Génétique Réf : 512 082 Français – p 1 Version : 1106 Kit Transcription de l’ADN Gènètique Kit Transcription de l’ADN Réf : 512 082 1. Instructions Ce kit vous fournit des molécules et des liaisons pour construire un modèle d‟ARNm comprenant 19 nucléotides, dont 1 coiffe de méthyl-guanosine et 1 queue de poly(A) comprenant 3 nucléotides. Il peut être utilisé conjointement avec le kit de Structure et Fonction de l‟ADN ou bien être utilisé seul. Ce kit renferme de petites particules susceptibles d‟engendrer des risques respiratoires. Il faut mettre en garde les élèves contre le fait de porter ces particules à la bouche. 2. Composition du kit 20 21 8 6 2 8 2 63 1 sucres (ribose) de couleur brune à 3 chevilles phosphates de couleur jaune à 2 chevilles adénines de couleur rouge à 3 chevilles uraciles de couleur bleue à 3 chevilles cytosines de couleur verte à 4 chevilles guanines de couleur argentée à 4 chevilles groupes méthyle de couleur noire à 4 chevilles liaisons covalentes transparentes liste de contrôle Dans une molécule d‟ADN, 3 bases (un triplet) constituent un codon qui correspond à un acide aminé à intégrer dans une protéine. L‟ARNm véhicule les codons à partir de l‟ADN vers un ribosome où des protéines sont assemblées à partir des acides aminés. Une molécule d‟ARNm est un polymère de nucléotides simple brin. Un nucléotide est composé d‟un sucre (ribose), un phosphate, et une des bases azotées suivantes : adénine, uracile, cytosine, ou guanine. 3. Partie I : Construction d’un ARNm Avant d‟assembler le modèle, identifiez les éléments qui représentent des molécules de sucre, d‟adénine, de guanine, de cytosine, d‟uracile, et un groupement phosphate [1]. FRANÇAIS 2 Gènètique Kit Transcription de l’ADN Réf : 512 082 Étape 1 : Construction d’un Nucléotide Assemblez un nucléotide en plaçant une liaison covalente transparente sur la cheville située au sommet de l‟angle de 130° (la plus éloignée des deux autres chevilles) de la molécule de sucre de couleur brune (voir Figure 1). Figure 1 Sugar molecule Ensuite, insérez une cheville de l‟une des bases dans la liaison que vous venez de placer sur la molécule de sucre. Pour achever le nucléotide, placez des liaisons covalentes transparentes sur les chevilles de la molécule de sucre qui sont les plus proches les unes des autres et disposez une cheville de phosphate de couleur jaune sur l‟une de ces liaisons. Le phosphate est maintenant sur le carbone 5´ du nucléotide que vous venez de construire. Disposez-le de manière à ce qu‟il ressemble à celui de la Figure 2. Figure 2 Clear tubes Étape 2 : Construction de nucléotides supplémentaires Construisez 18 nucléotides supplémentaires à partir des molécules et des liaisons covalentes transparentes restantes. Étape 3 : Préparation d’une matrice Si vous utilisez un kit dénommé Structure et Fonctions de l‟ADN comme matrice, vous vous servirez de la séquence d‟ADN 3´—TAC CCA CTT CGA ACT—5´ en tant que gène à transcrire en ARNm. Séparez du brin matriciel le brin non matriciel de l„ADN, en laissant les liaisons hydrogène sur les bases du brin matrice (voir Figure 3). FRANÇAIS 3 Gènètique Kit Transcription de l’ADN Réf : 512 082 Nontemplate DNA Figure 3 Template DNA Si vous n‟utilisez pas un kit dénommé Structure et Fonctions de l‟ADN comme matrice, reportez vous à la Figure A pour disposer d‟une représentation du début de la matrice d‟ADN. Figure A Reliez 15 nucléotides ensemble en plaçant la cheville d‟une molécule phosphate 5‟ de couleur jaune dans la liaison inoccupée 3‟ d‟un autre nucléotide. L‟ordre de succession des bases de l‟ARNm doit être complémentaire de la séquence des bases de l‟ADN : 3´—TAC CCA CTT CGA ACT—5´ (voir Figure 5). Remarque : Assurez-vous qu‟il vous reste bien 4 nucléotides dont 3 contenant de l‟adénine et 1 contenant une guanine. Ils ne doivent pas avoir été déjà intégrés dans l‟ARNm ; ces 4 nucléotides seront utilisés plus tard dans l‟étape 7. Avez-vous fait contrôler par votre professeur votre molécule d’ADN scindée en 2 brins ? [3] Étape 4 : Initiation de la transcription Fixez un des nucléotides que vous avez construits au cours de l‟Etape 1 à la première base sur l‟extrémité 3´ du brin matrice de l‟ADN comme sur la Figure 4. Utilisez l‟appariement des bases complémentaires. FRANÇAIS 4 Gènètique Kit Transcription de l’ADN Réf : 512 082 La base rouge est liée à la base bleue ; la base verte est liée à la base argentée. Figure 4 Avez-vous fait de nouveau vérifier votre modèle (4) ? Étape 5 : Achèvement de la transcription Continuez à fixer les bases des nucléotides à leurs bases complémentaires à l‟aide de liaisons hydrogène comme vous l‟avez fait à l‟étape 4. Quand vous avez terminé d‟ajouter les 14 nucléotides restants, insérez les phosphates dans les liaisons covalentes transparentes situées sur le sucre qui fait suite à chaque phosphate. Assurez-vous qu‟il vous reste 4 nucléotides de côté dont 3 contenant de l‟adénine et 1 contenant de la guanine. Ils ne doivent pas avoir été déjà intégrés dans l‟ARNm ; ces 4 nucléotides seront utilisés plus tard à l‟étape 7. Comparez le diagramme des 5 premiers nucléotides d‟un ARNm achevé et fixé représenté sur la Figure 5 à votre modèle. Completed mRNA Figure 5 Template DNA Votre professeur a-t-il vérifié votre modèle d’ADN-ARNm ? [5]. FRANÇAIS 5 Gènètique Kit Transcription de l’ADN Réf : 512 082 Étape 6 : Séparation de l’ARNm et de l’ADN Séparez le brin d‟ARNm de 15 nucléotides (voir Figure 6) de la matrice d‟ADN, en laissant les liaisons hydrogène sur l‟ADN. Rattachez le brin non matrice de la molécule d‟ADN au brin matrice. Completed mRNA Figure 6 Avez-vous fait vérifier les modèles séparés ? [6]. Étape 7 : Adjonction d’une coiffe et d’une queue Nous allons maintenant utiliser les 4 nucléotides laissés de côté que vous aviez construits précédemment. Fixez 2 liaisons et 2 phosphates au phosphate 5´ du nucléotide contenant de la guanine et ensuite fixez un groupe méthyle à 4 chevilles de couleur noire à la base guanine de couleur argentée (Voir Figure 7). Figure 7 Cela constitue la “coiffe” à disposer sur votre molécule d‟ARNm comme suit. Insérez le phosphate sur l‟extrémité 5´ de votre ARNm dans l‟extrémité 5´ de la coiffe de méthyl-guanosine que vous venez de construire. Maintenant construisez une “queue” poly(A) en reliant les 3 nucléotides restants contenant de l‟adénine les uns aux autres (voir Figure 8). Figure 8 FRANÇAIS 6 Gènètique Kit Transcription de l’ADN Réf : 512 082 Enfin, insérez le phosphate de l‟extrémité 5´ de la queue poly(A) dans la liaison covalente incolore à l‟extrémité 3´ de la molécule d‟ARNm. Votre molécule d‟ARNm est maintenant prête à quitter le noyau de la cellule et à se fixer à un ribosome pour y être traduite. 4. Partie II : Mutation ponctuelle Dans les régions où sévit la malaria, il est fréquent que les personnes aient un patrimoine génétique responsable d‟une modification de leur hémoglobine et d‟une conformation caractéristique de leurs hématies dite « falciforme » (en forme de faucille). La vie des personnes, qui possèdent les deux gènes identiques responsables de la pathologie, ou sujets homozygotes, est en danger. Le gène code le remplacement d'un acide aminé en l'occurrence l'acide glutamique par de la valine en sixième position d'une chaîne polypeptidique ß. La molécule d'hémoglobine compte 2 chaînes polypeptidiques ß. Quand de la valine est présente dans l'hémoglobine, les hématies contenant les molécules d'hémoglobine ont une forme irrégulière dite en faucille. Ces cellules présentent une susceptibilité importante à la lyse et obstruent les petits capillaires et le sang véhicule difficilement l'oxygène. L'anémie falciforme qui en résulte peut alors être fatale. C‟est le triplet CTT des bases de l'ADN qui code l'acide glutamique. Une mutation ponctuelle qui modifie ce triplet CTT en CAT engendre le remplacement de l'acide glutamique par la valine. Si vous utilisez le kit de Structure et Fonctions de l‟ADN, modifiez le troisième triplet du brin matrice en remplaçant CTT par CAT, ensuite suivez les instructions en partant de la Partie I, Etape 4. Si vous n‟utilisez pas un kit d‟ADN, modifiez le troisième codon de votre modèle d‟ARNm pour lire GUA. 5. Service après vente La garantie est de 2 ans, le matériel doit être retourné dans nos ateliers. Pour toutes réparations, réglages ou pièces détachées, veuillez contacter : JEULIN - SUPPORT TECHNIQUE Rue Jacques-Monod BP 1900 27 019 EVREUX CEDEX France 0 825 563 563* *0,15 €/TTC à partir d’un téléphone fixe FRANÇAIS 7