DFGSP3 - TD n°2 Bactériologie-Virologie - 2016/2017 Cas n°1 Dans un service de long séjour gériatrique, deux patients présentent des infections du tractus urinaire considérées comme associées aux soins. Pour le premier patient, le diagnostic biologique permet d’identifier Klebsiella pneumoniae comme étant la bactérie responsable de l’infection. L’analyse bactériologique réalisée pour le second patient révèle, quant à elle, la présence dans les urines d’une quantité importante d’un bacille à Gram négatif, ne possédant pas d’oxydase, ne fermentant pas le lactose et possédant l’enzyme tryptophane désaminase. 1- Comment est définie une infection associée aux soins ? 2- Quelle espèce bactérienne est vraisemblablement en cause dans l’infection du second patient ? 3- Les infections des deux patients correspondent-elles à une épidémie d’infections associées aux soins ? Justifiez votre réponse. 4- Quelle particularité de l’espèce bactérienne isolée chez le second patient rend compte de sa forte implication dans les infections du tractus urinaire ? Pourquoi ? 5- A quelle famille bactérienne appartiennent les 2 espèces bactériennes identifiées ? 6- Citer 8 caractéristiques générales communes aux membres de cette famille bactérienne. 7- Quel est l’habitat de ces espèces bactériennes ? 8- Quelles méthodes peuvent être utilisées pour identifier ce type d’agents infectieux ? Expliquer brièvement le principe général de ces méthodes d’identification bactérienne. 9- Quel caractère important a permis l’orientation vers l’identification de Klebsiella pneumoniae ? 10- Quels autres types d’infections peuvent être engendrés par ces 2 espèces bactériennes ? Cas n°2 Une femme de 31 ans est hospitalisée en réanimation à la suite d’un accident de la route. La gravité de ses traumatismes justifie une réanimation lourde. Après une semaine d’hospitalisation, une fièvre à 39 °C apparaît. Un prélèvement respiratoire montre la présence de nombreux bacilles à Gram négatif. Les premiers tests d’identification montrent : une croissance à 42 °C, des colonies pigmentées et la présence d’une cytochrome oxydase. 1- Quelle espèce bactérienne fréquente dans ce contexte a vraisemblablement été cultivée ? 2- Quels sont les facteurs qui ont favorisé cette infection ? Quelles sont les sources possibles de contamination de cette patiente ? 3- Quels sont les principaux facteurs de virulence produits par cette bactérie ? Nommer et expliquer le mécanisme régulant leur production. 4- Quel est la structure pluricellulaire développée par cette bactérie ? Décrire sa formation. Pourquoi une telle structure favorise-t-elle l’infection chez cette patiente ? Un traitement antibiotique est instauré. 5- Quel est le comportement général de cette bactérie vis-à-vis des antibiotiques ? Donnez un mécanisme associé à ce comportement. Cas n°3 Dix jours après son retour en France, une femme de 30 ans rentrant d’un séjour touristique au Maroc, présente une fièvre continue et élevée (40°C) accompagnée de maux de tête, d’anorexie, d’une asthénie très intense et de douleurs abdominales avec diarrhée. Vous lui conseillez de consulter un médecin. L’examen clinique révèle une hépato-splénomégalie. 1- Quelle pathologie suspectez-vous ? 2- Quelles sont les bactéries impliquées ? A quelle famille appartiennent-elles ? 3- Quelle a été la porte d’entrée de ces bactéries ? Comment la patiente a-t-elle été contaminée ? 4- Quels facteurs de virulence sont responsables du pouvoir pathogène de ces bactéries ? 5- Décrire les étapes principales de la physiopathologie de ces infections. 6- Quels types de prélèvements doivent être effectués pour poser le diagnostic ? 7- Expliquer les grandes étapes de l’analyse de ces échantillons : - Quels sont les milieux de culture pouvant être utilisés ? - Quels caractères présentent les colonies obtenues ? - Quels caractères biochimiques caractérisent ce genre bactérien ? - Comment réaliser l’identification précise de la bactérie impliquée ? Vous revoyez cette patiente, elle vous informe qu’elle a programmé un nouveau voyage en Afrique du Nord. 8- Quels conseils devez-vous lui donner ? Cas n°4 Sept enfants habitant une même région et n’ayant pas voyagé récemment avec leurs parents sont hospitalisés pour des diarrhées sanglantes. Pour deux d’entre eux, une forme plus sévère de l’infection est observée associant une thrombopénie, une anémie et une insuffisance rénale. 1- Quelle espèce bactérienne est vraisemblablement en cause ? 2- Quelles caractéristiques métaboliques caractérisent cette espèce ? 3- Quelle est la variété pathogène probablement en cause et quels sont ses facteurs de virulence ? 4- Citer un milieu de culture permettant d’orienter l’identification de cette variété pathogène. 5- Citer 2 méthodes pouvant être mises en œuvre pour identifier cette variété pathogène. Quels éléments de la bactérie sont mis en évidence par chacune de ces méthodes ? 6- Quelle est l’origine probable de la contamination ? 7- Comment trouver la source de la contamination et prouver qu’elle est à l’origine des cas d’infections ? 8- Comment est appelée la forme compliquée présentée par deux des enfants hospitalisés ? 9- Citer une autre variété pathogène de la même espèce pouvant être à l’origine de diarrhées sanglantes. 10- Citer un autre genre bactérien appartenant à la même famille pouvant être à l’origine de diarrhées sanglantes. Quelles caractéristiques bactériologiques le différencie du genre précédent ?