ADI GT Exploitation des données de santé – Entrepôt de données Entrepôt de données Biomédical - CHU de Bordeaux Service d’information médicale, Pôle de santé Publique, CHU de Bordeaux Vianney Jouhet, Frantz Thiessard, Moufid Hajjar, Véronique Gilleron, Florence Saillour-Glenisson, Rachid Salmi, Geneviève Chêne 07/10/2013 Utilisation secondaire des données biomédicales Enjeu important reconnu Nombreux travaux • Recherche clinique et Epidémiologie (EHR4CR – EURECA – Linked2Safety) • Vigilances (ALADIN-DTH – SALUS) Usage éthique et légal 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé – Entrepôt de données 2 Besoins identifiés au CHU de Bordeaux Repérage des patients Phénotypage Détection d’évènements indésirables Suivie de cohorte Pre-screening et aide à l’inclusion pour la recherche clinique EPP et Qualité de prise en charge … 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé – Entrepôt de données 3 Interrogation transversale du système d’information Infection du site opératoire (ISO) • Acte chirurgical • Bactériologie positive dans les 30 jours ou diagnostic clinique de l’infection Phénotypage Polyarthrites rhumatoïdes avec nodules rhumatoïdes 07/10/2013 Nouveaux cas de cancer pris en charge au CHU ADI GT Exploitation des données de santé – Entrepôt de données 4 Usage actuel des données Infocentre / Outil décisionnel (BO) • Direction du Système d’Information Pilotage Analyse de Données Difficultés liées au dossier patient informatisé (DPI) • Optimisé pour la saisie Temps de réponse • Structure en silo Risque de ne pas retrouver certaines informations • Structure complexe Où rechercher l’information ? • Hétérogénéité sémantique 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé – Entrepôt de données 5 Hétérogénéité sémantique M06.4 Ce patient présente depuis 5 ans une polyarthrite rhumatoïde. On note la présence de nodules rhumatoïdes. Il n’y a pas de syndrome sec associé 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé – Entrepôt de données 6 Algorithmes complexes • Nombre de nouveaux cas de cancer au CHU • Détection d’évènements indésirables • Nombreuses sources • Non exhaustives • Données bruitées Mise en œuvre très délicate avec les outils actuels 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé – Entrepôt de données 7 Enjeux : Qualité des données Production Représentation Accessibilité Représentation • Description des données du SIH • Intégration sémantique Terminologies de référence Hiérarchisation de l’information 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé – Entrepôt de données 8 Enjeux : Qualité des données Production Représentation Accessibilité Accessibilité • Utilisateurs cliniciens / chercheurs • Traitements automatisés Consolidation Agrégation Détection 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé – Entrepôt de données 9 Projet - Entrepôt de données SIH CHU de bordeaux Extract Transform ETL Load Entrepôt Interfaces 07/10/2013 Algorithmes … Extractions ADI GT Exploitation des données de santé – Entrepôt de données 10 Entrepôt de données • Intégration Sémantique • Terminologies de référence • Structuration de la représentation 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé – Entrepôt de données 11 Finalité Valorisation des données du CHU • Pre-screening / Faisabilité d’études • Aide à l’inclusion Recherche clinique Cohortes Algorithmes complexes de détection • Vigilances / Coordination des prélèvements / … • Autres : 3C, Qualité (EPP, analyse de prise en charge, …) Autonomie des cliniciens / chercheurs • Ergonomie des outils (orientés métiers) • Sécurité 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé – Entrepôt de données 12 Avancement Objectif ajouté au Contrat du Pôle de Santé Publique Etat des lieux (DSI – PAD) – Partage d’expérience • Environnement actuel Présentation de l’infocentre • Présentation Ravel / Entrepôt de données (SIM - ERIAS) Anonymisation Extraction des données • Echange avec le CHU de Rennes Connecteurs et scripts d’extractions Réplication de base de données Intégration sémantique (Pôle de biologie) • Analyse des terminologies d’interface de biologie • Alignement vers un référentiel sémantique (LOINC) 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé – Entrepôt de données 13 Conclusion Qualité des données • Représentation et accessibilité • Processus de consolidation et d’agrégation Partage d’information • Plateforme territorial de partage Standardisation de l’information Sémantique • Lien avec les CRB Bio-banques, tumorothèques, données omiques Utilisation conjointe avec les données clinique issues du DPI Recherche translationnelle • Masse critique pour les maladies rares 07/10/2013 ADI GT Exploitation des données de santé – Entrepôt de données 14