PROGRAMMATION POUR LES BIOLOGISTES : PYTHON 2

PROGRAMMATION POUR LES BIOLOGISTES :
PYTHON 2
du 09 au 11 mai 2017
3 jours / 18 heures
1350 €
(TVA 0% incluse)
E N CA D R E ME NT
Dr Pierre TUFFERY
DO C U ME NTS
PDF sur clé USB des illustrations de cours
É VA LUAT I O N
Attestation de formation délivrée par
l’Université
I N FO R MAT I O N e t I NS CR IPTIO N
01 57 27 82 34 - [email protected]
►►PUBLIC Techniciens, ingénieurs et chercheurs des entreprises et des collectivités
dans le domaine des sciences du vivant.
Pré-requis : avoir suivi la formation Python 1 ou en avoir les
compétences.
►►COMPETENCES VISEES
Etre à l’aise avec la programmation objet dans un contexte d’analyse
bioinformatique.
►►LIEU
Plate-forme RPBS associée à l’Unité MTi, bâtiment Lamarck A, 39 rue
Hélène Brion, Paris 13e
PARTIE THÉORIQUE (3 H PAR JOUR)
►► Programmation objet en PYTHON : classes et héritage
►► Scripting, wrap de programmes externes
►► Interface PYTHON/C/R ou le module BIOPYTHON
PARTIE PRATIQUE (3 H PAR JOUR)
APPLICATIONS DIRECTES DE LA PARTIE THÉORIQUE AVEC COMME FINALITÉ :
►► Conception d’une classe minimale pour l’analyse de fichiers de séquence au format FASTA
►► Interface avec un programme externe comme CLUSTALW
►► Extension d’une classe pour parser les structures au format PDB
Des modifications mineures peuvent être apportées sous
la responsabilité de l’encadrement pédagogique
Conditions d’ouverture : 6 inscriptions minimum et 8 maximum
www.univ-paris-diderot.fr/FC/SDV