Cours intensif en statistique spatiale sous R : objectifs pédagogiques spécifiques Type d’Objectif Modélisation et Statistique Objectif Technique Les systèmes d'information géographiques (SIG) Types de données à référence spatiale Exemples de données géographiques : Shapefile Exemples de données géographiques : classe polylist (maptools et spdep) Exemples de données géographiques : classe goedata (geoR) Voisinage ; matrices de distances ; pondérations Processus continus ; exemple : pollution atmosphérique ; ce processus continue en statistique spatial en santé est le plus souvent le facteur d’exposition ; mais dans d’autres domaines, historiquement les minerais, c’est le processus étudié ; d’où la géostatistique Processus étudié au niveau de zones géographiques ; exemple : taux de césariennes par canton ; c’est le type de processus étudié le plus souvent dans le domaine de la santé Processus de points ; exemple : statut des individus d’un village concernant le toxoplasme ; Trois sous-modèles : modèle d’exposition, modèle d’effet, modèle de mesure ; exemple : prédiction de l’exposition à la pollution atmosphérique d’après sites de recueil, effet sur le risque respiratoire en fonction de cette exposition et des covariables, survenue ou non de l’événement chez les sujets ; autres exemples, le paludisme en Gambie, et la toxoplasmose en fonction de la présence de parasites dans le sol Modèle d’effet : variables observées, au niveau de l’individu et de la zone et variables non observées, au niveau de l’individu, de la zone ; la spatialité comme surrogate pour la prise en compte des variables non-observées Modèle d’exposition (les méthodes sont valables au-delà de ce modèle) : régression, variogramme ; krigeage ; Modèle de mesure : gaussien Modèle de mesure : poissonien Modèle de mesure : binomiale Modèle de mesure : surdispersion Modèle de mesure : transformation de Box-Cox Tendance et stationnarité Isotropie et anisotropie Autocorrélation spatiale : indices de Moran et autres ; indices globaux et locaux ; Autocorrélation spatiale : variogramme ; effet de pépite, palier, modèles exponentiel et autres Cartographie en santé : cartes de taux bruts, cartes d’estimateurs bayésiens (local et global), cartes de probabilité d’observation sous l’hypothèse d’homogénéité, cartes lissées (Kaldor-Clayton et autres), cartes d’isorisque Modèle gamma-Poisson ; modèle beta-binomial ; leurs extensions Modèles SAR (simultanément autorégressif) et modèles CAR (conditionnellement autorégressif) Atelier RED Biostat14 Lyon, 28-31/10/15 Pr René Ecochard, Lyon1