Sujet du stage (sous forme de titre court) : La réplication de l`ADN

Sujet du stage (sous forme de titre court) :
La réplication de l'ADN chez les eucaryotes
Laboratoire
Marie-Claude MARSOLIER-KERGOAT
Nom du Responsable :
Affiliation administrative (CNRS, CEA
INSERM...) et n° l'Unité :
Adresse précise du Laboratoire :
Laboratoire du métabolisme de l'ADN et réponses aux
génotoxiques
CEA/DSV/iBiTec-S/SBIGeM, bâtiment 144
91191
Équipe d'accueil des Doctorants
Mécanismes de Surveillance de l'ADN
Nom de l'équipe:
Nom du Responsable :
Marie-Claude Marsolier-Kergoat
École Doctorale de rattachement
:
Gènes, Génomes, Cellules
Responsable du Stage
Nom :
Arach Goldar
Numéro de téléphone :
01
69
08
64
86
Numéro de télécopie :
Adresse électronique :
[email protected]
Profil de l'étudiant(e) souhaité :
Physique et/ou biophysique
Renseignements complémentaires
Perspectives de poursuite de
thèse :
X
Avec une bourse spécifique :
oui
Non
oui
X Non
si oui précisez :
Laboratoire d'accueil (Unité CNRS, INSERM, etc..) :
Nombre de chercheurs :
4
(dont
2 dans
d'accueil)
l'équipe
Nombre
chercheurs :
0
(dont
0 dans
d'accueil)
l'équipe
Nombre de "HDR" :
3
(dont
1 dans
d'accueil)
l'équipe
Nombre d'ITA :
3
(dont
0 dans
d'accueil)
l'équipe
d'enseignants-
Nombre de "post-docs" :
2
(dont
0 dans
d'accueil)
l'équipe
Nombre de visiteurs étrangers :
0
(dont
0 dans
d'accueil)
l'équipe
Sujet de stage (et principales techniques) :
L’ADN génomique est associé à tout instant à des protéines. Ces protéines sont en
compétition pour interagir avec des séquences régulatrices. Le complexe protéique le plus
abondamment présent le long de l’ADN est appelé le nucléosome. Les nucléosomes
confèrent à l’ADN une structure tridimensionnelle appelée la chromatine. Cependant, les
connaissances actuelles ne permettent pas d’inscrire la structure locale et globale de la
chromatine dans le cadre des processus de régulation du cycle cellulaire.
Nous utiliserons comme système modèle la levure de boulanger, Saccharomyces cerevisiae
Comme pour toute cellule eucaryote, le cycle cellulaire de la levure comprend trois phases avant sa
division : 1) la préparation de l’ADN à la duplication (phase G1), 2) la duplication de l’ADN (phase
S) et 3) le contrôle de l’ADN dupliqué et la préparation à la division cellulaire (phase G2).
cerevisiae possède 16 chromosomes. La réplication de l’ADN commence de façon asynchrone à
plusieurs loci chromosomiques appelés les « origines de réplication ». La déclenchement d’une
origine crée deux fourches de réplication qui progressent dans des sens opposés avec une vitesse
constante. Les connaissances actuelles permettent de décrire de façon détaillée les protéines
intervenant durant la réplication de l’ADN, cependant les facteurs qui influent sur le positionnement
des origines de réplication et leur temps de déclenchement sont mal connus.
Nous proposons d’étudier les relations entre la structure de la chromatine et la position des origines
de réplication. Pour cela, nous utiliserons la technique de peignage moléculaire pour détecter les
origines de réplication et analyser leur répartition spatiale et temporelle. En utilisant des concepts
issues de la physique statistique nous explorons l'existence d'une relation entre la distribution
spatio-temporelle des origines de réplication et la structure de la chromatine.
Techniques mises en œuvre :
Culture cellulaire,
Peignage moléculaire,
Analyse du signal
Physique statistique
Modélisation.