ORIGINE DES BIOCONTAMINATIONS : les différentes flores, les
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ORIGINE DES BIOCONTAMINATIONS : les différentes flores, les voies de transmission et de pénétration Cours de microbiologie TCSS -1ORIGINE DES BIOCONTAMINATIONS LES DIFFERENTES FLORES LES VOIES DE TRANSMISSION ET DE PENETRATION Objectifs : 1. Classer les différentes flores 2. Indiquer les principales flores commensales de l’homme 3. Enoncer les principaux modes de contamination directs ou indirects (air, eau, aliments, terre, productions biologiques, matériels, insectes…) 4. Enoncer les voies de pénétration (cutanée, muqueuse, parentérale, sanguine…) Objectif 1 : classer les différentes flores à l’origine des biocontaminations Biocontamination : les matières premières, les instruments, les aliments sont rarement stériles, ils peuvent être contaminés par des micro-organismes, on parle de biocontamination. Les microorganismes contaminants sont très variés et peuvent être classés selon leur origine exogène ou endogène. Origine exogène : les biocontaminations peuvent provenir des milieux naturels : sol, air, eau. L’air : l’atmosphère n’est pas un milieu très favorable à la prolifération microbienne. Dans l’air extérieur les micro-organismes rencontrés sont plus nombreux à la ville, en été, au-dessus des terres cultivées fertiles, des eaux de surfaces polluées… les espèces rencontrées ne sont pas uniformes. Prédominance de bactéries (bacillus, staphylococcus, microcoques…) et de champignons (aspergillus, penicillium…). Dans l’air confiné des habitations, des écoles, des hôpitaux… l’air est d’autant plus contaminé qu’il y a beaucoup d’individus. Les micro-organismes sont véhiculés par les poussières, les gouttelettes de salive. L’eau : la flore d’une eau de rivière est très diversifiée : on y trouve des entérobactéries provenant des rejets égouts, des bactéries pathogènes, telles salmonella ou shigella, responsables de toxiinfections. L’eau du robinet a été traitée pour détruire les micro-organismes. L’eau de source contient des bactéries provenant du sol, des végétaux bordant le cours d’eau, et des plantes aquatiques. Le sol : la flore microbienne tellurique est très variée et comprend des bactéries, des champignons, des algues, des protozoaires et des virus. Les bactéries sont les plus nombreuses : plusieurs milliards par gramme. Origine endogène : les biocontaminations peuvent provenir : d’une flore commensale animale (exemple de la viande de boucherie contaminée par des micro-organismes appartenant à la flore intestinale de l’animal) d’une flore commensale humaine en particulier des flores intestinale et cutanée lorsque les précautions d’hygiène sont négligées Objectif 2 : indiquer les principales flores commensales de l’homme ORIGINE DES BIOCONTAMINATIONS : les différentes flores, les voies de transmission et de pénétration Cours de microbiologie TCSS -2Les flores commensales ou inoffensives vivent sur l’hôte sans lui causer de troubles. Il existe des flores commensales au niveau : De la peau : flore cutanée. Des muqueuses des cavités naturelles : voies aéro-digestives (nez, bouche, pharynx), intestin, vagin. Chaque flore comporte : Une flore résidante : c’est une flore de base constituée d’espèces permanentes. Ces espèces sont dépourvues de rôle pathogène tant quelles restent dans leur habitat normal. Une flore transitoire : c’est une flore constituée d’espèces inconstantes ou «touristiques». Ces espèces peuvent être pathogènes lorsque la flore résidante est perturbée. Parmi les espèces transitoires susceptibles d’être pathogènes, on peut citer le staphylocoque doré, certaines entérobactéries, clostridium perfringens… La flore résidante ne peut être éliminée en totalité par un nettoyage, même par les antiseptiques les plus puissants contrairement à la flore transitoire. Seul le port de gants est susceptible de réduire les contaminations par la flore résidante de la peau. Différentes flores commensales localisation Flore de base ou résidante Flore cutanée Peau et muqueuses Staphylocoques blancs Microcoques Corynebactéries Streptocoques Flore nasale Nez Staphylocoques blancs Flore buccopharyngée Bouche et gorge Streptocoques Corynebactéries Nom de la flore Flore intestinale Intestin Flore vaginale Organes génitaux Clostridium perfringens Streptocoques D Escherichia coli Coliformes Enterocoques bacillus Lactobacillus (bacilles de Döderlein) Streptocoques B et D Flore transitoire Staphylocoques dorés Entérobactéries (région anale, mains) Pseudomonas aeruginosa Staphylocoques dorés (35 à 75% de porteurs) Staphylocoques dorés Entérobactéries Pseudomonas aeruginosa Pneumocoques Staphylocoques dorés Pseudomonas aeruginosa Entérobactéries Clostridium perfringens Objectif 3 : énoncer les principaux modes de contamination directs et indirects Mécanismes de l’infection. Sources de l’infection : A partir des deux sources microbiennes essentielles : flores humaines et environnement, l’infection d’un patient peut répondre à trois mécanismes : Infection exogène : les germes responsables de l’infection sont extérieurs au patient. Ils ont été apportés par l’environnement, une autre personne. Infection endogène : le patient est contaminé par ses propres germes constituant la flore commensale et qui ont migré vers d’autres organes généralement à l’occasion d’une modification de cette flore sous l’influence d’une antibiothérapie. Infection par contiguïté : ce mécanisme intervient chez des patients qui présentent une plaie, des brûlures ou des escarres. La contamination peut se faire par l’intermédiaire du linge, par voie manuportée par le patient lui-même ou le personnel ou de proche en proche (région lombosacrée) ORIGINE DES BIOCONTAMINATIONS : les différentes flores, les voies de transmission et de pénétration Cours de microbiologie TCSS -3- PORTEURS DE GERMES PATIENT Nez et Flore nasale et Bucco-pharyngée MAINS FLORE INTESTINALE Infection exogène Bucco-pharynx Infection endogène FLORE INTESTINALE infection par contiguïté directe ou par l’intermédiaire des mains ou du linge La contamination : définition : C’est l’action d’introduire des micro-organismes issus d’un milieu donné dans un autre milieu qui devient contaminé. Pour qu’une infection se déclare, il faut qu’un germe pathogène pénètre un organisme et s’y développe. les différents modes de contamination : La contamination peut être directe : d’un individu malade à un individu sain. Elle peut se faire par deux voies : La voie aérienne : Par gouttelettes inhalées par le patient ou projetées au niveau d’une plaie lors d’un pansement. Le staphylocoque doré est la bactérie habituellement transmise par cette voie. La voie manuportée : les mains peuvent être souillées par des staphylocoques dorés par ex et les bactéries sont alors transmises directement au patient lors d’un pansement. La contamination peut être indirecte : le micro-organisme atteint l’individu par l’intermédiaire d’un vecteur (eau, aliment, animal, objet…). En milieu hospitalier, ces vecteurs sont représentés pr le matériel et les divers produits utilisés pour les soins. Un instrument mal stérilisé peut transmettre des micro-organismes provenant d’un autre malade. CONCLUSION Les sources de l’infection sont multiples. Dans les contaminations exogènes, la voie manuportée joue un rôle très important. Les précautions d’hygiène devraient donc limiter grandement ce type d’infection. L’infection endogène, considérée actuellement comme la plus habituelle, est imprévisible. On peut seulement en diminuer la fréquence et la gravité en évitant les traitements antibiotiques inutiles ou mal conduits
