Algorithmique
Mastère Bioinformatique
Mastère Bioinformatique
L. Majdoub
1
Programme
I. Généralités
II. Tableaux et structures dynamiques
III. Les fonctions et les procédures
IV. La complexité d’algorithmes
V. Alignement des séquences
VI. Distance et similitude entre séquences
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Chapitre I : Généralités
I.1. Types de données et variables
I.2. Instructions élémentaires
I.3. Expressions arithmétiques et opérations
logiques
I.4. Les structures de contrôles : les conditions et
les itérations
3
Les séquences génomiques et
l’information génétique
Deux types de molécules support de la
bio information : les acides nucléiques,
les aminés
Les acides nucléiques : ADN, ARN…
les acides aminés : Les protéines
les acides aminés : Les protéines
LADN, se trouvant dans le noyau de
chaque cellule, est le support de
l’information génétique. (les eucaryotes)
LADN est une macromolécule, faite de
deux brins s’enroulant en double hélices
4
Chapitre 1 : Généralités
Chaque brin est le support d’une succession de
nucléotides
Quatre types de nucléotides (bases azotées) (ADN) :
Adénine : A
Cytosine : C
Les séquences génomiques et
l’information génétique
Cytosine : C
Guanine : G
Thymine : T
A, C, G, T c’est l’alphabet de l’information génétique
Complémentarité entre les deux brins
5
Chapitre 1 : Généralités
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