L`avis du conseil scientifique est sollicité sur la première inscription
publicité
SUJET PROPOSE POUR UNE PREMIÈRE INSCRIPTION EN DOCTORAT RENTREE UNIVERSITAIRE 2013 / 2014 – AR DU MINISTERE Intitulé du laboratoire d’accueil UMR 1014 Secalim INRA-Oniris Nom et Prénom du responsable du laboratoire Professeur Hervé Prévost Nom et Prénom du responsable de l’équipe Intitulé français du sujet de thèse proposé : Mécanismes d’inhibition de Campylobacter jejuni par la bactérie lactique Lactobacillus salivarius Intitulé anglais du sujet de thèse proposé Mechanisms involved in Campylobacter jejuni inhibition by Lactobacillus salivarius Directeur de thèse (encadrement : 40%) Xavier Dousset (Professeur) [email protected] 02.51.78.55.25 Co-directeur (encadrement : 30%) Hervé PREVOST (Professeur) Co-encadrant (encadrement : 30%) Nabila HADDAD (Maitre de Conférences) Résumé du sujet de thèse proposé Enjeux économiques : En Europe, plus de 190 000 cas d’infections à Campylobacter ont été reportés, Campylobacter étant la première cause de gastro-entérite bactérienne en Europe. Les travaux de recherche montrent à l’évidence que le portage intestinal de Campylobacter par les volailles constitue un élément clé de la transmission de ce danger à l’homme. La diminution ou l’éradication du portage intestinal chez le poulet est un élément stratégique très important pour la maitrise du risque Campylobacter dans cette filière. Enjeux scientifiques : Nous avons récemment (UMR INRA Secalim) isolée une souche de bactérie lactique Lactobacillus salivarius SMXD51 pour ses propriétés à inhiber la croissance de Campylobacter. Cette souche présente une capacité d’inhibition de Campylobacter in vitro rare et notamment par la production d’un peptide anti-microbien (Messaoudi et al. 2011, 2012a). Par ailleurs, des premiers travaux ont aussi prouvé ses capacités potentiellement probiotiques (Messaoudi et al., 2012b). La connaissance partielle du génome de cette bactérie a confirmé la présence de gènes en rapport avec cette potentialité (Kergourlay et al., 2012). Le projet de thèse proposé a pour but de mieux connaitre cette interaction entre ces deux bactéries dans le but d’utiliser cette souche comme une flore d’exclusion compétitive de Campylobacter chez la volaille et/ou une flore de bioprotection pour les produits carnés. Les travaux seront poursuivis selon le plan ci-dessous. 1- Etudes in vitro : Etudes d’inhibition in vitro lors de cocultures C. jejuni - L. salivarius SMXD51 (UMR INRA 1014 SECALIM) effet des différents ratios et de la température. Observation en microscopie électronique de Campylobacter en coculture. Etude de la virulence et de la colonisation de Campylobacter sur modèle de cellules intestinales humaines et aviaires, respectivement, en présence de la souche de L. salivarius SMXD51 (UMR INRA 1014 SECALIM, INRA Nouzilly) 2- Etudes in vivo : Etude de la colonisation de Campylobacter dans le modèle poulet en présence de la souche de L. salivarius SMXD51 dans des isolateurs (UMR INRA 1014 SECALIM et ANSES Ploufragan). 3- Etude des mécanismes d’interaction L. salivarius et C. jejuni Compléter l’assemblage et l’annotation du génome de L. salivarius SMXD51 rechercher des gènes potentiellement impliqués dans l’interaction bactérienne (production de bactériocines, quorum sensing, production de AI-1, AI-2, AIPs, etc.) Comparaison des profils protéiques et ARN par des approches de transcriptomiques et protéomiques, respectivement, au cours de la coculture Partenaires : ANSES Ploufragan, INRA Nouzilly Messaoudi S., Kergourlay G., Dalgalarrondo M., Choiset Y., Ferchichi M., Prévost H., Pilet M.F., Chobert J.M.., Manai M and Dousset X. 2012a. Purification and characterization of a new bacteriocin active against Campylobacter produced by Lactobacillus salivarius SMXD51.Food Microbiology, 32:129-134. Messaoudi S, Madi A, Prévost H, Feuilloley M, Manai M, Dousset X, Connil N. 2012b.In vitro evaluation of the probiotic potential of Lactobacillus salivarius SMXD5, Anaerobe. 18:584-9. Kergourlay G, Messaoudi S, Dousset X, Prévost H. 2012. Genome sequence of Lactobacillus salivarius SMXD51, a potential probiotic strain isolated from chicken cecum, showing anti-campylobacter activity. J Bacteriol. 194:3008-9. Messaoudi S, Kergourlay G, Rossero A, Ferchichi M, Prévost H, Drider D, Manai M, Dousset X. 2011. Identification of lactobacilli residing in chicken ceca with antagonism against Campylobacter. Int Microbiol. 14:103-10.
