Bryophytes lato sensu (25000) Ptéridophytes (11 000) Les Embryophytes Gymnospermes (820) Cormophytes Végétaux terrestres Archegoniates Angiospermes (260000) Les « Ptéridophytes » Lignine ( trachéides; racines; « bois »; arbres) Taxon non monophylétique (pas clade) Comprend 3 clades : - Filicophytes (Fougères, ex Polypode) - Sphénophytes (ex Prêle) - Lycophytes (ex Sélaginelle) = Fougères et leurs alliées Filicophytes (Fougères) (9000) Les « Ptéridophytes » - Les Filicophytes = Les fougères Ex : le Polypode Racines Fronde = feuille Rhizome = tige Scolopendrium officinale La Scolopendre La lignine : les premiers arbres, des fougères arborescentes Dicksonia antarctica, fougère arborescente, Australie Sélaginelles Prêle Les Spermatophytes : l’acquisition de la graine (carbonifère-permien) Fécondation Graine : embryon (reproduction sexuée) réserves nutritives téguments vie ralentie (dormance) Dissémination, attente, germination; nouvel organisme 2000 Bryophytes lato sensu Ptéridophytes NB : 2004, les Gnétophytes ne sont pas le cladefrère des Angiospermes. Les Gymnospermes forment un clade Gymnospermes Bryophytes lato sensu (25000) Ptéridophytes (11 000) NB : 2004, les Gnétophytes ne sont pas le cladefrère des Angiospermes. Les Gymnospermes forment un clade Gymnospermes (820) Angiospermes (260000) Les Gymnospermes (820 espèces seulement !) Graine Taxon sans doute monophylétique (clade) Il comprend 4 clades +/- évolués : - Gingkophytes (Gingko biloba) (prégraine) - Cycadophytes (Cycas, etc.) (prégraine) - Pinophytes (= coniférophytes, pin, sapin, etc.) - Gnétophytes (Ephedra, etc.) (annonce fleur) Gymnospermes peu évolués : pré-graines Gingkophytes : Gingko biloba, arbre aux 40 écus Gymnospermes peu évolués : pré-graines Gingkophytes : Gingko biloba, arbre aux 40 écus Dioécie (espèce dioïque) Gymnospermes peu évolués : pré-graines Cycadophytes Gymnospermes peu évolués : pré-graines Les Pinophytes (conifères, résineux) Les Pinophytes (conifères, résineux) HG : Pinus sylvestris / Pin sylvestre (Eurosibérien) HD : Pinus pinaster / Pin maritime (Atlantique et circum méditerranéen) BG : Pinus radiata / Pin de Monterrey (origine : Californie) BD : Pinus strobus / Pin Weymouth (origine nord-est de l'Amérique du Nord) HG : Cedrus atlantica / Cèdre de l'Atlas (origine : Rif et Atlas du Maroc et d'Algérie) HD : Larix kaempferi / Mélèze du Japon (origine : Île de Hondo / Japon) BG : Thuya plicata / Thuya géant (origine : côte ouest de l'Amérique du Nord) BD : Cupressus macrocarpa / Cyprès de Lambert (origine : région de Monterrey / Californie) Gymnospermes évolués : en route vers les fleurs Les Gnétophytes Ephedra Welwitschia mirabilis (Gnétophytes) Bryophytes lato sensu (25000) Ptéridophytes (11 000) Les Embryophytes Gymnospermes (820) Cormophytes Végétaux terrestres Archegoniates Angiospermes (260000) Les Angiospermes, des fleurs, des graines et des fruits Monocotylédones : (environ 60 000 espèces) embryon à un cotylédon (feuille primitive) pas de bois secondaire, absence d’un véritable tronc (formes herbacées) feuilles à nervures principales parallèles Grande importance économique (Poacées notamment) Dicotylédones : (environ 200 000 espèces) embryon à deux cotylédons présence de bois secondaire feuilles à nervures principales ramifiées Albumen Tégument Les cotylédons sont les premières feuilles, plus ou moins simplifiées, formées lors de l’embryogenèse dans la graine 1ères feuilles de la plantule Cotylédon Radicule (NB : Les cotylédons existent aussi chez les Gymnospermes) LES ANGIOSPERMES Dicotylédones Monocotylédones (clade) * Très grande diversité !! ** * * * Dicotylédones (Eudicotylédones, clade) Angiosperm Phylogeny Group (APG) APG I, 1998 APG II, 2003 APG III, 2009 Poacées : paturin des prés, blé, riz, maïs, orge, avoine, sorgho, millet Fabacées : fève, haricot, pois, soja, lentille, arachide, trèfle, acacia, mimosa Rosacées : rosier, pommier, poirier, fraisier, amandier, pêcher, prunier, cerisier, Fagacées : hêtre, bouleau, chêne, chataîgnier Brassicacées : chou, moutarde, colza, Arabidopsis Solanacées : tomate, pomme de terre, aubergine, tabac, petunia, poivron Arabidopsis thaliana (Dicotylédones, herbacée, Brassicacées, génome 2000) Oryza sativa (riz) Populus alba (Monocotylédones (Peuplier) , herbacée, (Dicotylédones, Poacées, ligneuse, génome 2003) génome 2006) Vitis vinifera (vigne) (Dicotylédones, ligneuse à fruits 4 angiospermes charnus, Vitacées, « modèles » génome 2007) Biologie des organismes végétaux 1. Introduction générale L’importance et la définition des organismes végétaux 2. Classification et évolution des organismes végétaux Bases historiques des classifications L’apparition du monde végétal dans le contexte de l‘évolution du vivant. Les Algues (3); les Champignons (3); les Lichens; les Embryophytes [à spores (2); à graines (2)] Conclusion Importance particulières des angiospermes (fleurs et fruits) Attention à la nomenclature !! Continuité de l’évolution : diversité intra-spécifique ; influence considérable de l’homme Arbre phylogénétique des végétaux Qiu (2006) B B = bryophytes P = ptéridophytes G = gymnospermes A = angiospermes P G A pré-spermaphyte ptéridosperme disparue prêle fougère arborescente (spores) Echelle des temps géologiques et principaux évènements et modifications de la biosphère depuis 540 Ma 3. La fonction de nutrition chez les végétaux 3.1. Définition et fonctions de la nutrition - à l’échelle de l’organisme : mouvement, croissance, reproduction, etc. Besoin en énergie (?) - à l’échelle cellulaire : production de nouvelles cellules (mitoses), croissance du volume et différenciation des cellules, « vie » cellulaire. - à l’échelle moléculaire : apporter les substrats (précurseurs) pour les biosynthèses (anabolisme); fournir l’énergie nécessaire aux réactions anaboliques (métabolisme énergétique). Métabolisme : ensemble des réactions chimiques des organismes vivants, catalysées par des enzymes . Il est composé de trois groupes : métabolisme énergétique, anabolisme et catabolisme. 4.2. Les métabolismes énergétiques énergie Substrat 1 Produit 1 (réaction exergonique) Substrat 2 Produit 2 (réaction endergonique) Substrat 1 Produit 1 (couplage réactionnel) énergie Substrat 2 enzyme Produit 2 ATP, NADH, NADPH, FADH2, etc. 4.2. Les métabolismes énergétiques (suite) Métabolisme énergétique : ensemble des réactions chimiques qui permettent aux organismes et à leurs cellules de fabriquer leur monnaie d’échange énergétique (molécules riches en énergie : ATP, NADH, NADPH, …). 4.2. Les métabolismes énergétiques (suite) = synthèse de ATP, NADH, NADPH, FADH2, etc. = réactions endergoniques couplées à une réaction exergonique Chimiotrophie : oxydation d’un composé prélevé dans le milieu extérieur (respiration et fermentation) ex : oxydation du glucose (chimio-organotrophie) ex : oxydation de l’ammonium NH4+ (chimio-lithotrophie) Phototrophie : absorption de l’énergie lumineuse et conversion en énergie chimique = 1er rôle de la photosynthèse Les organismes phototrophes : les bactéries photosynthétiques et les plantes 4.3. La composition élémentaire de la biomasse et l’assimilation Biomasse : environ 30 éléments atomiques Abondance : 9 macroéléments (O, C, H, N, S, P, K, Ca, Mg) et environ 20 microéléments Essentiels : 16 éléments essentiels : 9 macroéléments et 7 microéléments (Fe, Mn, Zn, Cu, Mo, B, Cl) Assimilation : 10 éléments restant à l’état minéral; 6 éléments assimilés dans la matière organique (O, H, C, N, S, P) 4.3. L’assimilation (C, N, S, P) Autotrophie : prélèvement sous forme minérale, puis assimilation par l’organisme Hétérotrophie : impossibilité de l’autotrophie; besoin d’absorber l’élément sous forme déjà assimilée (par d’autres organismes) Animaux : hétérotrophie pour C, N, S Champignons : hétérotrophie pour C, (N), (S) Végétaux : autotrophie totale (de même certaines bactéries photosynthétiques) = 2ème rôle de la photosynthèse Végétaux, lichens et cyanobactéries sont totalement photo-autotrophes : capables de se développer dans un monde purement minéral, en présence de lumière. Assimilation Plantes (photosynthèse) Carbone C CO2 Azote N NO3NH4+ Soufre S SO4-- Phosphore P H2PO4- Les animaux sont hétérotrophes pour C, N, S. Assimilation Animaux (aliments) Carbone C Azote N Soufre S Matière organique protéines protéines Phosphore P H2PO4+ Matière organique Auxotrophie pour une molécule donnée : incapacité à synthétiser cette molécule; besoin de la trouver telle quelle dans l’alimentation Exemple : certains acides gras certains acides aminés certaines vitamines certains pigments Une plante ne fait pas la photosynthèse partout et toujours… - Organes non photosynthétiques : racines, bulbes, tubercules, rhizomes, bourgeons, jeunes feuilles, tronc, branches, fleurs, graines, fruits -Alternance jours / nuits - Saisons sans feuilles Les plantes sont aussi capables de chimio-organo-trophie (= respiration des substrats carbonés tels que les sucres). Conséquence : fabrication de réserves nutritives grâce à la photosynthèse; stockage et utilisation ultérieure; transport inter-organes (sève élaborée) Les réserves des végétaux (organes de réserves) Graines, bulbes, tubercules, tiges, tronc, racines, etc. lipides (acides gras; oléagineux) glucides (amidon = réserve amylacée; + cas particuliers) protides (protéines de réserves; protéagineux; cas particulier des Fabacées) Les organes de réserves sont aussi consommés par les animaux ! NB : Les graines sont des organismes complets, pas des organes