Diapositive 1

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Variabilité environnementale et énergétique
de Pecten maximus
R. LAVAUD
F. JEAN
J. FLYE SAINTE MARIE
POST-DOC COMANCHE
2011/2013
Introduction
Task 6 :
Modélisation de la croissance individuelle fac à la variabilité
environnementale

Comment expliquer les patterns de croissance et de
reproduction sur des sites aux conditions environnementales
contrastées ?

Ressources trophiques et filtration ?

Effet de la température sur le métabolisme ?

Effets croisés de la température et de l'hypoxie sur le
métabolisme ?
=> Estimation des paramètres du modèle DEB de croissance
individuelle
1
Contexte
Dynamique importante sur P. maximus au Lemar :

Historique LEMAR (séries, programmes, sujets divers...)

ANR CHIVAS

Projet PEMADAPT : (18 mois)


Identification des sources trophiques par approche
métaprotéomique
Effets de l'hypoxie sur la physiologie ?

ANR COMANCHE

Acquis de A. Emmery sur le DEB individuel

… projets sur génétique et reproduction
=> 4 thèses + 3 post-docs + stages de Master
1
Données historiques croissance RdB
A. Aguirre (M1 2010)
1
Premier DEB individuel
Première approche A. Emmery (M2 2008)
Variabilité de la croissance des « classe 3 » en fonction de la
variabilité de la ressource trophique
Premier DEB individuel
Années à croissances contrastées
Premier DEB individuel
Première
Premier DEB individuel
si [phytopk] > 1,5.106 => filtration = 0
Théorie du Dynamic Energy Budget
Nourriture
Alimentation
Défécation
Assimilation
Maintenance
Soma
Température
RESERVES
κ
Faecès
κ-1
Maintenance
Maturité
Croissance
STRUCTURE
2011 - Romain LAVAUD
Maturation
Production
gamètes
REPRODUCTION
3
Thèse Romain Lavaud
Approche comparative de 2 sites bien connus :

Population des fjords autour de Bergen (No)
grande taille max, croissance faible

Population de la rade de Brest (Fr)
petite taille max, croissance rapide
Simuler la croissance et la
reproduction de P. maximus

Expliquer les patterns de croissance dans
un site test par inversion du modèle :

Population de la mer d'Iroise (Fr)
petite taille max, faible croissance
2011 - Romain LAVAUD
2
Acquisition des données
Paramètres environnementaux
- Suivi de la température, salinité, chlorophylle a, etc.
Paramètres biologiques
- Bases de données existantes (croissance, maturité)
- Ajouter un aspect haute fréquence (bloom) aux suivis
- Ressources alimentaires (isotopes, acides gras, pigments,
marqueurs moléculaires...)
- Manips écophysiologie (filtration, assimilation, respiration, etc.)
Calibration
du modèle
Estimer et reconstruire la variabilité environnementale du site test par inversion du modèle
4
Calendrier
Mise en place des collaborations (B. Kooijman, IMR)
 Participation au DEB-course 2011 Brest
 Participation au symposium DEB2011 Lisbone
 Acquisition des données biologiques et environnementales
 Expérimentations haute fréquence de suivi alimentation lors d'un bloom
printanier (RL) Brest
 Température et métabolisme (PDoc -?- coll. B.A.S.) Argenton





1ère année
Calibration paramètres du modèle DEB pour P. maximus in silico
Acquisition des données biologiques et environnementales :
 Expérimentations de «jeûne» (PDoc) Argenton
 Expérimentations de suivi alimentation (RL) Bergen
 Expérimentations de « common garden » sur les paramètres
physiologiques (RL + Pdoc) Argenton
2ème année
Calibration, inversion et simulations
Rédaction thèse, articles...
3ème année
5
Tâche 6
Modélisation de la coquille St-Jacques dans
son environnement
Contribution de DYNECO/EB
►Modélisation de l’écosystème de la Manche
►Modélisation de la dynamique de population
Modélisation de l’écosystème de la Manche (Dyneco/EB : P. Cugier)
Maillage 2 km, 10 sigma, imbriqué dans MANGA
Modèle biogéochimique
Interaction avec
la tâche 5
Pseudo-Nitzschia
Biomasse et
toxicité
Modèle en cours de calibration
Salinité
Chlorophylle
NO3
Chlorophylle
satellite
Modélisation de la dynamique de population de la coquille St Jacques
► Thèse de M. Savina (2004) sur la palourde et l’amande
Interaction avec
Tâche 3
► Application à la coquille St Jacques
Exemple de résultats pour la Palourde
Reproduction
larves (larves/m2 intégré)
120000
100000
80000
60000
40000
0-2 j
3000
larves (ind.m-3)
oeufs pondus (oeufs/m2/j)
2-4 j
2500
4-6 j
2000
6-8 j
1500
8-10 j
10-12 j
1000
12-14 j
14-16 j
500
20000
16-18 j
0
0
0
50
100
150
200
250
300
0
350
50
2500
14
2000
12
10
1500
8
1000
6
4
500
2
0
0
150
200
250
250
Temps (jours juliens)
300
350
classe d'âge 4 (2e cohort e)
300
18-20 j
350
20-22 j
22-24 j
classe d'âge 5 (2e cohort e)
12
densité (ind.m-2 )
16
100
200
Vie des adultes
2eme cohorte (ind.m-2)
1ere cohorte (ind.m-2)
Recrutement
50
150
Temps (jours juliens)
Temps (jours juliens)
0
100
10
8
6
4
2
0
0
50
100
150
200
250
Temps (jours juliens)
300
350
Résultats obtenus pour la palourde rose
après 15 ans de simulation
Recrutement
après la 1ere ponte
Recrutement
après la 2e ponte
Résultats obtenus pour la palourde rose
après 15 ans de simulation
densité de palourdes de 2 ans et +
Colonisation simulée de la Manche par la palourde rose :
Structure démographique après 15 ans de simulation vs observé
compartiment
Baie de Saint-Brieuc
% de l'effectif total
campagnes 2002
modèle
60
50
40
30
20
10
0
1
2
3
4
5
6
7
8
Nombre de stries
9
10
11
12
13
Résultats obtenus pour la palourde rose
après 15 ans de simulation
3D
Box
Similarities between 3D
model and data (Holme,
1966)
Data
Modélisation de la coquille Saint-Jacques dans son environnement
Modèle biogéochimique
Modèle
hydrodynamique
3D (MARS) de la
MANCHE à 2km
Nourriture
disponible
Filtration
globale
Broutage
sur les
larves
Mortalité
Fécondité
Modèle écophysiologie (DEB)
Modèle dynamique de population
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