Le sous-ordre des Frankineae

Microbiologie BIOL 3253
Les bactéries:
Les Gram-positives riches en GC
Le phylum des Actinobacteria
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Contient une classe, Actinobacteria; 5 sous-classes et 10
ordres.
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Également appelées actinobactéries, elles contiennent les
actinomycèteset autres espèces apparentées riches en
G+C.
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Actinomycètes: Bactéries aérobiques qui forment des
hyphes filamenteux ramifiés qui ne subissent normalement
pas de fragmentation.
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Production de spores asexuées.
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Résistent à la dessication mais généralement
pas à la chaleur.
Habituellement non mobiles.
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Lorsqu’il y a mobilité, elle est limitée
aux spores flagellées.
Très souvent aérobiques.
Une colonie d’actinomycète
Sporangiospores: Si les spores
sont localisées dans un sporange,
on les appellent sporangiospores.
Mycélium aérien
Mycélium végétatif
Thalle: masse ressemblant à un tissu.
Conidiospores = Conidies
Taxinomie basée sur l’approche phénotypique
Importance des actinomycètes
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Ce sont essentiellement des habitants du sol et
ils sont très largement distribués.
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Dégradent un nombre et une variété énorme de
composés organiques.
Extrêmement importants pour la minéralisation de la
matière organique.
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Produisent la plupart des antibiotiques naturels
utilisés en médecine.
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Une minorité sont des agents pathogènes chez
l’humain, les animaux et certains végétaux.
L’ordre des Actinomycetales
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Appartient à la sous-classe des Actinobacteridae.
Cet ordre est composé de 10 sous-ordres.
Le sous-ordre des Actinomycineae
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La plupart sont des bâtonnets, nonsporulants, de forme irrégulière.
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Ces bâtonnets peuvent être droits ou
légèrement incurvés et présentent
habituellement des gonflements, des formes
de massues, ou d’autres déviations de la
morphologie du bâtonnet normal.
Métabolisme principalement aérobie ou
anaérobie facultatif.
Le genre Actinomyces
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Bâtonnets droits ou légèrement incurvés, dont la forme varie
considérablement jusqu’à de minces filaments avec de réelles
ramifications.
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Anaérobies facultatifs ou strictes.
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Peuvent avoir des bouts enflés ou en forme de massue.
Requièrent du CO2 pour une croissance
optimale.
Se trouvent normalement à la surface des muqueuses
(principalement la cavité buccale) chez l’humain et les animaux
à sang chaud.
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i.e., A. bovis – actinomycose chez le bétail (maladie de la mâchoire
bosselée.
i.e., A. israeli – agent pathogène le plus important chez l’humain
(actinomycoses, infections oculaires, et une maladie péridontale).
Le sous-ordre des Micrococcineae
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Bactéries en formes de bâtonnets ou de coques qui
peuvent former des amas.
Aérobies ou anaérobies facultatifs.
Certaines présentent un cycle de développement
bâtonnets-coques.
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En phase de croissance exponentielle, ces bactéries sont
des bâtonnets. Lorsqu’elles entrent en phase stationnaire,
les cellules prennent une forme coccoïde.
Si elles sont transférées sur du milieu frais, les cellules
coccoïdes produisent des excroissances, et de nouveau,
forments des bâtonnets en croissance active.
Le genre Arthrobacter
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Cycle de développement bâtonnet-coque.
Aérobies.
Composant important de la flore microbienne du sol.
Très résistantes à la dessiccation et au manque de
nutriments.
Très souples au niveau nutritionnel: peuvent même
dégrader certains herbicides et pesticides.
Probablement importants pour la minéralisation de
molécules organiques complexes.
Mécanisme de division par cassure.
Le sous-ordre des Corynebacterineae
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Contient plusieurs genres bien connus:
Corynebacterium, Mycobacterium et
Nocardia.
Le genre Corynebacterium
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Bâtonnets droits à légèrement
incurvés (parfois en forme de
massues) avec des extrémités
effilées.
Aérobies ou anaérobies
facultatifs.
Restent souvent attachées après division par
cassure; il en résulte une disposition angulaire des
cellules ou un arrangement en palissade dans lequel
les rangées de cellules sont alignées côte à côte.
Certaines espèces sont des saprophytes
inoffensives du sol et de l’eau.
D’autres sont des agents pathogènes pour l’humain,
les animaux ou les végétaux.
 i.e., C. diphtheriae – diphthérie.
Le genre Mycobacterium
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Bâtonnets légèrement incurvés ou droits qui parfois
se ramifient ou forment des filaments.
Les filaments mycobactériens diffèrent de ceux des
actinomycètes, car ils se fragmentent rapidement en
bâtonnets et corps coccoïdes lorsqu’ils sont perturbés.
Aérobies.
Se développent très lentement et doivent être incubés de 2 à 40 jours
après inoculation pour former une colonie visible.
Les parois ont un contenu en lipides très élevé et possèdent des cires
de 60 à 90 carbones appelées acides mycoliques.
Acido-alcoolo-résistantes.
 La fuchsine basique ne peut être enlevée de la cellule par un
traitement acide-alcool.
Certaines espèces sont pathogènes:
 M. bovis – tuberculose du bétail.
 M. tuberculosis – tuberculose chez l’humain.
 M. leprae – lèpre.
Le genre Nocardia
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Mycélium végétatif qui se fragmente facilement en
bâtonnets et éléments coccoïdes.
La plupart sont des aérobies strictes.
Répandues dans le sol et les milieux aquatiques.
La plupart sont des saprophytes.
 Peuvent dégrader plusieurs
molécules:
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i.e., hydrocarbures,
détergents, benzène, PCB, et
divers pesticides.
Impliquées dans la biodégradation
des joints en caoutchouc dans les
conduites d’eau potable et d’égouts.
Certaines sont des agents pathogènes opportunistes
qui provoquent des nocardioses.
Le sous-ordre des Micromonosporineae
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De nombreux genres de ce groupe étaient placés parmi
les actinoplanes dans la première édition du Bergey.
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Possèdent un mycélium végétatif étendu.
Ces organismes n’ont pas de mycélium aérien ou celui-ci est
rudimentaire.
Les spores apparaissent dans un sporange dressé à la
surface du substrat, à l’extrémité d’une hyphe spéciale
appelée sporangiophore.
Présentes dans le sol et dans les eaux douces.
 Peuvent avoir un rôle
important à jouer dans
la décomposition des
matières végétales et
animales.
 Certaines espèces
produisent des
antibiotiques d’importance.
Le sous-ordre des Streptomycineae
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On désigne souvent l’ensemble des membres
de ce groupe sous le terme streptomycètes.
Le mycélium végétatif, lorsqu’il est présent,
ne subit pas de fragmentation.
Le genre le plus important est Streptomyces.
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Aérobies stricts.
Forment des chaînes de spores non mobiles dans
un fin fourreau fibreux.
Les Streptomycètes
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Représentent de 1 à 20% de la microflore
cultivable du sol.
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Produisent de la géosmine.
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Jouent un rôle important dans la
minéralisation.
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Substance volatile qui rappelle l’odeur de
la terre humide.
Peuvent dégrader en aérobiose des substances
résistantes telles que la pectine, la lignine, la chitine,
la kératine, le latex et des composés aromatiques.
Produisent un grand nombre
d’antibiotiques.
La plupart sont des saprophytes
non pathogènes.
Streptomyces coelicolor
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Organisme modèle pour la recherche
dont le génome a été séquencé
(8,67 Mpb – l’un des plus grands génomes
procaryotes séquencés à ce jour).
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7825 gènes; reflète le nombre de
protéines exigées par son cycle
biologique complexe.
Produit quatres antibiotiques:
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actinorhodine
méthylénomycine
prodigiosine
périmycine
Streptomycètes pathogènes
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Streptomyces scabies
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Maladie de la gale chez la pomme
de terre.
Streptomyces somaliensis
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Actinomycétomes
 Infection des tissus sous-cutanés
chez l’humain.
 Conduit à des abcès et même une destruction
osseuse.
Le sous-ordre des Streptosporangineae
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Le mycélium aérien porte des paires ou de courtes
chaînes de spores et le mycélium végétatif est ramifié.
La paroi cellulaire contient du madurose, un dérivé
glucidique (maduromycètes).
Certains genres forment des sporanges; les spores ne
sont pas résistantes à la chaleur.
Certains genres ont
été isolés à partir
d’habitats à
température
modérément
élevée, comme les
tas de compost et le
foin; ils peuvent
croître à 40-48°C.
Le sous-ordre des Frankineae
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Contient des genres (Frankia et
Geodermatophilus) appelés actinomycètes à
sporanges multiloculaires.
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Multiloculaire signifie que le sporange comporte
de nombreuses cellules ou compartiments.
Le genre Frankia:
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Forme des sporangiospores non mobiles.
Se développe en association
symbiotique avec les racines d’au
moins 8 familles de plantes
supérieures non légumineuses.
Microaérophile capable de fixer
l’azote atmosphérique.
L’ordre des Bifidobacteriales
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Contient 10 genres.
Le genre Bifidobacterium
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Probablement le genre le mieux étudié.
Bâtonnets, non sporulants, non mobiles, de
formes variées, légèrement incurvés ou en forme
de massue; ils sont souvent ramifiées.
Fermentent les glucides pour produire de l’acide
acétique ou lactique, mais pas de dioxyde de
carbone.
Anaérobies.
Retrouvées dans la bouche et le
tractus intestinal des vertébrés
à sang chaud, dans les égouts
et chez les insectes.
L’ordre des Bifidobacteriales
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i.e., Bifidobacterium bifidus
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Colonisateur précoce du tractus intestinal humain,
particulièrement lorsque les bébés sont nourris au
sein.
Le genre ne semble pas être une cause de
pathologie.
i.e., genres Falcivibrio et Gardnerella
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Retrouvés dans le système uro-génital de
l’humain.
On croit que Gardnerella est la principale cause de
vaginite bactérienne.