Atlas régionaux interactifs des Papillons de jour et des Libellules et

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Atlas régionaux interactifs des Papillons de jour et
des Libellules et Demoiselles du Languedoc-Roussillon
Répartition, écologie et conservation
Un double projet piloté par :
I - Préambule – Contexte général du projet
En comparaison aux autres groupes taxonomiques, chez les Insectes, les Papillons de jour et les
Odonates ont fait l’objet de nombreuses observations et recherches au cours des siècles passés.
Pourtant, faute de pouvoir mobiliser des informations souvent dispersées, ils demeurent actuellement
des groupes assez méconnus, trop délaissés par les projets de conservation. En effet, il est
aujourd’hui bien difficile de préciser la répartition exacte de bon nombre de ces espèces
emblématiques et par conséquent d’évaluer l’évolution de leurs populations. L’attrait du grand public
pour ces insectes reste pourtant important et une somme considérable d’informations détenues par
des naturalistes sont dispersées et rendent la connaissance diffuse.
Enfin, ces espèces ombrelles (ils traduisent la présence de tout un cortège de faune, de flore et
d’habitats) et sentinelles (ils réagissent à l’altération de leurs biotopes), constituent d’excellents
bioindicateurs de l’état des milieux et présentent un fort intérêt comme support pour la sensibilisation
des publics.
Les Papillons de jour
Riche en espèces de papillons Rhopalocères (appelés communément papillons de jour), la région
Languedoc-Roussillon accueille à elle seule près de 75 % des espèces connues en France
métropolitaine. Entre pelouses sommitales des Pyrénées, causses, dunes littorales et garrigues, la
diversité de milieux présents et le contexte géographique livrent un large éventail de conditions
climatiques et d’espèces végétales qui permettent le développement d’un grand nombre d’espèces.
C’est ainsi que l'on rencontre dans la région des espèces xérothermophiles (la Proserpine, l’Hermite,
le Fadet des garrigues, la Thécla de l'Arbousier…), des espèces forestières (les Mars changeant…),
des espèces de tourbières particulièrement menacées (le Nacré et le Cuivré de la bistorte…) ou
encore des papillons d’altitude (l’Apollon, le Moiré cantabrique…), dont certaines sont endémiques
des Pyrénées.
On sait également, depuis les études de monitoring menées notamment en Grande-Bretagne, que les
papillons de jour sont de bons indicateurs du maintien de l’ouverture des milieux, mais aussi de leur
conservation. Leur mobilité permet de suivre leur réactivité aux modifications de leurs milieux de vie,
et s’avère être un bon indicateur de l’état de santé des biotopes. Si la structuration de la végétation
est un facteur majeur dans l’apparition ou le développement de certaines espèces de papillons, la
composition floristique est également primordiale. L’absence des plantes nourricières (plantes hôtes)
est un facteur limitant pour le développement des Lépidoptères dans une station donnée. Leur
présence, l’abondance et la diversité des espèces de papillons constituent des paramètres pertinents
pour l’évaluation de la valeur écologique des milieux naturels.
Les Libellules et Demoiselles
Le Languedoc-Roussillon est également très riche pour ce groupe puisque la région abrite 73 espèces
sur les 94 présentes en France continentale. Cette grande diversité s’explique par la présence de très
nombreux milieux aquatiques répartis selon des gradients climatiques et altitudinaux importants. Ainsi,
du littoral à la montagne, s’étagent des cortèges liés aux eaux stagnantes (lagunes, mares), aux cours
d’eau lents et méditerranéens, aux eaux courantes des Cévennes et des Pyrénées, aux zones de
sources ainsi qu’aux milieux de tourbières.
De plus la région abrite des populations très importantes d’espèces inscrites dans les annexes de la
Directive Habitats, comme la Macromie splendide, le Gomphe de Graslin, la Cordulie à corps fin,
l’Agrion de Mercure, dont il convient, en priorité, de bien connaître la répartition et le statut de
conservation.
Tout comme les Papillons, les cortèges d'odonates peuvent constituer des indicateurs de la qualité
des milieux aquatiques, ce qui n’est pas négligeable au regard de la mise en œuvre de la Directive
Cadre sur l’Eau et de l’évaluation de la qualité des masses d’eau.
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Un atlas utile à tous
La réalisation d'un atlas écologique régional des Rhopalocères et des Odonates du LanguedocRoussillon, permettra de synthétiser et d'accroître nos connaissances sur la répartition, l'évolution et
les exigences de ces espèces. Ces connaissances nécessaires à la bonne gestion et à la
conservation de ces espèces et de leurs habitats, sont indispensables aux acteurs de
l’environnement. L'outil mis en œuvre dans ce cadre sera également un outil de sensibilisation qui
permettra à tout citoyen de mieux connaître la nature qui l’entoure.
Le développement sous licence libre de l’outil de collecte permettra la mise en commun des données
qui seront saisies selon des formats préconisés par le SINP (système d’information sur la nature et les
paysages). L’association d’une interface de saisie conviviale et de services web cartographiques
facilitera la diffusion et l’exploitation des connaissances recueillies par tous les publics.
II - Objectifs du projet
Concevoir un atlas implique la collecte et l’analyse pertinente de données (cartographiques,
écologiques) relatives aux espèces, avec une préoccupation continue d’apporter une information
scientifique qui fasse le point des connaissances actuelles dans la région Languedoc-Roussillon.
Le CEN-LR, les Ecologistes de l’Euzière, et l’OPIE-LR, souhaitent donc porter un double projet d’atlas
des Rhopalocères et des Odonates du Languedoc-Roussillon avec un outil informatique commun
innovant, visant à :
-
Dresser un état des lieux des connaissances sur les Papillons de jours et les Odonates
de la région.
-
Disposer d’un outil de collecte et de diffusion des connaissances auprès du grand
public, des administrations et des collectivités locales. Pour cela, il est évident que l’on
ne pourrait se passer d’une iconographie riche et soignée, avec le souci notamment d’illustrer
photographiquement chaque espèce et de proposer un ouvrage entièrement en couleurs ;
-
La prise en compte des enjeux de conservation des Papillons de jour et des Odonates dans
les politiques de conservation et servir d’appui technique aux gestionnaires dans les
problématiques de gestion des milieux naturels ;
-
Constituer un outil d’analyse et d’alerte de référence pour identifier les espèces
remarquables et/ou menacées à l’échelle locale, ainsi que les biotopes qui leurs sont
associés. Ceci permettrait l’élaboration d’une politique visant à la protection de ces habitats ;
mais aussi la création ultérieure d’une liste rouge régionale des papillons de jour et des
odonates ;
-
Faciliter l'accès à une donnée précise, récente et systématiser la valorisation des données
récoltées aux niveaux locaux, régionaux, nationaux et internationaux en mettant en place des
procédures automatisées d'export de données.
-
Créer un outil libre de saisie de données précises et réutilisables par tous.
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III - Organisation administrative du projet
1. Maîtrise d’ouvrage
Le CEN LR souhaite s’investir dans des projets de conservation de la faune. Conformément à sa
stratégie à 10 ans, le CEN L-R souhaite favoriser la production et la diffusion des connaissances
naturalistes, nécessaire à la conservation de la biodiversité. Ces préoccupations poussent le
conservatoire à être un acteur de la mise en œuvre du SINP au niveau régional.
Le CEN L-R s’appuie donc sur les compétences de deux structures membres de son conseil
d’administration (l’OPIE L-R et des Ecologistes de l’Euzière) pour porter ce projet en assurant sa
coordination générale, la mise en place des outils informatiques et le respect des préconisations du
SINP.
2. Coordination scientifique
Depuis sa création en 1992, l’OPIE-LR s’est donné pour mission de promouvoir, de diffuser la
connaissance sur les invertébrés continentaux, de protéger leurs milieux de vie et de faciliter les
relations entre les personnes et les organismes intéressés.
Un grand nombre de données sur les insectes ont été accumulées, notamment sur les Lépidoptères
Rhopalocères. L’OPIE-LR dispose d’une base de données issue de la bibliographie sur les
Lépidoptères. Près de 2780 données géoréférencées sont d’ores et déjà disponibles. Fort de son
expérience sur la coordination de la récolte des données « Insectes et les Arachnides » pour la
modernisation de l’inventaire des ZNIEFF du Languedoc-Roussillon, l’OPIE-LR semble la structure la
mieux positionnée pour animer le réseau qui sera généré par le lancement de l’atlas.
Afin que les atlas puissent fonctionner dans les meilleures conditions, les porteurs de projets
s’entoureront des meilleures compétences en la matière au niveau régional. Un certain nombre de
personnes répondant à ces qualifications seront contactées (Pascal Dupond de l’OPIE, Sylvain
Delmas de l’UEF, Josquin et Tristan Lafranchis). Enfin, la recherche de partenariats éventuels sera
privilégiée : associatifs, techniques et/ou institutionnels (UEF, OPIE National, Noé conservation,
MNHN, « Lépidoptéristes » parisiens…)
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3. Coordinations régionales
Le coordonnateur régional est l’OPIE-LR, en collaboration avec le CEN LR pour l’Atlas Papillons de
jour et les Ecologistes de l’Euzière pour l’Atlas Odonates. Au sein de chacun des 5 départements de
la région Languedoc-Roussillon, un réseau d’observateurs (représentant des structures locales ou
indépendant) participe au projet. Des correspondants locaux pourront être désignés si il y a besoin
d’animation locale. Le comité de pilotage régional comprendra, alors, le coordonnateur régional de
chaque atlas et les éventuels correspondants locaux.
4. Animation locale
L’animation locale, qu’elle soit effectuée par les porteurs de projets ou d’autres personnes / structures
motivées a pour finalité la récolte efficace des données et à contribuer à la connaissance des
observateurs (fiabilité...). En effet, ce seront de bons connaisseurs des Papillons et des Odonates de
leur département, qui seront aptes à alerter le comité de validation sur les possibles erreurs de
détermination et à animer les prospections à mener sur leurs territoires.
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IV - Organisation technique de l’Atlas
La réalisation d’un atlas se heurte souvent à la somme de travail considérable que représente la
saisie, la mise en forme et la validation des observations. Une partie de ces contraintes peuvent être
contournées ou atténuées par l’utilisation d’une interface Internet qui encourage et permet une
mobilisation beaucoup plus efficace des porteurs des données, motivés par la restitution et la
valorisation rapide de leurs contributions.
FONCTIONNEMENT GLOBAL DE L’ATLAS.
Figure 1 : organisation globale autour de l’atlas
L’Atlas des Papillons et des Odonates sera soumis à validation au CSRPN dans le cadre de la mise
en œuvre du SINP.
L’atlas sera alimenté par des données provenant des naturalistes régionaux. Les données seront
validées par un comité de validation composé de spécialistes des Papillons et des Odonates. La
composition de ce comité sera validée par le CSRPN LR.
L’Atlas interactif permet une consultation des données par divers utilisateurs et permet aussi la
visualisation de ces données par des serveurs cartographiques tel que celui de la DIREN capables
d’utiliser des services web. L’utilisation de ces services web pour la diffusion des données est un
élément central du SINP et de la Directive INSPIRE.
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DESCRIPTION DE L’OUTIL INFORMATIQUE PROPOSE
Les outils de mise en ligne d'atlas existent mais ne proposent pas de possibilité de saisie fine des
données, ni de restitution en ligne des données brutes.
Des outils de mutualisation des connaissances sur Internet existent et rencontrent un large succès
mais la restitution fine des données n’est pas possible car ces outils ne sont pas liés à une base de
données.
L'outil développé sera convivial pour les naturalistes tout en utilisant des fonds cartographiques précis
et une base de données pour le stockage des informations.
L'interface de saisie ne comportera qu'une fenêtre, présentant la carte, les outils de navigation et
d'édition et les données attributaires (cf. figure 2).
L’outil développé pourra par ailleurs être réutilisable pour tout autre groupe taxonomique.
1. Développement libre
Le développement d'une application sous licence logicielle libre garantit à toute personne ou structure
la possibilité de disposer des codes sources de l'application et d'apporter des modifications au
programme initial. Cela facilite l’appropriation de l’outil par la communauté des utilisateurs,
l’augmentation du nombre des fonctionnalités des applications et garanti le respect accru des normes
en vigueur.
Deux solutions sont aujourd'hui envisageables pour cette application : développer un outil propre à
nos besoins de la réalisation d'atlas interactifs ou développer un module « atlas en ligne » pour BDN
(outil libre développé pour l'ONF) offrant à ce dernier une interface simplifiée. La première solution est
à écarter. Les efforts de développement et les efforts financiers doivent favoriser la mutualisation des
projets. D’autres développements sont en cours autour de BDN, par l’IFN notamment. Tout cela
concourt à mettre sur pied une solution modulaire sur laquelle seront proposées à terme des offres de
formation.
La libre disposition des codes sources d’une application garantie la survie de l’application en cas de
disparition du prestataire initial et la possibilité de changer de prestataire, si par exemple le prestataire
historique ne satisfait plus aux exigences.
Dans le cadre du SINP, une forge logicielle (dépôt de code source) est en cours de création au sein
de l’ADULLACT. BDN doit rejoindre cette forge, ce sera aussi le cas des développements réalisés dans
le cadre de ce projet.
La finalisation du cahier des charges (cf. annexe) se fera en partenariat avec l’ATEN et Tela Botanica.
2. Saisie des données
Les données saisies sur le site seront localisées sur fond cartographique précis. La mise en œuvre du
SINP permet à ses adhérents de bénéficier des fonds de référence de l'IGN à moindre coût et
d'utiliser ces derniers dans le cadre de notre application. L'utilisation de tels fonds dans l'interface de
saisie encouragera la saisie de données précises par les naturalistes.
L'échange de données entre bases de données hétérogènes passe par la définition partagée et
consensuelle d'un format minimal de données. Les informations nécessaires à une utilisation
courante de la donnée (présence de l'espèce, abondance, type d'abondance, observateur, date,
protocole de collecte...) seront des composantes essentielles de ce format.
Ce format sera utilisé lors de la saisie et lors de l'export des données.
La définition de ces formats d'échanges et leur mise en œuvre informatique sont en cours d'étude
dans le cadre du SINP. L’adaptation de l'outil sera effectuée au fur et à mesure des travaux.
Les référentiels taxonomiques utilisés pour les atlas seront ceux de l'INPN.
Des outils d’aide à la saisie seront disponibles (listes déroulantes pour les taxons, calendrier pour les
dates…).
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Tous les types de données connues seront pris en compte pour cet atlas. Cela implique, outre le
recensement et la collecte des données récentes, une synthèse bibliographique exhaustive et un
inventaire des collections privées et publiques (dont les musées) ;
Un tableur type (formats microsoft office et openoffice) sera proposé aux contributeurs dans
l’incapacité de saisir en ligne.
Les contributions des observateurs (données de terrain) seront téléchargeables et utilisables par toute
personne ou structure pour toute utilisation, sous réserve de respect de la paternité des données.
3. Affichage et restitution des données
Différentes requêtes pourront être faite à partir du site pour visualiser les données (cartographie
ponctuelle par espèces, par commune, …)
Chaque contributeur pourra télécharger ses données. Les données pourront être interrogées par
d'autres outils (serveur cartographique de la DIREN par exemple) ou visualisées sur le site de l’Atlas
par les utilisateurs extérieurs.
Les données validées et en attente de validation seront cartographiées de manière différenciée. Un
champ « validation », renseigné par les membres du comité de validation permettra de préciser le
niveau de validation de cette donnée. Cela évitera aux personnes ayant téléchargé les informations
sur le site d’en faire une utilisation erronée
4. Comité de validation
Il sera composé de spécialistes reconnus par le CSRPN LR. Ces spécialistes, membres du comité de
validation ainsi que les coordinateurs du projet seront informés en temps réel des ajouts de données
effectués sur le site (syndication). Ce suivi continu de l’évolution des connaissances et de la
participation des naturalistes au projet permettra aux spécialistes de se rapprocher des naturalistes
participants et d’échanger avec eux sur leurs observations afin de pouvoir les valider.
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Figure 2 : Exemple d’interface de saisie
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