THEME 1 A Chapitre 3 : expression du patrimoine génétique I – LES GENES CONTROLENT LA SYNTHESE DES PROTEINES • A- les protéines, des macromolécules essentielles aux cellules. (FA n°7) Les fonctions essentielles des cellules (réactions chimiques, transmission de signaux, transports) et leur structure ellemême sont assurées par des molécules de structure complexe et chimiquement réactives : les protéines. 1) La composition d’une protéine • Une protéine est constituée par un ou plusieurs polypeptides. • Chaque polypeptide est une chaîne d'acides aminés, petites molécules qui sont liées entre elles par des liaisons peptidiques. • Exemple de protéine: la testostérone, l’hémoglobine, l’insuline… Composition de l’insuline L’insuline est une hormone produite par le pancréas découverte au 20eme siècle. Elle est hypoglycémiant c'est-àdire qu’elle a pour rôle de faire baisser la glycémie. En 1955, Frédéric Sanger décrit la structure chimique de l'insuline. C’est une protéine composée de 51 acides aminés, avec une chaîne A de 21 acides aminés et une chaîne B de 30 acides aminés reliés par 2 ponts di sulfures, lui conférant une forme particulière. Une protéine est une molécule de grande dimension constituée d’une succession d’acides aminés, repliée dans l’espace. 2) qu’est ce qu’un acide aminé? • Un acide aminé est une petite molécule constituée d’un C autour duquel s’organisent des liaisons simples avec H, N, O variable acide amine • Le radical va modifier les propriétés chimiques de l’acide aminé. Il existe 20 aa différents. 3) L’origine des acides aminés 4) De l’aa au polypeptide et à ses propriétés Lors de la formation d’une protéine, les acides aminés se lient les uns aux autres par une liaison peptidique grâce à une réaction de condensation. D’un a a on passe à 2 a a soit un DIPEPTIDE. Lorsqu’une protéine est formée de plusieurs a a , on parle alors de POLYPEPTIDES. Un polypeptide ne conserve pas sa forme linéaire car les a a régissent avec leurs voisins selon leurs affinités chimiques; la protéine prend une forme spécifique qui lui confère ses propriétés. DONC Les diverses propriétés d’une protéine dépendent de l’ordre précis dans lequel sont enchainés leurs acides aminés. Un plan de fabrication est donc nécessaire pour que les cellules produisent des Le document ci-contre schématise quelques-unes des étapes permettant d'insérer un gène, prélevé chez un organisme, dans les cellules d'un autre organisme. Cette technique de transfert de gène s'appelle la transgénèse. Les individus ayant reçu le gène sont des OGM (Organismes Génétiquement Modifiés). Lorsqu'on éclaire une souris modifiée par une lampe ultraviolette, la peau apparaît vert fluorescent mais les poils, qui sont des cellules mortes, restent sombres. B- un gène, une protéine. 1) Expérience de transgénèse Une souris verte qui… Conclusion des expériences de transgénèse. Une séquence d’ADN entraine l’expression d’une protéine particulière. 2) Les expériences de mutations Analyse d’une expérience Relation gène protéine historique: exp de Beadle et Tatum 1941 Cette expérience montre que: • La molécule qu’il faut ajouter dans le milieu pour permettre la croissance de la souche mutée est celle que cette dernière est incapable de synthétiser. Elle indique donc que l’enzyme est inactive: chaque gène muté détermine ainsi la synthèse d’une enzyme. • On aboutit au concept UN GENE , UNE PROTEINE. 3) Relation mutation – acide aminé • L’idée un gène, une protéine a été ensuite affinée : - on a pu comparer la position des mutations sur un gène donné et la position des acides aminés sur la séquence de la protéine correspondante - On a constaté alors que l'enchaînement des acides aminés d'une protéine suit le même ordre que la succession de informations sur l'ADN Expérience de Charles Yanosfsky Il isole 16 mutants différents pour le gène du tryptophane et mène en parallèle 2 analyses: -La localisation des mutations dans l’ADN - le séquençage des a a de l’enzyme sur chacun des mutants Une succession de nucléotides sur l’ADN code pour une succession d’a .a de la protéine correspondante. Cette propriété se nomme la COLINEATION gène/protéine CONCLUSION Une protéine est une succession linéaire d’acides aminés. Cette succession est déterminée par l’information contenue dans un gène, c’est-à-dire une suite de nucléotides de l’ADN. Ainsi, la séquence des nucléotides d’un gène contrôle la séquence des acides aminés d’une protéine. II- DE L’ADN A LA CONSTRUCTION DE LA PROTEINE. 1°) Des lieux différents. Chez les eucaryotes, l'ADN est toujours localisé dans le noyau cellulaire, séparé du cytoplasme par l'enveloppe nucléaire. Cet ADN ne quitte le noyau OR la synthèse des protéines s’effectue dans le cytoplasme. Comment s’effectue la transmission d’informations nécessaires à la construction de la protéine? 2) L’ARN, un intermédiaire mobile. La synthèse des protéines est dirigée par l'information génétique grâce à des « copies » du gène à exprimer qui sont exportées du noyau vers le cytoplasme. Ces copies sont fabriquées dans le noyau, sous forme d'ARN, une molécule très proche de l'ADN cette étape est la transcription. 3) Du gène à la protéine schéma bilan Comm ent s’effectue le copie de l’A DN en ARN? Comment la copie est – elle traduite en protéine? III- LA TRANSCRIPTION DE L'ADN EN ARN, PREMIERE ETAPE DE L'EXPRESSION DES GENES 1) le transfert de l’information génétique Désoxyribose Thymine 2 brins -Ribose - Uracile - Un seul brin 2) La transcription de l’ADN en ARN dans le noyau L'ARN est synthétisé dans le noyau, à partir de l'information contenue dans la séquence des nucléotides d'un gène. Il est ensuite transporté dans le cytoplasme. Cette copie du gène exprimé, dont l'existence est temporaire (quelques heures), transmet l'information de l'ADN du noyau vers le cytoplasme : elle est qualifiée pour cette raison d'ARN messager (ARNm). La transcription nécessite l'action d'une enzyme, l'ARN­ polymérase. Au fur et à mesure de sa progression le long de l'ADN, l'ARN-polymérase incorpore des nucléotides libres, présents dans le noyau, par complémentarité avec l'un des brins de l'ADN : G se place en face de C, C en face de G, A en face de T et U en face de A. Plusieurs ARN-polymérases se succèdent le long d'un même segment d'ADN et entament la fabrication « à la chaîne » d'ARNm identiques entre eux et qui constituent autant de copies d'un gène. 3) Le mécanisme de la transcription. Le brin d'ARN ainsi produit est donc complémentaire du brin d'ADN qui a servi de matrice, appelé brin transcrit. Par conséquent, le message de l'ARN est identique à celui du brin non transcrit d'ADN (à la différence du nucléotide U qui, sur l'ARN, occupe la place du nucléotide T de l'ADN). Brin transcrit= brin matrice= brin complémentaire à l’ARN 1 Début de la transcription Brin non transcrit Une molécule d’’ADN en cours de transcription C U A G G U C G A C C T A G C A G A C C U A G C A C T G G A C G T T ADN non transcrit T U A U T Brin transcrit G A C ARN m en cours de synthèse Sens de déplacement de l’ARN polymérase ARN polyméras e (enzyme) G 2 Nucléotid es libres A C C C A G C G T Progression de la transcription U C U A G A C T G G U C C G Appariements stricts des bases azotées au niveau de l’ADN A C A U C U A G C A Appariement strict Adénine/Uraci le lors de la synthèse de l’ARNm G A C C C A G C G C T G G G T C G C C U A ARN m en cours de synthèse Le mécanisme de la transcription de l’ADN en ARN messager au niveau du noyau IV- le système de correspondance entre nucléotides et a.a 1° Le système de lecture La « lecture » de l'information génétique se fait suivant un cadre de longueur fixe, constitué de trois nucléotides : un triplet de nucléotides (ou codon) code pour un acide aminé. Un codon = 3 nucléotide = 1 aa Ce système de correspondance codon / a.a est appelé le CODE GENETIQUE 2) Le code génétique est Il existe 4 nucléotides redondant. donc on peut former 4 soit 64 codons différents or il n’y a que 20 a.a différents. 3 codons 1 acide aminé correspond à plusieurs codons • Le code génétique est donc redondant mais UNIVOQUE ( 1codon = 1 a.a) Le code génétique est le même pour toutes les espèces; il est UNIVERSEL V- LA TRADUCTION DE L'ARN MESSAGER EN PROTEINE 1) la localisation de la traduction La synthèse protéique est localisée dans le cytoplasme au niveau de structures appelées ribosomes. Les ribosomes sont formés: - d'une petite sous-unité, capable de reconnaître et de se fixer sur une molécule d'ARNm d'une grosse sous-unité, associée à la petite sous-unité et qui réalise l'assemblage des acides aminés. 2) La lecture de l’ARN et l’ assemblage des acides aminés La lecture Elongation de la chaine peptidique du codon stop •La traduction débute toujours par un codon initiateur ARN Polyméras e Enzyme ADN 1 gène Noyau ARNm Transcript ion enveloppe nucléaire Pore nucléaire ARNm Traduction AA Liaison peptidique AA AA AA Protéin e ARN t Sens de lecture Ribosom e Cytoplasm e Membrane plasmique Petits ARN ( 70 à 100 nucléotides) servant d’intermédiaires entre ARN m et les ribosomes 3) conclusion • Les ribosomes réalisent la synthèse des protéines à partir de l’information de l’ARN messager. • La traduction commence toujours par un codon d’initiation AUG. Elle se poursuit de codon en codon, en ajoutant des acides amines correspondants, phénomène d’élongation jusqu’à la lecture du codon – stop. VI- du génome au « protéome ». • Le génome humain comporte environ 20 à 25000 gènes. • Le « protéome » c’est-à-dire l’ensemble des protéines humaines sont bien plus importantes. • Cette découverte remet en cause le postulat historique : un gène, une protéine. • Comment expliquer cette différence? 1) Les gènes morcelés Chez les eucaryotes, le gène n’est pas directement transcrit en ARN messager mais en un « ARN prémessager » qui devra subir une opération qualifiée de maturation. Dans l’ARN pré messager, on trouve des parties codantes des parties non codantes. La maturation consiste à supprimer les parties non codantes ou introns pour fournir un ARN messager exportable dans le cytoplasme. VOCABULAIRE: Partie codante: exon Partie non codante: intron 2) Un gène et plusieurs protéines. Au cours de sa maturation, certaines séquences d’ARN pré messager sont sélectionnées au dépens d’autres: Un ARN pré messager donne naissance à plusieurs ARN donc à plusieurs protéines . Ce mécanisme sélectif se nomme L’EPISSAGE ALTERNATIF. Cet épissage alternatif est fonction du type cellulaire mais aussi du moment où s’exprime le gène. Cette découverte remet en cause le postulat: un gène, une protéine; on devrait dire un gène, des protéines. Arn pré messager unique Différents ARN messager qui en découlent après l’épissage 3) Génome et évolution des espèces. Toutes les espèces n’ont pas la même organisation de leur génome , on parle de morcellement du génome qui peut être plus ou moins important. L’épissage joue donc un rôle dans l’évolution des espèces. Le génome de levure contient une densité de gène plus importante, avec peu d’introns. À l’inverse, le génome humain a une densité de gènes faible, contenant une proportion d’introns très importante. Le génome de drosophile est intermédiaire