1 Utilisation d’EXCEL comme base de données BASE DE DONNÉES DU TAUX D’HORMONES REPRODUCTIVES DES FEMMES Données fournies par le professeur Paul Biscof du département de Gynécologie et d'Obstétrique de l’Hôpital Universitaire de Genève Utiliser la base de données contenant les informations de 20 femmes en bonne santé âgées de 20 à 35 ans provenant toutes de la région de Genève en Suisse. Ces femmes n’ont pas utilisé de contraceptifs oraux durant les trois derniers mois précédent le début de l’étude. À partir du premier jour de leur cycle menstruel (déterminé par le début de leurs menstruations), toutes les volontaires ont fait une prise de sang quotidienne et ont fait la prise de sang jusqu’au premier jour de leur prochain cycle menstruel. Six hormones ont été mesurées dans ces échantillons de sang: FSH LH Prolactine Oestrogène Progestérone Testostérone UI = Unités internationales pg = picogrammes ng = nanogrammes Les données concernant le stage de développement des follicules dans les ovaires ont été obtenues par ultrasons. Utilisation de la base de données d’EXCEL Comment préparer votre base de données Ouvrir le document EXCEL Hormones.xls récemment reçu de votre enseignant. Supprimer les lignes retrouvées entre chaque volontaire. (exemple , les lignes 29 et 30) Sélectionner les lignes et en cliquant avec le bouton droit de la souris, choisir l’option supprimer. Répéter pour toutes les autres lignes entre les informations des 20 volontaires. 2 Retourner à la ligne 1 et sélectionner les cellules A à H Dans le menu Données, sélectionner le Filtre et choisir Filtre automatique 3 De petites flèches pointant vers le bas apparaîtront dans le coin inférieur droit des cellules A à H de la ligne 1. Quand vous cliquez sur une d’elles, vous obtenez le menu suivant : Tous 10 premiers… personnalisé… 1 2 3 … 19 20 Vides non vides Dans la cellule A1 des volontaires, cliquer sur la flèche et sélectionner 3. Vous avez maintenant filtré toutes les informations concernant les volontaires ayant le numéro 3. 4 Remarquer que la flèche de la cellule A1 est maintenant colorée (ici en bleu). Ceci indique qu’un filtre a été utilisé dans cette colonne. Vous remarquerez également que le nombre d’entrées filtrées est indiqué dans le coin inférieur gauche de la feuille. Ici on a «33 enregistrement(s) trouvé(s) sur 579». Pour retourner à une base de données complète, cliquer sur la flèche colorée (ici dans la cellule A1) et sélectionner Tout. 5 Utiliser l’option personnalisé… Cette option est très utile si vous désirez comparer des résultats, par exemple le volontaire 3 et le volontaire 7. Retourner à la base de données complète, cliquer sur la flèche de la cellule A1 et sélectionner personnalisé. Une fenêtre apparaîtra. Entrer les informations suivantes : Volontaire 3 ou 7 comme dans le tableau suivant. Appuyer OK Vous venez de filtrer les informations pour les volontaires 3 et 7 seulement. Maintenant, aller à la cellule B1 et cliquer la flèche afin de sélectionner le jour 8. 6 Vous pouvez maintenant comparer les résultats du jour 8 pour les deux volontaires sélectionnés. Remarquer que les flèches des cellules A1 et B1 sont maintenant colorées. Ceci signifie qu’un filtre est utilisé dans les deux colonnes. Sélectionner Tous dans les deux cas pour revenir à la base de données complète. 7 Exercice Commencer avec la base de données complète. Filtrer le jour 8 de la cellule B1 Maintenant, cliquer sur la flèche de la cellule E1 et sélectionner Personnalisé. Quand la fenêtre apparaîtra, entrer «est supérieur ou égal à» et «10» 12 résultats sont filtrés 8 Maintenant, sélectionner toutes les informations des 12 lignes, choisir Données dans le menu et sélectionner trier… Une fenêtre apparaîtra, Trier à partir de la Cellule F1 et choisir l’ordre décroissant. Cette action vous a permis de pouvoir comparer les niveaux d’œstrogène (pg/mL) avec un niveau élevé de prolactine ((≥ 10 ng/mL) pendant le 8e jour du cycle menstruel à partir des 20 volontaires. Questions 1. Combien de volontaires démontrent un niveau de progestérone supérieur à 1 ng/mL au 9e jour du cycle menstruel ? 2. Lequel des 20 volontaires démontre un niveau de FSH supérieur à 10 UI/mL pour 5 jours. Ces jours sont-ils consécutifs ? Essayer de répondre à ces questions et regarder la méthode à la page suivante. 9 Méthode de la page précédente. Débuter avec une base de données complète. Sélectionner le jour 9 de la cellule B1. Sélectionner Personnalisé dans la cellule G1. Entrer dans la fenêtre : “Supérieur à” et 1. OK Réponse: 4 volontaires Débuter avec une base de données complète. Sélectionner Personnalisé dans la cellule C1. Entrer dans la fenêtre : “Supérieur à” et 10. À partir de la cellule A1, sélectionner le numéro des volontaires un à un. Réponse: Le volontaire 14 a 5 entrées. Les jours ne sont pas consécutifs. Recherche 1 La rupture des follicules se produit environ 36 heures après le pic de LH. a) Choisir 5 volontaires parmi les 20 et tracer un graphique de dispersion (points reliés) de la concentration de LH en fonction du temps. – Soumettre ce graphique (4) b) Étudier le graphique et déterminer la concentration minimale de LH des 5 pics. Quelle est cette valeur ? (1) c) Dans la base de données, sélectionner la colonne de LH, Filtre, Personnalisé, afin de filtrer tous les volontaires donc la concentration est supérieure ou égale à la valeur que vous venez de déterminer. Vous devez maintenant avoir une liste de volontaires dont le niveau de LH est supérieur ou égal à la valeur déterminée en b) à un moment ou un autre de son cycle. – Quels sont ces volontaires ? (1) d) Si vous avez deux valeurs ou plus pour le même volontaire, que devezvous faire au filtre pour n’obtenir qu’une valeur par volontaire ? (2) e) Vous remarquerez possiblement que certains volontaires sont absents de la liste après le filtrage. Pourquoi en est-il ainsi ? (2) f) Si la condition du filtre vous donne moins de 6 volontaires, que devriezvous faire à ce filtre pour en avoir plus ? (2) 10 Le pic pour la LH apparait à un moment particulier dans le cycle menstruel. L’ovulation se produit 36 heures plus tard. g) Copier les jours de la colonne B et coller les informations sous le tableau. Additionner 1,5 à chacun des jours afin de déterminer le moment précis de l’ovulation. Déterminer la moyenne et l’écart type pour les jours d’ovulation pour cet échantillon de volontaires. Soumettre le tableau.(3) http://www.saburchill.com/IBbiology/ICT/dataprocessing/014.html http://www.saburchill.com/IBbiology/ICT/dataprocessing/011.html La méthode de contraception Ogino-Knaus, dite aussi méthode rythmique, consiste à calculer la «période sécuritaire» où aucun ovule (oocyte) viable n’est retrouvé dans les trompes de Fallope. Les ovules sont fécondables par les spermatozoïdes jusqu’à 24 heures après l’ovulation et meurent après 3 jours. Les gynécologues ne s’entendent pas sur la durée de vie des spermatozoïdes dans l’utérus. Ils estiment ce temps entre une seule journée et 7 jours après éjaculation. h) En utilisant les données calculées en g), quelle est la période sécuritaire de la méthode Ogino-Knaus du groupe de femmes étudiées ? (2) i) Avec les informations fournies dans cette base de données, évaluer la méthode de contraception Ogino-Knaus.(5) Total : 22 points 11 Recherche 2 Il existe plusieurs interactions entre les hormones dans un cycle, on t’en propose quatre. La rétroaction négative contrôle le niveau de FSH après que cette hormone ait stimulé la sécrétion d’œstrogène. 2. Il existe une rétroaction positive entre le niveau de LH et celui de l’œstrogène. 3. La testostérone est un précurseur de l’œstrogène (la testostérone est fabriquée par les cellules ovariennes et ensuite convertie en œstrogène). 4. La prolactine est une hormone qui inhibe la sécrétion de progestérone. 1. a) Définir les expressions suivantes i) Rétroaction négative (1) ii) rétroaction positive (1) iii) corrélation négative (1) b) Si une hormone stimuli une autre, devrait-il y avoir une corrélation positive ou négative entre leur concentration. Explique. (2) c) Choisir entre les interactions 1 à 4 proposées ci-haut. Laquelle as-tu choisie ? (1) d) Choisir 5 volontaires et copier dans la colonne B les valeurs de l’hormone choisie du 1er volontaire sur une autre feuille. Les colonnes C, D, E et F devraient avoir les valeurs de la même hormone pour la 2e, 3e, 4e et du 5e volontaire. Dans la colonne F, faire la moyenne des valeurs B à E pour chaque jour du cycle. Faire la même chose avec la seconde hormone dans les colonnes G à L. Insérer ce tableau dans ton travail. (5) e) Illustrer le graphique à points de la relation entre les taux de ces deux hormones et les jours du cycle. Ce graphique devrait avoir deux axes verticaux et une droite la mieux ajustée pour chaque hormone. P.S. Des barres d’incertitudes de donneront des points d’extra. (5) f) En utilisant ce graphique indique le type de corrélation et justifie ta réponses. (2) Total : 18 points Grand total : 40 points. 12