la vie aux sources hydrothermales des grands fonds marins), les bactéries pathogènes (responsables de maladies), les bactéries lactiques (fermenteuses utilisées pour fabriquer le yaourt et le fromage), les décomposeurs qui purifient notre eau Archées – halophiles (qui aiment le sel), hyperthermophiles (qui aiment les températures extrêmes), méthanogènes (générateurs de méthane) Bactéries–Plus de détails sur quatre grands groupes parmi plus de 30 Cyanobactéries – Bon nombre de ces producteurs d'oxygène essentiels sont des bactéries plus grandes que la moyenne. Elles possèdent Chlorophylles vertes et pigments bleus. Beaucoup possèdent également des pigments rougeâtres. Les chloroplastes et les cyanobactéries partagent un ancêtre commun. Bactéries Gram-positives – Elles sont ainsi nommées en raison de leur coloration lors du test de Gram, qui Cela montre qu'ils possèdent des parois cellulaires épaisses. Ils comprennent d'importants décomposeurs, des habitants communs de la peau saine et des pathogènes notoires tels queStaphylocoque,Streptocoque,ClostridiumCertaines forment des endospores, des structures de résistance qui peuvent survivre à l'ébullition et au séchage, et résistent à de nombreux désinfectants. D'autres sont utilisées pour la fabrication de yaourts et de fromages. Protéobactéries – Ce vaste groupe comprend des bactéries fixatrices d'azote et d'autres bactéries clés des cycles. de soufre et d'azote ; bactéries communes vivant dans le bas de l'intestin humain, notammentEscherichia coliet des bactéries apparentées ; de nombreuses bactéries pathogènes, dont l’agent du choléra ; les bactéries sulfureuses pourpres, qui réalisent la photosynthèse sans libérer d’oxygène ; les spirilles, bactéries spiralées rigides ; et un grand nombre de bactéries du sol et de l’eau. Ce groupe est Gram négatif, ce qui signifie que sa paroi cellulaire présente une structure différente de celle des bactéries Gram positif. Les mitochondries partagent un ancêtre commun avec un groupe de protéobactéries. Spirochètes – Ces bactéries spiralées flexibles comprennent l'agent de la maladie de Lyme, ainsi que des bactéries courantes Bactéries aquatiques non pathogènes. Elles font partie des rares bactéries reconnaissables à leur forme. Archées–Les deux lignées principales sont les protéoarchéotes–, y compris les crénarchéotes– (hyperthermophiles, Les organismes marins et terrestres, ainsi que les euryarchéotes (méthanogènes, halophiles, thermophiles), font encore l'objet de recherches sur leur lignée. Les Protistes (anciennement « Royaume Protiste ») Introduction simple pour les plus jeunes enfants • Donnez aux enfants des cartes illustrées montrant une variété de protistes, notamment des ciliés, des amibes, des algues vertes, des algues rouges, des algues brunes, des diatomées, des euglènes et des myxomycètes. • Inclure une étiquette indiquant « Branches des protistes » et une brève description de chaque organisme. 12 Les quatre supergroupes eucaryotes, tels que déterminés par l'ADN et d'autres analyses 1. Amorphea (anciennement appelées Unikontes) Opisthokontes – protistes possédant un seul flagelle postérieur, incluant les flagellés à collerette (choanoflagellés) ; le règne fongique et le règne animal. Amoebozoa – Amibes libres, avec ou sans test (coquille), en eau douce et en milieu marin habitats; amibes parasites qui causent des maladies intestinales (Entamoeba,Acanthamoeba); amibe géante (Pelomyxa); les myxomycètes cellulaires (y comprisDictyostelium); et les myxomycètes plasmodiaux (y comprisPhysaria). 2. Archaeplastida – les algues rouges (rhodophytes) et les algues vertes (chlorophytes et charophytes). Le règne végétal s'est développé à partir de la branche des charophytes, qui appartient aux algues vertes. 3. Lignée SAR (issue des straménopiles, des alvéolés et des rhizaires) Straménopiles – algues brunes, diatomées, algues dorées, oomycètes et myxomycètes. Alvéolés – apicomplexes (parasites du paludisme et autres), ciliés et dinoflagellés. Rhizaria – foraminifères, radiolaires, héliozoaires, tous possédant des pseudopodes filiformes et des coquilles composées de minéraux tels que la silice ou le carbonate de calcium ; amibes vertes formant des réseaux (Chlorarachnea). 4. Excavata – Euglenozoa (euglènes et kinétoplastidés – ces derniers incluent les trypanosomes, responsables de la maladie du sommeil africaine) ; Métamonades (Giardia,Trichomonaset d'autres protistes dépourvus de mitochondries) De plus, certaines petites lignées ne sont pas clairement positionnées sur l'arbre de la vie. Les protistes recèlent de nombreuses expériences naturelles sur la manière de devenir une cellule eucaryote. Le règne des champignons ou règne des champignons Les premières branches des champignons Champignons à zoospores – chytrides (décomposeurs de pollen et de poils ; pathogènes des plantes, des insectes, et les grenouilles). Il existe d'autres lignées, mais les chytrides constituent une bonne introduction. Mucoromycètes, embranchement des Mucoromycota (anciennement partie des Zygomycota) Sous-embranchement des Mucoromycotina –Rhizopus(moisissure noire du pain),Pilobolus(champignon lanceur de chapeaux). Sous-embranchement des Glomeromycotina – les champignons AM, qui forment des mycorhizes arbusculaires. On les trouve sur les racines de la plupart des plantes herbacées et de certaines plantes tropicales ligneuses. Les Zoopagomycètes – une autre petite lignée des anciens Zygomycètes, non représentée dans ce livre Diagramme de l'Arbre de Vie – parasites d'insectes, d'amibes et de petits animaux dans le sol Sous-règne Dikarya (ancien nom : Dikaryomycota), les champignons dicaryotiques, qui possèdent des noyaux provenant de deux individus différents dans leurs cellules pendant une grande partie de leur cycle de vie. Ascomycètes –Pénicillium,Aspergillus, champignons en forme de coupe, morilles, lichens Basidiomycètes – champignons, moisissures, rouilles, charbons ; les champignons qui forment des mycorhizes avec les arbres dans les climats tempérés Le règne animal ou règne animalia Embranchement des Porifères (éponges) Eumétazoaires Radiata – les animaux à symétrie radiale – une description, mais pas un clade Embranchement des Cténophores (cténophores, noix de mer) Embranchement des Cnidaires (anémones, méduses, hydres) 13 Le règne animal (suite) Eumétazoaires (suite) Bilatériens – les animaux à symétrie bilatérale Protostomiens (« bouche en premier ») Spiralia Embranchement des Plathelminthes (vers plats, douves, ténias) Embranchement des Rotifères (rotifères) Lophotrochozoaires Embranchement des Mollusques (mollusques) Embranchement des Annélides (vers segmentés, vers de terre, sangsues) Ecdysozoaires, les animaux à mue Embranchement des Nématodes (vers ronds, nématodes) Embranchement des Arthropodes (arthropodes) Deutérostomiens (« bouche en second ») Embranchement des échinodermes (Echinodermata) Embranchement des chordés (Chordés) Le règne végétal ou règne Plantae Les principaux groupes de plantes, traditionnellement appelés divisions ou embranchements, ont évolué au cours des vingt dernières années. La liste ci-dessous présente la nouvelle classification phylogénétique, et il est important d'initier les enfants à ces groupes. Les noms communs peuvent être plus parlants pour eux que les termes scientifiques, en attendant qu'un nouveau système soit adopté par les chercheurs. Le système le plus répandu aujourd'hui est la classification de l'Angiosperm Phylogeny Group (APG), qui n'utilise pas de termes de rang supérieur à l'ordre (ni classes ni embranchements). Bryophytes, aussi appelées plantes non vasculaires Anthocérotes Hépatiques Mousses Les trachéophytes, les plantes vasculaires Lycophytes – lycophytes, mousses à pointes, isoètes Les euphyllophytes, « les vraies plantes à feuilles » Clade des fougères, Polypodiopsida (monilophytes, ptéridophytes) Les prêles, les prêles Fougères à psilotes et fougères à grappes (ophioglossidées) Vraies fougères, les fougères leptosporangiées, Polypodiidae Les plantes à graines, les spermatophytes Gymnospermes Cycadées Ginkgo conifères Gnétophytes Les angiospermes, les plantes à fleurs Les monocotylédones, les eudicotylédones et les magnoliidées, ainsi que plusieurs petites branches primitives appelées les angiospermes basales 14 Un tutoriel sur les diagrammes de branchement Les diagrammes arborescents représentent l'histoire évolutive et les relations entre groupes d'organismes. À l'instar des lettres sur une page, ces diagrammes sont lisibles. Les informations ci-dessous vous aideront à comprendre les données codées dans les diagrammes arborescents. Ces diagrammes sont appelés arbres phylogénétiques ou phylogénies. On les désigne également sous les noms de cladogrammes, arbres phylogénétiques ou encore arbres familiaux. Les diagrammes de branchement peuvent être représentés de plusieurs manières. Les diagrammes ci-dessous illustrent tous la même chose. B C B C UN UN UN B C Alors que les publications scientifiques utilisent généralement le schéma de droite, la version simplifiée, de type « dessin animé », à gauche, est plus facile à comprendre pour les débutants. J’utiliserai le schéma central pour illustrer les différentes parties d’un diagramme arborescent. UN B C Ancêtres de l'organisme C Le changement des caractéristiques donne naissance à de nouvelles espèces. Ancêtres communs des organismes B et C. Ancêtres communs des organismes A, B et C Les lettres A, B et C symbolisent des groupes d'organismes actuellement vivants. Le terme scientifique pour « actuellement vivant » est «existantLes organismes actuels sont placés à l'extrémité des branches. A, B et C, dans le diagramme ci-dessus, représentent des espèces, mais ils pourraient aussi symboliser des genres, des familles, des ordres, des classes ou des embranchements. Les branches montrent les ancêtres de A, B et C, ainsi que tous les organismes ayant partagé ces ancêtres mais qui se sont éteints. Un point de bifurcation est appelé unnœudLe nœud situé sous B et C est encerclé. Les nœuds symbolisent une modification génétique au sein de la population d'organismes ancestraux, créant une nouvelle lignée porteuse de cette nouvelle caractéristique. Ces nouvelles caractéristiques sont appelées mutations.dérivé traits. Les caractéristiques de l'ancêtre sont décrites commeancestralcaractéristiques. Il est important de connaître les caractères dérivés qui définissent une lignée. On peut les représenter sur des diagrammes de ramification. Si le groupe A symbolise les amphibiens, et les groupes B et C les reptiles et les mammifères, on pourrait placer un repère sur le segment de l'ancêtre commun de B et C et l'intituler « ponte d'œufs sur la terre ferme ». Un repère sur la branche des mammifères pourrait être intitulé « production de lait ». Cependant, ce n'est pas toujours aussi simple. Certains caractères dérivés sont des séquences d'ADN, difficiles à représenter sur un diagramme. 15 B et C sont appeléssœurDeux groupes issus d'une même lignée ancestrale sont appelés groupes frères. Ces groupes n'ont pas nécessairement la même taille ; l'un est souvent beaucoup plus grand que l'autre. On dit alors qu'un groupe est un groupe frère. basalElle appartient à la lignée B et C car elle s'est séparée plus près de la base du diagramme ; elle s'est séparée des lignées B et C. Un groupe basal peut être plus grand ou plus petit que les autres groupes. Les branches basales continuent d'évoluer après leur séparation. Par exemple, les nénuphars constituent une branche basale des plantes à fleurs. Les nénuphars ont continué d'évoluer après leur séparation. Les plus anciens fossiles de nénuphars que nous avons trouvés présentaient de minuscules fleurs. Les nénuphars actuels ont de très grandes fleurs. La disposition des branches sur le diagramme est arbitraire. Le diagramme peut pivoter au niveau des nœuds. Par exemple, B et C pourraient échanger leurs positions sans que cela modifie les informations affichées. Les diagrammes de la page précédente illustrent la situation idéale, avec suffisamment d'informations sur A, B et C pour déterminer l'ordre de leurs ramifications. Dans de nombreux cas, nous ne disposons pas encore d'informations suffisantes pour déterminer quel groupe s'est ramifié en premier. Au lieu de deux branches issues d'un nœud, les diagrammes doivent alors représenter plusieurs branches disposées en palmette. Lorsque davantage d'informations seront disponibles, ces multiples branches seront redessinées afin de n'afficher que deux branches par nœud. L'idéal serait de regrouper un ancêtre, tous ses descendants, et uniquement ses descendants, au sein d'un même groupe. G H je D E F Les groupes G et H sont frères, de même que les groupes E et F. Les lignées G, H et I forment ensemble un groupe frère des lignées D, E et F. Si les positions de G et H étaient inversées, le diagramme indiquerait la même information. Ce que les enfants doivent savoir sur les graphiques des leçons sur « L’avènement des royaumes » Les branches représentées sur les graphiques des règnes constituent une hypothèse sur l'histoire de la vie. Elles indiquent quels groupes d'organismes sont plus étroitement apparentés et lesquels le sont plus éloignés. On peut retracer la lignée de chaque organisme jusqu'à l'origine de son règne ou domaine, voire jusqu'à l'origine de la vie. Chaque organisme représenté à l'extrémité des branches est un organisme vivant. Les branches symbolisent les ancêtres de ces organismes. Chaque branche possède des caractéristiques qui la distinguent des autres et de ses ancêtres plus éloignés. Si vous observez un groupe de branches issues d'une seule, cela signifie que nous ne disposons pas d'informations suffisantes pour déterminer l'ordre d'évolution des groupes. Par exemple, nous ignorons encore les liens de parenté entre toutes les lignées de plantes à graines ; elles sont donc toutes représentées comme issues d'un ancêtre commun. Les lignées représentées sur les tableaux peuvent être développées pour afficher davantage de branches. Par exemple, chez les plantes à fleurs, on trouve de nombreuses lignées de monocotylédones, d'eudicotylédones, de magnoliidées et d'angiospermes basales. Les extrémités des branches du tableau du règne animal représentent les embranchements. Chaque embranchement comprend plusieurs autres branches, dont certaines sont des classes. Il n'est pas toujours possible d'attribuer une étiquette linnéenne à une branche. Il existe davantage de niveaux de ramification que de catégories linnéennes. Cependant, l'extrémité des plus petites branches représente les espèces, et ces espèces continuent d'évoluer. Ressources Internet pour en savoir plus sur les diagrammes de branchement((consulté en janvier 2022) « Qu'est-ce qui s'est passé ? »T. rex« Quel goût ? » est un excellent tutoriel pour les enfants :https://evolution.berkeley.edu/ teachresources/what-did-t-rex-taste-like/ethttp://www.ucmp.berkeley.edu/education/explorations/tours/ Trex/ L’ouvrage « Systématique phylogénétique » comprend une section consacrée à la lecture des diagrammes d’arbres phylogénétiques :https:// evolution.berkeley.edu/ phylogenetic-systematics/ Le Musée américain d'histoire naturelle possède un site pour enfants qui comprend des informations sur l'arbre de la vie et un tutoriel sur la lecture des phylogénies :https://www.amnh.org/ology/features/treeoflife/index.php 16 Leçon principale : Présentation de l’Arbre de Vie Voir l'annexe pour la version couleur de cette illustration. Dimensions réelles du graphique : 39 × 71 pouces (99 × 180 cm). La première leçon sur la diversité du vivant est une introduction à l'arbre de vie. Matériels • Vous aurez besoin du compositediagramme de l'Arbre de ViePour cette leçon, vous pouvez télécharger le fichier à imprimer sur le site web de Big Picture Science (www.bigpicturescience.biz) – voir l'illustration miniature ci-dessus. Plusieurs méthodes permettent de réaliser le tableau. Vous pouvez apporter le fichier à un imprimeur pour le faire imprimer et plastifier. Je vous déconseille de l'imprimer sur un support durable comme le vinyle, car le tableau risque de se déformer au bout de quelques années. Vous pouvez également projeter l'image sur un mur, la reproduire sur du papier et la colorier. • Vous aurez également besoin ducartes illustréesCes cartes sont placées sur les rectangles colorés aux extrémités des branches. Un jeu est inclus dans ce livre, en annexe. Découpez les cartes au ras de l'image, sans marge blanche. Elles s'inséreront parfaitement dans leurs cases et la légende restera visible si elles n'ont pas de bordure. Si vous avez besoin d'exemplaires supplémentaires, vous pouvez acheter un fichier à imprimer sur le site web Big Picture Science. REMARQUE : il vous sera beaucoup plus facile de donner cette leçon si vous avez déjà placé les cartes sur le schéma de l'Arbre de Vie à plusieurs reprises afin de vous familiariser avec ce matériel. Suggestions de leçons • Déroulez le tableau sur le sol et invitez les enfants à participer à uneleçon sur les multiples formes de vieAidezles à placer les cartes sur le tableau pour cette première leçon. Plus tard, ils pourront les placer eux-mêmes. Au dos de chaque carte, le premier mot en gras indique le groupe : bactéries, archées, protistes, champignons, animaux ou plantes. Le deuxième mot en gras indique la lignée : mollusques, par exemple. • Une fois les cartes en place, dites aux enfants que ceci estune illustration de l'Arbre de VieIl montre comment les biologistes représentent les types d'êtres vivants et leurs relations. Ce tableau contientun lieu pour tous les organismes vivantsLes petits carrés colorés représentent la vie actuelle, c'est-à-dire les organismes vivants aujourd'hui. Sur ce type de diagramme, les biologistes placent les organismes actuels à l'extrémité des branches. Les branches situées en dessous symbolisent les ancêtres de la vie actuelle. Ce diagramme donne une notion du temps : les ancêtres se trouvent à la base, tandis que les formes de vie plus récentes sont situées à l'extrémité des branches. 17 • Invitez les enfants àNommez un être vivant, et puisindiquer où il se situerait sur le graphiqueQue ce soit dans les rectangles ou sur une branche voisine, demandez aux enfants de citer des exemples. La plupart des organismes qu'ils nomment sont probablement des vertébrés. Soyez prêt à les inciter à donner des exemples de plantes, de champignons ou de protistes. Si les enfants donnent des exemples qui ne figurent pas sur le tableau, comme les tardigrades, montrez-leur les plus proches parents. (Les tardigrades sont étroitement apparentés aux arthropodes ; vous pouvez donc le leur faire remarquer.) S'ils nomment un organisme que vous ne pouvez pas placer sur l'Arbre de Vie, ditesleur que vous les aiderez à trouver sa place. Attirez leur attention sur certaines branches du tableau pour lesquelles personne n'a donné d'exemple. La vie est vraiment très variée ! (Si un enfant cite un virus, expliquez-lui que les virus ne figurent pas sur ce tableau car ils ne sont pas constitués de cellules. Les virus ont besoin d'une cellule hôte vivante pour se reproduire, mais ils ne sont pas vivants au sens propre du terme. Voir le chapitre 8 pour plus d'informations.) • Maintenant, demandez aux enfants de concentrer leur attention sur legrandes lignes noiresqui constituent les branches de l'Arbre de Vie. Sont-ellestout connectéOui, tout à fait. (Considérez la ligne pointillée reliant les procaryotes aux eucaryotes comme un lien, même si l'on ignore précisément comment la branche des eucaryotes s'est formée.) Toute vie remonte à des ancêtres très anciens, les premières cellules apparues sur notre planète. Y avait-il une seule cellule à l'origine, ou plusieurs ? Nous n'en sommes pas certains, mais il y a probablement eu de nombreuses expériences, car il existe aujourd'hui trois types de cellules différents. À partir de ce ou ces premiers ancêtres, la vie a expérimenté et évolué. Au fil du temps, les nombreuses branches du vivant actuel se sont développées. • Idée importante : l’évolution ne part pas de zéro ; elle modifie la vie préexistante. • Pour les enfants plus avancés, montrez-leur letrois domainesBactéries, Archées et Eucaryotes. Ce sont les premières branches de l'arbre de la vie. Chaque domaine regroupe des cellules dotées de différents « systèmes d'exploitation » : leurs structures sont constituées de molécules diverses. Les domaines classent le vivant selon le type cellulaire. • Maintenant, demandez aux enfants de noter lecontours rectangulaires colorésqui entourent les branches. Expliquez-leur qu'il existe tellement de formes de vie qu'il est nécessaire de diviser l'Arbre de Vie afin de pouvoir l'étudier une partie à la fois. Il y a cinq rectangles de couleur : les procaryotes (bordure violette), les protistes (bordure bleue), le règne des champignons (bordure jaune), le règne animal (bordure rouge) et le règne végétal (bordure verte). • Demandez aux enfants d'observer les branches dans les grands rectangles colorés et de trouver celles quiCommencez avec une seule branche et n'ayez aucune branche qui sorte du cadre.Ils devraient être capables de situer les trois règnes. Demandez-leur quel règne est le plus proche du règne animal. Ils découvriront que le règne des champignons est un règne frère de celui des animaux. Les champignons et les plantes ne sont pas étroitement apparentés, mais autrefois, avant que les biologistes ne connaissent les relations entre les règnes, on les regroupait. Aujourd'hui, les biologistes classent les organismes apparentés ensemble et déterminent leurs liens de parenté en étudiant l'ADN de leurs cellules. • Expliquez aux enfants qu'ils auront l'occasion d'observer plus en détail les branches de chaque bordure colorée au cours des prochaines leçons. Ensuite, invitez-les à s'exercer à placer euxmêmes les images sur le schéma de l'Arbre de Vie. Pour approfondir cette leçon et voir comment elle s'intègre dans une séquence complète de biologie, voir : Leçons de sciences de la vie pour la classe élémentaire MontessoriPar Cynthia Brunold-Conesa. Cet album Montessori présente un parcours complet d'études en biologie, abordant notamment la diversité du vivant. Disponible sur https://georgeconesa.wixsite.com/lifesciencemont. Pour plus d'informations, veuillez envoyer un courriel à [email protected] . 18 Chapitre 2 Caractéristiques des branches de la vie Avant de pouvoir présenter efficacement les branches du vivant, les enseignants doivent avoir une vision claire de leurs similitudes et différences. Les tableaux suivants proposent une comparaison rapide de plusieurs propriétés communes aux êtres vivants. Les enseignants peuvent s'en servir comme support de révision avant d'aborder la diversité du vivant. Les élèves du secondaire peuvent utiliser les titres et effectuer des recherches pour créer leur propre tableau. Ces tableaux peuvent servir de point de départ à une discussion sur les règnes et les autres groupes, ou constituer une activité d'approfondissement après une introduction et des recherches personnelles. Des notes complémentaires sur les propriétés des êtres vivants et des règnes suivent les tableaux. Les guillemets autour d'un nom indiquent que ce groupe ne constitue pas un règne scientifiquement valide. Les procaryotes sont regroupés par commodité, mais ils représentent en réalité deux lignées distinctes. Le nom « Règne des Monères » peut encore apparaître dans les livres pour enfants, mais il n'est plus pertinent pour la recherche d'informations actuelles. Les protistes comprennent certaines lignées d'eucaryotes, mais pas toutes. Ils sont regroupés pour faciliter l'apprentissage, mais ils ne constituent pas un règne. Les trois autres branches – les champignons, les animaux et les plantes – sont des règnes valides car leurs membres descendent tous d'un ancêtre commun. 19 Une comparaison des branches de la vie Groupe Pro- caryotes anciennement "Royaume Monera” Exemples bactéries cellules isolées. Certaines forment des amas ou des Leur ADN n'est pas enfermé dans une filaments, mais si ces structures sont perturbées, chaque membrane. La plupart d'entre elles cellule peut vivre de manière autonome. Certaines cyanobactéries possèdent une paroi cellulaire. Ce sont les possèdent des flagelles, mais les flagelles bactériens plus petites cellules. Leur diamètre moyen sont plus petits et plus simples que ceux des cellules archées est d'un micromètre (0,001 mm), soit un eucaryotes. Ils tournent comme de minuscules hélices au dixième de la taille des plus petites cellules lieu de fouetter comme les flagelles eucaryotes. Les eucaryotes. flagelles des archées sont composés de molécules Bactéries) y compris Archées) anciennement "Royaume Protistes La plupart des archées se développent sous forme de Le Les cellules iriennes sont procaryotes. (Domaine (Domaine Protistes Structure Cellules eucaryotes supergroupes y compris protozoaires, algues, moisissures visqueuses, et moisissures d'eau différentes de celles des flagelles bactériens. Leurs cellules sont eucaryotes. Elles possèdent un noyau et des organites délimités par une membrane. Un cytosquelette étendu contrôle leur forme et leurs mouvements. Certaines possèdent une paroi cellulaire, d'autres non. La composition de ces parois est variable. Certaines espèces se développent sous forme de cellules uniques. D'autres sont des organismes multicellulaires simples. Quelques-unes possèdent des tissus simples, c'est-àdire des assemblages de cellules aux fonctions spécialisées. Certaines espèces unicellulaires présentent les cellules les plus complexes connues. Nombre d'entre elles possèdent des flagelles ou des cils à un stade ou un autre de leur cycle de vie, à l'exception des algues rouges qui en sont dépourvues. La plupart des organismes se développent sous forme Champignon Royaume moisissures, levures, chytrides, morilles, et des champignons Leurs cellules sont eucaryotes. Elles de nombreux filaments multicellulaires ramifiés appelés possèdent un noyau et des organites hyphes, qui constituent le mycélium (corps de délimités par une membrane. Un l'organisme). Les cellules des hyphes ne sont soit pas cytosquelette étendu contrôle la séparées par des parois cellulaires, soit présentent des croissance cellulaire et le pores entre elles, permettant ainsi une communication mouvement des composants intercellulaire du cytoplasme à travers tout le mycélium. cellulaires. Leurs parois cellulaires Les levures se développent sous forme de cellules contiennent de la chitine. isolées. À l'exception des zoospores et des cellules reproductrices des chytrides, elles sont dépourvues de flagelles. Leurs cellules sont eucaryotes. Elles Animal Royaume éponges, possèdent un noyau et des organites vers de terre, délimités par une membrane. Un palourdes, insectes, cytosquelette étendu contrôle leur poissons, et division, leur forme et leurs mammifères mouvements. Leurs cellules sont dépourvues de paroi cellulaire. Leur organisme est multicellulaire et comprend des tissus, des groupes de cellules aux caractéristiques et fonctions spécifiques. Chez la plupart des animaux, les tissus sont regroupés en organes et en systèmes d'organes. Ils possèdent des tissus nerveux et musculaires qui leur permettent de se mouvoir. Au sein de leurs tissus, des substances de liaison comme le collagène assurent la cohésion cellulaire. Leurs cellules sont eucaryotes. Elles Usine Royaume possèdent un noyau et des organites Ce sont des organismes multicellulaires. Ils possèdent délimités par une membrane. Un des tissus, des groupes de cellules qui remplissent des hépatiques, fougères, cytosquelette étendu contrôle le fonctions spécialisées et présentent une apparence conifères, graminées mouvement des composants particulière. Ils possèdent des organes, comme la feuille. cellulaires et la division cellulaire. La plupart possèdent deux systèmes d'organes. Leurs parois cellulaires sont – le système racinaire et le système caulinaire. composées de cellulose. 20 Nutrition Groupe Certains organismes effectuent la Pro- caryotes photosynthèse, mais plusieurs espèces qui la pratiquent ne libèrent pas d'oxygène. Certains utilisent des aliments produits par d'autres êtres anciennement vivants. D'autres peuvent synthétiser "Royaume leur propre nourriture en utilisant Monera” l'énergie des minéraux. Ce dernier processus est appelé chimiosynthèse. Seuls les procaryotes en sont capables. Certains réalisent la photosynthèse. Protistes D'autres ingèrent ou absorbent la anciennement organismes. Certains peuvent faire "Royaume Protistes nourriture produite par d'autres les deux. Certains sont des parasites, qui se nourrissent du corps vivant d'un organisme hôte. Ils utilisent la nourriture produite par d'autres êtres vivants. Ils digèrent leur nourriture à l'extérieur de leur corps et absorbent les nutriments. Champignon Royaume Beaucoup sont des décomposeurs. qui se nourrissent de matières ayant autrefois vécu. Certains sont des parasites d'organismes vivants. Beaucoup forment des mycorhizes, des associations mutualistes avec les plantes. Ils ingèrent (absorbent) des aliments produits par d'autres Animal Royaume êtres vivants et les digèrent (les décomposent). Nombre d'entre eux sont des parasites qui se nourrissent des tissus de leur hôte. Quelques-uns se nourrissent d'algues vivant dans leurs tissus. Presque tous effectuent la photosynthèse. Quelques-uns sont des parasites qui puisent leurs nutriments dans les tiges ou Usine Royaume les racines de leurs hôtes. Certains sont des mycohétérotrophes qui ont perdu leurs chloroplastes et parasitent des champignons. Ils se nourrissent alors des nutriments apportés au champignon par une autre plante. Croissance et reproduction Elles peuvent se diviser toutes les 20 minutes dans des conditions optimales. Presque toutes les espèces se divisent par fission binaire, produisant deux cellules filles identiques. Quelques-unes bourgeonnent ou se divisent en plus de deux cellules filles. Chez les bactéries Gram-positives, certaines espèces peuvent former des endospores lorsqu'elles sont à court de nutriments. Ces structures de résistance sont imperméables à la dessiccation, à la chaleur et aux désinfectants chimiques. L'endospore peut germer et donner naissance à une cellule en pleine croissance lorsque les conditions de vie redeviennent favorables. Leur mode de division est très varié. Les cellules uniques se reproduisent par fission binaire, fragmentation ou sporulation. Certaines fusionnent lors de la reproduction (fusion et échange de matériel génétique). Beaucoup forment des kystes capables de survivre à des conditions défavorables, comme la dessiccation. Nombre d'entre elles présentent des cycles de vie complexes. Le mycélium se développe par division cellulaire aux extrémités des hyphes, s'étendant ainsi dans toutes les directions à partir d'un point central. La reproduction se fait par spores. Les champignons, les morilles et bien d'autres forment de grandes structures visibles, porteuses de spores, au-dessus du sol. Le mycélium à l'origine de ces structures se développe de manière invisible, souvent sous terre. Chez les levures, les cellules filles bourgeonnent à partir d'une cellule mère. Les cellules reproductrices des chytrides sont flagellées ; les formes asexuées sont appelées zoospores. D'autres organismes se reproduisent grâce à des noyaux cellulaires, mais sans spermatozoïdes mobiles. Ils se reproduisent grâce à l'accouplement d'ovules et de spermatozoïdes. L'œuf fécondé se développe en une sphère creuse de cellules appelée blastula, qui se replie ensuite sur elle-même et forme des tissus. Certaines espèces pondent des œufs ; d'autres donnent naissance à des petits vivants. Certains éclosent sous forme de larves et subissent une métamorphose avant de devenir adultes. D'autres commencent leur vie sous forme juvénile, ressemblant à l'adulte mais incapable de se reproduire. Elles se reproduisent par spores ou graines, ou par voie végétative. Leur cycle de vie est complexe et comprend des embryons, cellules ovulaires fécondées qui se développent au sein des tissus de la plante mère. Leur croissance s'effectue à la fois par division cellulaire (comme chez les autres organismes) et par élongation cellulaire. Les cellules en division sont situées dans des tissus appelés méristèmes. Les plantes à fleurs ont souvent besoin d'un partenaire animal pour la pollinisation de leurs fleurs ou la dissémination de leurs graines. Les plantes sans graines nécessitent un film d'eau pour que leurs spermatozoïdes puissent atteindre les cellules ovulaires. 21 Groupe Pro- Habitats Niveaux trophiques dans Âge du premier connu écosystèmes fossiles On les trouve pratiquement partout : dans le sol, dans l’eau et sur d’autres Ils peuvent être producteurs, caryotes organismes. Certaines peuvent se consommateurs ou décomposeurs. Ils Il s'agissait des premières cellules développer dans des partagent le rôle de décomposeurs apparues sur Terre. Les plus anciennement environnements extrêmes, comme majeurs avec les champignons. Dans anciens fossiles datent d'au moins des milieux très salés, très chauds ou certains écosystèmes, ils sont les 3,5 milliards d'années. très acides. Elles vivent sur l’être producteurs primaires. "Royaume Monera” humain et dans son tube digestif. Ils peuvent être producteurs, consommateurs Protistes anciennement "Royaume Protistes On les trouve dans tous les milieux aquatiques et humides. ou décomposeurs. Ils jouent un rôle majeur dans les réseaux trophiques aquatiques. Ils Leur première apparition dans les Dans le sol. Certains sont des symbiotes constituent une source de nourriture archives fossiles remonte à environ vivant dans les tissus humides d'autres importante pour les organismes de plus 1,8 milliard d'années. organismes. grande taille. Ils produisent environ la moitié de l'oxygène terrestre. Des filaments fossiles ont été La plupart sont adaptés à la vie terrestre. découverts dans des dépôts du Ils peuvent pousser dans des endroits humides ou secs. Beaucoup se Ce sont d'importants décomposeurs, Champignon développent sous terre ou dans des capables de décomposer des matériaux Royaume matières végétales en décomposition. complexes comme le bois. Les parasites Certains vivent en parasites sur ou dans sont des consommateurs. Aucun n'est d'autres organismes. Certains vivent en producteur. eau douce ou en eau de mer. Certains Animal Royaume Ils sont adaptés à la vie terrestre. Quelques-uns, comme les Usine Royaume nénuphars, sont retournés à l'eau. Les membres de ce règne sont adaptés à la vie dans des conditions d'humidité très variées, des climats les plus humides aux plus arides de la planète. Dévonien inférieur, des champignons fossiles sont associés aux tiges souterraines des premières plantes terrestres. Toutes les lignées de champignons sont présentes dans les archives fossiles à la fin du lichens poussent sur la roche nue. On les trouve dans l'eau, dans les sols humides et sur la terre ferme. Certains (reptiles, oiseaux, mammifères et certains arthropodes) sont adaptés à une vie entièrement terrestre. Les parasites vivent dans ou sur d'autres organismes. Protérozoïque supérieur. Au Carbonifère. Les fossiles d'éponges et d'animaux La plupart sont des consommateurs, de l'Édiacarien datent de la fin du y compris de nombreux parasites. Précambrien, il y a environ 600 Certains, comme les vers de terre, millions d'années. Les fossiles de la sont des décomposeurs. Aucun n'est plupart des embranchements producteur. animaux apparaissent au début du Cambrien. il y a environ 541 millions d'années. Ce sont eux qui permettent la vie sur terre. Certains ont perdu leur chlorophylle et vivent en parasites. D'autres piègent les insectes et agissent à la fois comme consommateurs et comme producteurs. Leur rôle dans la décomposition est très limité. Il s'agit du règne le plus jeune. Spores fossiles ont été découvertes pour la première fois dans des roches datant du début de la période ordovicienne. Plante vasculaire Les fossiles datent du Silurien. Les fossiles de plantes à graines remontent à plus de 360 millions d'années, à la fin du Dévonien. 22 Groupe Pro- caryotes Les caractéristiques utilisées pour le regroupement traditionnel sont : la structure de la paroi cellulaire (déterminée par la coloration de Gram), la forme cellulaire, • De minuscules cellules qui peuvent vivre de bien des façons différentes la capacité à former des endospores, la capacité à croître anciennement en absence d’oxygène et d’autres caractéristiques "Royaume métaboliques (réactions chimiques que la cellule peut Monera” Phrases descriptives Base pour les grands groupes effectuer). Le regroupement phylogénétique est basé sur • Les inventeurs de la photosynthèse • Elles assurent le cycle de la vie. les séquences de bases de l’ARN et de l’ADN. Les supergroupes d'eucaryotes sont définis par les Protistes anciennement "Royaume Protistes séquences d'ADN et d'ARN. Parmi les autres caractéristiques utiles à leur classification, on peut • Les expériences de la nature sur les multiples citer : la structure cellulaire ; le cycle de vie ; la façons d'être une cellule eucaryote présence et la composition de la paroi cellulaire ; le nombre et le type de flagelles ; la présence de • Des corps simples, mais des cellules complexes chlorophylles et d'autres pigments ; la forme des réserves nutritives ; et le processus de sporulation. Les principaux lignages sont définis par les séquences d'ADN et les structures reproductives (basides ou zygospores, par exemple). Chaque lignage possède un Champignon cycle de vie différent. Le mode de reproduction • Le royaume caché des recycleurs Royaume (sexuée ou asexuée) est important. Si la phase sexuée • Les amis des plantes du cycle de vie est inconnue, le champignon peut être classé grâce à l'information de son ADN ou de son ARN. Les embranchements sont définis par l'organisation et les structures internes du corps. Par exemple : la Animal Royaume structure du système digestif, le type de système circulatoire, le type de tissu de soutien et la présence de segmentation. Chaque embranchement possède un plan d'organisation interne différent. L'analyse des • Les personnes qui bougent, avec leurs nerfs et leurs muscles • Structurellement complexe séquences d'ADN révèle les structures importantes pour la classification. De nouveaux regroupements d'embranchements ont été établis grâce à ces études. Les grandes branches étaient traditionnellement définies par les structures reproductives et autres. Par exemple : la Usine Royaume présence et la structure des tissus vasculaires ; les spores ou les graines pour la reproduction ; la structure du feuillage ; ou la présence de fleurs. Les études d’ADN ont confirmé ces grands groupes et précisé les relations entre • Des collecteurs de lumière solaire qui nourrissent la terre • Elles se constituent à partir de lumière, d'eau, d'air et de minéraux. eux. De nombreuses lignées majeures ne correspondent pas à la classification linnéenne. 23 Autres faits importants Groupe Seules quelques espèces de bactéries sont pathogènes pour l'homme. De nombreux autres procaryotes sont Pro- caryotes indispensables au fonctionnement de la biosphère. Un groupe, les cyanobactéries, a contribué à la formation de l'atmosphère terrestre et participe encore aujourd'hui à son maintien. Les bactéries sont essentielles au cycle de l'azote et d'autres éléments chimiques dans la biosphère. Les mitochondries et les chloroplastes des cellules eucaryotes étaient autrefois des bactéries libres. Les archées possèdent des structures membranaires uniques, différentes de celles anciennement des bactéries et des eucaryotes. Leur processus de synthèse protéique est plus proche de celui des eucaryotes que de "Royaume celui des bactéries. Ces caractéristiques, parmi d'autres, ont conduit les scientifiques à les classer dans un système de Monera” classification distinct : le système des domaines. Il existe trois domaines : les Bactéries, les Archées et les Eucaryotes (qui regroupent tous les eucaryotes). Les bactéries et les archées sont plus différentes l'une de l'autre que les éléphants ne le sont des palmiers ! Les protistes forment un ensemble d'organismes bien plus hétérogène que les règnes proprement dits, ce qui Protistes anciennement "Royaume Protistes rend difficile toute généralisation à leur sujet. Ce groupe recèle les expériences de la nature sur la cellule eucaryote. Certains protistes ont perdu leurs mitochondries. D'autres possèdent des cellules complexes avec deux types de noyaux. Ces organismes unicellulaires sont capables d'accomplir toutes les fonctions d'un animal supérieur. Les ancêtres des règnes végétal, animal et fongique étaient d'anciens protistes. Certains protistes phototrophes (ceux qui réalisent la photosynthèse) vivent à l'intérieur d'animaux aquatiques ou d'autres protistes et contribuent à leur nutrition. Les champignons sont remarquables par les associations qu'ils forment avec d'autres organismes. Les lichens sont des organismes composites formés par l'étroite association de champignons avec des algues ou des cyanobactéries. Ils jouent un rôle pionnier important dans la décomposition des roches lors de la première étape de la formation des sols. Champignon Les champignons forment des mycorhizes, associations vitales avec les racines des plantes. Dans cette symbiose, le Royaume champignon aide la plante à absorber l'eau et les minéraux, et la plante lui fournit des sucres. Les mycorhizes sont présentes chez la plupart des plantes et sont essentielles à la croissance de nombreuses d'entre elles, notamment les conifères. Certains champignons sont des endophytes des feuilles et des tiges. Ils se développent à l'intérieur des tissus de la plante et peuvent l'aider à absorber les nutriments et à résister aux prédateurs. Ces organismes sont les plus complexes structurellement de tous les règnes. Leur comportement est également complexe. Ils possèdent des sens aigus leur permettant de déterminer les conditions de leur environnement et d'y Animal Royaume réagir. Les animaux sont souvent caractérisés par leur structure sociale. Nombre d'entre eux ont coévolué avec les plantes. Ils pollinisent les fleurs et disséminent les graines, et se nourrissent en retour de ces dernières. Beaucoup d'animaux sont des parasites ou des parasitoïdes, notamment sur terre. Dans ces milieux, les nutriments sont souvent transmis d'un organisme à l'autre. Les vertébrés ne constituent qu'une partie d'un seul embranchement du règne animal. On dénombre plus de 30 embranchements animaux décrits ; la plupart sont des vers marins. Toute vie terrestre dépend des plantes, mais rares sont celles qui peuvent survivre sans d'autres organismes. La plupart ont besoin d'un champignon mycorhizien pour absorber les minéraux et l'eau. Nombre d'entre elles nécessitent un Usine Royaume partenaire animal pour la pollinisation de leurs fleurs ou la dispersion de leurs graines. Certaines plantes vivent en symbiose avec des bactéries fixatrices d'azote qui leur fournissent des composés azotés. Contrairement aux animaux, les plantes ne réagissent pas à leur environnement en adoptant les mêmes comportements. Elles se développent plutôt en fonction des conditions et produisent une grande variété de molécules. Ces molécules remplissent de nombreuses fonctions, notamment la défense de la plante contre les herbivores et les maladies. Le règne végétal est sans doute le plus diversifié sur le plan biochimique. 24 Notes sur le tableau comparatif des branches de la vie Cellules Cette section décrit l'aspect général des cellules de ce groupe. Les Remarque : Pour étudier en détail le système des domaines, les cellules procaryotes ne possèdent pas de structures internes élèves doivent maîtriser les bases de la biochimie. L’étude délimitées par une membrane, mais cette dernière peut être approfondie commence généralement au collège ou plus tard. Si repliée à l'intérieur de la cellule. Chez de nombreuses vous souhaitez aborder le système des domaines plus tôt, cyanobactéries, ces replis augmentent la surface photosynthétique, concentrez-vous sur les activités ou le lieu de vie des différents car les molécules responsables de la photosynthèse sont localisées groupes. sur la membrane cellulaire. Bien qu'elles soient dépourvues de membrane nucléaire, les procaryotes possèdent leur ADN concentré dans une zone du cytoplasme, appelée nucléoïde. Les procaryotes possèdent des ribosomes, organites responsables de la synthèse des protéines, et une membrane cellulaire. Toutes les cellules possèdent ces éléments. La plupart des procaryotes possèdent également une paroi cellulaire. La composition des parois et des membranes cellulaires des bactéries et des archées diffère. Les cellules eucaryotes sont plus grandes que les cellules procaryotes (à quelques rares exceptions près – il s'agit d'organismes vivants, et il y a toujours des exceptions). Leur intérieur est complexe et comporte de nombreux compartiments délimités par des membranes, contrairement à celui des cellules procaryotes, plus simple. Tous les eucaryotes ne possèdent pas de mitochondries. Certains protistes parasites ont perdu ces organites producteurs d'énergie, mais leur ADN révèle que leurs ancêtres en possédaient. Quelques-uns abritent dans leur cytoplasme des bactéries qui remplissent une fonction similaire à celle des La plupart des bactéries possèdent une paroi cellulaire composée de peptidoglycane, un complexe d'acides aminés et de sucres. De nombreux antibiotiques inhibent la synthèse de ces parois cellulaires bactériennes et peuvent être utilisés chez l'homme car le peptidoglycane est absent de nos cellules. Les supergroupes eucaryotes présentent de grandes variations dans la composition de leur paroi cellulaire, le type de pigments présents, les substances utilisées pour les réserves nutritives, et même les structures fondamentales qu'ils partagent. Les protistes regroupent une incroyable diversité de cellules. Nombre d'entre elles sont unicellulaires et possèdent des structures et des comportements complexes. Au sein de chaque règne (champignons, animaux et plantes), les cellules partagent la plupart de leurs caractéristiques fondamentales. Leurs membres descendent d'un ancêtre commun, ce qui explique la similarité de leurs cellules. Structure mitochondries. Les cellules eucaryotes possèdent un cytosquelette Cette section explique comment les cellules des organismes sont étendu qui assure le transport des vésicules de substances à l'intérieur associées entre elles et si elles forment des tissus – des groupes de de la cellule et lui permet d'englober des particules ou des gouttelettes cellules possédant une structure et une fonction spécialisées. Il est de liquide. Le cytosquelette est également responsable du important de noter que les protistes multicellulaires ne possèdent fonctionnement des flagelles et des cils. pas les mêmes types de tissus que les plantes. Les cellules du crampon d'une algue brune peuvent différer légèrement de celles Le principe « Plus la lignée est ancienne, plus la variation est grande » se vérifie ici. Les procaryotes diffèrent considérablement au niveau de la biochimie cellulaire la plus fondamentale. Leurs cellules sont toutes procaryotes, mais elles peuvent être divisées en deux lignées très différentes : les bactéries et les archées. Par exemple, ces deux lignées présentent des compositions de membrane cellulaire et des mécanismes de synthèse protéique de son thalle, mais cette différence est minime comparée à celle qui existe entre une cellule racinaire et une cellule foliaire. Lorsqu'une algue multicellulaire commence à se développer à partir d'une spore, ses cellules sont toutes identiques et ressemblent fortement à celles de l'organisme adulte. Contrairement aux plantes, il n'y a pas de stade embryonnaire de développement, où l'œuf fécondé est nourri dans les tissus de l'organisme mère avant d'être libéré. différents. Elles représentent les descendants de deux des trois types cellulaires ancestraux, le troisième ayant donné naissance Les protistes présentent la plus grande diversité structurale. Les aux cellules eucaryotes. Ces types cellulaires sont classés selon le myxomycètes cellulaires, aussi appelés amibes sociales, passent système des domaines, qui comprend le domaine Bacteria une partie de leur cycle de vie sous forme de cellules isolées qui (bactéries et leurs ancêtres), le domaine Archaea (archées et leurs s'assemblent ensuite en une structure multicellulaire. Il existe de ancêtres) et le domaine Eukarya (cellules eucaryotes et leurs nombreux protistes coloniaux, de simples agrégats de cellules ancêtres). capables de vivre individuellement. 25 Structure (suite) Les cellules animales possèdent de nombreuses jonctions ou structures d'assemblage entre elles, ainsi que des substances « collantes » intracellulaires. Ces caractéristiques sont propres aux animaux, ce qui n'est pas surprenant étant donné qu'il s'agit d'organismes multicellulaires complexes dépourvus de paroi cellulaire. «Chimiotrophe« » signifie « distributeur de produits chimiques » ou « Un organisme qui se nourrit d’énergie chimique. » Cela inclut la plupart des bactéries, de nombreux protistes, tous les animaux et tous les champignons. «Autotroph« » signifie « auto-alimenté » et fait référence à Un organisme qui utilise le dioxyde de carbone de l'air pour fabriquer la plupart de ses composants. Les plantes sont Nutrition autotrophes, tout comme les algues et certaines bactéries. Les élèves doivent comprendre qu'il existe des organismes «Hétérotrophe« » signifie « se nourrit des autres » et capables de produire leur propre nourriture (autotrophes) et désigne les organismes qui nécessitent des molécules d'autres qui ont besoin de nourriture produite par d'autres de base fabriquées par d'autres organismes. organismes (hétérotrophes). Les autotrophes que les élèves du Les procaryotes remportent la palme de la diversité des modes de vie. primaire rencontrent sont les photosynthétiques. Les On trouve des phototrophes qui vivent sans oxygène et rejettent du hétérotrophes se divisent en deux catégories : ceux qui absorbent soufre, ainsi que d'autres qui, comme les plantes, rejettent de l'oxygène. les aliments en solution (comme en absorbant un bouillon) et ceux Certains utilisent la lumière comme source d'énergie, mais ont tout de qui ingèrent des particules alimentaires. « Engloutir » signifie même besoin de matière organique pour se développer. qu'une seule cellule absorbe la particule alimentaire. Les amibes Ce sont des photohétérotrophes. C'est comme avoir une plante qui a engloutissent leur nourriture. « Ingérer » signifie qu'un animal besoin de sucre pour fabriquer ses cellules, ce dont aucune plante n'a absorbe la nourriture dans son corps et son système digestif. Nous besoin. Les chimiotrophes comprennent ceux qui utilisent des ingérons les aliments et les digérons. Ensuite, nous absorbons les molécules alimentaires produites par d'autres organismes molécules solubles qui les constituent. Les morceaux solides (chimiohétérotrophes) et ceux qui peuvent synthétiser leur propre d'aliments ne pénètrent pas dans nos cellules. Les protistes nourriture à partir de minéraux (chimioautotrophes, également appelés constituent une autre catégorie : les mixotrophes. Ces organismes chimiolithotrophes). Seuls les procaryotes peuvent être à la fois utilisent les deux modes de nutrition : la photosynthèse et chimioautotrophes et photohétérotrophes. Tous les animaux et les l'hétérotrophie. champignons sont des chimiohétérotrophes. Les élèves doivent connaître les différents modes de nutrition : libre, Les protistes se distinguent des champignons, des plantes et des parasitaire et saprophyte. Les parasites se nourrissent de fluides animaux par le fait que nombre d'entre eux peuvent se nourrir de prélevés sur un hôte vivant. La plupart des parasites sont lumière (phototrophes) ou de substances chimiques microscopiques et chaque espèce abrite au moins quelques parasites. (chimiotrophes). Les euglènes, par exemple, sont des mixotrophes. Parmi ceux-ci, on trouve davantage de parasites que de dinoflagellés libres et de cryptomonades. Chez les organismes non parasites, les saprotrophes se nourrissent de cadavres. Au cours de la phase gamétophyte de leur cycle de reproduction, Les organismes qu'ils n'ont pas tués. Il existe de nombreux certains lycophytes sont hétérotrophes grâce à des champignons, autres termes qui traitent des distinctions nutritionnelles : mais ils ne peuvent pas alterner leur mode nutritionnel comme le prédateur, détritivore, commensal, mutualiste, etc. font certains protistes. Si le sujet de la nutrition et du bien-être vous intéresse, poursuivez votre Croissance et reproduction lecture. Sinon, passez directement à la section sur la croissance et la reproduction. La différence entre la reproduction asexuée et la reproduction sexuée réside dans le fait que, lors de la reproduction asexuée, il n'y a pas Il est important de noter que la nutrition comporte deux aspects. L'organisme d'échange de matériel génétique. De fait, la descendance ne possède a besoin d'une source d'énergie pour assurer le maintien et la croissance de qu'un seul parent. Les modifications du génome sont donc lentes. Lors ses cellules. Il a également besoin d'une source de matière pour constituer les de la reproduction sexuée, la descendance reçoit du matériel génétique éléments de base nécessaires à la fabrication de nouvelles pièces cellulaires. de deux parents. Une variation encore plus importante est générée par Voici quelques termes utiles pour définir la nutrition des organismes : la méiose. Au cours des enjambements chromosomiques, le matériel génétique des deux parents est recombiné pour former de nouvelles «Phototroph« » signifie « nourrisseur léger » ou « celui qui » 26 combinaisons. La reproduction sexuée permet une plus grande « Se nourrit d’énergie lumineuse. » Les plantes, les algues et variation chez la descendance, ce qui augmente les chances de survie de certaines bactéries sont phototrophes. l'espèce face aux changements de son environnement. Les bactéries et les archées se reproduisent de manière asexuée, Habitats mais certaines peuvent insérer une partie de leur matériel asexuées. Tous les champignons libèrent des spores sexuées. Bien que On trouve des bactéries vivant profondément dans la Terre et presque partout à sa surface. Il existe une exception : les milieux très secs où certaines espèces de champignons (xérophiles, « qui aiment la sécheresse ») peuvent se développer. À l’opposé, certains champignons jouent un rôle de décomposeurs dans l’océan. la majorité des animaux se reproduisent sexuellement, la reproduction L'ancêtre des plantes terrestres a quitté l'eau pour s'installer sur la asexuée existe. Par exemple, les anémones de mer et les vers plats terre ferme. Certaines plantes sont retournées vivre dans les peuvent se diviser en deux. Des fragments d'éponges peuvent se milieux aquatiques. À l'instar des mammifères marins, les formes détacher et donner naissance à de nouveaux individus. Les lézards à aquatiques descendent d'ancêtres terrestres. génétique dans un autre procaryote. Ceci permet des mutations rapides, comme le développement d'une résistance à un antibiotique. Le cycle de vie court des procaryotes offre également de nombreuses opportunités de propagation des mutations. De nombreux champignons produisent des spores à la fois sexuées et queue de fouet, exclusivement femelles, sont les animaux les plus complexes à se reproduire de manière asexuée, mais ce mode de reproduction est rare chez les vertébrés. Les plantes se reproduisent souvent de manière asexuée en utilisant des stolons, des tiges Pour les organismes aquatiques, il est important de faire la distinction entre les milieux d'eau douce et les milieux marins. Les contraintes environnementales sont très différentes dans les deux cas. souterraines ou d'autres parties végétatives pour faire pousser de nouvelles plantes. Les trembles poussent en bosquets d'individus génétiquement apparentés. Niveau trophique (alimentation) dans les écosystèmes Des individus identiques se sont formés par reproduction végétative. Cette information offre une autre perspective sur la reproduction. Certaines plantes produisent des graines sans Nous allons aborder la nutrition de l'organisme, en nous concentrant cette La fécondation. Les embryons contenus dans les graines sont des fois sur le flux de nutriments au sein de l'écosystème. Tous les organismes clones de leurs parents. Les pissenlits utilisent ce type de peuvent être classés comme producteurs, consommateurs ou décomposeurs. reproduction, appelé apomixie. Certains appartiennent à plusieurs catégories. Les phototrophes sont les La croissance peut être due à deux processus différents : soit les cellules s’agrandissent, soit elles se divisent et produisent de nouvelles cellules. Même les cellules bactériennes s’agrandissent avant de se diviser. Chez les animaux, les cellules se divisent dans tout le tissu en croissance. Les plantes croissent en pompant de producteurs de la quasi-totalité du vivant. Dans quelques rares écosystèmes, comme les communautés des sources hydrothermales des grands fonds marins et certaines communautés souterraines, ce sont les bactéries chimioautotrophes qui jouent ce rôle. Elles se nourrissent de soufre et, à leur tour, fournissent de la nourriture aux autres membres de la communauté. l’eau dans la vacuole centrale de leurs cellules, ce qui provoque leur allongement. C’est principalement grâce à ce processus que leur Les consommateurs se nourrissent de producteurs et d'autres consommateurs. Les croissance rapide s’accélère. Les racines et les tiges des plantes décomposeurs constituent un sous-ensemble de consommateurs ; ils se nourrissent s’allongent à partir d’un méristème (point de croissance) situé à leur de déchets et les décomposent : organismes morts, débris végétaux comme les extrémité, où les cellules se divisent. La plupart des plantes ont une feuilles mortes et excréments d'animaux. croissance indéterminée de leurs racines et de leurs tiges : elles continuent de croître tout au long de la vie de la plante. Les Âge des premiers fossiles mammifères et les oiseaux ont une croissance déterminée. Les recherches dans ce domaine ont produit des données – ils atteignent leur taille adulte et cessent de grandir. Les poissons, les isotopiques controversées qui pourraient indiquer des processus reptiles, les amphibiens et certains invertébrés continuent de grandir à vitaux il y a environ 3,8 milliards d'années. Des chercheurs ont l'âge adulte. découvert des fossiles de procaryotes dans des roches datant de Les champignons peuvent mobiliser les ressources de leur mycélium et développer rapidement un sporophore, comme celui d'un champignon. Ceci est dû à la présence de cloisons entre leurs cellules, voire à l'absence totale de ces cloisons (septums). plus de 3,4 milliards d'années. Il est probable que des cellules aient existé encore plus tôt. Il est difficile de trouver des fossiles de cellules isolées, sauf si elles formaient de grands agrégats comme les stromatolithes. Les fossiles d'eucaryotes authentifiés datent d'environ 1,8 milliard d'années. Les tests minéralisés (coquilles externes) des protistes sont les fossiles les plus faciles à identifier. 27 Âge des premiers fossiles (suite) En 2000, des paléontologues ont découvert des fossiles qui semblent être des embryons animaux, datant de 609 millions d'années. Il est probable que de nouvelles techniques et des études complémentaires permettront de repousser encore davantage la date des premiers fossiles des règnes eucaryotes. Affirmer que les plus anciens fossiles d'un règne ont une date précise est toujours risqué. Il convient de préciser : « les plus anciens fossiles découverts par les scientifiques ». Critères de division du royaume en grands groupes Les bactéries se développent grâce à certains sucres, produits finaux de fermentation et réactions avec des anticorps. La classification phylogénétique diffère souvent de la classification traditionnelle. Elle révèle des liens de parenté invisibles à partir de la simple structure ou du métabolisme des cellules bactériennes. Les procaryotes sont cependant très difficiles à classer. On peut aider les enfants à découvrir les principaux types de procaryotes sans avoir à les classer de manière très détaillée. Il est important de noter que les embranchements animaux sont basés sur l'ADN et la structure interne (organisation corporelle), mais pas sur les structures reproductrices. Les embranchements des champignons, quant à eux, reposent sur l'étude de l'ADN et des structures Les groupements phylogénétiques regroupent les organismes reproductrices. Les plantes sont classées selon leurs structures descendants d'un ancêtre commun. Ces groupements reposent corporelles et reproductrices, ainsi que selon leur ADN. La plupart des essentiellement sur l'étude de l'ADN, de l'ARN et d'autres molécules botanistes n'utilisent pas la classification par embranchement/division cellulaires. Les procaryotes se divisent en deux grands groupes : les ou par classe. Il est relativement simple d'apprendre les principaux bactéries et les archées. Les eucaryotes pourraient compter jusqu'à lignages végétaux, même s'ils ne sont pas classés selon la hiérarchie 60 groupes phylogénétiques. Leurs membres n'ont pas encore été linnéenne. Les protistes sont classés en fonction de toutes les suffisamment étudiés pour définir tous ces groupements. (Nous informations disponibles, et souvent, cela ne suffit pas ! Les principaux n'avons probablement même pas encore découvert tous les lignages de protistes se précisent, mais la position de nombreux protistes, et encore moins les avons classés.) Plusieurs grands lignages plus petits reste encore floue. L'information moléculaire issue groupements ont toutefois été définis. L'un d'eux est celui des de l'ADN et de l'ARN prévaut généralement, à condition d'en disposer straménopiles, qui comprend les algues dorées, les algues brunes, suffisamment et de l'interpréter correctement. les diatomées, les oomycètes et les myxomycètes. Son groupe frère, les alvéolés, regroupe les dinoflagellés, les ciliés et les apicomplexes. Comme vous pouvez le constater, il n'est pas aisé de déterminer les liens de parenté entre les organismes. Les véritables règnes… Les animaux, les plantes et les champignons descendent d'un ancêtre commun. L'évolution convergente est l'une des raisons justifiant la nécessité des regroupements phylogénétiques. Elle explique pourquoi les organismes vivant dans le même environnement finissent par se ressembler. Les dauphins et les ichtyosaures en sont un exemple. Le principe sous-jacent est « la forme suit la fonction ». Lorsqu'un règne est divisé en lignées, le premier sous-groupe ne constitue pas nécessairement un embranchement. Par exemple, la première division du règne végétal oppose les bryophytes aux plantes vasculaires. Aucune de ces deux lignées n'est considérée comme un embranchement. Il est donc important de connaître les lignées principales, qu'elles soient ou non classées selon la classification linnéenne. Il est nécessaire de se demander pourquoi nous classons les organismes afin de trouver le système le plus adapté à nos besoins. Les scientifiques ont d'abord classé les bactéries pour identifier les espèces pathogènes. La réaction des cellules à la coloration de Gram indique si elles possèdent ou non une paroi cellulaire épaisse. Parmi les autres caractéristiques utilisées figure la capacité à… 28 Autres faits importants Cette section met en lumière les interrelations essentielles à la vie et d'autres informations qui ne pourraient pas figurer sur le tableau. Phrases descriptives Ces phrases peuvent aider les élèves à se souvenir des caractéristiques essentielles des règnes. Vos élèves pourront ensuite écrire leurs propres slogans ou phrases récapitulatives. Ressources pour l'étude des règnes et des branches du vivant Livres((Voir les chapitres 3 à 7 pour plus de détails) Ouvrages de référence récents utiles : DK Smithsonian Natural History : Le guide visuel ultime de tout ce qui existe sur Terre. 2021. DK Éditions. Ce volumineux ouvrage encyclopédique utilise la classification phylogénétique la plus récente. Il comprend un diagramme de quatre pages illustrant l'Arbre de la Vie, et ses nombreuses photos en couleur le rendent très agréable à consulter. La moitié du livre est consacrée aux chordés, mais il aborde tous les domaines du vivant. Il présente notamment les ordres des plantes à fleurs. Public : du primaire à l'adulte. Urry, Lisa A. et al. 2021.Biologie de Campbell12e édition. Pearson. C'est l'un des ouvrages les plus utilisés et Ce manuel d'introduction à la biologie universitaire est l'un des plus précieux. Il contient de nombreux schémas utiles pour l'étude de la diversité du vivant. Livres anciens encore utiles : Lecointre, Guillaume et Hervé Le Guyader. 2006.L'arbre de la vie : une classification phylogénétique. Éditions Belknap de Harvard University Press. Cet ouvrage propose des informations pertinentes et une introduction à une approche novatrice de la classification : la classification phylogénétique récente du vivant. Les illustrations sont des dessins au trait clairs. Public : de la fin du primaire (pour les illustrations) à l’âge adulte. Pascoe, Elaine et Dwight Kuhn. 2003. Collection « Guide de classification pour les enfants ». Titres :Cellule unique Organismes;Champignons;Plantes sans graines;Plantes à graines;Animaux sans colonne vertébrale; et Animaux à colonne vertébraleCette série propose des informations de grande qualité et d'excellentes illustrations pour les élèves du primaire inférieur et du début du primaire supérieur. Tudge, Colin. 2000.La diversité de la vieOxford University Press. Cet excellent ouvrage de référence montre Ce livre présente la classification phylogénétique du vivant, bien qu'elle soit aujourd'hui quelque peu dépassée. L'auteur précise les éléments de cette classification qui sont bien établis et ceux qui restent à confirmer. Il contient des schémas précis et des descriptions claires des groupes. 29 Sites Internet consacrés aux royaumes et à l'Arbre de Vie -Consulté en août 2022 Le site web le plus complet : L'application Zoom Tree of Life Explorer présente l'histoire et la diversité de la vie d'une manière nouvelle et captivante. Ce site recense toutes les formes de vie connues, mais il est peut-être préférable de commencer par quelque chose que vous connaissez déjà. Vous trouverez des suggestions sur la page d'accueil. À tout le moins, il illustre la diversité du vivant et ses interrelations.http://www.onezoom.org/ Un site web plus ancien qui pourrait contenir des informations utiles : Le projet web Arbre de Vie commence par un magnifique diagramme arborescent. Cliquez sur le cercle à la fin. Pour commencer votre exploration du monde vivant, rendez-vous en bas de page. Chaque page contient des liens supplémentaires en bas. (Ce site web n'a pas été mis à jour en 2022 et son utilisation est limitée.)http://tolweb.org/arbre/ Autres sites web contenant des informations sur la diversité du vivant et l'Arbre de Vie : La vidéo « L’Arbre de Vie » de Wellcome Trust est une introduction de 6 minutes disponible sur [lien manquant].https:// www.youtube.com/watch?v=H6IrUUDboZoVous pouvez également le rechercher en utilisant « Wellcome Tree of Life ». L'Arbre de Vie d'Evogeneao est un diagramme ramifié qui permet de visualiser les lignées et leur transmission. Pour établir des liens, cliquez sur « Arbre de la vie interactif » afin de trouver les ancêtres communs de deux branches du vivant. https://www.evogeneao.com/en Le site Understanding Evolution de l'Université de Californie à Berkeley propose des tutoriels pour vous aider. Apprenez-en davantage sur la systématique phylogénétique.https://evolution.berkeley.edu/ Un diagramme simplifié de l'Arbre de Vie de National Geographic est disponible en téléchargement. Voirhttps:// www.nationalgeographic.org/media/tree-life/. Le site web « La forme de la vie : l'histoire du règne animal » propose un arbre de vie téléchargeable. diagramme.https://www.shapeoflife.org/news/resource/2016/10/18/tree-life Le musée d'histoire naturelle d'Oxford possède un site web présentant un arbre de vie simplifié pour les animaux.http:// www.oum.ox.ac.uk/thezone/animals/animalid/tree.htm Les articles de Wikipédia peuvent être très utiles pour identifier les lignées d'organismes, à condition de vérifier les références sur lesquelles ils se fondent. Notez la date de publication et assurez-vous que les articles cités proviennent de revues scientifiques à comité de lecture. Si les références sont issues de sources fiables et récentes, les clades présentés seront probablement pertinents. Cet article de 2020, tiré de la revueTendances en écologie et évolution–https://doi.org/10.1016/ J.TREE.2019.08.008–est l'une des plus récentes sur les branches eucaryotes du vivant. 30 Chapitre 3 : Les procaryotes Cyanobactéries (à gauche, (vue au microscope optique) etCampylobacter, une tige rigide et incurvée du groupe des protéobactéries (électrons à balayage image au microscope). Cette dernière provoque des maladies d'origine alimentaire et est fréquente chez les volailles. Introduction – Enseignement sur les procaryotes Les procaryotes constituent un groupe complexe à étudier. Les Ils pourraient souhaiter explorer les maladies bactériennes et enfants ne peuvent avoir qu'une expérience limitée l'histoire de la découverte par des scientifiques comme Louis d'observation et de manipulation de ces organismes, or il est Pasteur et Robert Koch du rôle des bactéries dans les maladies. essentiel qu'ils comprennent leur importance pour tous les Il est important que les enfants connaissent les mesures de écosystèmes. De nombreux livres pour enfants utilisent le santé publique essentielles pour prévenir les épidémies. terme « microbes », ce qui peut donner une impression L'étude du système immunitaire s'intègre naturellement à ce négative. En tant qu'enseignant, votre rôle sera de présenter thème. les bactéries de manière captivante et positive, tout en transmettant des compétences pratiques pour prévenir les maladies bactériennes. Comment appelle-t-on ce groupe ? Les livres pour enfants l’appellent « Règne des Monères ». On a aussi utilisé le nom de « Règne des Procaryotes », mais il est plus simple de l’appeler La leçon « L'arrivée des procaryotes » sert de point de départ à des les procaryotes. Si l’on abandonne le terme « règne », c’est études plus approfondies. La leçon « Les bactéries et les objets du parce que ces organismes ne descendent probablement pas quotidien » aborde ensuite le sujet sous un angle plus pratique. Il d’un ancêtre commun. Les bactéries et les archées sont s'agit d'une discussion visant à aider les enfants à comprendre les apparues il y a si longtemps que l’on ne peut affirmer avec différents rôles positifs que jouent les bactéries dans notre vie. Par certitude qu’elles partagent un ancêtre commun. Ces deux la suite, les enfants devraient avoir l'occasion de faire des branches du vivant partagent la structure cellulaire procaryote recherches sur les procaryotes et, si possible, de réaliser quelques de base, mais elles sont radicalement différentes au niveau expériences. Les expériences et explorations les plus pertinentes moléculaire. On les appelait initialement eubactéries et pour approfondir ces études concernent la transformation et la archéobactéries. Aujourd’hui, on les appelle bactéries et conservation des aliments. Je déconseille la culture de bactéries archées, car ces noms mettent plus clairement en évidence sans avoir mis en place les mesures de sécurité appropriées (par qu’il s’agit de deux branches distinctes du vivant. exemple, des désinfectants pour les déversements) et un moyen de stériliser les cultures avant de les jeter. (Extrait du livre de Betsey Dexter Dyer,)Guide pratique des bactéries(Voir la section Ressources) propose de nombreuses suggestions pour observer et apprécier l'activité des bactéries et des archées. Aucun microscope n'est nécessaire pour ces activités, bien qu'elle fournisse également des informations sur la microscopie. Devrions-nous même utiliser le terme « Monères » ? Pour les enfants du primaire, ce terme ne devrait servir que de référence historique. Ils devraient privilégier les termes « bactéries » et « archées », et comprendre que ce groupe possède une structure de type procaryote. Il n’est pas trop tôt pour leur présenter les notions de « Domaine des Bactéries » et de « Domaine des Archées », car ils les utiliseront plus tard Après avoir abordé les aspects positifs des bactéries, il est essentiel que les dans leurs études. Les enfants doivent comprendre la place enfants connaissent aussi les agents pathogènes, responsables de maladies. qu’occupe le terme « Monères » dans l’histoire de la S'ils savent de quoi les bactéries ont besoin pour se développer, ils seront classification. Ils pourront rencontrer le terme « Règne des mieux armés pour manipuler les aliments en toute sécurité. Monères » dans des ouvrages pour enfants plus âgés. 31 L'avènement des procaryotes Les récits de la série « L’arrivée des _____ » sont conçus pour aider Histoire simplifiée :La vie sur Terre a débuté peu après les enseignants à présenter aux enfants les origines de chaque l'apparition de l'eau dans les océans. Il est peu probable que nous groupe et la diversité de ses membres. Le thème central est le cycle sachions un jour exactement comment les premiers êtres vivants de la vie et l’interconnexion des lignées. Les enfants ont peut-être sont apparus, mais nous pouvons formuler des hypothèses assez déjà eu un bref aperçu de plusieurs de ces groupes dans les précises sur leur apparence. Ils ressemblaient probablement aux Grandes Leçons, mais les leçons de ce livre mettent davantage bactéries actuelles : minuscules, avec peu de structures internes. Ils l’accent sur l’ascendance et les liens familiaux. Un objectif n'étaient probablement visibles que sous forme d'écume, de film important de ces leçons est d’inspirer les enfants et de les ou de trouble à la surface de l'eau. Contrairement aux organismes encourager à entreprendre leurs propres recherches. actuels, ils vivaient sans oxygène, car l'atmosphère terrestre en Les instructions pour réaliser le tableau qui accompagne l'histoire suivent les illustrations des organismes. L'annexe contient la version couleur des illustrations, que vous pouvez détacher et utiliser pendant la leçon. Placez chaque illustration sur le tableau au fur et à mesure de sa présentation. Vous pouvez lire le texte au dos des images pendant que vous les placez, ou le laisser aux enfants pour qu'ils le lisent plus tard. Le code couleur des procaryotes est le violet, car certaines bactéries et archées sont de cette couleur. Notez que les tableaux de « L'arrivée des procaryotes » et des autres leçons d'introduction ne sont pas censés ressembler à de vrais arbres. était alors très pauvre. La vie primitive, comme toute forme de vie connue, a expérimenté et cherché de nouvelles façons de se nourrir et de croître. Si ces expériences étaient concluantes, la branche du vivant se perpétuait. Trois branches du vivant se sont développées. Deux d'entre elles sont des procaryotes. On les appelait auparavant « règne des Monères ». « Procaryote » signifie « avant le noyau » et indique que ces petites cellules étaient dépourvues de noyau. Le noyau est une structure plus foncée à l'intérieur de la cellule, qui contient l'ADN, le matériel génétique de la cellule. Les procaryotes possèdent de l'ADN, mais celui-ci est faiblement organisé dans la cellule. transition vers des schémas scientifiques plus formels. Le tableau des procaryotes se trouve à la base de l'arbre de vie. Sa position symbolise que toute autre vie sur Terre dépend des procaryotes. Noter queseulement quelques branches de bactériesLes Une branche des procaryotes est appelée lesDomaine bactéries constituent un groupe bien plus vaste que les Bactéries[« Bactéries » avec un « B » majuscule désigne le archées. Je pense que les jeunes enfants n'ont pas besoin de domaine. Le terme « bactéries » avec un « b » minuscule est un connaître le nom de nombreuses bactéries qu'ils ne peuvent terme générique pour ce groupe.] De nombreuses espèces de pas observer, c'est pourquoi je n'ai représenté que quatre bactéries existent aujourd'hui et sont essentielles au lignées. Trois d'entre elles sont importantes dans notre vie fonctionnement de tous les écosystèmes. Sur notre schéma, la quotidienne, ainsi que pour l'histoire de l'évolution et branche des bactéries se trouve ici. Les cartes présentent l'écologie. La quatrième possède une forme caractéristique. quatre branches de bactéries. Les scientifiques ont découvert N'oubliez pas de préciser aux enfants qu'il existe bien d'autres plus de 30 branches de bactéries. Notre schéma nous offre un lignées. Ils peuvent consulter une encyclopédie ou Wikipédia petit échantillon, mais significatif, des bactéries. Leur style, proche de celui des dessins animés, vise à faciliter la pour en savoir plus. SpirochètesCe sont des bactéries longues et spiralées, très [Les notes ou commentaires à l'intention des enseignants sont indiqués flexibles et ondulantes. Elles vivent dans l'eau et la boue. Certaines entre crochets.] espèces sont pathogènes, notamment pour la maladie de Lyme. Le gbactéries ram-positivesElles possèdent une couche externe très épaisse. L'histoire des procaryotes Elles vivent sur notre peau et dans le sol. Nous les utilisons pour fabriquer du [Il est à noter que les biologistes considèrent les l'angine streptococcique. procaryotes comme un groupe artificiel car il comprend LeprotéobactériesLes bactéries constituent un vaste groupe deux branches peu apparentées. Les procaryotes sont divisés en deux domaines au lieu de former un seul règne. Les enfants peuvent apprendre les noms de ces deux domaines, même s'ils ne comprennent pas forcément toutes les différences entre eux. Il est préférable de leur donner un nom qu'ils rencontreront par la suite plutôt qu'un nom qu'ils devront « désapprendre ».] 32 fromage et du yaourt. Certaines sont responsables de maladies, comme présent dans de nombreux milieux, notamment le sol, les nodules racinaires des plantes et notre intestin. Elles jouent un rôle important dans les écosystèmes. Certaines sont responsables de maladies, comme la diarrhée. Lecyanobactériesconstituent un groupe TRÈS important. Les ancêtres de ces bactéries ont développé la capacité de fabriquer de la nourriture à partir de l'énergie lumineuse du soleil ET de la libérer Ils ont commencé à libérer de l'oxygène il y a environ 3,5 milliards Si l'on observe aujourd'hui les plus petits organismes au microscope, on d'années et contribuent encore de manière importante à la teneur constate qu'il s'agit de cellules uniques dépourvues de noyau – c'est-à- en oxygène de l'atmosphère terrestre. dire sans noyau, cette partie centrale plus foncée. Ce type La deuxième branche des procaryotes est celle desDomaine Archées[[Archées]. Elles ressemblent beaucoup aux bactéries. Ce sont toutes deux de minuscules organismes, mais leur composition et leur fonctionnement interne sont très différents. Les bactéries et les archées sont plus différentes l'une de l'autre que les éléphants d'organisation cellulaire est appelé cellule procaryote. Les procaryotes étaient autrefois désignés sous le nom de « règne des Monères », ce qui signifie « règne des cellules uniques ». D'après ce que l'on peut observer de leurs fossiles, les premières cellules présentaient la taille caractéristique des procaryotes. ne le sont des palmiers ! Les archées sur notre tableau sont les La vie primitive a partagé ses talents. On a beaucoup hyperthermophiles(«« les amoureux de la chaleur extrême » qui échangé d'informations sur l'art de vivre. Des aptitudes vivent dans des sources thermales ;méthanogènes (« générateurs essentielles ont émergé, notamment celle de capter de méthane ») qui vivent dans les marais et le rumen des vaches, où l'énergie solaire. C'est ce qui a donné à la vie l'énergie ils libèrent du méthane ; et les halophiles(«Certaines archées nécessaire à son existence et à son évolution. (« amoureuses du sel ») vivent dans des milieux très salés, comme Aujourd'hui, de minuscules êtres vivants semblables aux premières formes de l’eau de mer en voie de dessiccation. D’autres vivent dans des vie existent encore. Il existe deux groupes principaux : lesDomaine Bactéries milieux plus « classiques », comme le sol, l’eau de mer et même et leDomaine ArchéesNous montrons que ces deux groupes se sont notre bouche. développés à partir des premiers êtres vivants, bien que nous ne puissions La troisième branche de notre schéma ne fait pas partie des pas déterminer le chemin qu'ils ont emprunté ni leur degré de parenté. procaryotes. Elle représente la lignée des organismes qui a donné naissance à toutes les autres formes de vie sur Terre. Elle partage Pendant près de deux milliards d'années, seuls de petits certaines caractéristiques avec le domaine des Bactéries et d'autres avec organismes simples ont vécu sur Terre. Ils ont transformé la celui des Archées, mais elle s'en distingue. Elle est représentée par une planète et ouvert la voie à une vie plus grande et plus complexe. ligne pointillée car nous ignorons précisément quand et comment elle a Aujourd'hui, les procaryotes sont essentiels au fonctionnement de débuté, mais c'est cette branche du vivant qui a produit les organismes tous les écosystèmes. Ils produisent de la nourriture et de plus grands, comme ceux que nous pouvons observer – et nous-mêmes. l'oxygène, recyclent les nutriments et décomposent les déchets. Notre schéma illustre certaines lignées phylogénétiques chez les Histoire plus détaillée :La Terre était très jeune lorsque la vie est procaryotes. Les scientifiques décrivent plus de 30 groupes de apparue. Elle s'était suffisamment refroidie pour que l'eau liquide bactéries et une demi-douzaine d'archées. Nous présenterons puisse se former, mais son atmosphère était très différente de celle quelques groupes majeurs de ces deux domaines. d'aujourd'hui. L'oxygène y était rare. On y trouvait en revanche des Sur notre schéma, cette large zone en bas symbolise la vie gaz comme le dioxyde de carbone, le méthane et l'azote. Les originelle et son origine à partir de nombreuses molécules océans contenaient de nombreuses petites molécules carbonées. Si différentes. Ces trois branches en sont issues. À gauche, la ces molécules étaient présentes dans l'eau aujourd'hui, un branche des bactéries. À droite, celle des archées. La branche organisme vivant les utiliserait rapidement pour se nourrir, mais à centrale n'appartient pas aux procaryotes. Elle représente les cette époque, aucune forme de vie n'était présente pour les autres formes de vie sur Terre, mais nous ignorons encore son consommer. Pourtant, d'une manière ou d'une autre, ces lien avec les deux branches des procaryotes ; c'est pourquoi molécules se sont assemblées et ont donné naissance à la vie. Nous elle est représentée en pointillés. ne saurons jamais exactement comment cela s'est produit, mais nous pouvons formuler des hypothèses plausibles en nous basant sur nos connaissances actuelles de la vie et sur l'étude des fossiles. La vie est un perpétuel processus d'expérimentation et de nouveauté. Si une nouvelle structure, un nouveau mode d'alimentation ou une nouvelle façon de faire s'avère efficace, elle s'intègre au monde vivant. La première forme de vie était minuscule, si petite que si nous pouvions Dans le cas contraire, elle disparaît et les autres formes de vie explorent remonter le temps pour l'observer (en combinaison spatiale, bien sûr), d'autres pistes. Sur de longues périodes, les êtres vivants se nous ne verrions probablement qu'une légère turbidité à la surface de transforment et développent de nouvelles capacités. De nouveaux l'eau. Plusieurs millions d'années après cette apparition, nous aurions groupes sont apparus chez les procaryotes et continuent d'évoluer. peut-être aperçu une sorte d'écume verte sur les rochers. Plus tard encore, de gros nodules composés de nombreuses couches de ces minuscules organismes vivants se sont formés. Ces nodules se forment encore aujourd'hui en quelques endroits sur Terre ; on les appelle stromatolithes. [Si possible, afficher une image de stromatolithes.] Tout d'abord, examinons quelques lignées debactériesLa plupart des informations que nous recevons aux informations concernant les bactéries concernent celles qui peuvent causer des maladies – les germes. N'oublions pas que la vie sur Terre dépend des bactéries. Aucun écosystème ne pourrait fonctionner sans elles. 33 Le graphique présente quatre grands groupes de bactéries, mais il Le virus pourrait pénétrer dans vos tissus et commencer à se en existe bien d'autres. La plupart se ressemblent beaucoup. Les multiplier. Votre vaccination antitétanique vous protège contre la scientifiques peuvent les distinguer grâce à leurs modifications toxine produite par cette espèce. Cette toxine provoque le tétanos. moléculaires et à leur ADN. Une autre branche du domaine des bactéries est appelée la LespirochètesLes spirochètes constituent une lignée sur notre protéobactériesIl s'agit d'un groupe très important dont les arbre phylogénétique. De forme spiralée, ils sont très flexibles membres font toutes sortes de choses. [Les noms entre et ondulants. Ce sont parmi les rares bactéries à posséder une parenthèses sont des exemples pour les enfants qui veulent en forme caractéristique. Certaines sont pathogènes (notamment savoir plus, et non pour la première leçon.] Certains vivent dans la maladie de Lyme), mais beaucoup vivent dans des milieux notre tube digestif (bactéries entériques). D'autres « mangent » des aquatiques, comme la vase au fond des étangs, où elles minéraux soufrés (Thiobacillus), fixent l'azote dans les nodules décomposent les déchets. Une espèce particulière vit dans le racinaires des légumineuses ou dans le sol (Rhizobium,Azotobacter tube digestif des mollusques et pourrait contribuer à leur ), recycler l'azote (bactéries nitrifiantes), attaquer d'autres bactéries digestion. (Bdellovibrio), faire du vinaigre (Acetobacter), ou provoquer des Un autre type de bactéries a développé une paroi cellulaire particulièrement épaisse, une enveloppe extérieure autour de la cellule. On les appelle les bactéries bactéries gram-positives( Également appelées Bacillota ou Firmacutes, ces bactéries doivent leur nom à leur coloration lors d'une coloration de Gram, une technique de laboratoire qui renseigne sur la structure de leur paroi cellulaire. Cette paroi épaisse leur permet de vivre dans des milieux secs, comme notre peau ou le sol. Il n'y a pas lieu de s'inquiéter de la présence de bactéries sur la peau ; au contraire, une flore cutanée saine limite la prolifération des bactéries maladies (Rickettsia,Salmonelleet bien d'autres). Une lignée de protéobactéries comprend des membres qui vivent à l'intérieur des cellules d'autres organismes (Rickettsia, AgrobacteriumNous verrons que cette branche de bactéries a joué un rôle essentiel dans le développement des autres règnes du vivant. L'un de ses premiers représentants est devenu la mitochondrie, centrale énergétique des cellules eucaryotes. [Bien qu'une flèche soit prévue sur le schéma reliant la lignée des protéobactéries aux eucaryotes, vous pouvez la placer lors de la leçon sur les protistes, afin de ne pas trop vous concentrer ici sur les bactéries.] pathogènes. Parmi les bactéries Gram-positives, on trouve celles utilisées pour la fabrication des yaourts et des fromages, ainsi que Le dernier groupe de bactéries est peut-être le plus important pour de nombreux décomposeurs vivant dans le sol. Les bactéries Gram- la vie sur Terre. Il s'agit descyanobactériesLes cyanobactéries, ou positives pathogènes incluent :Staphylocoque,Streptocoqueet les bactéries bleues-vertes, ont combiné deux façons d'utiliser organismes responsables de la coqueluche, du tétanos et de la l'énergie solaire et ont commencé à produire leur propre diphtérie. nourriture (par photosynthèse) tout en libérant de l'oxygène. Ce [Il existe une autre branche des bactéries à coloration grampositive, les Actinomycetota. Elle comprend des bactéries qui vivent dans le sol et forment des partenariats fixateurs d'azote avec les racines de plantes comme les aulnes et les chrysothamnus.] phénomène s'est produit il y a très longtemps, peut-être plus de trois milliards et demi d'années. Les cyanobactéries sont le seul organisme vivant à libérer de l'oxygène. Les chloroplastes, qui sont les parties des algues et des plantes qui utilisent la lumière pour produire leur nourriture, proviennent tous des cyanobactéries. Certaines bactéries Gram-positives peuvent former une structure [Une flèche sur le schéma relie la lignée des cyanobactéries aux de repos spéciale appelée uneendosporeLes endospores survivent Archaeplastida. Ce schéma peut être intégré à la leçon sur les à la dessiccation et à l'ébullition. Pour éliminer toutes les bactéries protistes.] d'un aliment et éviter sa détérioration, on peut le conserver dans des récipients hermétiques et le cuire à l'autocuiseur. L'autocuiseur permet de chauffer les aliments à une température supérieure au point d'ébullition de l'eau. Ce procédé est nécessaire pour détruire les endospores des bactéries Gram-positives. [Les bactéries végétatives, c'est-à-dire celles qui ne sont pas des endospores, sont facilement détruites par l'ébullition. Parmi les autres méthodes de conservation des aliments, on peut citer la dessiccation et la congélation, qui empêchent la prolifération bactérienne.] La vaccination antitétanique est nécessaire en raison des endospores d'une bactérie appeléeClostridium tetaniSes endospores sont L'oxygène libéré par les cyanobactéries s'est progressivement accumulé dans notre atmosphère. La présence d'oxygène a permis le développement d'animaux et de plantes plus grands, car ils pouvaient tirer davantage d'énergie de leur nourriture. Elle a également permis la formation d'une couche d'ozone dans la haute atmosphère. Cette couche a protégé la vie à la surface de la Terre des rayons ultraviolets nocifs du Soleil. Sans ozone, nous serions victimes de graves coups de soleil en très peu de temps. La vie dans les eaux peu profondes ou sur terre serait quasiment impossible. courantes dans le sol. Si vous vous blessiez avec un clou, les Aujourd'hui encore, les cyanobactéries produisent de l'oxygène et endospores fournissent de la nourriture à de nombreux organismes aquatiques. 34 Les cyanobactéries se développent en filaments, comme on le voit comme les paillettes de sulfate de molybdène sur la photo. [Cette sur notre photo. D'autres vivent sous forme de cellules isolées. Elles archée appartient à la lignée des crénarchéotes.] sont communes dans les sols et tous les milieux aquatiques. On les trouve même dans les sols désertiques, où elles font partie de la croûte cryptobiotique (« vie cachée »). Les cyanobactéries peuvent être plus grandes que d'autres bactéries. Certaines atteignent 60 micromètres de diamètre, alors que celui d'une bactérie moyenne est de 1 à 2 micromètres. On peut facilement observer les plus grandes cyanobactéries au microscope optique. On peut également en observer des amas dans l'eau. Elles sont souvent bleu-vert, mais peuvent aussi être orange, brunes, rougeâtres ou Un autre groupe est lehalophiles, ce qui signifie « amoureux du sel ». [Du grec.halo, sel +philoCes archées vivent dans des étangs où l'eau de mer est asséchée pour produire du sel et dans des baies peu profondes où l'eau de mer est plus salée. Elles donnent une teinte rosée à l'eau salée concentrée, mais le sel produit est blanc et comestible. Les halophiles prospèrent dans des milieux dix fois plus salés que l'eau de mer. La plupart des procaryotes ne peuvent pas se développer dans ces environnements très salés. noirâtres. [Les cellules individuelles d'un filament sont viables si elles sont séparées. Lorsqu'une cellule grandit et se divise, les LeméthanogènesLes méthanogènes constituent le troisième groupe cellules filles s'agglutinent et le filament se reforme.] d'archées. Leur nom signifie « générateurs de méthane » ou Examinons la deuxième branche de notre graphique. Elle montre…archéesLes archées, qui ont une taille comparable à celle des bactéries, se ressemblent beaucoup, mais leur fonctionnement est très différent. On pourrait comparer cela aux ordinateurs Mac et PC. Les archées sont connues pour vivre dans des environnements extrêmes, comme les sources thermales acides ou les milieux à forte concentration de sel. Ces milieux sont dits extrêmes, et les archées qui y vivent sont appelées extrêmophiles – c'est-à-dire qu'elles affectionnent les conditions extrêmes. D'autres archées vivent dans le sol et les milieux aquatiques à des températures normales. On les trouve dans le rumen des vaches (et d'autres ruminants), où elles contribuent à la production de méthane dans les rots des vaches. Aucune archée n'est connue pour être pathogène. Contrairement aux bactéries et aux eucaryotes, aucune archée ne forme de spores. Le graphique présente trois groupes d'archées. L'un d'eux est lehyperthermophiles, ce qui signifie « amoureux de la chaleur extrême ». [Du grec.hyper, excessif +thermie, chaleur +philo [Amoureux] Ces organismes vivent dans les sources chaudes et près des cheminées hydrothermales des fonds marins. L'espèce photographiée tire son énergie de minéraux, tels que « fabricateurs de méthane ». Ces archées vivent dans la boue noire et malodorante qui se forme dans les marais. Elles libèrent du méthane. Elles vivent également dans le rumen des bovins et provoquent chez eux des éructations de méthane. On les trouve aussi dans le tube digestif humain. [Le méthane est un gaz à effet de serre plus puissant que le dioxyde de carbone ; les éructations des bovins contribuent donc au changement climatique. Les méthanogènes, la plupart des halophiles et certains thermophiles appartiennent à la lignée des euryarchaeota.] La troisième lignée majeure représentée sur ce schéma n'appartient pas aux procaryotes. Sa présence s'explique par le fait que de nombreux biologistes pensent que ses cellules ont commencé à vivre au moment même où les procaryotes se développaient. Elle est représentée en pointillés car nous ignorons précisément quand elle s'est séparée et quelles sont ses relations avec les domaines des Bactéries et des Archées. Cette troisième lignée est appelée domaine des Eucaryotes car elle donne naissance aux cellules eucaryotes et à leurs nombreuses lignées : les protistes, les animaux, les champignons et les plantes. Les Eucaryotes partagent certaines caractéristiques avec les archées et d'autres avec les bactéries, tout en possédant des traits qui leur sont propres. Ils sont peut-être issus du partage et de l'échange d'informations qui ont accompagné l'apparition de la vie primitive. Aidez les enfants à comprendre les images qu'ils verront dans les leçons « L'arrivée des procaryotes » et « L'arrivée des protistes ». Le livre,Mondes cachés : Regard à travers le microscope d'un scientifiqueL'ouvrage de Stephen Kramer (2001) comporte une excellente section sur les différences entre les loupes, les microscopes optiques et les microscopes électroniques. De nombreuses illustrations des tableaux sur les procaryotes et les protistes ont été réalisées à l'aide d'un microscope électronique à balayage (MEB). Elles montrent la surface externe, mais pas les structures internes des organismes. Les images obtenues au microscope optique peuvent révéler davantage la structure interne, mais elles passent souvent à côté de nombreux détails importants en surface. La plage de grossissement utile pour les microscopes optiques est d'environ 10x à 1000x. Le grossissement du MEB peut descendre jusqu'à 15x, mais ses limites supérieures sont beaucoup plus élevées : plus de 100 000x. 35 Cette version en noir et blanc des cartes des procaryotes sur le schéma de l'Arbre de Vie est destinée à l'enseignant. Consultez l'annexe pour connaître les cartes à placer sur le schéma. Archées - Méthanogènes Méthanosarcine Les méthanogènes vivent dans de nombreux milieux, notamment le sol, l'eau, les intestins des animaux et les stations d'épuration. Ils produisent et libèrent du méthane. Certaines archées vivent sous forme de cellules isolées ; d'autres forment des amas ou de longs filaments. © Dr Herbert Fang, utilisé avec autorisation Archées - Halophiles Ces organismes vivent dans des milieux très salés. Leurs parois cellulaires se désagrègent lorsque la salinité diminue. Ils vivent dans l'océan, notamment dans les zones d'évaporation. Ils colorent l'eau salée concentrée en rouge ou en rose. Crédit : Consortium d'astrobiologie du Maryland, NASA et STScI. Archées - Hyperthermophiles Acidianus brierleyiOn observe sa croissance sur des flocons de sulfate de molybdène. Ses cellules sont sphériques et mesurent environ 1 D'un diamètre de µm, cet organisme se développe dans l'acidité prononcée et les températures élevées des sources chaudes du parc national de Yellowstone. © Dr Corale Brierley, utilisé avec autorisation Les trois images d'Archaea sont des micrographies électroniques à balayage (MEB). 36 Bactéries Protéobactéries–Escherichia coli Ce sont des cellules en forme de bâtonnet, une forme courante chez les procaryotes. Ces cellules mesurent 2 à 3 µm (micromètres) de long. Cet organisme est souvent désigné par son nom abrégé :E. coliElle vit dans notre tube digestif. Certaines de ces cellules étaient en division. Bactéries Spirochètes–Leptospira Ces organismes en forme de spirale mesurent environ 0,1 µm de diamètre, mais peuvent atteindre 20 µm de long. Les cellules vivantes sont très flexibles.Leptospira« » signifie « spirale mince ». Cette espèce provoque une maladie appelée leptospirose. Bactéries Bactéries Gram-positives Entérocoques Cette forme est appelée cocci, du grec « coccus » (baie). Les cellules séparées par un sillon se divisent en deux. Les cocci mesurent environ 1 µm de diamètre. Entérocoquesvit dans notre tube digestif. Bactéries Cyanobactéries–Nostoc Cette image, prise au microscope optique, montre des filaments composés de nombreuses cellules agglomérées. Les cellules les plus grandes fixent l'azote. Les plus petites sont bleuvert. Les cellules mesurent environ 5 µm de diamètre et les filaments peuvent s'étendre sur plusieurs centaines de cellules. Les trois premières images sont des images MEB, dans le domaine public, avec l'aimable autorisation du Département de l'Agriculture des États-Unis et des Centres de contrôle et de prévention des maladies. Nostoc-©Peter Siver, Chrysophytes, LLC, autorisé à être utilisé uniquement dans cette publication. 37 Diagramme de ramification pour la leçon « L’arrivée des procaryotes » Matériaux : Ce tableau peut être réalisé avec du carton, du papier coloré ou tout autre matériau approprié. Utilisation en salle de classe. Dimensions : Le tableau mesure 30 pouces (76 cm) de large sur 11¼ pouces (29 cm) de haut. Schéma de couleurs : La bordure est violette, de 6 mm (¼ de pouce) de large, sur un fond blanc ou neutre clair. Les étiquettes Les cadres des photos sont d'un violet plus clair, ce qui assure un bon contraste avec le texte et facilite sa lecture. L'étiquette « Première Vie » est blanche. Le schéma arborescent est noir. Étiquette principale : Dimensions réelles : 1¾ x 5 pouces (4,4 x 12,5 cm) Les procaryotes anciennement « Royaume Monera » Autres étiquettes :Bactéries (en violet clair, sur le schéma de ramification, côté gauche ; ⅞ x 2¾ pouces, 2,2 x 7 cm) (Les quatre étiquettes ci-dessous sont placées au bas des rectangles colorés. Les rectangles mesurent 2⅜ x 3 pouces ; 6 x 7,6 cm) Spirochètes (en bas à droite, branche Bactéries) Bactéries Gram-positives (en bas à gauche, branche Bactéries) Cyanobactéries (fin de la branche Bactéries) Protéobactéries (début de la branche Bactéries) Archées (en violet clair, sur le schéma de ramification, à droite ; ⅞ x 2¾ pouces ; 2,2 x 7 cm) (Les trois étiquettes ci-dessous sont placées au bas des rectangles colorés. Les rectangles mesurent 2½ x 2½ pouces ; 6,3 x 6,3 cm) Hyperthermophiles (en haut à gauche sur la branche Archaea) Méthanogènes (en haut à droite de la branche Archaea) Halophiles (rectangle inférieur, branche Archaea) Première Vie ((sur fond blanc, placé au centre, en bas du diagramme de ramification) Lorsque les photos sont placées sur les rectangles colorés, seule la bordure inférieure avec la légende est visible. Agrandissez les rectangles si vous souhaitez que la bordure soit visible tout autour de la photo. La ligne pointillée indique les cellules eucaryotes sur le tableau des protistes. Utilisez les cartes photos fournies ou vos propres illustrations pour chaque rectangle. La taille des illustrations dépend uniquement de celle des photos disponibles. Les photos d'archées étaient difficiles à trouver ! Pour voir comment ce tableau s'intègre aux autres, reportez-vous à la couverture du livre ou à l'annexe. 38 Bactéries et objets du quotidien : une exploration de la pensée But:Cette leçon vise à présenter aux élèves du primaire (CM1-CM2) et du collège certains rôles non pathogènes des bactéries. Elle met l'accent sur leur rôle dans la production d'objets et de substances du quotidien. Ce dont vous avez besoin :Faites une copie des cartes et des étiquettes des pages suivantes. Vous pouvez également rassembler des photos illustrant des situations où les bactéries sont à l'œuvre. Exemples : l'eau du robinet, une cuisine ou des aliments, une buanderie, un paysage, des tuyaux ou des câbles en cuivre. Que faites vous:Commencez par distribuer la carte question. Vous pouvez discuter avec les élèves de leur perception des bactéries. Distribuez ensuite les cartes d'information (celles avec du texte). Présentez les cartes nominatives une à une et demandez si quelqu'un a des informations sur la substance ou l'objet en question. Laissez l'élève lire l'information au groupe, puis sollicitez les commentaires. Pour plus d'informations, consultez la liste des ressources pédagogiques. à la fin de ce chapitre. Lorsque vous buvez de l'eau propre, vous consommez un produit de l'activité bactérienne. Les bactéries éliminent toutes sortes de déchets de l'eau. Les stations d'épuration utilisent des bactéries pour décomposer les déchets. Dans un premier temps, les bactéries combinent les molécules de déchets avec de l'oxygène et les décomposent. Les étapes suivantes font appel à des bactéries anaérobies. Au final, l'eau est traitée et peut être rejetée dans les lacs ou les rivières. Les bactéries contribuent à nettoyer les marées noires et même à éliminer les substances toxiques. comme le cyanure provenant des déchets miniers. Des bactéries contribuent à l'extraction du cuivre dans plusieurs régions du monde. Les mineurs les utilisent pour dissoudre le cuivre contenu dans les minerais à faible teneur, dont la fusion serait trop coûteuse. Le cuivre est ensuite extrait de la solution. Ce procédé est appelé biolixiviation. Les bactéries qui réalisent cette tâche sont très différentes des organismes qui nous entourent, car elles peuvent se nourrir exclusivement de minéraux. Elles produisent leur propre nourriture grâce à la chimiosynthèse. Une espèce de bactérie utilisée dans l'extraction du cuivre est… Acidithiobacillus ferrooxidans. 39 Quel est le rapport entre les bactéries et… Ces objets ou substances ? 40 Cuivre Oxygène Haricots Produits de lessive Lin Riz Pommade antibiotique Vinaigre Yaourt et fromage Eau propre pilules vitaminées Cornichons et choucroute Chocolat Insecticide biologique (Bt ou Thuricide) On ne peut pas fabriquer de fromage ni de yaourt Quel est le lien entre les bactéries et le chocolat ? sans bactéries. Lors de la fabrication du fromage, les On peut espérer qu’elles ne se trouvent pas à bactéries modifient la texture du caillé et lui proximité de votre chocolat, mais sans elles, il confèrent son arôme au fil de l'affinage. (Certains n’aurait pas ce goût délicieux. Le chocolat provient fromages sont également aromatisés par des des fèves du cacaoyer. Après la récolte, les champignons.) Le yaourt est fabriqué à partir de lait ouvriers entassent les fèves en grands tas pour les frais mélangé à une culture de bactéries. laisser fermenter. Des bactéries et des levures se Streptococcus thermophilus et Lactobacilles développent dans les fèves et modifient leur bulgaricusIl existe deux espèces utilisées pour fabriquer le yaourt. D'autres bactéries transforment le lait écrémé en babeurre et la crème en crème fraîche. Il y en a environ… saveur. Elles contribuent notamment à éliminer Chaque gramme de yaourt frais contient des milliards bénéfiques pour la santé. aider à décomposer la baie de café afin que les graines (grains de café) puissent être séparées. Lorsque des chenilles s'attaquent aux légumes Pour faire des cornichons ou de la choucroute, de votre jardin, vous pourriez avoir besoin de il n'est pas nécessaire d'ajouter du vinaigre aux l'aide de bactéries appeléesBacillus concombres ou au chou. Les bactéries thuringiensisou BT. Cette espèce forme un naturellement présentes sur les légumes cristal toxique pour les larves de papillons, de suffisent à les conserver. Pour éviter la mites et de moustiques. Sa particularité est que prolifération de micro-organismes la toxine est inoffensive pour les humains et les responsables de la détérioration, ajoutez de autres animaux. Elle est même inoffensive pour l'eau salée et isolez-les de l'air. Les bactéries de la plupart des insectes. Les insecticides la fermentation transforment l'amidon et les chimiques sont toxiques pour tous les animaux sucres des légumes en acides. Contrairement à et insectes, ils peuvent donc être dangereux la fabrication du vinaigre, la fermentation se pour vous et pour les humains. déroule en l'absence d'oxygène. Votre écosystème. Les insecticides BT peuvent Ces bactéries se développent en l'absence d'oxygène, être utilisés pour protéger les forêts comme les transforment les molécules de sucre et captent l'énergie ; jardins. ce processus est appelé fermentation. de bactéries. Rassurez-vous ! Ces bactéries sont les substances amères. Les bactéries jouent également un rôle dans la transformation des grains de café. 41 Les haricots, comme les autres légumineuses, Bien avant que l'on connaisse l'existence des entretiennent une symbiose particulière avec bactéries, on les utilisait déjà pour fabriquer du des bactéries. Ils développent des structures lin. Cette fibre provient des tiges de la plante de (nodules) sur leurs racines où la bactérie, lin, mais celles-ci ne peuvent être utilisées RhizobiumPourquoi une plante ferait-elle cela ? qu'après un processus appelé rouissage. Pour Parce que les bactéries absorbent l’azote de l’air rouir le lin, les tiges sont trempées dans l'eau. et le transforment chimiquement pour que la Au cours de ce processus, des bactéries plante puisse l’utiliser comme source d’énergie. décomposent une partie de la tige et libèrent Ce processus s’appelle la fixation de l’azote, et les fines fibres de lin. Il n'est pas nécessaire les bactéries sont les seuls êtres vivants d'ajouter des bactéries spécifiques, car celles capables de le réaliser. Plusieurs autres espèces naturellement présentes sur les tiges s'en de bactéries fixent également l’azote. Certaines chargent. sont associées aux racines d’une plante hôte, d’autres vivent dans le sol ou l’eau. Les riziculteurs d'Asie utilisent depuis des D'où proviennent les vitamines contenues dans les siècles un type d'engrais particulier : la culture comprimés vitaminés ? Si certaines sont synthétisées de la fougère flottante. AzollaDes chimiquement, de nombreuses vitamines que nous cyanobactéries se développent sur les feuilles utilisons dans les compléments alimentaires et pour de la fougère. Elles absorbent l'azote gazeux de enrichir les aliments sont produites par des bactéries l'air et le transforment chimiquement en une ou des champignons. Les bactéries sont les seuls forme assimilable par les plantes. Ce processus organismes à produire de la vitamine B.12Quelle est est appelé fixation de l'azote. Le riz produit de la signification du fait que les humains et les bien meilleurs rendements lorsqu'il bénéficie bactéries utilisent les mêmes vitamines ? Cela montre d'une quantité suffisante d'azote. Aujourd'hui, que toute vie sur Terre a commencé à partir du dans de nombreux pays, les agriculteurs même type de cellules. Même si la vie… utilisent cette fougère et ses cyanobactéries Les choses ont énormément changé en 3,5 milliards comme biofertilisant. Il s'agit d'une méthode de d'années ; toutes les cellules partagent un ensemble culture durable. fondamental de réactions chimiques. 42 Les bactéries nous aident à laver nos vêtements ! Les cyanobactéries sont les premières À l'intérieur de toutes les cellules, on trouve de productrices d'oxygène dans l'atmosphère nombreuses molécules appelées enzymes. Les terrestre. Elles contribuent encore largement enzymes sont des « molécules outils ». Elles à son maintien. En fin de compte, tout notre accomplissent toutes les tâches cellulaires oxygène provient des cyanobactéries. Certes, impliquant la transformation d'autres molécules. les plantes et les algues produisent L'une des fonctions des enzymes est de également de l'oxygène, mais grâce à leurs décomposer les grosses molécules en plus petites. chloroplastes. Ces derniers sont issus Lorsque la grosse molécule provient du chocolat d'anciennes cyanobactéries ! Ces dernières que vous avez mis sur votre pantalon, les enzymes ont commencé à vivre à l'intérieur d'autres de la lessive sont très utiles. Elles décomposent les cellules. Finalement, incapables de survivre grosses molécules de chocolat en… seules, elles se sont transformées en Les petites particules que le détergent peut éliminer. chloroplastes. En cas de coupure, il est parfois nécessaire d'appliquer une pommade antibiotique pour éviter l'infection. Saviez-vous que cette pommade utilise des bactéries pour combattre d'autres bactéries ? Les antibiotiques qu'elle contient peuvent être de la néomycine, de la bacitracine ou de la polymyxine. Ils sont produits par trois espèces bactériennes présentes dans le sol. Ces antibiotiques ne peuvent être utilisés que sur la peau, car leur ingestion serait dangereuse. Le vinaigre est issu du vin et sa fabrication nécessite des bactéries. Une méthode consiste à utiliser des bactéries cultivées sur des copeaux de bois. Le vin est versé très lentement à travers ces copeaux. Les bactéries combinent l'oxygène de l'air et l'alcool du vin pour produire du vinaigre. Le vinaigre s'écoule par le bas des copeaux, tandis que les bactéries restent en place. Le mot « vinaigre » signifie littéralement « vin aigre ». La bière est la matière première du vinaigre de malt, et le cidre brut sert à fabriquer le vinaigre de cidre. Cette transformation est réalisée par des bactéries acétiques.. 43 Que peuvent faire les enfants avec des bactéries ? bactéries en croissancePour manipuler directement des bactéries, il est indispensable de suivre une formation aux bonnes pratiques de laboratoire. Toute culture bactérienne en boîtes de Petri contenant de la gélose doit être effectuée avec la plus grande précaution, comme si elle pouvait être pathogène. À moins de bénéficier de l'aide d'un microbiologiste qualifié, il est préférable d'éviter la culture bactérienne. Il est essentiel de disposer au minimum d'un désinfectant efficace en cas de déversement accidentel et de mettre au rebut les boîtes de Petri usagées afin d'éliminer les bactéries. Une exception notable est la culture mixte de bactéries environnementales appelée colonne de Winogradsky. Le risque de développer des agents pathogènes dans ces cultures est faible. Voir Betsey Dexter Dyer.Guide de terrain sur les bactériesPour obtenir des instructions sur la mise en place d'une colonne Winogradsky, consultez la section Ressources à la fin de ce chapitre pour plus d'informations sur cet ouvrage. Une autre façon d'explorer la croissance bactérienne consiste à observer la détérioration des aliments. Voir l'exercice ci-dessous. Les enfants peuvent réaliser plusieurs types de transformations alimentaires utilisant des bactéries, comme la préparation de cornichons et de yaourts. Ils peuvent conserver les aliments en créant des conditions qui empêchent la prolifération des bactéries et leur détérioration. Le séchage ou le salage créent ces conditions. Les enfants pourraient être intéressés de découvrir la quantité de sel nécessaire ou le degré de séchage requis pour la conservation des aliments. Observation des bactériesOn peut observer les cyanobactéries avec un grossissement de 200 à 400x, mais il faut un grossissement de 1000x pour distinguer la plupart des bactéries. Dans les infusions de foin (voir l'activité des protistes, chapitre 4), les bactéries sont abondantes. À un grossissement de 400x, elles apparaissent sous forme de minuscules bâtonnets pâles qui se déplacent en tourbillonnant. Les cyanobactéries sont uniformément vertes, tandis que chez les algues eucaryotes, le vert est concentré dans les chloroplastes. Recherche sur les bactéries pathogènesS'il est très important de montrer les aspects positifs des procaryotes, les organismes pathogènes font partie du règne animal et, bien entendu, fascinent les enfants. Ils pourraient être intéressés par l'étude des bactéries pathogènes et des mécanismes de défense de notre organisme. (Extrait de Betsey Dyer)Guide de terrain sur les bactériesIl contient un bon tableau récapitulatif des maladies bactériennes et de leurs agents causaux. Il est important que les enfants connaissent les trois moyens de prévenir les maladies. L'étude des bactéries est une excellente occasion d'apprendre les bonnes pratiques de manipulation des aliments (voir page suivante). 1. Hygiène–se laver les mains, avoir accès à de l'eau potable, éviter de rejeter nos déchets dans le réseau d'eau potable, manipuler nos aliments de manière à minimiser la contamination et la prolifération bactériennes. La manipulation sécuritaire des aliments comprend : éviter que la saleté ne se dépose sur les aliments et les comptoirs de la cuisine, nettoyer les surfaces de travail, conserver les produits laitiers à une température inférieure à 4 °C et les aliments chauds à une température supérieure à 60 °C. Les aliments humides non acides, comme les produits laitiers, ne doivent pas rester entre 4 °C et 60 °C pendant plus de 4 heures au total avant d’être consommés, y compris le temps de transport des courses. Le réfrigérateur ne tue pas les bactéries ; il ralentit seulement leur prolifération. Les éponges en contact avec les aliments sont de véritables nids à bactéries et peuvent contaminer les surfaces de la cuisine. 2. Vaccinations–vaccination infantile contre la diphtérie, le tétanos et la coqueluche (pertussis),Haemophilustype B, méningite et pneumonie. Ces vaccins renforcent notre système immunitaire afin qu'il puisse combattre efficacement les bactéries en cas de contact. Ils nous protègent des toxines bactériennes, comme celles de la diphtérie. Nous sommes également vaccinés contre les maladies virales telles que la rougeole, les oreillons, la rubéole et la COVID-19. Les maladies causées par des protistes sont beaucoup plus difficiles à combattre par la vaccination. 3. Antibiotiques–Des médicaments qui tuent les bactéries ou empêchent leur prolifération. Ces médicaments sont utilisés après une infection. Comment votre vie serait-elle différente sans antibiotiques ? Seriez-vous devenu sourd à cause d’une otite ? Seriez-vous décédé, vous ou un membre de votre famille ? Auriezvous dû rester alité pendant des semaines pour guérir d’une infection bactérienne ? Une bonne alimentation aide également notre organisme à lutter contre les bactéries nocives. Par exemple, dans les régions où les enfants ne consomment pas suffisamment de fer, les infections sont plus fréquentes. 44 Quelles sont les conditions qui permettent aux bactéries de se développer ? But:Observer les conditions de croissance des bactéries dans les aliments et apprendre les bonnes pratiques de manipulation des aliments. Ce dont vous avez besoin : Exemples d'aliments comprenant les éléments suivants : Aliments secs (biscuits apéritifs, sucre, nouilles sèches, fruits ou légumes secs) Aliments acides (cornichons, choucroute, olives) Aliments en conserve (bocal en verre hermétique ou boîte métallique) Aliments sucrés (confitures de fruits, bonbons) Plusieurs tranches de pain blanc sans conservateurs et des sacs à sandwich en plastique refermables. Du lait, des petits gobelets en papier et du film alimentaire. Papier pH ou solution indicatrice de pH. Accès à un réfrigérateur et un congélateur. (Facultatif) Un déshydrateur alimentaire et un aliment périssable à sécher Que faites vous: [Rassemblez les enfants pour une leçon. Dites-leur que nous allons parler de la conservation des aliments.] Nous devons connaître les conditions de développement des bactéries afin d'éviter que nos aliments ne se gâtent. Lorsque des bactéries ou des champignons se développent dans les aliments, ceux-ci deviennent souvent impropres à la consommation ; nous risquons d'être malades si nous les mangeons. Il est donc essentiel de savoir comment conserver nos aliments en toute sécurité. Examinons ces aliments. On y observe rarement la prolifération de bactéries. Comment le savons-nous ? Leur couleur, leur texture et leur goût restent inchangés. Ils ne dégagent pas de mauvaise odeur. Essayons d'en comprendre la raison. [Veuillez avertir les enfants des dangers liés à la dégustation d'aliments suspects. Rappelez-leur qu'il s'agit d'une expérience scientifique et qu'ils ne goûteront pas les aliments. Prévoyez d'autres échantillons à déguster dans un coin goûter. Si les enfants ont déjà goûté les aliments acides et les conserves, ils comprendront mieux les propriétés de ces aliments.] Tout d'abord, observez ces aliments. [Montrez les aliments secs.] Se conservent-ils mal dans le placard ou sur le plan de travail ? [Si les enfants ne sont pas sûrs, laissez des échantillons sur le plan de travail pendant quelques jours pour qu'ils puissent observer.] Qu'ont en commun ces aliments ? [Ils contiennent très peu d'eau ; ils sont secs.] L'eau est essentielle à la vie. On peut empêcher la prolifération des bactéries si les aliments sont suffisamment secs. Voici d'autres aliments qui se conservent bien. [Montrer des aliments marinés.] À votre avis, qu'est-ce qui les empêche de se gâter ? Quel est leur goût ? Leur goût acide indique qu'ils sont très acides. Les bactéries responsables de la détérioration des aliments ne se développent généralement pas dans les aliments très acides. Les aliments contenus dans ces boîtes ou bocaux vont-ils se gâter ? Pourquoi pas ? [Ils ont été scellés et chauffés pour détruire toutes les bactéries et les endospores qu'ils contiennent.] Se gâteraient-ils si on les sortait de leur contenant ? Pourquoi ? [D'autres bactéries présentes dans l'air et sur la vaisselle pourraient s'y développer. Les enfants peuvent faire l'expérience. Un aliment neutre comme les haricots verts ou les petits pois se gâtera plus vite. De nombreux fruits mettent plus de temps à se gâter car ils sont acides et sucrés.] Pensez-vous que les bactéries se développent dans un environnement sec ? Comment pourrions-nous vérifier cette hypothèse ? [Laissez les enfants réfléchir ensemble. Montrez-leur le pain et les sacs en plastique et demandez-leur s’ils pourraient concevoir une expérience pour tester si le séchage permet de conserver le pain.] Expérimentez le séchage Avant de commencer, établissez les règles de sécurité. Les enfants peuvent vous aider à en définir certaines. Parmi les règles essentielles : NE PAS OUVRIR DE CULTURE PRÉSENTANT DES MOISISSURES. Ne pas toucher les échantillons présentant une prolifération microbienne visible. Se laver les mains après manipulation des échantillons. Ne rien goûter. Une expérience typique peut être réalisée avec plusieurs échantillons de pain. Chacun est placé dans un sac plastique scellé et observé pendant environ une semaine. 45 L'expérience peut comprendre : 1) Un morceau de pain non traité comme témoin. 2) Un autre morceau est grillé ou cuit au four pour le sécher. Le séchage peut se faire en deux étapes : un échantillon Une photo de pain à peine sec et une autre de pain très sec. 3) Un morceau de pain et une cuillère à soupe d'eau. Cela permet de vérifier si une plus grande quantité d'eau entraîne une détérioration plus importante ou différente. 4) D'autres méthodes pour tester les idées des enfants, comme la réfrigération ou la congélation. L'ajout de sel ou de sucre déshydrate efficacement les micro-organismes ; ils pourraient donc avoir envie d'essayer. Une autre méthode pour expérimenter le séchage comme moyen de conservation des aliments consiste à sécher des fruits. Les pommes conviennent parfaitement. Comparez différents temps de séchage. Placez les échantillons dans des sacs en plastique et observez-les après séchage. Utilisez un échantillon frais comme témoin. Vous pourrez peut-être démontrer que des champignons peuvent se développer même si les aliments ne sont pas parfaitement secs. Expérimentation avec le lait Le lait permet de démontrer la détérioration rapide d'un aliment riche, ni très acide ni très salé. Il peut servir à tester des méthodes de conservation par réfrigération ou congélation. Le yaourt et le fromage sont des aliments fabriqués à partir de lait grâce à des bactéries. Ils se conservent mieux que le lait grâce à leur acidité et aux bonnes bactéries qu'ils contiennent. Le fromage, beaucoup plus sec que le lait, freine la prolifération bactérienne. Pour illustrer les conditions de détérioration du lait, versez une cuillère à soupe de lait dans un petit gobelet en papier et recouvrez-le de film alimentaire. Demandez aux enfants de préparer plusieurs gobelets et de les placer dans différentes conditions. Expliquez-leur qu'ils vont tester la détérioration par l'odeur et l'apparence. Invitez-les à réfléchir aux conditions de test. Par exemple : la température (à température ambiante ou au réfrigérateur ; un endroit chaud ou frais dans la pièce) et l'hygiène (un gobelet propre ou un gobelet légèrement sale ; un gobelet déjà utilisé ou un gobelet propre). Veillez à laisser l'échantillon au réfrigérateur suffisamment longtemps pour qu'il se détériore. Les enfants doivent comprendre que la réfrigération ralentit la prolifération microbienne, mais ne l'arrête pas. Concrètement, les restes conservés au réfrigérateur doivent être consommés dans les jours qui suivent. Demandez aux enfants de préparer un tableau pour les résultats et d'y consigner leurs observations. Au cours des deux ou trois jours suivants, invitez-les à examiner leurs cultures et à les sentir avec précaution. NE PAS OUVRIR NI SENTIR UNE CULTURE PRÉSENTANT DES MOISISSURES. Les spores de moisissures peuvent déclencher des allergies et des crises d'asthme. Vous pouvez également détecter une altération en ajoutant un indicateur de pH ou en utilisant du papier pH pour vérifier si le lait est devenu plus acide. Les bactéries ont tendance à acidifier le lait en se développant. Résumez vos conclusions À la fin de cette étude, discutez de vos conclusions et dressez une liste des mesures que nous pouvons prendre pour préserver la qualité de nos aliments et les rendre propres à la consommation. Voici quelques idées à inclure : 1) Gardez les aliments propres. Ne laissez pas de saletés s'y déposer. Lavez-vous les mains avant de préparer ou de consommer des aliments. Ne buvez pas le lait directement à la brique. 2) Ne laissez pas les aliments neutres (non acides) à des températures favorisant la prolifération bactérienne. Il est conseillé de conserver les aliments périssables à une température supérieure à 60 °C (140 °F) ou inférieure à 4 °C (40 °F). Les bactéries se développent très lentement, voire pas du tout, à ces températures. Les recommandations sanitaires pour les restaurants précisent qu'un aliment Par exemple, le lait ne doit pas rester à ces températures pendant plus de quatre heures au total avant d'être consommé. 3) Mettez les restes alimentaires au réfrigérateur rapidement après avoir terminé un repas. 4) Ne consommez pas d'aliments qui ont une apparence ou une odeur suspecte. Mieux vaut prévenir que guérir. Élimination sécuritaire des aliments avariés issus de vos expériences Pour commencer, utilisez de petites quantités de nourriture. Vous pouvez les jeter dans un sac hermétique à la poubelle ou, mieux encore, les déposer directement dans un conteneur à déchets. S'il est possible que vous ayez développé des quantités ou des types de micro-organismes potentiellement dangereux pour les éboueurs, ajoutez de l'eau de Javel diluée de moitié ou un autre désinfectant efficace à la culture. Laissez reposer pendant une heure avant de le jeter. 46 Ressources pour l'étude des procaryotes LE = primaire inférieur (6-9 ans) ; UE = primaire supérieur (9-12 ans) ; MS = collège Barker, David M. 2010.Archées : Amoureuses du sel, productrices de méthane, thermophiles et autres archées. Collection « Une classe à part ». Éditions Crabtree. Ce volume contient des informations de base intéressantes, mais il présente une confusion concernant la photosynthèse, un processus que les archées ne possèdent pas. UE-MS. Biskup, Angnieszka. 2010.Le monde surprenant des bactéries avec Max Axiom, super scientifique.Projet de fin d'études Presse. L'intrigue est mince, mais les faits sont bons, et le format graphique pourrait intéresser les lecteurs réticents. LE. Bjorklund, Ruth. 2006.Maladies d'origine alimentaireSérie d'alertes sanitaires. Référence Marshall Cavendish. Il couvre un large éventail d'agents infectieux, y compris les bactéries, et explique comment prévenir ces maladies. LE-UE. Brosnan, Katie. 2020.Jardin intestinal : un voyage au cœur du monde merveilleux de votre microbiome. Le Les illustrations représentent des microbes caricaturaux avec des visages, mais elles sont suffisamment explicites. Ce livre permettra aux enfants de mieux comprendre les bactéries et les archées. LE-UE. Davies, Nicola et Emily Sutton. 2014.Petites créatures : le monde des microbesCandlewick Press. Ceci L'album illustré est une introduction attrayante pour les élèves débutants du primaire. DK Smithsonian. 2021.Microlife : Les miracles du monde miniature révélés.Ce grand livre relié a Excellentes photomicrographies de bactéries et d'archées. Les enfants apprécieront les illustrations. Public cible : adultes. Dyer, Betsey Dexter. 2003.Guide pratique des bactériesComstock Publishing Associates de Cornell Presses universitaires. Cet ouvrage, une excellente introduction aux bactéries dans leur milieu naturel, est très accessible et susceptible d'inspirer des expéditions et des recherches plus approfondies. Niveau : UE à adulte. Eamer, Claire et Marie-Eve Tremblay. 2016.À l'intérieur de votre corps : un guide des microbes qui vous appellent MaisonKids Can Press. Ce livre est exact et à jour pour sa date de publication, ce qui est rare. Les illustrations amusantes et humoristiques s'accordent parfaitement avec l'histoire. Les enfants apprécieront les blagues. LE-UE. Farrell, Jeanette. 2016.Alliés invisibles : les microbes qui façonnent nos viesFarrar Straus Giroux. Ceci Ce livre primé raconte l'histoire des microbes que nous utilisons pour fabriquer du fromage, purifier notre eau et transformer notre chocolat. Une lecture intéressante pour les adultes. Farrell, Jeanette. 2016.Ennemis invisibles : Histoires de maladies infectieusesFarrar Straus Giroux. Ceci a Des récits captivants, contextualisés historiquement. L'ouvrage relate sept maladies majeures causées par des virus, des bactéries et des protozoaires. Une lecture intéressante pour les jeunes lecteurs et les adultes. Ingraham, John L. 2010.La marche des microbes : observer l'invisibleBelknap Press de Harvard Presses universitaires. L'auteur écrit dans un style captivant, accessible à un large public adulte. De nombreux passages peuvent être partagés avec les enfants. Le premier chapitre offre un bon aperçu des microbes et de leurs activités. Ouvrage vivement recommandé. Wearing, Judy. 2010.Bactéries : Staphylocoque, streptocoque, Clostridium et autres bactéries.Une série à part. Crabtree Publishing Co. Cet ouvrage fournit de bonnes informations sur les bactéries et leurs rôles bénéfiques, ainsi que leur implication dans les maladies. Certaines illustrations sont confuses, mais la plupart sont correctes. UE-MS. Weiss, James. 2021.La beauté cachée du monde microscopiqueLes illustrations aideront les enfants à former Une représentation réaliste des bactéries telles qu'elles apparaissent au microscope optique. Niveau secondaire. Public cible : adultes. Wild, Ailsa, Aviva Reed et Gregory Crocetti. 2014.Le calmar, le vibrion et la lune.Échelle libre Réseau. www.smallfriendsbooks.com. Ce livre raconte une histoire fascinante de symbiose mutualiste. Les bactéries y sont personnifiées, ce qui contribue à rendre le récit captivant. Ce livre est particulièrement précieux pour les connaissances qu'il apporte sur la vie microbienne. LE-UE Wild, Ailsa, Aviva Reed, Briony Barr et Gregory Crocetti. 2014.Zobi et le Zoox.Encore une merveilleuse Ce livre met en scène des microbes comme personnages. Il raconte la vie à l'intérieur d'un polype corallien, la multitude d'organismes qui le composent et leurs interactions. L'histoire est captivante et très instructive. Wild, Ailsa, Aviva Reed, Briony Barr et Gregory Crocetti. 2019.Nema et les Xénos : une histoire du sol CyclesJe recommande vivement tous les livres de ces auteurs. Ils permettront aux enfants de mieux comprendre les bactéries et leur rôle dans les écosystèmes. LE-UE 47 Sites Internet pour les procaryotes((Consulté en août 2022) Consultez le « Zoo microbien » pour découvrir les microbes procaryotes et eucaryotes. Il est disponible sur CD-ROM. Ce produit contient plus d'informations, d'animations et de sons que le site Web. Vous pouvez commander en ligne ou par téléphone au 517-353-9229.http://commtechlab.msu.edu/sites/dlc-me/zoo Le site web du Musée Micropolitain possède une superbe collection d'images de bactéries et de protistes. Vous pouvez y trouver… bactéries sous la « Collection d'eau douce ».http://www.microscopy-uk.org.uk/micropolitan/ Pour plus d'informations sur la croûte cryptobiotique et les cyanobactéries qui y vivent, voir :https://en.wikipedia. org/wiki/Biological_soil_crust Pour voir comment les bactéries se déplacent, rendez-vous sur ce site et sélectionnez « Vidéos ».http://www.rowland.harvard.edu/labs/ bactéries/index.html « À la rencontre du microcosme » est une vidéo qui présente des procaryotes et des eucaryotes microscopiques. Elle offre une bonne introduction à la culture microscopique. comparaison entre les deux.https://www.youtube.com/playlist? list=PLf3BfsFyWWMGYCZdbEfp2_w0RSCj0gV7X Le site « Life on Earth » de l’Université de Californie à Berkeley fournit des informations sur la morphologie et les fossiles. enregistrement et écologie des domaines Bacteria et Archaea.http://www.ucmp.berkeley.edu/alllife/ threedomains.html Pour en savoir plus sur le fonctionnement des bactéries dans le traitement des eaux usées, consultez :https://asm.org/Articles/2020/April/ Comment les microbes nous aident à recycler nos eaux usées Le site web du Musée américain d'histoire naturelle propose des vidéos d'un microbiologiste répondant aux questions des enfants. questions.https://www.amnh.org/explore/ology/microbiology/ask-a-scientist-about-microbes Guide de prononciation des termes relatifs aux procaryotes Acidianus(ah-Sid-eh-AN-us) Archées (are-KEY-ah) Clostridium tetani(klah-STRID-eh-um TET-an-eye) cryptobiotique (kryp-TOW-bye-AHHT-ick) cyanobactéries (Sigh-AN-oh-bac-TEAR-ee-eh) endospore (EN-doh-spore) entérocoques (En-ter-oh-COCK-us) pluriel, entérocoques (En-ter-oh-COCK-sigh) Escherichia coli(ES-cheh-REE-key-ah KOH-lye) Eukarya (vous-KARE-ee-eh) extrémophile (ek-STREAM-oh-File) halophile (HAY-low-File) Leptospira(Lep-tow-SPY-rah) méthanogène (mehTHANE-eh-jen) Methanosarcina (meh-THAN-ohsar-SIGH-nah) Nostoc(NOS-Tock) Procaryotes (Pro-kare-ee-OH-tee) procaryotes (Pro-kare-ee-AHHT-ick) protéobactéries (protee-OH-bac-TEAR-ee-eh) spirochète (spy-rowKEET) Staphylocoque(Personnel-ah-bas-COCKnous) Streptocoque(Strep-tow-COCK-us) 48 Chapitre 4 : Les protistes TétrahymèneIl s'agit d'une seule cellule. Ce protiste cilié actionne tous les cils présents à sa surface de manière coordonnée, ce qui lui permet de nager très rapidement. Il appartient à la lignée SAR, aux alvéolés et aux ciliés. Photomicrographie protégée par le droit d'auteur d'Aaron Bell et utilisée avec sa permission. Introduction – Enseignement sur les protistes Les protistes sont des organismes fascinants à étudier. Ils Les supergroupes eucaryotes constituent les principaux sont incroyablement différents des plantes et des animaux. groupes de protistes. Hormis les trois règnes valides Nombre d'entre eux sont suffisamment grands pour être (champignons, animaux et plantes), les supergroupes et les vus à l'œil nu, et les plus petits se prêtent bien à branches mineures, encore non classées, des organismes l'observation au microscope. Leur présence surprenante eucaryotes unicellulaires forment les protistes. dans une infusion de foin stimule la réflexion des enfants sur l'habitat de ces cellules étonnantes, leurs mécanismes de survie et leur origine dans la culture. Ce groupe d'organismes a connu des problèmes de dénomination. La plupart des biologistes l'appellent les protistes. Un ancien nom, Protoctista, est tombé en désuétude. Le terme de recherche le plus courant pour les enfants pour désigner ces organismes reste « protiste ». Si les enfants connaissent les principales branches des protistes et l'origine des règnes végétal, animal et fongique, ils auront une bonne base pour des études plus approfondies. L'histoire « L'arrivée des protistes » initie à l'étude de ces branches du vivant. Les protistes sont si diversifiés qu'une introduction plus approfondie nécessitera probablement deux leçons, voire plus. Une fois les connaissances de base acquises, les enfants seront sans Les protistes constituent-ils un véritable règne ? Non, selon la doute intéressés par des recherches et des expériences définition actuelle d'un règne. Un véritable règne regroupe supplémentaires avec les protistes. Une simple infusion de foin tous les descendants d'un ancêtre commun. Comme vous le constitue un bon point de départ. Consultez les instructions pour verrez sur le diagramme de ramification des protistes, les cette activité dans la section intitulée « Les protistes en classe ». règnes des champignons, des animaux et des plantes sont en réalité des branches continues de ce groupe d'eucaryotes. S'il existe un ancêtre eucaryote commun (et c'est probable), alors les protistes ne sont qu'une partie de sa descendance. Il est important de noter que la classification des protistes est encore en cours d'élaboration. Certains éléments du schéma présenté ici sont bien établis (les opisthocontes, par exemple), mais la branche des Excavata est susceptible La question la plus importante est de savoir s'il faut l'enseigner comme un règne. Le d'être remaniée. Quelques branches mineures ont été intégrées à la terme « règne des Protistes » n'a sa place que dans les cours d'histoire de la phylogénie des protistes, et la terminologie continue d'évoluer. Même si classification. Les manuels de biologie universitaire désignent ce groupe par certains aspects de cette classification venaient à changer, il est préférable de l'expression « protistes », sans le terme « règne ». Les biologistes, quant à eux, sont commencer l'étude des enfants avec ce schéma plutôt qu'avec des de plus en plus nombreux à le considérer comme tel. classifications plus anciennes. 49 L'avènement des protistes : les premiers eucaryotes Une version abrégée du récit précédent introduit chaque Les cellules eucaryotes se sont multipliées et ont évolué. Elles ont règne, permettant aux enfants de saisir les liens et le cycle exploré de nombreux modes de vie. Aujourd'hui, il en existe une de la vie. Pour cette leçon, disposez le tableau des immense diversité. Elles vivent dans l'eau ou des milieux humides procaryotes et alignez-y celui des protistes. Cette section du partout sur Terre. Nous examinerons les principales lignées et tableau peut être appelée « les protistes » ou « les verrons comment elles ont donné naissance aux autres règnes : les supergroupes des eucaryotes ». champignons, les animaux et les plantes. On appelle « protistes » Les élèves tireront profit de la visualisation d'images supplémentaires des protistes, en plus des cartes du tableau. Consultez le site web et la liste des ressources du livre pour trouver des sources. Cette leçon, en particulier la version avancée, présente un grand nombre de protistes ; les eucaryotes unicellulaires et leurs proches parents à corps multicellulaire simple. Ils constituent les branches des organismes eucaryotes ; les principaux groupes sont appelés les supergroupes eucaryotes. il est donc possible de la scinder et de la présenter en plusieurs séances. Sur notre tableau des protistes, on distingue deux branches principales. Vous pouvez commencer par la version simplifiée et approfondir L'une d'elles est appeléeAmorphéeet il s'agit d'un supergroupe. Son certains passages ultérieurement. nom signifie « sans forme ». Il fait référence aux cellules dépourvues de Introduction Lorsque la Terre était jeune, après l'apparition de l'eau liquide à sa surface, le miracle de la vie se produisit. Les premières cellules commencèrent à croître et à se reproduire, à échanger des informations et à expérimenter de nouvelles façons de vivre. Les bactéries et les archées se développèrent et la vie paroi cellulaire ; on en trouve de nombreuses chez les Amorphea. Cette lignée a également été appeléeunikonts.«« Uni » signifie « un » et « kont » signifie flagelle, une structure en forme de fouet qui permet aux cellules eucaryotes de se déplacer. Les Amorphea se divisent en deux branches principales : les amibozoaires et les opisthokontes. Ces noms peuvent paraître étranges, procaryote prospéra. Un autre type de cellule, doté de mais nous allons en découvrir la signification. caractéristiques particulières, fit son apparition. Cette cellule AmibozoairesLes amibes et les myxomycètes en sont des développa de nombreuses structures internes, dont un noyau, exemples. Les amibes sont dépourvues de paroi cellulaire. Leur une enveloppe spéciale contenant son ADN. Elle possédait une nom, d'origine grecque, signifie « vie changeante ». Ce sont des membrane externe, comme les autres cellules, mais aussi autre cellules unicellulaires qui se déplacent en déployant un lobe, chose. De minuscules fibres et tubes internes permettaient à sa appelé pseudopode, qui signifie « faux pied », ce qui leur membrane de se mouvoir et d'entourer et d'englober des confère une forme en constante évolution. Les amibes sont particules. Ce phénomène est fondamental pour la suite des communes dans les sols humides et les eaux stagnantes, et se événements et le développement de la vie plus complexe. [À nourrissent de bactéries et de petits eucaryotes. partir d'ici, consultez les versions simplifiée ou approfondie cidessous.] Histoire simplifiée Il y a environ deux milliards d'années, le troisième type de cellule a commencé à se développer. Les cyanobactéries avaient libéré suffisamment d'oxygène dans l'atmosphère pour être utilisables par une cellule – si tant est qu'elle puisse l'utiliser. Certaines Certaines amibes se construisent un minuscule abri. Cet abri s'appelle un test, et elles sont appeléesamibes à thèqueLes amibes dépourvues de test sont appelées amibes nuesou des gymnamoebas. Voici des images de ces deux types d'amibes. [Montrez aux enfants les structures clairement visibles sur les illustrations et présentez-leur les pseudopodes.] bactéries étaient capables d'utiliser l'oxygène, et notre troisième Certaines amibes vivent dans des matières végétales en décomposition. type de cellule a fusionné avec l'une d'elles. Cependant, elle n'a pas Elles se reproduisent par spores. Les cellules peuvent s'assembler et digéré la bactérie. Elle l'a conservée à l'intérieur comme centrale former des fructifications (sporanges), structures qui contiennent leurs énergétique. La bactérie est devenue la mitochondrie, une spores et facilitent leur dissémination. Ces amibes forment leurs structure présente dans les cellules eucaryotes. Elle a fourni à la fructifications lorsqu'elles n'ont plus de nourriture. On les appelle les cellule l'énergie nécessaire à la formation de structures plus amibes sporophiles.moisissures visqueusesou encore les amibes complexes, comme un noyau entouré de membranes. Cette sociales. Leurs fructifications peuvent ressembler à une boule de mucus association est appelée cellule eucaryote. [Sur les schémas, placez ou à de minuscules boules sur une tige. une flèche partant de la base de la lignée des protéobactéries et L'autre branche d'Amorphea est appelée la opisthokontes pointant vers la base de la lignée des eucaryotes sur le schéma des protistes.] « Eucaryote » signifie que la cellule possède un véritable noyau, ainsi que des mitochondries et d'autres structures internes. 50 Nous savons que « kont » signifie « flagelle ». « Opistho » est une racine grecque qui signifie « postérieur » ou « derrière ». Le flagelle des opisthocontes propulse… cellule vue de derrière. Notre schéma montre trois branches Le supergroupe suivant d'eucaryotes est appeléSARSAR, acronyme d'opisthocontes. L'une d'elles est un groupe de protistes de Straménopiles, Alvéolés et Rhizaires, regroupe de nombreux appelés les flagellés à collierLeur collerette est un anneau de organismes possédant des chloroplastes. Cependant, ces minuscules fibres. Les flagellés à collerette vivent aussi bien en chloroplastes ne leur ont pas été transmis par l'ingestion d'une milieu marin qu'en eau douce. cyanobactérie. Un ancêtre de cette lignée a en effet consommé une Les deux autres branches des opisthocontes ne figurent pas dans notre tableau car elles ne sont pas des protistes. À partir d'ancêtres opisthocontes, elles ont donné naissance aux règnes des champignons et des animaux. Nous étudierons ces lignées dans les algue rouge et a ainsi conservé les chloroplastes. [Vous pouvez ajouter une flèche pour illustrer cette transmission. Elle doit partir de la lignée des algues rouges et pointer au-dessus de la branche des Rhizaires sur la lignée SAR.] leçons suivantes. Nous allons d'abord examiner lestraménopiles.Elles comprennent les La deuxième branche principale des eucaryotes (les protistes) a algues brunes, les diatomées, les algues dorées et les algues jaune-vert. été appelée lesbikontsComme vous pouvez probablement le Leur nom signifie « flagelle recouvert de paille ». De nombreux deviner, « bikont » signifie « deux flagelles ». Il est probable membres de ce groupe possèdent deux flagelles, dont l'un est recouvert que l'ancêtre de cette lignée possédait deux flagelles ; nombre de petits poils. Outre les algues, on trouve dans la lignée des de ses membres actuels en possèdent également deux. Leurs straménopiles des organismes incolores, semblables à des flagelles sont situés à l'avant ou au milieu de la cellule, et ils la champignons. Un groupe, lesmoisissures d'eauElle provoque des propulsent dans l'eau. Il existe trois branches principales de ce maladies chez les plantes, notamment le mildiou de la pomme de terre côté de l'Arbre de Vie. et la mort subite du chêne. Archéplastidesest le supergroupe à gauche de notre tableau. Son nom Notre graphique présente des exemples d'algues straménopiles.algues signifie « plastides anciens ». Un plastide est une structure délimitée par brunesElles comprennent des algues géantes ainsi que des espèces une membrane, souvent colorée, dans une cellule végétale ou d'algue. microscopiques. Ce sont des algues très communes. Leurs proches [Du grecplastos[« moulé ».] Un événement TRÈS important pour la vie parents, lesdiatoméesLes diatomées sont des algues unicellulaires. sur Terre s'est produit dans la cellule ancestrale de ce groupe lors de Elles construisent de magnifiques petites enveloppes de silice autour de l'acquisition du premier plaste. Elle a absorbé une cellule de la lignée leurs cellules. [La silice est du dioxyde de silicium et ressemble au verre.] des cyanobactéries sans la digérer. L'ancienne cyanobactérie est restée Toutes jouent un rôle important dans les écosystèmes. Les diatomées dans la cellule et s'est transformée en chloroplaste, dont le nom signifie produisent environ 20 % de l'oxygène atmosphérique, soit à peu près « corps vert ». Ceci a permis aux descendants de cette cellule de réaliser autant que les forêts tropicales.chrysophytes à écaillesCe sont des la photosynthèse. Ce sont en réalité leurs chloroplastes, les cellules uniques d'algues dorées qui se recouvrent d'écailles de silice cyanobactéries qu'ils ont capturées, qui produisent la nourriture complexes. Elles vivent dans les écosystèmes d'eau douce. nécessaire à la vie terrestre et à une grande partie de la vie aquatique. [Sur les schémas, ajoutez une flèche reliant la base de la lignée des cyanobactéries au début de la branche des Archaeplastida.] LealvéolésLeur nom provient des petites poches situées sous la surface de leurs cellules. « Alvéo- » signifie « cavité » en latin. [Les petites poches de nos poumons sont appelées Une branche des Archaeplastida est devenue laalgues rougesLes alvéoles.] Les protistes alvéolés sont unicellulaires. Ils algues rouges vivent dans les océans. Quelques espèces vivent en comprennent les dinoflagellés, les ciliés et un groupe eau douce. Certaines sont unicellulaires, mais beaucoup sont de d'organismes pathogènes appelés apicomplexes. grandes algues visibles à l'œil nu. Certaines espèces déposent une couche protectrice de calcium autour d'elles ; on les appelle les algues corallines. Nous consommons des algues rouges ; l'algue nori est utilisée comme enveloppe pour les sushis. [Afficher la photo en couleur de l'algue rouge à insérer dans le tableau.] LedinoflagellésCes dinoflagellés tournoient dans l'eau. Leur nom signifie « flagellés tournoyants ». L'un de leurs flagelles est enroulé autour du centre de la cellule, tandis que l'autre la suit. De nombreuses espèces possèdent des cellules recouvertes de plaques de cellulose. [La cellulose constitue également les parois L'autre branche des Archaeplastida est celle desalgues vertesElles cellulaires des plantes et les fibres comme le coton.] Leurs flagelles sont très répandues en eau douce et dans les océans. On trouve sont logés dans deux sillons de leurs plaques. Certains dinoflagellés des organismes unicellulaires, des filaments et des formes plus réalisent la photosynthèse, comme les algues, tandis que d'autres grandes, comme la laitue de mer. Les principaux groupes d'algues sont hétérotrophes. Une prolifération importante de dinoflagellés vertes sont leschlorophyteset lecharophytes. Le groupe frère de dans les eaux côtières peut provoquer des marées rouges, qui la lignée des charophytes s'étend au-delà de notre tableau car les empoisonnent d'autres organismes marins. Certains dinoflagellés descendants de cette lignée ont donné naissance au règne végétal. sont des partenaires essentiels des coraux et d'autres espèces marines. Ils vivent à l'intérieur de leurs hôtes et les nourrissent. 51 LeciliésLes ciliés vivent dans l'eau et le sol. Une infusion de foin permet d'en cultiver de nombreux. Ils doivent leur nom aux cils, de courts filaments souples présents à leur surface. « Cilium » signifie « cil » en latin. Ces cils leur permettent de se déplacer très rapidement dans l'eau. Certains ciliés restent immobiles et utilisent leurs cils pour faire circuler l'eau et ainsi se nourrir. à une structure située près de la base de leur flagelle. LeapicomplexesLes parasites sont ainsi nommés d'après une « entre les cellules ». Certains organismes de cette lignée ont perdu structure située à l'une de leurs extrémités cellulaires, le complexe leurs mitochondries, probablement parce qu'ils se développent apical. Cette structure leur permet de se fixer à leurs hôtes, qui dans des environnements pauvres en oxygène. comprennent des vertébrés et des invertébrés. Le paludisme, qui Notre tableau peut sembler recenser de nombreux protistes, mais il y en appartient à ce groupe, est transmis d'une personne à l'autre par une espèce particulière de moustique. Maladie des régions tropicales, c'est l'une des maladies humaines les plus mortelles. Elle tue environ 600 000 personnes chaque année. Lemétamonadesnotamment un parasite intestinal, Giardia lamblia Cet organisme forme des kystes (structures de résistance) qui survivent dans l'eau et provoquent des diarrhées chez les personnes qui consomment de l'eau non traitée. On le trouve fréquemment dans les cours d'eau et les lacs, mais il peut être éliminé par ébullition ou filtration de l'eau. « Métamonade » signifie a encore plus dans la nature. On peut considérer les protistes comme « les multiples expériences de la nature sur la manière d'être une cellule ». Certains protistes ont donné naissance à de vastes lignées. – les branches de notre schéma. D'autres sont restées un seul La prochaine lignée SAR est laRhizariaLe nom provient du mot type de cellule. [La zone plate au-dessus de l'étiquette grecrhiza,Ce terme signifie « racine ». Les rhizaires se « Eucaryotes » sur le schéma indique qu'il peut exister d'autres nourrissent grâce à de fins prolongements filiformes de leur lignées.] Nous avons vu que trois lignées de protistes ont cytoplasme, semblables aux poils absorbants des racines des évolué pour donner naissance à d'autres règnes : les plantes. Les rhizaires comprennent les foraminifères et les champignons, les animaux et les plantes. Nous étudierons radiolaires, qui sont des organismes unicellulaires produisant l'apparition de ces règnes dans les leçons suivantes. des coquilles complexes (appelées tests). Leforaminifères(Les foraminifères (ou foraminifères) doivent leur nom aux orifices présents dans leur testicule. « Fora » est un mot latin qui signifie « ouverture » ou « fenêtre ». Le testicule des foraminifères comporte de nombreux petits orifices par lesquels ils se nourrissent. LeradiolairesElles forment des coquilles ajourées et dentelées, parsemées de nombreuses pointes. Il est difficile d'imaginer que ces magnifiques structures soient constituées d'une seule cellule. Histoire avancée (suite de l'introduction) Cette cellule primitive possédait de nombreuses membranes au sein de son cytoplasme. Quelques autres cellules, comme les cyanobactéries, peuvent présenter des replis de leur membrane cellulaire vers l'intérieur de leur cytoplasme, mais la plupart des procaryotes ne possèdent qu'une membrane externe. Vous l'aurez sans doute deviné, la cellule que nous décrivons ici est l'ancêtre des cellules eucaryotes, c'est-à-dire des cellules dotées d'un véritable Le dernier supergroupe d'eucaryotes est lefouillesou FouillesCe noyau. Chez les cellules eucaryotes, l'ADN est contenu dans une groupe doit son nom à la présence d'un sillon ou d'une poche dans structure particulière entourée de membranes : le noyau. leurs cellules, servant de réserve nutritive. Il comprend les euglènes et les kinétoplastidés, ainsi qu'un groupe de parasites appelés métamonades. Ce groupe pourrait ne pas constituer une branche unique ; des études complémentaires sont nécessaires. On ignore l'origine exacte de la lignée cellulaire eucaryote. Les premiers fossiles connus remontent à environ deux milliards d'années. Les eucaryotes partagent certaines caractéristiques avec les archées et d'autres avec les bactéries, mais ce groupe possède LeeuglènesLes euglènes sont des cellules uniques qui peuvent ou non des particularités qui lui sont propres, comme ses structures posséder des chloroplastes verts. Les biologistes pensent que leur ancêtre intracellulaires et sa capacité à phagocyter des particules. Ses s'est nourri d'une algue verte et en a conservé des fragments, notamment les descendants ont donné naissance aux protistes et aux autres chloroplastes. [Vous pouvez ajouter une flèche reliant la lignée des algues eucaryotes actuels. vertes à celle des euglènes pour illustrer cela.] Les euglènes peuvent engloutir Il y a plus de 2 milliards d'années, un événement crucial pour la vie des proies ou absorber la nourriture produite par d'autres êtres vivants. eucaryote s'est produit. À cette époque, les cyanobactéries avaient Celles qui possèdent des chloroplastes se nourrissent d'autres organismes si libéré suffisamment d'oxygène dans l'atmosphère terrestre pour elles se trouvent dans l'obscurité, lorsque leurs chloroplastes sont incapables que les êtres vivants puissent utiliser ce gaz en permanence. de produire leur propre nourriture. Lorsqu'elles sont capables d'utiliser l'oxygène, les cellules Kinétoplastidesincluretrypanosomesqui peuvent extraire beaucoup plus d'énergie de leur nourriture. Ce sont des parasites. Une espèce provoque le sommeil africain. La cellule en devenir eucaryote était incapable d'utiliser La trypanosomiase est une maladie transmise par un type de mouche l'oxygène. Elle a reçu l'aide d'une cellule procaryote, une piqueuse. Les trypanosomes infectent les mammifères, les oiseaux et les protéobactérie dont les cousines actuelles vivent à l'intérieur insectes. « Kinétoplastidé » signifie « corps moteur » et fait référence à… d'autres cellules et sont souvent responsables de maladies. 52 Il y a très longtemps, une cellule en devenir eucaryote a absorbé une amibes socialesLes amibes sont des organismes remarquables. Leur vie bactérie. Cependant, la cellule plus grande n'a pas digéré le procaryote. commence sous forme de cellules uniques qui se nourrissent de bactéries La petite cellule pouvait utiliser l'oxygène pour extraire une grande présentes dans la végétation en décomposition. Les amibes se multiplient, quantité d'énergie des molécules alimentaires de la cellule plus grande. produisant de nombreuses cellules distinctes. Lorsque les ressources Elle a fourni à cette dernière les molécules de stockage d'énergie alimentaires viennent à manquer, ces amibes s'assemblent et migrent vers un nécessaires à la construction de structures complexes et au endroit propice à la sporulation. Elles forment alors une structure appelée fonctionnement de ses processus vitaux. Au fil du temps, la cellule sporange ou fructification, qui peut présenter des formes étonnantes. Le procaryote est devenue une partie intégrante de la cellule eucaryote sporange s'élève de quelques millimètres au-dessus de la surface, puis libère plus grande. Elle est devenue la mitochondrie. des spores qui peuvent être dispersées par le vent vers un nouvel Cela paraît simple, mais ça ne l'était pas. Il est possible que ce phénomène soit unique. L'inclusion d'une cellule dans une autre implique de nombreuses conditions complexes et difficiles. Sur notre schéma, un trait épais représente la lignée cellulaire eucaryote. Sa base est en pointillés car nous ignorons précisément comment et quand cette lignée est apparue. Une flèche indique qu'une cellule issue des protéobactéries a intégré la lignée cellulaire eucaryote. environnement. Ces spores germent et donnent naissance à de nouvelles Les cellules eucaryotes se sont développées et reproduites, et ont amibes. LeopisthokontesCe groupe comprend les flagellés à collerette, le règne fongique et le règne animal. Son nom provient de deux racines grecques : « opistho- », qui signifie « postérieur », et « -kont », qui fait référence au flagelle. Les opisthocontes possèdent un unique flagelle qui propulse la cellule par l’arrière. Certains en sont dépourvus. [Les illustrations montrent souvent des flagelles postérieurs, mais la plupart des protistes possèdent des flagelles antérieurs qui les tirent.] évolué au fil du temps. La première grande division a donné Leflagellés à collierLes choanoflagellés, également appelés naissance à deux branches. L'une comprenait de nombreux choanoflagellés, vivent sous forme de cellules isolées ou de petites individus dotés d'un seul flagelle, tandis que la plupart des autres colonies. Ils ressemblent beaucoup aux cellules qui tapissent branches conservaient les deux flagelles habituels. Les flagelles, en l'intérieur des éponges. Certains restent ancrés à un endroit précis, forme de fouet, permettent à la cellule de se déplacer dans l'eau. leur flagelle faisant circuler l'eau pour acheminer la nourriture [Les flagelles eucaryotes sont beaucoup plus grands et plus jusqu'à leur collerette de fibrilles, au lieu de propulser les cellules complexes que les flagelles procaryotes.] dans l'eau. Commençons par examiner la branche à flagelle unique. Il s'agit de la Il existe deux lignées d'opisthocontes devenues multicellulaires : les Amorphée,anciennement appelé leunikontsLe nom « Amorphea », qui champignons et les animaux. Sur notre schéma, les lignes qui signifie « informe », fait référence aux nombreuses cellules de cette dépassent du bord indiquent l'existence d'une descendance plus lignée dépourvues de paroi cellulaire rigide. Vous savez que « uni » nombreuse. Nous examinerons plus tard les schémas de leurs signifie « un », comme dans monocycle. Devinez ce que signifie « kont ». règnes respectifs. Eh oui, cela fait référence au flagelle. La plupart des cellules de cette branche possèdent un seul flagelle, voire aucun. Les lignées Amorphea sont lesAmoebozoaireset leOpisthokonta. La deuxième grande branche des protistes a été appelée labikont Groupe. Pouvez-vous nous dire ce que signifie « bikonte » ? Oui, cela signifie « à deux flagelles ». L'ancêtre des bikontes possédait Examinons leAmoebozoairesLe nom « amibe » signifie « changeant probablement deux flagelles, tout comme de nombreuses espèces », et ces protistes changent de forme en se déplaçant. De actuelles. Les flagelles des bikontes sont généralement situés à nombreuses amibes de cette branche ont perdu leurs flagelles et l'avant ou au milieu des cellules et permettent à ces dernières de se leur paroi cellulaire, bien que leurs ancêtres possédaient déplacer dans l'eau, au lieu de s'y propulser. probablement ces structures. Elles sont devenues des amibes qui se déplacent en rampant sur des lobes digitiformes de leurs cellules. Ces lobes sont appelés pseudopodes, ce qui signifie « faux pieds ». Certaines amibes collent ensemble de minuscules particules de sable ou de matière organique pour se constituer une coque appelée test. Les amibes qui fabriquent un test sont appeléesamibes à thèqueCeux qui n'ont pas passé de test sont appelésamibes nues ougymnamoebas. (Gymnos(signifie « nu ») Les amibozoaires comprennent les amibes sociales, également appelées moisissures visqueusesCertaines d'entre elles possèdent des flagelles pendant une partie de leur cycle de vie. La lignée à gauche de notre tableau est appelée la Archéplastides« Archae- » signifie « ancien », et les plastes sont des structures cellulaires des organismes photosynthétiques. À l'origine de cette lignée, un événement rare et miraculeux a rendu possible la vie diversifiée sur Terre. Une cyanobactérie ancestrale a réussi à pénétrer dans une cellule eucaryote et à s'y maintenir, vivant dans le cytoplasme et produisant de la nourriture pour la cellule hôte. Elle est devenue le chloroplaste (« corps vert »). Les Archaeplastida descendent de cette première cellule à posséder un chloroplaste. [Le chloroplaste et 53 Les cyanobactéries présentent aujourd'hui des différences, mais elles partageaient Lorsque des biologistes ont observé leurs chloroplastes au microscope un ancêtre commun. électronique, ils ont fait une découverte surprenante : ces algues Les chloroplastes sont essentiels à toute forme de vie. Les algues et les plantes qui en possèdent, ainsi que les cyanobactéries, captent l'énergie solaire et produisent la nourriture nécessaire à la quasi-totalité du reste du vivant sur Terre. Lealgues rouges, ourhodophytesLes algues rouges appartiennent à une branche des Archaeplastida. Ces algues possèdent deux pigments, un vert et un rouge, mais le rouge recouvre souvent le vert. Elles sont dépourvues de flagelles tout au long de leur cycle de vie. Presque toutes les algues rouges vivent en milieu marin, mais quelques-unes se développent en eau douce. Ce groupe comprend des organismes unicellulaires, des filaments et des formes multicellulaires plus grandes qui se développent en feuilles ou en branches aplaties. Les espèces corallines déposent du carbonate de calcium autour d'elles, et certaines ressemblent à des croûtes roses sur les rochers des bassins de marée. Les algues corallines jouent un rôle important dans la construction des récifs. Nous consommons plusieurs types d'algues rouges. Le nori, utilisé comme enveloppe pour les sushis, est fabriqué à partir de l'algue rouge du genre *Cylinaria*.PorphyraLa dulse et le laver sont deux espèces comestibles originaires des côtes irlandaises. L'agar-agar et le possédaient des membranes supplémentaires autour de leurs chloroplastes. Il semblerait qu'un ancêtre des straménopiles et des alvéolés ait consommé une algue rouge et l'ait conservée comme source de chloroplastes. [Les Archaeplastida ont perdu leur capacité à ingérer des particules alimentaires après avoir acquis des chloroplastes. D'autres lignées ont conservé cette capacité et l'ont utilisée pour acquérir des chloroplastes auprès d'autres algues, et non directement auprès de la lignée des cyanobactéries. Vous pouvez ajouter une flèche sur le schéma pour indiquer le transfert secondaire de chloroplastes. Cette flèche devrait partir de la base de la lignée des algues rouges et pointer vers la lignée SAR supérieure.] La branche de gauche, lastraménopiles,C'est ce qui donne le « S » dans le nom SAR. Ils possèdent (ou leurs ancêtres possédaient) deux flagelles, dont l'un est recouvert de petits poils et est appelé flagelle à soies. Le terme « straménopile » vient des mots latins signifiant paille (stramen) et les cheveux ( pilusLeurs deux flagelles différents valent à ce groupe un autre nom : les hétérocontes. « Hétéro » signifie « autre » ou « différent » et « kont » fait référence aux flagelles. carraghénane sont extraits d'algues rouges et utilisés comme Les straménopiles comprennent plusieurs grands groupes d'organismes épaississants alimentaires. marins.algues brunes, alias le phéophytes(«Les « plantes brunes » Lealgues vertesLes Archaeplastida constituent une autre branche. Leurs chloroplastes sont verts, comme l'herbe. Les algues vertes se présentent sous différentes formes : unicellulaires, filamenteuses, coloniales, et même des espèces multicellulaires plus grandes. On les trouve partout sur Terre, aussi bien en eau douce qu'en milieu marin. Certaines vivent en association avec des champignons dans les lichens. Une branche de ces algues vertes, leschlorophytes(« plantes vertes”), comprendVolvox, qui se développe sous forme de boule de cellules, et Chlorelle, qui est parfois cultivée pour l'alimentation. Les formes marines comprennentUlva, communément appelée laitue de mer. Une autre branche des algues vertes est appelée la charophytesCette lignée est sœur du règne végétal. Elle comprend les algues filamenteuses et celles à ramifications plus complexes. Ces dernières, d'eau douce, sont communément appelées characées ou lysimaques. Elles possèdent des filaments ramifiés et ressemblent beaucoup aux plantes. La ligne qui s'étend jusqu'au bord du schéma comprennent les algues brunes et les varechs, les plus grandes des algues marines.diatomées Les diatomées sont des algues unicellulaires qui se développent en formant des « maisons de verre » – des parois cellulaires externes appelées frustules. Les frustules de diatomées sont composés de deux moitiés similaires qui s'emboîtent l'une dans l'autre, à la manière d'une boîte de Petri. Le terme « diatomée » signifie « coupée en deux » et fait référence à leur coque en deux parties. Les frustules présentent des formes géométriques étonnantes, notamment triangulaires, mais la plupart sont de forme arrondie ou allongées et fines. Les diatomées sont dépourvues de flagelles. Elles constituent un élément majeur du plancton et sont d'importants producteurs d'oxygène. Lealgues dorées(chrysophytesLes chrysophytes et les algues jaune-vert (xanthophytes) sont deux groupes de straménopiles communs en eau douce. Les chrysophytes à écailles forment un groupe particulièrement remarquable. Ces organismes unicellulaires enrobent leurs cellules d'écailles de silice complexes. « Chryso- » signifie « doré » et « xantho- » signifie « jaune ». représente les plantes terrestres et illustre leur étroite De plus, les straménopiles comprennent des protistes ressemblant à des parenté avec les charophytes. champignons. Les moisissures aquatiques et les mildious,oomycètesLes Revenons à l'arbre de vie et suivons une autre lignée, une labyrinthulomycètes sont des décomposeurs, et nombre d'entre eux lignée importante appeléeSARSon nom provient de ses trois branches principales : les straménopiles, les alvéolés et les rhizaires. Les straménopiles et les alvéolés sont des branches sœurs situées en haut de notre tableau.. Ces deux lignées comprennent des algues parmi leurs membres. Ces algues sont brunes, rougeâtres ou dorées. 54 provoquent des maladies chez les plantes et les animaux. Ils sont responsables du mildiou de la pomme de terre, qui a causé une terrible famine en Irlande au milieu des années 1840. Un oomycète est à l'origine de la maladie de la mort subite du chêne, qui s'attaque aux chênes en Californie. Les labyrinthulomycètes, qui forment des réseaux de mucus, sont des décomposeurs présents en eau douce et en eau de mer.Oo-” signifie « œuf » et «mycètes« » signifie « champignon ». Oomycètes et On a d'abord cru que les filaments visqueux étaient des champignons. [Notez Au microscope, on observe généralement de nombreux que de nombreuses moisissures aquatiques vivent dans des sols humides ciliés qui s'agitent. Parmi les ciliés communs, on trouve : plutôt que dans l'eau. Précisez que les mildious ne sont pas les oïdiums communs, qui sont de véritables champignons.] Paramécie, Tétrahymène,Stentor,Vorticellaet le cilié prédateurDidinium, qui se nourrit d'autres ciliés. La branche sœur des staménopiles estAlvéolé, les alvéolés. Ce Le troisième groupe d'alvéolés est leapicomplexesIls doivent groupe est ainsi nommé en raison des petites poches situées sous leur nom à une structure présente dans leurs cellules : le la membrane cellulaire.AlvéoLe terme « alvéole » signifie « cavité » complexe apical. Les apicomplexes sont des parasites en latin. Les petits sacs présents dans nos poumons sont appelés d’animaux, vertébrés et invertébrés. Ils utilisent leur complexe alvéoles. Les protistes alvéolés comprennent les dinoflagellés, les apical pour se fixer aux cellules hôtes et pénétrer dans ciliés et les apicomplexes. l’organisme de l’animal. LedinoflagellésIls constituent une part importante du plancton Malaria, genrePlasmodiumCe parasite appartient à cette océanique. Certains vivent en eau douce. Ce sont presque tous des lignée. Comme beaucoup d'autres, il a deux hôtes : les organismes unicellulaires. Beaucoup possèdent une enveloppe moustiques et les humains. Le paludisme est une maladie très externe rainurée composée de plaques de cellulose. Ils sont dotés grave dans les climats chauds et il tue de nombreuses de deux flagelles : l’un situé dans une rainure qui entoure la cellule, personnes en Afrique. Selon l'Organisation mondiale de la et l’autre qui s’étend à l’extérieur de celle-ci. Lorsque ces flagelles Santé, près de la moitié de la population mondiale est exposée battent, les cellules tournoient dans l’eau. C’est ainsi qu’ils ont reçu au risque de paludisme. Les scientifiques étudient le paludisme leur nom.Dinosaures« » est une racine grecque qui signifie afin de trouver de meilleurs médicaments contre cette maladie « tourbillonnant ». très difficile à soigner. L'étude de ses cellules a révélé une Les dinoflagellés comprennent des hétérotrophes qui se nourrissent de bactéries et d'autres protistes, et des photosynthétiques possédant des chloroplastes brunâtres. Certains dinoflagellés vivent dans les tissus d'anémones de mer, de coraux et d'autres organismes marins. Ils produisent de la nourriture pour surprise : elle dévoile son histoire très ancienne.Plasmodium L'ancêtre de ce parasite possédait autrefois un chloroplaste. Il en subsiste un vestige dans ses cellules, et il est essentiel à sa survie. [Cette découverte pourrait mener à de nouveaux traitements contre le paludisme, peut-être à base d'herbicides.] leurs hôtes par photosynthèse. Ces organismes symbiotiques sont Parmi les autres apicomplexes, on trouveCryptosporidium, qui appelés zooxanthelles et sont dépourvus de plaques cellulosiques. provoque la diarrhée chez les bovins et les humains, et Il arrive que les dinoflagellés prolifèrent en si grand nombre qu'ils colorent l'eau : c'est ce qu'on appelle une efflorescence algale. Ces efflorescences présentent un aspect intéressant : nombre de ces organismes deviennent bioluminescents lorsque l'eau est agitée. Toxoplasme, qui provoque une maladie chez les chats, les humains et les rongeurs. [L'illustration de l'apicomplexe pour le tableau est un kyste au repos deCryptosporidium, une structure très résistante au chlore.] Cependant, certaines dinoflagellés sont également dangereuses : Pour revenir à la branche SAR, examinons la troisième ce sont les marées rouges. Certains dinoflagellés produisent une lignée,RhizariaLes membres de ce groupe ressemblent à toxine mortelle pour la faune marine et même pour l'homme qui des amibes, mais ils ne possèdent pas les grands consomme des coquillages provenant de la zone touchée. Les pseudopodes à lobes obtus des amibozoaires. Ils se coquillages ingèrent les dinoflagellés et transmettent ainsi la toxine nourrissent plutôt grâce à de fins filaments de cytoplasme. aux personnes qui les consomment. Le nom « Rhizaria » provient de l'aspect racinaire de leurs LeciliésLes Ciliophora constituent un autre groupe d'alvéolés. Ces protistes sont très communs dans les sols humides et les milieux d'eau douce et marins. Ils se pseudopodes.Rhiza« Rhizarian » est un mot grec qui signifie « racine ». Les rhizarians construisent généralement de magnifiques et complexes coquilles. nourrissent généralement de bactéries. Ils tirent leur nom LeforaminifèresouforaminifèresCe sont des cellules uniques des structures filiformes qu'ils utilisent pour se déplacer ou dotées d'un tubercule pouvant présenter des chambres spiralées et se nourrir.Cil« » est une racine latine qui signifie « cil » ; « atteindre plusieurs centimètres de diamètre. Les plus grandes phoro”« Porter » est un mot grec qui signifie « porter ». Leurs cils travaillent ensemble pour propulser la cellule dans l’eau très rapidement. abritent généralement des dinoflagellés zooxanthelles. La plupart Lorsqu'on prépare une infusion de foin, de nombreux ciliés petits orifices. En latin, le mot désignant une ouverture est « s'y développent généralement. Ces organismes peuvent vivre avec peu d'oxygène et prospèrent dans l'infusion. Ils se développent à partir de kystes, structures de résistance courantes dans le sol et sur les plantes. mesurent cependant moins d'un millimètre et sont parfois appelées « sables vivants ». Le tubercule est percé de nombreux foramenD'où le nom du groupe. Les foraminifères sont principalement marins et vivent pour la plupart dans la zone benthique (fond de l'océan). Comme leurs tests contiennent des composés calciques et se fossilisent bien, ils ont laissé des traces. 55 un riche registre fossile remontant à la période cambrienne. Un autre groupe de Rhizaria prospère à la surface de l'océan et de l'eau douce. Il s'agit desradiolairesLes radiolaires sont des protistes unicellulaires qui fabriquent des tests complexes en silice. Ces tests présentent de nombreux orifices, et les pseudopodes étroits s'étendent à travers ces ouvertures. Le nom « radiolaire » dérive du latin et signifie « petit rayon de soleil ». radiolusCela fait référence aux nombreux pseudopodes minuscules qui s'étendent dans toutes les directions à partir de la cellule. Les radiolaires possèdent également un long registre fossile, du Cambrien à nos jours. Certains radiolaires abritent des zooxanthelles. Le dernier supergroupe eucaryote, lefouillesou Fouilles, se trouve sur la branche de Bikont au moins pour l'instant. On ignore encore la composition exacte et la répartition de ces protistes. Leur nom provient d'une dépression présente dans leurs cellules : une gouttière nourricière ou une poche située à une extrémité de la cellule. Les excavates sont des organismes unicellulaires qui comprennent des groupes libres et des groupes parasites. LeeuglènesLes euglènes appartiennent à la lignée des excavates. Ces organismes ont causé beaucoup de confusion lorsque les biologistes ont tenté de classer toute forme de vie dans le règne végétal ou le règne animal. Certaines euglènes possèdent des chloroplastes, probablement hérités de leur ancêtre qui consommait une algue verte, tandis que d'autres en sont dépourvues et sont hétérotrophes. Les euglènes vivent en eau douce. Elles possèdent deux flagelles, bien que l'un d'eux puisse être très court chez les espèces photosynthétiques. Elles sont recouvertes d'une pellicule enroulée en spirale. Certaines euglènes sont longues et fines, d'autres arrondies. [Vous pouvez observer de superbes images d'euglènes à l'adresse http://tolweb.org/Euglenida/97461. Sur le schéma, vous pouvez tracer une flèche reliant la lignée des algues vertes à la base de la lignée des euglènes pour illustrer le transfert secondaire des chloroplastes.] LekinétoplastidesIls comprennent des protistes parasites étroitement apparentés aux euglènes. Tous deux appartiennent au clade des Euglenozoa.TrypanosomesLes trypanosomes appartiennent au groupe des kinétoplastidés. La maladie du sommeil africaine est une maladie causée par des trypanosomes. Les métamonades sont dépourvues de mitochondries. Leur nom signifie « entre les cellules », car les scientifiques pensaient initialement qu'elles se situaient, par leur structure, entre les procaryotes et les eucaryotes. Elles vivent dans des milieux pauvres en oxygène, comme le tube digestif des animaux. C'est pourquoi elles n'ont pas de mitochondries. En étudiant attentivement les métamonades, les biologistes ont découvert des preuves que ces cellules en avaient autrefois possédé. On sait aujourd'hui que les métamonades appartiennent au groupe des excavates. [Parmi les preuves de la présence passée de mitochondries chez les métamonades, on trouve des vestiges de structures dégénérées dans le cytoplasme et des gènes mitochondriaux dans leur ADN.] Certaines espèces de métamonades vivent dans l'intestin des termites et leur permettent de digérer le bois. D'autres infectent l'homme. L'une des plus notoires est Giardia, qui provoque la diarrhée. Elle se transmet par l'eau contaminée et constitue un problème dans les cours d'eau des zones sauvages. Elle peut infecter de nombreux mammifères, tels que les chats, les chiens, les cerfs et les castors. En camping ou en randonnée, l'eau potable provenant des ruisseaux ou des lacs doit être bouillie ou filtrée pour éliminer la bactérie. GiardiaLes cellules deGiardiaIls possèdent deux noyaux et quatre paires de flagelles. Ils semblent être doublés, ce qui donne à leur groupe le nomDiplomonades, « cellules doubles ». [Tous les flagelles ne sont pas visibles sur l'image.] Comme vous pouvez le constater sur notre schéma, les cellules eucaryotes ont beaucoup expérimenté différents modes de vie. Ces expériences ont donné naissance aux supergroupes eucaryotes. Bien que notre schéma comprenne de nombreux protistes, la diversité des cellules eucaryotes est encore plus vaste. Plusieurs branches mineures n'y figurent pas. Les scientifiques n'ont pas encore déterminé la lignée de certains protistes. Ceux qui apparaissent sur notre schéma représentent les lignées principales. [De nombreux genres de protistes n'ont pas été classés. Parmi les lignées mineures notables, on peut citer les cryptophytes, qui pourraient être apparentés aux Archaeplastida, et les haptophytes, qui pourraient être apparentés aux SAR.] [Remarque : cette leçon d’introduction est un simple aperçu et de nombreux protistes n’y figurent pas. Si vous pensez que vos enfants souhaitent en savoir plus, vous pouvez ajouter les informations cidessous.] Ce trypanosome est transmis à l'homme par la mouche tsé-tsé, un Par exemple, les haptophytes sont un groupe d'algues insecte piqueur. Les trypanosomes possèdent un flagelle unique et unicellulaires très répandues dans le plancton, mais non une longue membrane ondulée sur le côté de la cellule. Ce groupe représentées sur le graphique. Un groupe d'entre elles, les doit son nom à une structure située près de la base du flagelle, le coccolithophores (« graines à baies »), se recouvre de kinétoplaste, dont le nom signifie « corps mobile ». plaques contenant du calcium. Ces plaques, appelées LemétamonadesLes Excavates constituent un autre groupe important. Au départ, les biologistes pensaient qu'ils pouvaient descendre de la première cellule eucaryote, car les métamonades… 56 coccolithes, sont retrouvées dans les archives fossiles jusqu'au Jurassique. [Voir les sites web surEmiliania Huxleyi si les enfants souhaitent voir ces organismes.] Cette version en noir et blanc des cartes représentant les protistes sur l'arbre de vie est destinée à l'enseignant. Les cartes en couleur à placer sur l'arbre se trouvent en annexe. « Unikont » signifie « flagelle unique ». flagellé à collier, choanoflagellé flagellé à collier,Codosiga botrytis, par DJ Hubberd, J. Cell Science 1975 Protiste–Amorphée–Amoebozoaires amibe nue(gymnamoeba) Cette cellule unique déploie des lobes émoussés de son cytoplasme lorsqu'elle se déplace. Ces lobes sont appelés pseudopodes, ce qui signifie « faux pieds ». Les amibes utilisent leurs pseudopodes pour ingérer des particules alimentaires. Il s'agit d'une amibe nue ; elle est dépourvue de test (coque). Taille : environ 400 µm de long. © Peter Siver, Chrysophytes, LLC., autorisé pour une utilisation dans cette publication Protiste–Amorphée Amoebozoa –Amibe testate Cette amibe du genreDiffugiaElle a construit un test à partir de grains de sable et d'autres débris qu'elle a agglomérés. Ces tests survivent souvent à la mort de l'amibe. Des tests fossiles datant du Protérozoïque sont connus. Taille : le test mesure environ 100 micromètres (µm) de long. ©Jason Oyadomari, utilisé avec permission ; les organismes en forme de bâtonnets à l'arrière-plan sont des diatomées. Protiste–Amorphea – Amoebozoa Mycetozoa –Moisissures visqueuses Les myxomycètes ou amibes sociales commencent leur cycle de vie sous forme de cellules isolées. Plus tard, ces cellules s'assemblent pour former un sporange, structure au sein de laquelle se forment les spores. Ces sporanges appartiennent àDiachea leucopodeet mesurent environ 2 mm de haut. ©Alain Michaud, utilisé avec autorisation. La photo en couleur est visible à l'adresse suivante : http://www.discoverlife.org/20/q?search=Eumycetozoa 57 – Amorphée okonts -flagellés à collier ll montre le m unique et postérieur des opisthocontes. Son collier g est composé de minuscules fibrilles. Le flagelle La cellule transporte ou apporte de la nourriture dans le collier des espèces sessiles. Taille du corps cellulaire : 3-5 µm x 5-15 µm. « Bikont » signifie « deux » flagelles. Elles possèdent généralement deux flagelles ou plus à l'avant ou au milieu de leurs cellules. Chlamydomonas, une algue verte de la lignée des chlorophytes. L'image de Chlamydomonas est du domaine public et provient du service de microscopie électronique de Dartmouth. Protiste–Bikontes – Archaeplastida algues rouges Cette algue rouge s'est échouée sur une plage du sud de la Californie. Elle mesure environ 15 centimètres de long, de son crampon à l'extrémité de ses frondes. Ces dernières sont épaisses et gélatineuses. Elles sont d'un rouge foncé, mais certaines algues rouges sont vertes. Protiste–Bikontes – Archaeplastida Algues vertes -Chlorophytes La branche des chlorophytes, qui regroupe les algues vertes, comprendPédiastreCette algue forme des colonies en forme d'étoile et vit en eau douce. Chaque cellule mesure de 10 à 15 µm de diamètre. Les colonies comptent de 4 à 64 cellules. Les chloroplastes présents dans chacune de ses cellules lui confèrent une couleur vert vif. PédiastrePhoto © Jason Oyadomari, utilisée avec son autorisation. Photo d'algue rouge par l'auteur. 58 Protiste–Bikontes – Archaeplastida Algues vertes -Charophytes La branche des charophytes des algues vertes comprendNitella, une algue d'eau douce à nombreuses ramifications verticillées. Son nom commun est chara. Chaque ramification mesure environ 2 mm de diamètre et environ 15 cm de long. Tapis deNitella r petite faune aquatique. ©Jason Oyadomari et utilisé avec permission. Protiste–Bikontes Straménopiles SAR Ceci est unmoisissure d'eau(oomycète), du genre BrémielleIl provoque le mildiou, une maladie qui affecte des plantes comme la vigne et le tournesol. Les spores se forment à l'extrémité des branches et sont disséminées par le vent vers d'autres plantes. Taille : environ 300 µm de longueur. L'image de l'oomycète est une gracieuseté du Service de recherche agricole du Département de l'agriculture des États-Unis. Protiste–Bikontes – Straménopiles SAR Cette algue est unealgues brunesUn fragment de fronde s'est échoué sur une plage californienne. Les structures sphériques sont des flotteurs remplis d'air. Les frondes sont dépourvues de vaisseaux et de fibres. Les flotteurs mesurent environ 3 cm de long. La fronde entière mesure plus d'un mètre de long. Photo d'algue brune par l'auteur 59 Protiste–Bikontes – Straménopiles SAR CediatoméeLa diatomée, une algue unicellulaire, possède une coque externe triangulaire en silice, appelée frustule. Cette coque est composée de deux moitiés qui s'emboîtent et se chevauchent latéralement. D'autres diatomées ont des formes circulaires, ovales ou allongées et sinueuses. Plage de tailles : 20-200 µm ©Aaron Bell, utilisé avec sa permission Protiste–Bikonts – Straménopiles SAR - Chrysophytes L'échellechrysophytessont unicellulaires algues doréesqui se recouvrent d'écailles de silice complexes. Ce sont d'importants producteurs en eau douce. Il s'agit de l'espèce :Mallomonas lychenensisElle mesure 15 à 20 µm de long. Ses écailles mesurent environ 5 µm de long. © Peter Siver, Chrysophytes, LLC., autorisé pour une utilisation dans cette publication Protiste–Bikontes – Alvéolés SAR Cilié, genreTétrahymène Cette cellule unique est recouverte de cils. La zone plus épaisse en haut à droite marque l'ouverture de son sillon oral, par lequel elle absorbe les bactéries et autres particules solides. Elle peut également absorber des aliments dissous. Longueur : 50 µm ©Aaron Bell, utilisé avec sa permission 60 Protiste–Bikontes – Alvéolés SAR CedinoflagelléIl possède un sillon périphérique au milieu de son test. L'un de ses flagelles se loge dans ce sillon, l'autre dans un sillon perpendiculaire. Certains dinoflagellés ont des tests munis de longues « cornes », d'autres en sont dépourvus. Son nom signifie « flagellé tournoyant ». Taille : 20 à 200 µm. ©Aaron Bell, utilisé avec sa permission Protiste–Bikontes – Alvéolés SAR Cryptosporidiumest un apicomplexeIl s'agit d'un parasite intestinal. Voici son kyste, très résistant au chlore ; les traitements d'eau classiques peuvent donc s'avérer inefficaces. Il infecte les bovins et les humains et peut contaminer les réseaux d'eau potable. Taille : 4-6 µm ©Aaron Bell, utilisé avec sa permission Protiste–Bikontes – Rhizaires SAR – Radiolaires Il s'agit du test d'unradiolaireCes organismes font partie du plancton marin. Une seule cellule utilise la silice pour construire ce test complexe. Les radiolaires se nourrissent grâce à de fines projections de cytoplasme appelées axopodes, qui capturent les bactéries. Leur diamètre moyen est de 100 à 200 µm. © Roger Heady de l'Université nationale australienne, utilisé avec son autorisation 61 bélier) y minuscule C'est dehors avec orams e à l'intérieur d pour eter de Protiste–Bikonts – Excavata Euglenozoaires–Euglena EuglenasElles possèdent des chloroplastes verts provenant d'une algue verte, mais elles peuvent également absorber ou ingérer des aliments. Leur long flagelle est ancré dans une poche située à l'avant de la cellule. Les euglènes peuvent être longues et fines ou courtes et larges, et leur longueur varie de 20 à 300 µm. Protiste-Bikonts - Excavata Diplomonades-Métamonades Il s'agit de la forme d'alimentation active deGiardia, un parasite des humains er animaux. Il s'attache Paroi intestinale, se nourrit et s'écoule. Les cellules se transforment en substances qui sont excrétées. Elles évacuent et transmettent les toxines. Taille : 10-15 µm de long Protiste–Bikontes – Excavata Euglenozoa - Kinetoplastidés TrypanosomesCe sont des parasites d'insectes et de vertébrés. Chez l'une de leurs formes, leurs cellules possèdent un flagelle auquel est attachée une membrane ondulée. Leur mouvement est en forme de tire-bouchon. Taille : environ 30 µm de long. Foraminifères ©Aaron Bell, utilisé avec sa permission ;Euglena©Jason Oyadomari, utilisé avec permission ;Giardia-Domaine public (Centres pour le contrôle et la prévention des maladies/Janice Carr) ; Trypanosome aviaire - domaine public, consulté via la Fondation Guttenberg 62