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Pr Daniel GAUTHERET – Dr Charles FERTE
Date : les 9 et 10 Mai 2016
Année Universitaire 2015-2016
Total heure : CM 6h et TP 8h
Lieu : Sup’Biotech – Salle V301
HORAIRES
9h00 –
10h30
10h30 –
12h00
Pause
14h00 15h30
15h30 –
18h00
Lundi 9 Mai 2016
Mardi 10 Mai 2016
Introduction à la médecine de
précision (CM)
Dr C. FERTE
Les principales technologies de
séquençage à haut débit (NGS) et
médecine (CM)
Pr D. GAUTHERET /Y. BOURSIN
Problématiques du clustering des données
d'expression (CM)
B. JOB
Analyse quantitative des données RNA-seq :
normalisation, expression différentielle (CM)
M.A DILLIES – Institut Pasteur
L’accès aux bases de données
génomiques publiques et aux
ressources associées (TP)
Synapse, Cosmic, TCGA, Bioportal
Dr C. FERTE/Pr D. GAUTHERET
14h00 Atelier RNA-seq : détection
d’expression différentielle dans le
18h00 transcriptome tumoral (TP)
Intervenants plateforme bioinfo ParisSud/Gustave Roussy
Pr D. GAUTHERET/C. BILLEREY/M.
DELOGER
Initiation à la détection de variants
génomiques par séquençage d’exome
(TP)
Intervenants plateforme bioinfo
Gustave Roussy,
Pr D. GAUTHERET/Y. BOURSIN/ C.
BILLEREY
Mercredi 11 Mai 2016
Pr Daniel GAUTHERET – Dr Charles FERTE
Date : les 11 et 12 Mai 2016
Année Universitaire 2015-2016
Total heure : CM 10h et TP 3h
Lieu : Gustave Roussy – Bâtiment de Médecine Moléculaire – Salle 62
HORAIRES
9h00 –
10h30
10h45 –
12h15
Mercredi 11 Mai 2016
HORAIRES
Jeudi 12 Mai 2016
Analyse des CNA (arrays et NGS) :
atelier pratique (TP)
F. COMMO
Non-coding genome & cancer. (CM)
Pr D. GAUTHERET
8h45 – 9h15
Perspectives on precision medicine trials
C. MASSARD (Gustave Roussy)
9h15 – 10h00
Highlights of the Tumor identity card research program
A De REYNIES (Ligue Nationale Contre le Cancer) (TBC)
10h15 – 11h00
Computational imaging in Cancer
Hugo Aerts, Dana Farber CC, Boston (TBC)
Predicting drug efficacy in cancer
Matthew Garnett, Wellcome Trust Cancer Institute (TBC)
11h00 – 11h45
Pause
14h00 15h30
15h30 17h00
Metastatic breast cancer sequencing:
identification of driver genes of
resistance (CM+TP)
C. LEFEBVRE
Liquid Biopsies
L. LACROIX
11h45 – 12h15
Epidemium Open Data Open Science : example of Epidemium efforts
(TBC)
14h00 - 15h00
Modèles prédictifs de la réponse au traitement et de la survie :
l’expérience Quinten
Y.G MATHE
15h00 – 15h45
Sharing Data issues
Alain Viairi 45 min (TBC)