BLAST - Ent Paris 13

140
BLAST :
Basic Local Alignment Search Tool
Paramètres à régler :
Il existe des valeurs «"par défaut"»
Lorsqu'elles ne conviennent pas, il est possible de changer ces
valeurs
BLAST est disponible sur Internet

141
BLAST sur Internet
http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi
Plusieurs programmes :
Blast p
 !"#
Blast n
Blast x
t Blast n
t Blast x
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%%"&'
"!!'

142
BLAST sur Internet
SEQUENCE BANQUE
Protéique Protéique
Nucléique Nucléique
T T
T T
BLASTP
BLASTN
TBLASTX
TBLASTN
BLASTX

Séquence à rechercher
$(
!!
)%
$*+,

BLAST sur Internet
-
"
!!
 .&#
E-value = 10 => parmi les résultats, statistiquement en
moyenne 10 alignement de séquence seront dus au hasard